Changes

              
    

          
          
        
        

            
f
1
{
f
1
{
            
2
  "author": "[{\"affiliation\": \"ETH Z\\u00fcrich\", 
2
  "author": "[{\"affiliation\": \"ETH Z\\u00fcrich\", 
            
3
\"affiliation_02\": \"WSL\", \"affiliation_03\": \"\", 
3
\"affiliation_02\": \"WSL\", \"affiliation_03\": \"\", 
            
4
\"data_credit\": [\"validation\", \"curation\", \"software\", 
4
\"data_credit\": [\"validation\", \"curation\", \"software\", 
            
5
\"publication\"], \"email\": \"giulia.donati@usys.ethz.ch\", 
5
\"publication\"], \"email\": \"giulia.donati@usys.ethz.ch\", 
            
6
\"given_name\": \"Giulia Francesca Azzurra \", \"identifier\": 
6
\"given_name\": \"Giulia Francesca Azzurra \", \"identifier\": 
            
7
\"0000-0002-5954-3283\", \"name\": \"Donati\"}, {\"affiliation\": 
7
\"0000-0002-5954-3283\", \"name\": \"Donati\"}, {\"affiliation\": 
            
8
\"CRIOBE, USR 3278 CNRS-EPHE-UPVD, LABEX \\u2018CORAIL\\u2019, 
8
\"CRIOBE, USR 3278 CNRS-EPHE-UPVD, LABEX \\u2018CORAIL\\u2019, 
            
9
University of Perpignan, 66860 Perpignan, France\", 
9
University of Perpignan, 66860 Perpignan, France\", 
            
10
\"affiliation_02\": \"CESAB-FRB, Immeuble Henri Poincar\\u00e9, 
10
\"affiliation_02\": \"CESAB-FRB, Immeuble Henri Poincar\\u00e9, 
            
11
Domaine du Petit Arbois, FR-13857 Aix-en-Provence cedex 3, France\", 
11
Domaine du Petit Arbois, FR-13857 Aix-en-Provence cedex 3, France\", 
            
12
\"affiliation_03\": \"\", \"data_credit\": [\"collection\", 
12
\"affiliation_03\": \"\", \"data_credit\": [\"collection\", 
            
13
\"validation\", \"curation\", \"publication\"], \"email\": 
13
\"validation\", \"curation\", \"publication\"], \"email\": 
            
14
\"valeriano.parravicini@gmail.com\", \"given_name\": \"Valeriano\", 
14
\"valeriano.parravicini@gmail.com\", \"given_name\": \"Valeriano\", 
            
15
\"identifier\": \"0000-0002-3408-1625\", \"name\": \"Parravicini\"}, 
15
\"identifier\": \"0000-0002-3408-1625\", \"name\": \"Parravicini\"}, 
            
16
{\"affiliation\": \"MARBEC, Universit\\u00e9 de Montpellier, CNRS, 
16
{\"affiliation\": \"MARBEC, Universit\\u00e9 de Montpellier, CNRS, 
            
17
Ifremer, IRD, Montpellier, France\", \"affiliation_02\": \"Institut 
17
Ifremer, IRD, Montpellier, France\", \"affiliation_02\": \"Institut 
            
18
Universitaire de France, Paris, France\", \"affiliation_03\": \"\", 
18
Universitaire de France, Paris, France\", \"affiliation_03\": \"\", 
            
19
\"data_credit\": [\"publication\", \"supervision\"], \"email\": 
19
\"data_credit\": [\"publication\", \"supervision\"], \"email\": 
            
20
\"fabien.leprieur@umontpellier.fr\", \"given_name\": \"Fabien\", 
20
\"fabien.leprieur@umontpellier.fr\", \"given_name\": \"Fabien\", 
            
21
\"identifier\": \"0000-0001-6869-342X\", \"name\": \"Leprieur\"}, 
21
\"identifier\": \"0000-0001-6869-342X\", \"name\": \"Leprieur\"}, 
            
22
{\"affiliation\": \"WSL\", \"affiliation_02\": \"ETH\", 
22
{\"affiliation\": \"WSL\", \"affiliation_02\": \"ETH\", 
            
23
\"affiliation_03\": \"\", \"data_credit\": [\"validation\", 
23
\"affiliation_03\": \"\", \"data_credit\": [\"validation\", 
            
24
\"curation\", \"software\"], \"email\": \"oskar.hagen@usys.ethz.ch\", 
24
\"curation\", \"software\"], \"email\": \"oskar.hagen@usys.ethz.ch\", 
            
25
\"given_name\": \"Oskar\", \"identifier\": \"0000-0002-7931-6571\", 
25
\"given_name\": \"Oskar\", \"identifier\": \"0000-0002-7931-6571\", 
            
26
\"name\": \"Hagen\"}, {\"affiliation\": \"Department of Computational 
26
\"name\": \"Hagen\"}, {\"affiliation\": \"Department of Computational 
            
27
Biology, University of Lausanne, 1015 Lausanne, Switzerland.\", 
27
Biology, University of Lausanne, 1015 Lausanne, Switzerland.\", 
            
28
\"affiliation_02\": \"Swiss Institute of Bioinformatics, Quartier 
28
\"affiliation_02\": \"Swiss Institute of Bioinformatics, Quartier 
            
29
Sorge, 1015 Lausanne, Switzerland.\", \"affiliation_03\": \"MARBEC, 
29
Sorge, 1015 Lausanne, Switzerland.\", \"affiliation_03\": \"MARBEC, 
            
30
Universit\\u00e9 de Montpellier, CNRS, Ifremer, IRD, Montpellier, 
30
Universit\\u00e9 de Montpellier, CNRS, Ifremer, IRD, Montpellier, 
            
31
France\", \"data_credit\": [\"validation\", \"curation\", 
31
France\", \"data_credit\": [\"validation\", \"curation\", 
            
32
\"software\"], \"email\": \"theogaboriau@gmail.com\", \"given_name\": 
32
\"software\"], \"email\": \"theogaboriau@gmail.com\", \"given_name\": 
            
33
\"Theo\", \"identifier\": \"0000-0001-7530-2204\", \"name\": 
33
\"Theo\", \"identifier\": \"0000-0001-7530-2204\", \"name\": 
            
34
\"Gaboriau\"}, {\"affiliation\": \"EarthByte Group, The University of 
34
\"Gaboriau\"}, {\"affiliation\": \"EarthByte Group, The University of 
            
35
Sydney, Australia. Now: Upstream International New Ventures, Shell 
35
Sydney, Australia. Now: Upstream International New Ventures, Shell 
            
36
International Exploration & Production, The Hague, The Netherlands.\", 
36
International Exploration & Production, The Hague, The Netherlands.\", 
            
37
\"affiliation_02\": \"\", \"affiliation_03\": \"\", \"data_credit\": 
37
\"affiliation_02\": \"\", \"affiliation_03\": \"\", \"data_credit\": 
            
38
\"collection\", \"email\": \"chhei@mensa.uberspace.de\", 
38
\"collection\", \"email\": \"chhei@mensa.uberspace.de\", 
            
39
\"given_name\": \"Christian\", \"identifier\": \"\", \"name\": 
39
\"given_name\": \"Christian\", \"identifier\": \"\", \"name\": 
            
40
\"Heine\"}, {\"affiliation\": \"Institut pour la Recherche en 
40
\"Heine\"}, {\"affiliation\": \"Institut pour la Recherche en 
            
41
D\\u00e9veloppement, UR UMR \\u201cEntropie\\u201d -Labex Corail- 
41
D\\u00e9veloppement, UR UMR \\u201cEntropie\\u201d -Labex Corail- 
            
42
Universit\\u00e9 de Perpignan- 66000-Perpignan- France.\", 
42
Universit\\u00e9 de Perpignan- 66000-Perpignan- France.\", 
            
43
\"affiliation_02\": \"\", \"affiliation_03\": \"\", \"data_credit\": 
43
\"affiliation_02\": \"\", \"affiliation_03\": \"\", \"data_credit\": 
            
44
[\"collection\", \"supervision\"], \"email\": 
44
[\"collection\", \"supervision\"], \"email\": 
            
45
\"michel.kulbicki@ird.fr\", \"given_name\": \"Michel\", 
45
\"michel.kulbicki@ird.fr\", \"given_name\": \"Michel\", 
            
46
\"identifier\": \"0000-0003-1258-5061\", \"name\": \"Kulbicki\"}, 
46
\"identifier\": \"0000-0003-1258-5061\", \"name\": \"Kulbicki\"}, 
            
47
{\"affiliation\": \"Department of Computational Biology, University of 
47
{\"affiliation\": \"Department of Computational Biology, University of 
            
48
Lausanne, 1015 Lausanne, Switzerland.\", \"affiliation_02\": \"Swiss 
48
Lausanne, 1015 Lausanne, Switzerland.\", \"affiliation_02\": \"Swiss 
            
49
Institute of Bioinformatics, Quartier Sorge, 1015 Lausanne, 
49
Institute of Bioinformatics, Quartier Sorge, 1015 Lausanne, 
            
50
Switzerland.\", \"affiliation_03\": \"\", \"data_credit\": 
50
Switzerland.\", \"affiliation_03\": \"\", \"data_credit\": 
            
51
[\"publication\", \"supervision\"], \"email\": 
51
[\"publication\", \"supervision\"], \"email\": 
            
52
\"jonathan.rolland@yahoo.fr\", \"given_name\": \"Jonathan\", 
52
\"jonathan.rolland@yahoo.fr\", \"given_name\": \"Jonathan\", 
            
53
\"identifier\": \"0000-0002-7141-0870\", \"name\": \"Rolland\"}, 
53
\"identifier\": \"0000-0002-7141-0870\", \"name\": \"Rolland\"}, 
            
54
{\"affiliation\": \"Department of Computational Biology, University of 
54
{\"affiliation\": \"Department of Computational Biology, University of 
            
55
Lausanne, 1015 Lausanne, Switzerland.\", \"affiliation_02\": \"Swiss 
55
Lausanne, 1015 Lausanne, Switzerland.\", \"affiliation_02\": \"Swiss 
            
56
Institute of Bioinformatics, Quartier Sorge, 1015 Lausanne, 
56
Institute of Bioinformatics, Quartier Sorge, 1015 Lausanne, 
            
57
Switzerland.\", \"affiliation_03\": \"\", \"data_credit\": 
57
Switzerland.\", \"affiliation_03\": \"\", \"data_credit\": 
            
58
[\"publication\", \"supervision\"], \"email\": 
58
[\"publication\", \"supervision\"], \"email\": 
            
59
\"nicolas.salamin@unil.ch\", \"given_name\": \"Nicolas\", 
59
\"nicolas.salamin@unil.ch\", \"given_name\": \"Nicolas\", 
            
60
\"identifier\": \"0000-0002-3963-4954\", \"name\": \"Salamin\"}, 
60
\"identifier\": \"0000-0002-3963-4954\", \"name\": \"Salamin\"}, 
            
61
{\"affiliation\": \"ETH\", \"affiliation_02\": \"WSL\", 
61
{\"affiliation\": \"ETH\", \"affiliation_02\": \"WSL\", 
            
62
\"affiliation_03\": \"IFREMER, unit\\u00e9 Ecologie et Mod\\u00e8les 
62
\"affiliation_03\": \"IFREMER, unit\\u00e9 Ecologie et Mod\\u00e8les 
            
63
pour l\\u2019Halieutique, rue de l\\u2019Ile d\\u2019Yeu, BP21105, 
63
pour l\\u2019Halieutique, rue de l\\u2019Ile d\\u2019Yeu, BP21105, 
            
64
44311 Nantes cedex 3, France.\", \"data_credit\": [\"validation\", 
64
44311 Nantes cedex 3, France.\", \"data_credit\": [\"validation\", 
            
65
\"curation\", \"software\", \"publication\", \"supervision\"], 
65
\"curation\", \"software\", \"publication\", \"supervision\"], 
            
66
\"email\": \"albouycamille@gmail.com\", \"given_name\": \"Camille\", 
66
\"email\": \"albouycamille@gmail.com\", \"given_name\": \"Camille\", 
            
67
\"identifier\": \"0000-0003-1629-2389\", \"name\": \"Albouy\"}, 
67
\"identifier\": \"0000-0003-1629-2389\", \"name\": \"Albouy\"}, 
            
68
{\"affiliation\": \"ETH\", \"affiliation_02\": \"WSL\", 
68
{\"affiliation\": \"ETH\", \"affiliation_02\": \"WSL\", 
            
69
\"affiliation_03\": \"\", \"data_credit\": [\"software\", 
69
\"affiliation_03\": \"\", \"data_credit\": [\"software\", 
            
70
\"publication\", \"supervision\"], \"email\": 
70
\"publication\", \"supervision\"], \"email\": 
            
71
\"loic.pellissier@usys.ethz.ch\", \"given_name\": \"Loic\", 
71
\"loic.pellissier@usys.ethz.ch\", \"given_name\": \"Loic\", 
            
72
\"identifier\": \"0000-0002-2289-8259\", \"name\": \" Pellissier\"}]",
72
\"identifier\": \"0000-0002-2289-8259\", \"name\": \" Pellissier\"}]",
            
73
  "author_email": null,
73
  "author_email": null,
            
74
  "creator_user_id": "ff67ca9b-ddb9-4698-bfc3-ced0bbe915d6",
74
  "creator_user_id": "ff67ca9b-ddb9-4698-bfc3-ced0bbe915d6",
            
75
  "date": "[{\"date\": \"2017-01-01\", \"date_type\": \"created\", 
75
  "date": "[{\"date\": \"2017-01-01\", \"date_type\": \"created\", 
            
76
\"end_date\": \"\"}]",
76
\"end_date\": \"\"}]",
            
77
  "doi": "10.16904/envidat.85",
77
  "doi": "10.16904/envidat.85",
            
78
  "extras": [
78
  "extras": [
            
79
    {
79
    {
            
80
      "key": "dora_link",
80
      "key": "dora_link",
            
81
      "value": ""
81
      "value": ""
            
82
    }
82
    }
            
83
  ],
83
  ],
            
84
  "funding": "[{\"grant_number\": \"Project \u2018REEFISH\u2019 no. 
84
  "funding": "[{\"grant_number\": \"Project \u2018REEFISH\u2019 no. 
            
85
310030E\u2010164294\", \"institution\": \"FNS and ANR\", 
85
310030E\u2010164294\", \"institution\": \"FNS and ANR\", 
            
86
\"institution_url\": \"\"}]",
86
\"institution_url\": \"\"}]",
            
87
  "groups": [],
87
  "groups": [],
            
88
  "id": "6b06ad48-bd85-47a8-b478-0850b6def1a4",
88
  "id": "6b06ad48-bd85-47a8-b478-0850b6def1a4",
            
89
  "isopen": true,
89
  "isopen": true,
            
90
  "language": "en",
90
  "language": "en",
            
91
  "license_id": "odc-odbl",
91
  "license_id": "odc-odbl",
            
92
  "license_title": "ODbL with Database Contents License (DbCL)",
92
  "license_title": "ODbL with Database Contents License (DbCL)",
            
93
  "license_url": "https://opendefinition.org/licenses/odc-odbl",
93
  "license_url": "https://opendefinition.org/licenses/odc-odbl",
            
94
  "maintainer": "{\"affiliation\": \"eawag\", \"email\": 
94
  "maintainer": "{\"affiliation\": \"eawag\", \"email\": 
            
95
\"giulia.donati@eawag.ch\", \"given_name\": \"Giulia Francesca Azzurra 
95
\"giulia.donati@eawag.ch\", \"given_name\": \"Giulia Francesca Azzurra 
            
96
\", \"identifier\": \"0000-0002-5954-3283\", \"name\": \"Donati\"}",
96
\", \"identifier\": \"0000-0002-5954-3283\", \"name\": \"Donati\"}",
            
97
  "maintainer_email": null,
97
  "maintainer_email": null,
            
98
  "metadata_created": "2019-09-09T14:15:41.472773",
98
  "metadata_created": "2019-09-09T14:15:41.472773",
            
n
99
  "metadata_modified": "2022-05-09T11:19:28.659530",
n
99
  "metadata_modified": "2023-09-27T14:05:50.562852",
            
100
  "name": "dispersal-prevalence-fish-traits-assemblages",
100
  "name": "dispersal-prevalence-fish-traits-assemblages",
            
101
  "notes": "This dataset contains all data and R codes (R Development 
101
  "notes": "This dataset contains all data and R codes (R Development 
            
102
Core Team, https://www.R-project.org) used in the following 
102
Core Team, https://www.R-project.org) used in the following 
            
103
publication: Donati GFA, Parravicini V, Leprieur F, Hagen O, Gaboriau 
103
publication: Donati GFA, Parravicini V, Leprieur F, Hagen O, Gaboriau 
            
104
T, Heine C, Kulbicki M, Rolland J, Salamin N, Albouy C, Pellissier L. 
104
T, Heine C, Kulbicki M, Rolland J, Salamin N, Albouy C, Pellissier L. 
            
105
\"A process-based model supports an association between dispersal and 
105
\"A process-based model supports an association between dispersal and 
            
106
the prevalence of species traits in tropical reef fish assemblages\" 
106
the prevalence of species traits in tropical reef fish assemblages\" 
            
107
accepted by Ecography in August 2019. When using this data and R 
107
accepted by Ecography in August 2019. When using this data and R 
            
108
scripts the above publication should be cited. \r\n\r\nThe interaction 
108
scripts the above publication should be cited. \r\n\r\nThe interaction 
            
109
of habitat dynamics with species dispersal abilities could generate 
109
of habitat dynamics with species dispersal abilities could generate 
            
110
gradients\r\nin species diversity and prevalence of life-history and 
110
gradients\r\nin species diversity and prevalence of life-history and 
            
111
ecological traits, when the latter are associated with dispersal 
111
ecological traits, when the latter are associated with dispersal 
            
112
potential. In this dataset, we use a spatial mechanistic model of 
112
potential. In this dataset, we use a spatial mechanistic model of 
            
113
speciation, extinction and dispersal, constrained by a dispersal 
113
speciation, extinction and dispersal, constrained by a dispersal 
            
114
parameter. This model allows to simulate the interplay between reef 
114
parameter. This model allows to simulate the interplay between reef 
            
115
habitat dynamics over the past 140 million years and dispersal, 
115
habitat dynamics over the past 140 million years and dispersal, 
            
116
shaping lineage diversification history and global assemblage 
116
shaping lineage diversification history and global assemblage 
            
117
composition of over 6000 tropical reef fish species. Global trait 
117
composition of over 6000 tropical reef fish species. Global trait 
            
118
distribution data of tropical reef fish are used to evaluate the 
118
distribution data of tropical reef fish are used to evaluate the 
            
119
congruence between simulations and observations.",
119
congruence between simulations and observations.",
            
120
  "num_resources": 13,
120
  "num_resources": 13,
            
121
  "num_tags": 5,
121
  "num_tags": 5,
            
122
  "organization": {
122
  "organization": {
            
123
    "approval_status": "approved",
123
    "approval_status": "approved",
            
n
124
    "created": "2018-12-01T11:42:44.590217",
n
124
    "created": "2018-12-01T11:59:01.791513",
            
125
    "description": "Our laboratory aims at understanding and 
125
    "description": "Our laboratory aims at understanding and 
            
126
forecasting the response of biodiversity to landscape changes. We 
126
forecasting the response of biodiversity to landscape changes. We 
            
127
investigate the historical responses of species to past changes such 
127
investigate the historical responses of species to past changes such 
            
128
as plate tectonics or the glaciations of the Quaternary and 
128
as plate tectonics or the glaciations of the Quaternary and 
            
129
contemporary responses to ongoing global changes. We develop spatial 
129
contemporary responses to ongoing global changes. We develop spatial 
            
130
mechanistic models of biodiversity that account for processes such as 
130
mechanistic models of biodiversity that account for processes such as 
            
131
dispersal and biotic interactions.",
131
dispersal and biotic interactions.",
            
n
132
    "id": "3b0fde83-e15c-4f8b-a451-9778f5309a84",
n
132
    "id": "153392ee-d556-4b16-a330-dedb177e87f9",
            
133
    "image_url": 
133
    "image_url": "2018-12-01-105921.8275952000px-LogoWSL.svg.png",
            
134
ww.ites.ethz.ch/_jcr_content/orgLogo.imageformat.logo.1518520524.jpg",

            
135
    "is_organization": true,
134
    "is_organization": true,
            
n
136
    "name": "landscape-ecology",
n
135
    "name": "ele-group",
            
137
    "state": "active",
136
    "state": "active",
            
n
138
    "title": "Landscape Ecology",
n
137
    "title": "Ecosystems and Landscape Evolution",
            
139
    "type": "organization"
138
    "type": "organization"
            
140
  },
139
  },
            
t
141
  "owner_org": "3b0fde83-e15c-4f8b-a451-9778f5309a84",
t
140
  "owner_org": "153392ee-d556-4b16-a330-dedb177e87f9",
            
142
  "private": false,
141
  "private": false,
            
143
  "publication": "{\"publication_year\": \"2019\", \"publisher\": 
142
  "publication": "{\"publication_year\": \"2019\", \"publisher\": 
            
144
\"EnviDat\"}",
143
\"EnviDat\"}",
            
145
  "publication_state": "published",
144
  "publication_state": "published",
            
146
  "related_datasets": "",
145
  "related_datasets": "",
            
147
  "related_publications": "https://doi.org/10.1111/ecog.04537",
146
  "related_publications": "https://doi.org/10.1111/ecog.04537",
            
148
  "relationships_as_object": [],
147
  "relationships_as_object": [],
            
149
  "relationships_as_subject": [],
148
  "relationships_as_subject": [],
            
150
  "resource_type": "dataset",
149
  "resource_type": "dataset",
            
151
  "resource_type_general": "dataset",
150
  "resource_type_general": "dataset",
            
152
  "resources": [
151
  "resources": [
            
153
    {
152
    {
            
154
      "cache_last_updated": null,
153
      "cache_last_updated": null,
            
155
      "cache_url": null,
154
      "cache_url": null,
            
156
      "created": "2019-09-09T14:16:30.892060",
155
      "created": "2019-09-09T14:16:30.892060",
            
157
      "description": "Each species corresponds to a \"Gaspar_code\" 
156
      "description": "Each species corresponds to a \"Gaspar_code\" 
            
158
gathered from the General Approach to Species Abundance Relationships 
157
gathered from the General Approach to Species Abundance Relationships 
            
159
(GASPAR) database (Kulbicki et al. 2013, Parravicini et al. 2013) and 
158
(GASPAR) database (Kulbicki et al. 2013, Parravicini et al. 2013) and 
            
160
is linked to a specific Fishned ID corresponding to a specific 
159
is linked to a specific Fishned ID corresponding to a specific 
            
161
Latitude and Longitude.",
160
Latitude and Longitude.",
            
162
      "doi": "",
161
      "doi": "",
            
163
      "format": "CSV",
162
      "format": "CSV",
            
164
      "hash": "",
163
      "hash": "",
            
165
      "id": "f554c199-621c-4c60-9566-e3ae1d9479b0",
164
      "id": "f554c199-621c-4c60-9566-e3ae1d9479b0",
            
166
      "last_modified": "2019-09-11T09:51:35.327551",
165
      "last_modified": "2019-09-11T09:51:35.327551",
            
167
      "metadata_modified": null,
166
      "metadata_modified": null,
            
168
      "mimetype": "text/csv",
167
      "mimetype": "text/csv",
            
169
      "mimetype_inner": null,
168
      "mimetype_inner": null,
            
170
      "name": "Global species distribution of tropical reef fish 
169
      "name": "Global species distribution of tropical reef fish 
            
171
species",
170
species",
            
172
      "package_id": "6b06ad48-bd85-47a8-b478-0850b6def1a4",
171
      "package_id": "6b06ad48-bd85-47a8-b478-0850b6def1a4",
            
173
      "position": 0,
172
      "position": 0,
            
174
      "resource_type": null,
173
      "resource_type": null,
            
175
      "restricted": "{\"shared_secret\": \"\", \"allowed_users\": 
174
      "restricted": "{\"shared_secret\": \"\", \"allowed_users\": 
            
176
\"\", \"level\": \"public\"}",
175
\"\", \"level\": \"public\"}",
            
177
      "size": 3224423,
176
      "size": 3224423,
            
178
      "state": "active",
177
      "state": "active",
            
179
      "url": 
178
      "url": 
            
180
554c199-621c-4c60-9566-e3ae1d9479b0/download/fishnet_gaspar_code.csv",
179
554c199-621c-4c60-9566-e3ae1d9479b0/download/fishnet_gaspar_code.csv",
            
181
      "url_type": "upload"
180
      "url_type": "upload"
            
182
    },
181
    },
            
183
    {
182
    {
            
184
      "cache_last_updated": null,
183
      "cache_last_updated": null,
            
185
      "cache_url": null,
184
      "cache_url": null,
            
186
      "created": "2019-09-11T09:59:30.476293",
185
      "created": "2019-09-11T09:59:30.476293",
            
187
      "description": "Dispersal parameter value d per simulation 
186
      "description": "Dispersal parameter value d per simulation 
            
188
starting with a minimum dispersal value, where each species is able to 
187
starting with a minimum dispersal value, where each species is able to 
            
189
colonise each adjacent cell, and ending with the value of d for which 
188
colonise each adjacent cell, and ending with the value of d for which 
            
190
all the extant habitats, including the most remote Pacific islands, 
189
all the extant habitats, including the most remote Pacific islands, 
            
191
have been colonised (d \u2208 [1.75\u00b0: 5.45\u00b0]).",
190
have been colonised (d \u2208 [1.75\u00b0: 5.45\u00b0]).",
            
192
      "doi": "",
191
      "doi": "",
            
193
      "format": "TXT",
192
      "format": "TXT",
            
194
      "hash": "",
193
      "hash": "",
            
195
      "id": "f895d8b6-3eff-4479-892b-8cc86b476a22",
194
      "id": "f895d8b6-3eff-4479-892b-8cc86b476a22",
            
196
      "last_modified": "2019-09-11T09:59:30.298599",
195
      "last_modified": "2019-09-11T09:59:30.298599",
            
197
      "metadata_modified": null,
196
      "metadata_modified": null,
            
198
      "mimetype": "text/plain",
197
      "mimetype": "text/plain",
            
199
      "mimetype_inner": null,
198
      "mimetype_inner": null,
            
200
      "name": "Dispersal parameter value d per simulation",
199
      "name": "Dispersal parameter value d per simulation",
            
201
      "package_id": "6b06ad48-bd85-47a8-b478-0850b6def1a4",
200
      "package_id": "6b06ad48-bd85-47a8-b478-0850b6def1a4",
            
202
      "position": 1,
201
      "position": 1,
            
203
      "resource_type": null,
202
      "resource_type": null,
            
204
      "restricted": "{\"shared_secret\": \"\", \"allowed_users\": 
203
      "restricted": "{\"shared_secret\": \"\", \"allowed_users\": 
            
205
\"\", \"level\": \"public\"}",
204
\"\", \"level\": \"public\"}",
            
206
      "size": 124575,
205
      "size": 124575,
            
207
      "state": "active",
206
      "state": "active",
            
208
      "url": 
207
      "url": 
            
209
source/f895d8b6-3eff-4479-892b-8cc86b476a22/download/d_param_sim.txt",
208
source/f895d8b6-3eff-4479-892b-8cc86b476a22/download/d_param_sim.txt",
            
210
      "url_type": "upload"
209
      "url_type": "upload"
            
211
    },
210
    },
            
212
    {
211
    {
            
213
      "cache_last_updated": null,
212
      "cache_last_updated": null,
            
214
      "cache_url": null,
213
      "cache_url": null,
            
215
      "created": "2019-09-11T10:04:43.975616",
214
      "created": "2019-09-11T10:04:43.975616",
            
216
      "description": "Global distribution of simulated species 
215
      "description": "Global distribution of simulated species 
            
217
richness under a range of dispersal parameter values d \r\nd \u2208 
216
richness under a range of dispersal parameter values d \r\nd \u2208 
            
218
[1.75\u00b0: 5.45\u00b0].",
217
[1.75\u00b0: 5.45\u00b0].",
            
219
      "doi": "",
218
      "doi": "",
            
220
      "format": "TXT",
219
      "format": "TXT",
            
221
      "hash": "",
220
      "hash": "",
            
222
      "id": "471350ea-cbf8-409e-a8cc-55a84fe4a8cd",
221
      "id": "471350ea-cbf8-409e-a8cc-55a84fe4a8cd",
            
223
      "last_modified": "2019-09-11T10:04:43.792820",
222
      "last_modified": "2019-09-11T10:04:43.792820",
            
224
      "metadata_modified": null,
223
      "metadata_modified": null,
            
225
      "mimetype": "text/plain",
224
      "mimetype": "text/plain",
            
226
      "mimetype_inner": null,
225
      "mimetype_inner": null,
            
227
      "name": "Global simulated distribution of species under a range 
226
      "name": "Global simulated distribution of species under a range 
            
228
of dispersal parameter values",
227
of dispersal parameter values",
            
229
      "package_id": "6b06ad48-bd85-47a8-b478-0850b6def1a4",
228
      "package_id": "6b06ad48-bd85-47a8-b478-0850b6def1a4",
            
230
      "position": 2,
229
      "position": 2,
            
231
      "resource_type": null,
230
      "resource_type": null,
            
232
      "restricted": "{\"level\": \"public\", \"allowed_users\": \"\", 
231
      "restricted": "{\"level\": \"public\", \"allowed_users\": \"\", 
            
233
\"shared_secret\": \"\"}",
232
\"shared_secret\": \"\"}",
            
234
      "size": 30514436,
233
      "size": 30514436,
            
235
      "state": "active",
234
      "state": "active",
            
236
      "url": 
235
      "url": 
            
237
350ea-cbf8-409e-a8cc-55a84fe4a8cd/download/matrix_sim_sprichness.txt",
236
350ea-cbf8-409e-a8cc-55a84fe4a8cd/download/matrix_sim_sprichness.txt",
            
238
      "url_type": "upload"
237
      "url_type": "upload"
            
239
    },
238
    },
            
240
    {
239
    {
            
241
      "cache_last_updated": null,
240
      "cache_last_updated": null,
            
242
      "cache_url": null,
241
      "cache_url": null,
            
243
      "created": "2019-09-11T10:26:54.719658",
242
      "created": "2019-09-11T10:26:54.719658",
            
244
      "description": "Grid cells of 5 \u00d7 5\u00b0, corresponding to 
243
      "description": "Grid cells of 5 \u00d7 5\u00b0, corresponding to 
            
245
circa 555 \u00d7 555 km at the Equator (see Parravicini et al. 2013, 
244
circa 555 \u00d7 555 km at the Equator (see Parravicini et al. 2013, 
            
246
Leprieur et al. 2016)\r\n\r\nParravicini, V. et al. 2013. Global 
245
Leprieur et al. 2016)\r\n\r\nParravicini, V. et al. 2013. Global 
            
247
patterns and predictors of tropi- cal reef  sh species richness. 
246
patterns and predictors of tropi- cal reef  sh species richness. 
            
248
\u2013 Ecography 36: 1254\u20131262.\r\n\r\nLeprieur, F. et al. 2016. 
247
\u2013 Ecography 36: 1254\u20131262.\r\n\r\nLeprieur, F. et al. 2016. 
            
249
Plate tectonics drive tropical reef biodiver- sity dynamics. \u2013 
248
Plate tectonics drive tropical reef biodiver- sity dynamics. \u2013 
            
250
Nat. Commun. 7: 11461.",
249
Nat. Commun. 7: 11461.",
            
251
      "doi": "",
250
      "doi": "",
            
252
      "format": "SHP",
251
      "format": "SHP",
            
253
      "hash": "",
252
      "hash": "",
            
254
      "id": "7b6a4981-0f00-432c-9ed8-502c43126613",
253
      "id": "7b6a4981-0f00-432c-9ed8-502c43126613",
            
255
      "last_modified": "2019-09-11T10:32:45.354348",
254
      "last_modified": "2019-09-11T10:32:45.354348",
            
256
      "metadata_modified": null,
255
      "metadata_modified": null,
            
257
      "mimetype": "application/zip",
256
      "mimetype": "application/zip",
            
258
      "mimetype_inner": null,
257
      "mimetype_inner": null,
            
259
      "name": "Coral reef grid cells (shape, dbf, etc. files)",
258
      "name": "Coral reef grid cells (shape, dbf, etc. files)",
            
260
      "package_id": "6b06ad48-bd85-47a8-b478-0850b6def1a4",
259
      "package_id": "6b06ad48-bd85-47a8-b478-0850b6def1a4",
            
261
      "position": 3,
260
      "position": 3,
            
262
      "resource_type": null,
261
      "resource_type": null,
            
263
      "restricted": "{\"shared_secret\": \"\", \"allowed_users\": 
262
      "restricted": "{\"shared_secret\": \"\", \"allowed_users\": 
            
264
\"\", \"level\": \"public\"}",
263
\"\", \"level\": \"public\"}",
            
265
      "size": 12441,
264
      "size": 12441,
            
266
      "state": "active",
265
      "state": "active",
            
267
      "url": 
266
      "url": 
            
268
ce/7b6a4981-0f00-432c-9ed8-502c43126613/download/grid_4326_files.zip",
267
ce/7b6a4981-0f00-432c-9ed8-502c43126613/download/grid_4326_files.zip",
            
269
      "url_type": "upload"
268
      "url_type": "upload"
            
270
    },
269
    },
            
271
    {
270
    {
            
272
      "cache_last_updated": null,
271
      "cache_last_updated": null,
            
273
      "cache_url": null,
272
      "cache_url": null,
            
274
      "created": "2019-09-11T10:31:48.317970",
273
      "created": "2019-09-11T10:31:48.317970",
            
275
      "description": "Global coast files from 
274
      "description": "Global coast files from 
            
276
https://www.ngdc.noaa.gov/mgg/shorelines/gshhs.html used in the 
275
https://www.ngdc.noaa.gov/mgg/shorelines/gshhs.html used in the 
            
277
Figures\r\n\r\n",
276
Figures\r\n\r\n",
            
278
      "doi": "",
277
      "doi": "",
            
279
      "format": "SHP",
278
      "format": "SHP",
            
280
      "hash": "",
279
      "hash": "",
            
281
      "id": "a14c6b25-180d-42d8-a863-e13574487a03",
280
      "id": "a14c6b25-180d-42d8-a863-e13574487a03",
            
282
      "last_modified": "2019-09-11T10:31:48.141004",
281
      "last_modified": "2019-09-11T10:31:48.141004",
            
283
      "metadata_modified": null,
282
      "metadata_modified": null,
            
284
      "mimetype": "application/zip",
283
      "mimetype": "application/zip",
            
285
      "mimetype_inner": null,
284
      "mimetype_inner": null,
            
286
      "name": "Global coast files from 
285
      "name": "Global coast files from 
            
287
https://www.ngdc.noaa.gov/mgg/shorelines/gshhs.html",
286
https://www.ngdc.noaa.gov/mgg/shorelines/gshhs.html",
            
288
      "package_id": "6b06ad48-bd85-47a8-b478-0850b6def1a4",
287
      "package_id": "6b06ad48-bd85-47a8-b478-0850b6def1a4",
            
289
      "position": 4,
288
      "position": 4,
            
290
      "resource_type": null,
289
      "resource_type": null,
            
291
      "restricted": "{\"level\": \"public\", \"allowed_users\": \"\", 
290
      "restricted": "{\"level\": \"public\", \"allowed_users\": \"\", 
            
292
\"shared_secret\": \"\"}",
291
\"shared_secret\": \"\"}",
            
293
      "size": 566907,
292
      "size": 566907,
            
294
      "state": "active",
293
      "state": "active",
            
295
      "url": 
294
      "url": 
            
296
source/a14c6b25-180d-42d8-a863-e13574487a03/download/coast_files.zip",
295
source/a14c6b25-180d-42d8-a863-e13574487a03/download/coast_files.zip",
            
297
      "url_type": "upload"
296
      "url_type": "upload"
            
298
    },
297
    },
            
299
    {
298
    {
            
300
      "cache_last_updated": null,
299
      "cache_last_updated": null,
            
301
      "cache_url": null,
300
      "cache_url": null,
            
302
      "created": "2019-09-11T10:48:15.665206",
301
      "created": "2019-09-11T10:48:15.665206",
            
303
      "description": "Simulated rates of speciation and extinction 
302
      "description": "Simulated rates of speciation and extinction 
            
304
under a range of dispersal parameters. Net diversification rates are 
303
under a range of dispersal parameters. Net diversification rates are 
            
305
calculated from the difference between speciation and extinction 
304
calculated from the difference between speciation and extinction 
            
306
rates. This data allows the creation of Figure A4 in Supporting 
305
rates. This data allows the creation of Figure A4 in Supporting 
            
307
information, Appendix 1. ",
306
information, Appendix 1. ",
            
308
      "doi": "",
307
      "doi": "",
            
309
      "format": "rds",
308
      "format": "rds",
            
310
      "hash": "",
309
      "hash": "",
            
311
      "id": "3b9df6ee-3cc3-4760-a51c-8241db1fa78c",
310
      "id": "3b9df6ee-3cc3-4760-a51c-8241db1fa78c",
            
312
      "last_modified": "2019-09-11T10:48:15.474354",
311
      "last_modified": "2019-09-11T10:48:15.474354",
            
313
      "metadata_modified": null,
312
      "metadata_modified": null,
            
314
      "mimetype": null,
313
      "mimetype": null,
            
315
      "mimetype_inner": null,
314
      "mimetype_inner": null,
            
316
      "name": "Simulated rates of speciation and extinction under a 
315
      "name": "Simulated rates of speciation and extinction under a 
            
317
range of dispersal parameters.",
316
range of dispersal parameters.",
            
318
      "package_id": "6b06ad48-bd85-47a8-b478-0850b6def1a4",
317
      "package_id": "6b06ad48-bd85-47a8-b478-0850b6def1a4",
            
319
      "position": 5,
318
      "position": 5,
            
320
      "resource_type": null,
319
      "resource_type": null,
            
321
      "restricted": "{\"level\": \"public\", \"allowed_users\": \"\", 
320
      "restricted": "{\"level\": \"public\", \"allowed_users\": \"\", 
            
322
\"shared_secret\": \"\"}",
321
\"shared_secret\": \"\"}",
            
323
      "size": 8135,
322
      "size": 8135,
            
324
      "state": "active",
323
      "state": "active",
            
325
      "url": 
324
      "url": 
            
326
1a4/resource/3b9df6ee-3cc3-4760-a51c-8241db1fa78c/download/rates.rds",
325
1a4/resource/3b9df6ee-3cc3-4760-a51c-8241db1fa78c/download/rates.rds",
            
327
      "url_type": "upload"
326
      "url_type": "upload"
            
328
    },
327
    },
            
329
    {
328
    {
            
330
      "cache_last_updated": null,
329
      "cache_last_updated": null,
            
331
      "cache_url": null,
330
      "cache_url": null,
            
332
      "created": "2019-09-11T15:08:30.062346",
331
      "created": "2019-09-11T15:08:30.062346",
            
333
      "description": "Input for spatial congruence test overlap 
332
      "description": "Input for spatial congruence test overlap 
            
334
between proportions of low and high  dispersal and observed low- and 
333
between proportions of low and high  dispersal and observed low- and 
            
335
high- dispersal-related traits in assemblages (30-50% threshold). see 
334
high- dispersal-related traits in assemblages (30-50% threshold). see 
            
336
Table 2.",
335
Table 2.",
            
337
      "doi": "",
336
      "doi": "",
            
338
      "format": "R",
337
      "format": "R",
            
339
      "hash": "",
338
      "hash": "",
            
340
      "id": "95d1d60f-7dc9-4c51-992e-baaca842c296",
339
      "id": "95d1d60f-7dc9-4c51-992e-baaca842c296",
            
341
      "last_modified": "2019-09-11T15:54:47.215386",
340
      "last_modified": "2019-09-11T15:54:47.215386",
            
342
      "metadata_modified": null,
341
      "metadata_modified": null,
            
343
      "mimetype": null,
342
      "mimetype": null,
            
344
      "mimetype_inner": null,
343
      "mimetype_inner": null,
            
345
      "name": "",
344
      "name": "",
            
346
      "package_id": "6b06ad48-bd85-47a8-b478-0850b6def1a4",
345
      "package_id": "6b06ad48-bd85-47a8-b478-0850b6def1a4",
            
347
      "position": 6,
346
      "position": 6,
            
348
      "resource_type": null,
347
      "resource_type": null,
            
349
      "restricted": "{\"shared_secret\": \"\", \"allowed_users\": 
348
      "restricted": "{\"shared_secret\": \"\", \"allowed_users\": 
            
350
\"\", \"level\": \"public\"}",
349
\"\", \"level\": \"public\"}",
            
351
      "size": 17762,
350
      "size": 17762,
            
352
      "state": "active",
351
      "state": "active",
            
353
      "url": 
352
      "url": 
            
354
f-7dc9-4c51-992e-baaca842c296/download/cong_sim_obs_trait_prop.rdata",
353
f-7dc9-4c51-992e-baaca842c296/download/cong_sim_obs_trait_prop.rdata",
            
355
      "url_type": "upload"
354
      "url_type": "upload"
            
356
    },
355
    },
            
357
    {
356
    {
            
358
      "cache_last_updated": null,
357
      "cache_last_updated": null,
            
359
      "cache_url": null,
358
      "cache_url": null,
            
360
      "created": "2019-09-11T15:11:32.398671",
359
      "created": "2019-09-11T15:11:32.398671",
            
361
      "description": "Geographic distribution data (species richness 
360
      "description": "Geographic distribution data (species richness 
            
362
and proportions of high/low dispersal-related traits) on predominantly 
361
and proportions of high/low dispersal-related traits) on predominantly 
            
363
low dispersing and high dispersing species expected based on the 
362
low dispersing and high dispersing species expected based on the 
            
364
simulations, and those where low- and high- dispersal related traits 
363
simulations, and those where low- and high- dispersal related traits 
            
365
values are observed for the five investigated traits.",
364
values are observed for the five investigated traits.",
            
366
      "doi": "",
365
      "doi": "",
            
367
      "format": "CSV",
366
      "format": "CSV",
            
368
      "hash": "",
367
      "hash": "",
            
369
      "id": "2115cb5b-7557-4897-8892-f109a15eb0c1",
368
      "id": "2115cb5b-7557-4897-8892-f109a15eb0c1",
            
370
      "last_modified": "2019-09-11T15:55:15.828261",
369
      "last_modified": "2019-09-11T15:55:15.828261",
            
371
      "metadata_modified": null,
370
      "metadata_modified": null,
            
372
      "mimetype": "text/csv",
371
      "mimetype": "text/csv",
            
373
      "mimetype_inner": null,
372
      "mimetype_inner": null,
            
374
      "name": "Input for the Global distribution maps for proportions 
373
      "name": "Input for the Global distribution maps for proportions 
            
375
of species richness for (a) simulated dispersal parameter value (b) 
374
of species richness for (a) simulated dispersal parameter value (b) 
            
376
observed dispersal-related traits",
375
observed dispersal-related traits",
            
377
      "package_id": "6b06ad48-bd85-47a8-b478-0850b6def1a4",
376
      "package_id": "6b06ad48-bd85-47a8-b478-0850b6def1a4",
            
378
      "position": 7,
377
      "position": 7,
            
379
      "resource_type": null,
378
      "resource_type": null,
            
380
      "restricted": "{\"level\": \"public\", \"allowed_users\": \"\", 
379
      "restricted": "{\"level\": \"public\", \"allowed_users\": \"\", 
            
381
\"shared_secret\": \"\"}",
380
\"shared_secret\": \"\"}",
            
382
      "size": 45638,
381
      "size": 45638,
            
383
      "state": "active",
382
      "state": "active",
            
384
      "url": 
383
      "url": 
            
385
-4897-8892-f109a15eb0c1/download/grid_pl_sim_obs_trait_prop_cong.csv",
384
-4897-8892-f109a15eb0c1/download/grid_pl_sim_obs_trait_prop_cong.csv",
            
386
      "url_type": "upload"
385
      "url_type": "upload"
            
387
    },
386
    },
            
388
    {
387
    {
            
389
      "cache_last_updated": null,
388
      "cache_last_updated": null,
            
390
      "cache_url": null,
389
      "cache_url": null,
            
391
      "created": "2019-09-11T15:19:07.537807",
390
      "created": "2019-09-11T15:19:07.537807",
            
392
      "description": "Functions for Figures illustrated in Donati et 
391
      "description": "Functions for Figures illustrated in Donati et 
            
393
al. 2019 \"A process-based-model supports an association between 
392
al. 2019 \"A process-based-model supports an association between 
            
394
dispersal and the prevalence of species traits in tropical reef fish 
393
dispersal and the prevalence of species traits in tropical reef fish 
            
395
assemblages\" accepted in Ecography, August 2019.",
394
assemblages\" accepted in Ecography, August 2019.",
            
396
      "doi": "",
395
      "doi": "",
            
397
      "format": "R",
396
      "format": "R",
            
398
      "hash": "",
397
      "hash": "",
            
399
      "id": "eed003d7-c661-42ab-bafb-c2fd2290d94e",
398
      "id": "eed003d7-c661-42ab-bafb-c2fd2290d94e",
            
400
      "last_modified": "2019-09-11T15:19:07.353178",
399
      "last_modified": "2019-09-11T15:19:07.353178",
            
401
      "metadata_modified": null,
400
      "metadata_modified": null,
            
402
      "mimetype": null,
401
      "mimetype": null,
            
403
      "mimetype_inner": null,
402
      "mimetype_inner": null,
            
404
      "name": "Functions used in R scripts in: Donati et al. 2019 \"A 
403
      "name": "Functions used in R scripts in: Donati et al. 2019 \"A 
            
405
process-based-model supports an association between  # dispersal and 
404
process-based-model supports an association between  # dispersal and 
            
406
the prevalence of species traits in tropical reef fish assemblages\" 
405
the prevalence of species traits in tropical reef fish assemblages\" 
            
407
accepted in Ecography, August 2019",
406
accepted in Ecography, August 2019",
            
408
      "package_id": "6b06ad48-bd85-47a8-b478-0850b6def1a4",
407
      "package_id": "6b06ad48-bd85-47a8-b478-0850b6def1a4",
            
409
      "position": 8,
408
      "position": 8,
            
410
      "resource_type": null,
409
      "resource_type": null,
            
411
      "restricted": "{\"shared_secret\": \"\", \"allowed_users\": 
410
      "restricted": "{\"shared_secret\": \"\", \"allowed_users\": 
            
412
\"\", \"level\": \"public\"}",
411
\"\", \"level\": \"public\"}",
            
413
      "size": 8444,
412
      "size": 8444,
            
414
      "state": "active",
413
      "state": "active",
            
415
      "url": 
414
      "url": 
            
416
download/donati_et_al_dispersal_global_prevalence_traits_functions.r",
415
download/donati_et_al_dispersal_global_prevalence_traits_functions.r",
            
417
      "url_type": "upload"
416
      "url_type": "upload"
            
418
    },
417
    },
            
419
    {
418
    {
            
420
      "cache_last_updated": null,
419
      "cache_last_updated": null,
            
421
      "cache_url": null,
420
      "cache_url": null,
            
422
      "created": "2019-09-11T16:28:43.313989",
421
      "created": "2019-09-11T16:28:43.313989",
            
423
      "description": "Main script used in : Donati et al. 2019 \"A 
422
      "description": "Main script used in : Donati et al. 2019 \"A 
            
424
process-based-model supports an association between dispersal and the 
423
process-based-model supports an association between dispersal and the 
            
425
prevalence of species traits in tropical reef fish 
424
prevalence of species traits in tropical reef fish 
            
426
assemblages\"\r\naccepted in Ecography, August 2019",
425
assemblages\"\r\naccepted in Ecography, August 2019",
            
427
      "doi": "",
426
      "doi": "",
            
428
      "format": "R",
427
      "format": "R",
            
429
      "hash": "",
428
      "hash": "",
            
430
      "id": "e00d3cf8-4845-4de0-8eb6-33243506c274",
429
      "id": "e00d3cf8-4845-4de0-8eb6-33243506c274",
            
431
      "last_modified": "2019-09-11T16:28:43.066435",
430
      "last_modified": "2019-09-11T16:28:43.066435",
            
432
      "metadata_modified": null,
431
      "metadata_modified": null,
            
433
      "mimetype": null,
432
      "mimetype": null,
            
434
      "mimetype_inner": null,
433
      "mimetype_inner": null,
            
435
      "name": "Donati et al. main script",
434
      "name": "Donati et al. main script",
            
436
      "package_id": "6b06ad48-bd85-47a8-b478-0850b6def1a4",
435
      "package_id": "6b06ad48-bd85-47a8-b478-0850b6def1a4",
            
437
      "position": 9,
436
      "position": 9,
            
438
      "resource_type": null,
437
      "resource_type": null,
            
439
      "restricted": "{\"shared_secret\": \"\", \"allowed_users\": 
438
      "restricted": "{\"shared_secret\": \"\", \"allowed_users\": 
            
440
\"\", \"level\": \"public\"}",
439
\"\", \"level\": \"public\"}",
            
441
      "size": 9040,
440
      "size": 9040,
            
442
      "state": "active",
441
      "state": "active",
            
443
      "url": 
442
      "url": 
            
444
c274/download/donati_et_al_dispersal_global_prevalence_traits_main.r",
443
c274/download/donati_et_al_dispersal_global_prevalence_traits_main.r",
            
445
      "url_type": "upload"
444
      "url_type": "upload"
            
446
    },
445
    },
            
447
    {
446
    {
            
448
      "cache_last_updated": null,
447
      "cache_last_updated": null,
            
449
      "cache_url": null,
448
      "cache_url": null,
            
450
      "created": "2019-09-11T16:30:53.475602",
449
      "created": "2019-09-11T16:30:53.475602",
            
451
      "description": "R Script used for figures in main text in: 
450
      "description": "R Script used for figures in main text in: 
            
452
Donati et al. 2019: \"A process-based-model supports an association 
451
Donati et al. 2019: \"A process-based-model supports an association 
            
453
between dispersal and the prevalence of species traits in tropical 
452
between dispersal and the prevalence of species traits in tropical 
            
454
reef fish assemblages\" accepted in Ecography, August 2019.",
453
reef fish assemblages\" accepted in Ecography, August 2019.",
            
455
      "doi": "",
454
      "doi": "",
            
456
      "format": "R",
455
      "format": "R",
            
457
      "hash": "",
456
      "hash": "",
            
458
      "id": "c0870690-1143-4ac8-957a-2bfd2d6c96e3",
457
      "id": "c0870690-1143-4ac8-957a-2bfd2d6c96e3",
            
459
      "last_modified": "2019-09-11T16:30:53.294089",
458
      "last_modified": "2019-09-11T16:30:53.294089",
            
460
      "metadata_modified": null,
459
      "metadata_modified": null,
            
461
      "mimetype": null,
460
      "mimetype": null,
            
462
      "mimetype_inner": null,
461
      "mimetype_inner": null,
            
463
      "name": "Main text figures",
462
      "name": "Main text figures",
            
464
      "package_id": "6b06ad48-bd85-47a8-b478-0850b6def1a4",
463
      "package_id": "6b06ad48-bd85-47a8-b478-0850b6def1a4",
            
465
      "position": 10,
464
      "position": 10,
            
466
      "resource_type": null,
465
      "resource_type": null,
            
467
      "restricted": "{\"shared_secret\": \"\", \"allowed_users\": 
466
      "restricted": "{\"shared_secret\": \"\", \"allowed_users\": 
            
468
\"\", \"level\": \"public\"}",
467
\"\", \"level\": \"public\"}",
            
469
      "size": 15475,
468
      "size": 15475,
            
470
      "state": "active",
469
      "state": "active",
            
471
      "url": 
470
      "url": 
            
472
/donati_et_al_dispersal_global_prevalence_traits_figures_main_text.r",
471
/donati_et_al_dispersal_global_prevalence_traits_figures_main_text.r",
            
473
      "url_type": "upload"
472
      "url_type": "upload"
            
474
    },
473
    },
            
475
    {
474
    {
            
476
      "cache_last_updated": null,
475
      "cache_last_updated": null,
            
477
      "cache_url": null,
476
      "cache_url": null,
            
478
      "created": "2019-09-11T16:41:22.199130",
477
      "created": "2019-09-11T16:41:22.199130",
            
479
      "description": "Supplementary material Appendix 1 Figures 
478
      "description": "Supplementary material Appendix 1 Figures 
            
480
illustrated in Donati et al. 2019 \"A process-based-model supports an 
479
illustrated in Donati et al. 2019 \"A process-based-model supports an 
            
481
association between dispersal and the prevalence of species traits in 
480
association between dispersal and the prevalence of species traits in 
            
482
tropical reef fish assemblages\". accepted in Ecography, August 2019",
481
tropical reef fish assemblages\". accepted in Ecography, August 2019",
            
483
      "doi": "",
482
      "doi": "",
            
484
      "format": "R",
483
      "format": "R",
            
485
      "hash": "",
484
      "hash": "",
            
486
      "id": "2946e2c8-9f5c-4ed8-bce2-13069fcb6faf",
485
      "id": "2946e2c8-9f5c-4ed8-bce2-13069fcb6faf",
            
487
      "last_modified": "2019-09-11T16:41:22.012280",
486
      "last_modified": "2019-09-11T16:41:22.012280",
            
488
      "metadata_modified": null,
487
      "metadata_modified": null,
            
489
      "mimetype": null,
488
      "mimetype": null,
            
490
      "mimetype_inner": null,
489
      "mimetype_inner": null,
            
491
      "name": "Supplementary material Appendix 1 Figures",
490
      "name": "Supplementary material Appendix 1 Figures",
            
492
      "package_id": "6b06ad48-bd85-47a8-b478-0850b6def1a4",
491
      "package_id": "6b06ad48-bd85-47a8-b478-0850b6def1a4",
            
493
      "position": 11,
492
      "position": 11,
            
494
      "resource_type": null,
493
      "resource_type": null,
            
495
      "restricted": "{\"shared_secret\": \"\", \"allowed_users\": 
494
      "restricted": "{\"shared_secret\": \"\", \"allowed_users\": 
            
496
\"\", \"level\": \"public\"}",
495
\"\", \"level\": \"public\"}",
            
497
      "size": 26270,
496
      "size": 26270,
            
498
      "state": "active",
497
      "state": "active",
            
499
      "url": 
498
      "url": 
            
500
d/donati_et_al_dispersal_global_prevalence_traits_figures_supp_mat.r",
499
d/donati_et_al_dispersal_global_prevalence_traits_figures_supp_mat.r",
            
501
      "url_type": "upload"
500
      "url_type": "upload"
            
502
    },
501
    },
            
503
    {
502
    {
            
504
      "cache_last_updated": null,
503
      "cache_last_updated": null,
            
505
      "cache_url": null,
504
      "cache_url": null,
            
506
      "created": "2019-09-13T09:28:30.074831",
505
      "created": "2019-09-13T09:28:30.074831",
            
507
      "description": "Species trait (i.e. adult body size, home range 
506
      "description": "Species trait (i.e. adult body size, home range 
            
508
mobility behaviour, circadian activity and schooling) data gathered 
507
mobility behaviour, circadian activity and schooling) data gathered 
            
509
from the General Approach to Species Abundance Relationships (GASPAR) 
508
from the General Approach to Species Abundance Relationships (GASPAR) 
            
510
database (Kulbicki et al. 2013, Parravicini et al. 2013). 
509
database (Kulbicki et al. 2013, Parravicini et al. 2013). 
            
511
\r\n\r\nKulbicki, M. et al. 2013. Global biogeography of reef  shes: a 
510
\r\n\r\nKulbicki, M. et al. 2013. Global biogeography of reef  shes: a 
            
512
hier- archical quantitative delineation of regions. \u2013 PLoS One 8: 
511
hier- archical quantitative delineation of regions. \u2013 PLoS One 8: 
            
513
e81847.\r\n\r\nParravicini, V. et al. 2013. Global patterns and 
512
e81847.\r\n\r\nParravicini, V. et al. 2013. Global patterns and 
            
514
predictors of tropi- cal reef  sh species richness. \u2013 Ecography 
513
predictors of tropi- cal reef  sh species richness. \u2013 Ecography 
            
515
36: 1254\u20131262.\r\n\r\nTo complement the trait data with Pelagic 
514
36: 1254\u20131262.\r\n\r\nTo complement the trait data with Pelagic 
            
516
Larval Duration information refer to the following 
515
Larval Duration information refer to the following 
            
517
publication:\r\n\r\nLuiz, Osmar J., et al. \"Adult and larval traits 
516
publication:\r\n\r\nLuiz, Osmar J., et al. \"Adult and larval traits 
            
518
as determinants of geographic range size among tropical reef fishes.\" 
517
as determinants of geographic range size among tropical reef fishes.\" 
            
519
Proceedings of the National Academy of Sciences 110.41 (2013): 
518
Proceedings of the National Academy of Sciences 110.41 (2013): 
            
520
16498-16502.\r\n\r\nIn Donati et al. \"A process-based model supports 
519
16498-16502.\r\n\r\nIn Donati et al. \"A process-based model supports 
            
521
an association between dispersal and the prevalence of species traits 
520
an association between dispersal and the prevalence of species traits 
            
522
in tropical reef fish assemblages\" accepted in Ecography in August 
521
in tropical reef fish assemblages\" accepted in Ecography in August 
            
523
2019, we used the PLD gathered from Luiz et al. 2013 as described in 
522
2019, we used the PLD gathered from Luiz et al. 2013 as described in 
            
524
the methods - section \"Species trait data\".\r\n\r\n",
523
the methods - section \"Species trait data\".\r\n\r\n",
            
525
      "doi": "",
524
      "doi": "",
            
526
      "format": "CSV",
525
      "format": "CSV",
            
527
      "hash": "",
526
      "hash": "",
            
528
      "id": "a5227230-5514-4bdc-b81d-b38d5aaea5cb",
527
      "id": "a5227230-5514-4bdc-b81d-b38d5aaea5cb",
            
529
      "last_modified": "2019-09-13T09:28:29.874780",
528
      "last_modified": "2019-09-13T09:28:29.874780",
            
530
      "metadata_modified": null,
529
      "metadata_modified": null,
            
531
      "mimetype": "text/csv",
530
      "mimetype": "text/csv",
            
532
      "mimetype_inner": null,
531
      "mimetype_inner": null,
            
533
      "name": "Tropical reef fish trait data",
532
      "name": "Tropical reef fish trait data",
            
534
      "package_id": "6b06ad48-bd85-47a8-b478-0850b6def1a4",
533
      "package_id": "6b06ad48-bd85-47a8-b478-0850b6def1a4",
            
535
      "position": 12,
534
      "position": 12,
            
536
      "resource_type": null,
535
      "resource_type": null,
            
537
      "restricted": "{\"shared_secret\": \"\", \"allowed_users\": 
536
      "restricted": "{\"shared_secret\": \"\", \"allowed_users\": 
            
538
\"\", \"level\": \"public\"}",
537
\"\", \"level\": \"public\"}",
            
539
      "size": 428195,
538
      "size": 428195,
            
540
      "state": "active",
539
      "state": "active",
            
541
      "url": 
540
      "url": 
            
542
30-5514-4bdc-b81d-b38d5aaea5cb/download/sp_ecological_trait_data.csv",
541
30-5514-4bdc-b81d-b38d5aaea5cb/download/sp_ecological_trait_data.csv",
            
543
      "url_type": "upload"
542
      "url_type": "upload"
            
544
    }
543
    }
            
545
  ],
544
  ],
            
546
  "spatial": 
545
  "spatial": 
            
547
36914,-27.60323689456202],[-160.5813217163086,-27.60323689456202]]]}",
546
36914,-27.60323689456202],[-160.5813217163086,-27.60323689456202]]]}",
            
548
  "spatial_info": "World",
547
  "spatial_info": "World",
            
549
  "state": "active",
548
  "state": "active",
            
550
  "subtitle": "",
549
  "subtitle": "",
            
551
  "tags": [
550
  "tags": [
            
552
    {
551
    {
            
553
      "display_name": "BIODIVERSITY",
552
      "display_name": "BIODIVERSITY",
            
554
      "id": "cb53f136-b0e5-418c-a3d3-cda8d0945ec6",
553
      "id": "cb53f136-b0e5-418c-a3d3-cda8d0945ec6",
            
555
      "name": "BIODIVERSITY",
554
      "name": "BIODIVERSITY",
            
556
      "state": "active",
555
      "state": "active",
            
557
      "vocabulary_id": null
556
      "vocabulary_id": null
            
558
    },
557
    },
            
559
    {
558
    {
            
560
      "display_name": "DISPERSAL",
559
      "display_name": "DISPERSAL",
            
561
      "id": "445e60b4-b097-4a37-8fea-5ad2a677dd1d",
560
      "id": "445e60b4-b097-4a37-8fea-5ad2a677dd1d",
            
562
      "name": "DISPERSAL",
561
      "name": "DISPERSAL",
            
563
      "state": "active",
562
      "state": "active",
            
564
      "vocabulary_id": null
563
      "vocabulary_id": null
            
565
    },
564
    },
            
566
    {
565
    {
            
567
      "display_name": "ECOLOGY",
566
      "display_name": "ECOLOGY",
            
568
      "id": "ac917ce0-9057-40ba-95f8-41e3e6e51ad4",
567
      "id": "ac917ce0-9057-40ba-95f8-41e3e6e51ad4",
            
569
      "name": "ECOLOGY",
568
      "name": "ECOLOGY",
            
570
      "state": "active",
569
      "state": "active",
            
571
      "vocabulary_id": null
570
      "vocabulary_id": null
            
572
    },
571
    },
            
573
    {
572
    {
            
574
      "display_name": "REEF FISH",
573
      "display_name": "REEF FISH",
            
575
      "id": "9c505aa1-e9b4-4120-a152-49aadf53617a",
574
      "id": "9c505aa1-e9b4-4120-a152-49aadf53617a",
            
576
      "name": "REEF FISH",
575
      "name": "REEF FISH",
            
577
      "state": "active",
576
      "state": "active",
            
578
      "vocabulary_id": null
577
      "vocabulary_id": null
            
579
    },
578
    },
            
580
    {
579
    {
            
581
      "display_name": "TRAITS",
580
      "display_name": "TRAITS",
            
582
      "id": "c6db4760-4d90-4bd9-a2fc-c47126238079",
581
      "id": "c6db4760-4d90-4bd9-a2fc-c47126238079",
            
583
      "name": "TRAITS",
582
      "name": "TRAITS",
            
584
      "state": "active",
583
      "state": "active",
            
585
      "vocabulary_id": null
584
      "vocabulary_id": null
            
586
    }
585
    }
            
587
  ],
586
  ],
            
588
  "title": "Simulated and observed prevalence of dispersal-related 
587
  "title": "Simulated and observed prevalence of dispersal-related 
            
589
traits in tropical reef fish assemblages worldwide",
588
traits in tropical reef fish assemblages worldwide",
            
590
  "type": "dataset",
589
  "type": "dataset",
            
591
  "url": null,
590
  "url": null,
            
592
  "version": "1.0"
591
  "version": "1.0"
            
593
}
592
}