Changes

              
    

          
          
        
        

            
f
1
{
f
1
{
            
2
  "author": "[{\"affiliation\": \"Landscape Ecology, Institute of 
2
  "author": "[{\"affiliation\": \"Landscape Ecology, Institute of 
            
3
Terrestrial Ecosystems, ETH Z\\u00fcrich, 8049 Z\\u00fcrich, 
3
Terrestrial Ecosystems, ETH Z\\u00fcrich, 8049 Z\\u00fcrich, 
            
4
Switzerland\", \"affiliation_02\": \"Landscape Ecology, Landscape 
4
Switzerland\", \"affiliation_02\": \"Landscape Ecology, Landscape 
            
5
Change Science, Swiss Federal Institute for Forest, Snow and Landscape 
5
Change Science, Swiss Federal Institute for Forest, Snow and Landscape 
            
6
Research WSL, 8903 Birmensdorf, Switzerland\", \"affiliation_03\": 
6
Research WSL, 8903 Birmensdorf, Switzerland\", \"affiliation_03\": 
            
7
\"\", \"data_credit\": [\"collection\", \"software\", 
7
\"\", \"data_credit\": [\"collection\", \"software\", 
            
8
\"publication\"], \"email\": \"flurin.leugger@usys.ethz.ch\", 
8
\"publication\"], \"email\": \"flurin.leugger@usys.ethz.ch\", 
            
9
\"given_name\": \"Flurin\", \"identifier\": \"0000-0001-9027-6892\", 
9
\"given_name\": \"Flurin\", \"identifier\": \"0000-0001-9027-6892\", 
            
10
\"name\": \"Leugger\"}, {\"affiliation\": \"CNRS, Sorbonne 
10
\"name\": \"Leugger\"}, {\"affiliation\": \"CNRS, Sorbonne 
            
11
Universit\\u00e9, UMR 7144, Station Biologique de Roscoff\", 
11
Universit\\u00e9, UMR 7144, Station Biologique de Roscoff\", 
            
12
\"affiliation_02\": \"\", \"affiliation_03\": \"\", \"data_credit\": 
12
\"affiliation_02\": \"\", \"affiliation_03\": \"\", \"data_credit\": 
            
13
[\"collection\", \"validation\", \"publication\"], \"email\": 
13
[\"collection\", \"validation\", \"publication\"], \"email\": 
            
14
\"thomas.broquet@sb-roscoff.fr\", \"given_name\": \"Thomas\", 
14
\"thomas.broquet@sb-roscoff.fr\", \"given_name\": \"Thomas\", 
            
15
\"identifier\": \"\", \"name\": \"Broquet\"}, {\"affiliation\": 
15
\"identifier\": \"\", \"name\": \"Broquet\"}, {\"affiliation\": 
            
16
\"WSL\", \"affiliation_02\": \"\", \"affiliation_03\": \"\", 
16
\"WSL\", \"affiliation_02\": \"\", \"affiliation_03\": \"\", 
            
17
\"data_credit\": [\"collection\", \"publication\"], \"email\": 
17
\"data_credit\": [\"collection\", \"publication\"], \"email\": 
            
18
\"dirk.karger@wsl.ch\", \"given_name\": \"Dirk Nikolaus\", 
18
\"dirk.karger@wsl.ch\", \"given_name\": \"Dirk Nikolaus\", 
            
19
\"identifier\": \"0000-0001-7770-6229\", \"name\": \"Karger\"}, 
19
\"identifier\": \"0000-0001-7770-6229\", \"name\": \"Karger\"}, 
            
20
{\"affiliation\": \"Universit\\u00e9 Grenoble Alpes, Universit\\u00e9 
20
{\"affiliation\": \"Universit\\u00e9 Grenoble Alpes, Universit\\u00e9 
            
21
Savoie Mont Blanc, CNRS, LECA\", \"affiliation_02\": \"\", 
21
Savoie Mont Blanc, CNRS, LECA\", \"affiliation_02\": \"\", 
            
22
\"affiliation_03\": \"\", \"data_credit\": [\"collection\", 
22
\"affiliation_03\": \"\", \"data_credit\": [\"collection\", 
            
23
\"publication\"], \"email\": 
23
\"publication\"], \"email\": 
            
24
\"Delphine.Rioux@univ-grenoble-alpes.fr\", \"given_name\": 
24
\"Delphine.Rioux@univ-grenoble-alpes.fr\", \"given_name\": 
            
25
\"Delphine\", \"identifier\": \"\", \"name\": \"Rioux\"}, 
25
\"Delphine\", \"identifier\": \"\", \"name\": \"Rioux\"}, 
            
26
{\"affiliation\": \"University of Primorska, Faculty of Mathematics, 
26
{\"affiliation\": \"University of Primorska, Faculty of Mathematics, 
            
27
Natural Sciences, and Information Technologies\", \"affiliation_02\": 
27
Natural Sciences, and Information Technologies\", \"affiliation_02\": 
            
28
\"Environmental Protection College\", \"affiliation_03\": \"\", 
28
\"Environmental Protection College\", \"affiliation_03\": \"\", 
            
29
\"data_credit\": [\"collection\", \"publication\"], \"email\": 
29
\"data_credit\": [\"collection\", \"publication\"], \"email\": 
            
30
\"elena.buzan@famnit.upr.si\", \"given_name\": \"Elena\", 
30
\"elena.buzan@famnit.upr.si\", \"given_name\": \"Elena\", 
            
31
\"identifier\": \"\", \"name\": \"Buzan\"}, {\"affiliation\": \"Chair 
31
\"identifier\": \"\", \"name\": \"Buzan\"}, {\"affiliation\": \"Chair 
            
32
of Wildlife Ecology and Management, University of Freiburg\", 
32
of Wildlife Ecology and Management, University of Freiburg\", 
            
33
\"affiliation_02\": \"Stelvio National Park\", \"affiliation_03\": 
33
\"affiliation_02\": \"Stelvio National Park\", \"affiliation_03\": 
            
34
\"\", \"data_credit\": [\"collection\", \"publication\"], \"email\": 
34
\"\", \"data_credit\": [\"collection\", \"publication\"], \"email\": 
            
35
\"luca.corlatti@wildlife.uni-freiburg.de\", \"given_name\": \"Luca\", 
35
\"luca.corlatti@wildlife.uni-freiburg.de\", \"given_name\": \"Luca\", 
            
36
\"identifier\": \"\", \"name\": \"Corlatti\"}, {\"affiliation\": 
36
\"identifier\": \"\", \"name\": \"Corlatti\"}, {\"affiliation\": 
            
37
\"Conservation Genomics Research Unit, Fondazione Edmund Mach\", 
37
\"Conservation Genomics Research Unit, Fondazione Edmund Mach\", 
            
38
\"affiliation_02\": \"\", \"affiliation_03\": \"\", \"data_credit\": 
38
\"affiliation_02\": \"\", \"affiliation_03\": \"\", \"data_credit\": 
            
39
[\"collection\", \"publication\"], \"email\": 
39
[\"collection\", \"publication\"], \"email\": 
            
40
\"barbara.crestanello@fmach.it\", \"given_name\": \"Barbara\", 
40
\"barbara.crestanello@fmach.it\", \"given_name\": \"Barbara\", 
            
41
\"identifier\": \"\", \"name\": \"Crestanello\"}, {\"affiliation\": 
41
\"identifier\": \"\", \"name\": \"Crestanello\"}, {\"affiliation\": 
            
42
\"Universit\\u00e9 Grenoble Alpes, Universit\\u00e9 Savoie Mont Blanc, 
42
\"Universit\\u00e9 Grenoble Alpes, Universit\\u00e9 Savoie Mont Blanc, 
            
43
CNRS, LECA\", \"affiliation_02\": \"\", \"affiliation_03\": \"\", 
43
CNRS, LECA\", \"affiliation_02\": \"\", \"affiliation_03\": \"\", 
            
44
\"data_credit\": [\"collection\", \"publication\"], \"email\": 
44
\"data_credit\": [\"collection\", \"publication\"], \"email\": 
            
45
\"nadine.curt-grand-gaudin@univ-smb.fr\", \"given_name\": \"Nadine \", 
45
\"nadine.curt-grand-gaudin@univ-smb.fr\", \"given_name\": \"Nadine \", 
            
46
\"identifier\": \"\", \"name\": \"Curt-Grand-Gaudin\"}, 
46
\"identifier\": \"\", \"name\": \"Curt-Grand-Gaudin\"}, 
            
47
{\"affiliation\": \"Conservation Genomics Research Unit, Fondazione 
47
{\"affiliation\": \"Conservation Genomics Research Unit, Fondazione 
            
48
Edmund Mach\", \"affiliation_02\": \"\", \"affiliation_03\": \"\", 
48
Edmund Mach\", \"affiliation_02\": \"\", \"affiliation_03\": \"\", 
            
49
\"data_credit\": [\"collection\", \"publication\"], \"email\": 
49
\"data_credit\": [\"collection\", \"publication\"], \"email\": 
            
50
\"heidi.hauffe@fmach.it\", \"given_name\": \"Heidi Christine\", 
50
\"heidi.hauffe@fmach.it\", \"given_name\": \"Heidi Christine\", 
            
51
\"identifier\": \"\", \"name\": \"Hauffe\"}, {\"affiliation\": 
51
\"identifier\": \"\", \"name\": \"Hauffe\"}, {\"affiliation\": 
            
52
\"Institute of Vertebrate Biology of the Czech Academy of Sciences\", 
52
\"Institute of Vertebrate Biology of the Czech Academy of Sciences\", 
            
53
\"affiliation_02\": \"\", \"affiliation_03\": \"\", \"data_credit\": 
53
\"affiliation_02\": \"\", \"affiliation_03\": \"\", \"data_credit\": 
            
54
[\"collection\", \"publication\"], \"email\": \"roleckova@ivb.cz\", 
54
[\"collection\", \"publication\"], \"email\": \"roleckova@ivb.cz\", 
            
55
\"given_name\": \"Barbora\", \"identifier\": \"\", \"name\": 
55
\"given_name\": \"Barbora\", \"identifier\": \"\", \"name\": 
            
56
\"Role\\u010dkov\\u00e1\"}, {\"affiliation\": \"University of Zagreb, 
56
\"Role\\u010dkov\\u00e1\"}, {\"affiliation\": \"University of Zagreb, 
            
57
Faculty of Agriculture, Department of Fisheries, Apiculture, Wildlife 
57
Faculty of Agriculture, Department of Fisheries, Apiculture, Wildlife 
            
58
Management and Special Zoology\", \"affiliation_02\": \"\", 
58
Management and Special Zoology\", \"affiliation_02\": \"\", 
            
59
\"affiliation_03\": \"\", \"data_credit\": [\"collection\", 
59
\"affiliation_03\": \"\", \"data_credit\": [\"collection\", 
            
60
\"publication\"], \"email\": \"nsprem@agr.hr\", \"given_name\": 
60
\"publication\"], \"email\": \"nsprem@agr.hr\", \"given_name\": 
            
61
\"Nikica\", \"identifier\": \"\", \"name\": \"\\u0160prem\"}, 
61
\"Nikica\", \"identifier\": \"\", \"name\": \"\\u0160prem\"}, 
            
62
{\"affiliation\": \"Universit\\u00e9 Grenoble Alpes, Universit\\u00e9 
62
{\"affiliation\": \"Universit\\u00e9 Grenoble Alpes, Universit\\u00e9 
            
63
Savoie Mont Blanc, CNRS, LECA\", \"affiliation_02\": \"\", 
63
Savoie Mont Blanc, CNRS, LECA\", \"affiliation_02\": \"\", 
            
64
\"affiliation_03\": \"\", \"data_credit\": [\"collection\", 
64
\"affiliation_03\": \"\", \"data_credit\": [\"collection\", 
            
65
\"publication\"], \"email\": \"Nathalie.Tissot@univ-smb.fr\", 
65
\"publication\"], \"email\": \"Nathalie.Tissot@univ-smb.fr\", 
            
66
\"given_name\": \"Nathalie\", \"identifier\": \"\", \"name\": 
66
\"given_name\": \"Nathalie\", \"identifier\": \"\", \"name\": 
            
67
\"Tissot\"}, {\"affiliation\": \"Universit\\u00e9 Grenoble Alpes, 
67
\"Tissot\"}, {\"affiliation\": \"Universit\\u00e9 Grenoble Alpes, 
            
68
Universit\\u00e9 Savoie Mont Blanc, CNRS, LECA\", \"affiliation_02\": 
68
Universit\\u00e9 Savoie Mont Blanc, CNRS, LECA\", \"affiliation_02\": 
            
69
\"\", \"affiliation_03\": \"\", \"data_credit\": [\"collection\", 
69
\"\", \"affiliation_03\": \"\", \"data_credit\": [\"collection\", 
            
70
\"publication\"], \"email\": \"sophie.tissot@etu.umontpellier.fr\", 
70
\"publication\"], \"email\": \"sophie.tissot@etu.umontpellier.fr\", 
            
71
\"given_name\": \"Sophie\", \"identifier\": \"\", \"name\": 
71
\"given_name\": \"Sophie\", \"identifier\": \"\", \"name\": 
            
72
\"Tissot\"}, {\"affiliation\": \"Institute of Vertebrate Biology of 
72
\"Tissot\"}, {\"affiliation\": \"Institute of Vertebrate Biology of 
            
73
the Czech Academy of Sciences\", \"affiliation_02\": \"\", 
73
the Czech Academy of Sciences\", \"affiliation_02\": \"\", 
            
74
\"affiliation_03\": \"\", \"data_credit\": [\"collection\", 
74
\"affiliation_03\": \"\", \"data_credit\": [\"collection\", 
            
75
\"publication\"], \"email\": \"radkpol@centrum.cz\", \"given_name\": 
75
\"publication\"], \"email\": \"radkpol@centrum.cz\", \"given_name\": 
            
76
\"Radka\", \"identifier\": \"\", \"name\": \"Valterov\\u00e1\"}, 
76
\"Radka\", \"identifier\": \"\", \"name\": \"Valterov\\u00e1\"}, 
            
77
{\"affiliation\": \"Universit\\u00e9 Grenoble Alpes, Universit\\u00e9 
77
{\"affiliation\": \"Universit\\u00e9 Grenoble Alpes, Universit\\u00e9 
            
78
Savoie Mont Blanc, CNRS, LECA\", \"affiliation_02\": \"\", 
78
Savoie Mont Blanc, CNRS, LECA\", \"affiliation_02\": \"\", 
            
79
\"affiliation_03\": \"\", \"data_credit\": [\"collection\", 
79
\"affiliation_03\": \"\", \"data_credit\": [\"collection\", 
            
80
\"validation\", \"publication\", \"supervision\"], \"email\": 
80
\"validation\", \"publication\", \"supervision\"], \"email\": 
            
81
\"glenn.yannic@univ-smb.fr\", \"given_name\": \"Glenn\", 
81
\"glenn.yannic@univ-smb.fr\", \"given_name\": \"Glenn\", 
            
82
\"identifier\": \"\", \"name\": \"Yannic\"}, {\"affiliation\": 
82
\"identifier\": \"\", \"name\": \"Yannic\"}, {\"affiliation\": 
            
83
\"Landscape Ecology, Institute of Terrestrial Ecosystems, ETH 
83
\"Landscape Ecology, Institute of Terrestrial Ecosystems, ETH 
            
84
Z\\u00fcrich, 8049 Z\\u00fcrich, Switzerland\", \"affiliation_02\": 
84
Z\\u00fcrich, 8049 Z\\u00fcrich, Switzerland\", \"affiliation_02\": 
            
85
\"Landscape Ecology, Landscape Change Science, Swiss Federal Institute 
85
\"Landscape Ecology, Landscape Change Science, Swiss Federal Institute 
            
86
for Forest, Snow and Landscape Research WSL, 8903 Birmensdorf, 
86
for Forest, Snow and Landscape Research WSL, 8903 Birmensdorf, 
            
87
Switzerland\", \"affiliation_03\": \"\", \"data_credit\": 
87
Switzerland\", \"affiliation_03\": \"\", \"data_credit\": 
            
88
[\"collection\", \"validation\", \"publication\", \"supervision\"], 
88
[\"collection\", \"validation\", \"publication\", \"supervision\"], 
            
89
\"email\": \"loic.pellissier@usys.ethz.ch\", \"given_name\": \"Loic\", 
89
\"email\": \"loic.pellissier@usys.ethz.ch\", \"given_name\": \"Loic\", 
            
90
\"identifier\": \"0000-0002-2289-8259\", \"name\": \"Pellissier\"}]",
90
\"identifier\": \"0000-0002-2289-8259\", \"name\": \"Pellissier\"}]",
            
91
  "author_email": null,
91
  "author_email": null,
            
92
  "creator_user_id": "29b58075-315f-4aa2-bfff-425ea9553e90",
92
  "creator_user_id": "29b58075-315f-4aa2-bfff-425ea9553e90",
            
93
  "date": "[{\"date\": \"2021-03-02\", \"date_type\": \"created\", 
93
  "date": "[{\"date\": \"2021-03-02\", \"date_type\": \"created\", 
            
94
\"end_date\": \"\"}]",
94
\"end_date\": \"\"}]",
            
95
  "doi": "10.16904/envidat.291",
95
  "doi": "10.16904/envidat.291",
            
96
  "funding": "[{\"grant_number\": \"\", \"institution\": \"ETH\", 
96
  "funding": "[{\"grant_number\": \"\", \"institution\": \"ETH\", 
            
97
\"institution_url\": \"\"}, {\"grant_number\": \"310030_188550\", 
97
\"institution_url\": \"\"}, {\"grant_number\": \"310030_188550\", 
            
98
\"institution\": \"SNCF\", \"institution_url\": \"\"}]",
98
\"institution\": \"SNCF\", \"institution_url\": \"\"}]",
            
99
  "groups": [],
99
  "groups": [],
            
100
  "id": "880eb4ab-2150-44a9-a52a-985ba444a4ac",
100
  "id": "880eb4ab-2150-44a9-a52a-985ba444a4ac",
            
101
  "isopen": false,
101
  "isopen": false,
            
102
  "language": "en",
102
  "language": "en",
            
103
  "license_id": "wsl-data",
103
  "license_id": "wsl-data",
            
104
  "license_title": "WSL Data Policy",
104
  "license_title": "WSL Data Policy",
            
105
  "license_url": 
105
  "license_url": 
            
106
ps://www.wsl.ch/en/about-wsl/programmes-and-initiatives/envidat.html",
106
ps://www.wsl.ch/en/about-wsl/programmes-and-initiatives/envidat.html",
            
107
  "maintainer": "{\"affiliation\": \"WSL\", \"email\": 
107
  "maintainer": "{\"affiliation\": \"WSL\", \"email\": 
            
108
\"flurin.leugger@usys.ethz.ch\", \"given_name\": \"Flurin\", 
108
\"flurin.leugger@usys.ethz.ch\", \"given_name\": \"Flurin\", 
            
109
\"identifier\": \"\", \"name\": \"Leugger\"}",
109
\"identifier\": \"\", \"name\": \"Leugger\"}",
            
110
  "maintainer_email": null,
110
  "maintainer_email": null,
            
111
  "metadata_created": "2022-02-10T07:32:55.894233",
111
  "metadata_created": "2022-02-10T07:32:55.894233",
            
n
112
  "metadata_modified": "2022-04-06T05:49:50.084020",
n
112
  "metadata_modified": "2022-04-06T05:49:53.482711",
            
113
  "name": "simulating-chamois-populations",
113
  "name": "simulating-chamois-populations",
            
114
  "notes": "# General description\r\n\r\nGenomic data, habitat 
114
  "notes": "# General description\r\n\r\nGenomic data, habitat 
            
115
suitability raster files and scripts to run gen3sis to simulate 
115
suitability raster files and scripts to run gen3sis to simulate 
            
116
cumulative divergence over time as approximation for genetic 
116
cumulative divergence over time as approximation for genetic 
            
117
differentiation. Scripts for basic analysis of the simulations (e.g., 
117
differentiation. Scripts for basic analysis of the simulations (e.g., 
            
118
create distance matrix from sampling locations) are provided, too. See 
118
create distance matrix from sampling locations) are provided, too. See 
            
119
original publication (doi link will be provided after publication) for 
119
original publication (doi link will be provided after publication) for 
            
120
details. The study area are the European Alps.\r\nAll data is uploaded 
120
details. The study area are the European Alps.\r\nAll data is uploaded 
            
121
as zipped file. Unzip them after the download and put all data in one 
121
as zipped file. Unzip them after the download and put all data in one 
            
122
folder.\r\nSee linked publications for correct citation of the data 
122
folder.\r\nSee linked publications for correct citation of the data 
            
123
used, use of the data without correct citation is not 
123
used, use of the data without correct citation is not 
            
124
allowed.\r\n\r\n__Corresponding author__: Flurin Leugger, email: 
124
allowed.\r\n\r\n__Corresponding author__: Flurin Leugger, email: 
            
125
flurin.leugger@gmail.com\r\n\r\n\r\n# Description of the data (content 
125
flurin.leugger@gmail.com\r\n\r\n\r\n# Description of the data (content 
            
126
of the different zip folders)\r\n\r\n## Abiotic data\r\n\r\n### 
126
of the different zip folders)\r\n\r\n## Abiotic data\r\n\r\n### 
            
127
Glaciers\r\nFolders with raster stacks with glaciated areas at 
127
Glaciers\r\nFolders with raster stacks with glaciated areas at 
            
128
0.05\u00b0 resolution in WGS84 projection from Seguinot et al. 
128
0.05\u00b0 resolution in WGS84 projection from Seguinot et al. 
            
129
(2018).\r\nSeguinot, J., Ivy-Ochs, S., Jouvet, G., Huss, M., Funk, M., 
129
(2018).\r\nSeguinot, J., Ivy-Ochs, S., Jouvet, G., Huss, M., Funk, M., 
            
130
& Preusser, F. (2018). Modelling last glacial cycle ice dynamics in 
130
& Preusser, F. (2018). Modelling last glacial cycle ice dynamics in 
            
131
the Alps. _The Cryosphere, 12(10)_, 3265\u20133285. 
131
the Alps. _The Cryosphere, 12(10)_, 3265\u20133285. 
            
132
https://doi.org/10.5194/tc-12-3265-2018\r\n\r\n### Rivers\r\n* 
132
https://doi.org/10.5194/tc-12-3265-2018\r\n\r\n### Rivers\r\n* 
            
133
__river_raster_elevation_class.tif__: raster file (.tif) at 0.05\u00b0 
133
__river_raster_elevation_class.tif__: raster file (.tif) at 0.05\u00b0 
            
134
resolution and WGS84 projection with large rivers (scenario 2 from 
134
resolution and WGS84 projection with large rivers (scenario 2 from 
            
135
publication). The rivers (each cell) is classified according to the 
135
publication). The rivers (each cell) is classified according to the 
            
136
elevation of the cell.\r\nNatural Earth. (2018). Rivers + lake 
136
elevation of the cell.\r\nNatural Earth. (2018). Rivers + lake 
            
137
centerlines version 4.1.0. Retrieved January 22, 2020, from 
137
centerlines version 4.1.0. Retrieved January 22, 2020, from 
            
138
ta.com/downloads/50m-physical-vectors/50m-rivers-lake-centerlines\r\n* 
138
ta.com/downloads/50m-physical-vectors/50m-rivers-lake-centerlines\r\n* 
            
139
__river_raster_strahler_class_5km.tif__: raster file at 0.05\u00b0 
139
__river_raster_strahler_class_5km.tif__: raster file at 0.05\u00b0 
            
140
resolution and WGS84 projection with medium rivers. The rivers are 
140
resolution and WGS84 projection with medium rivers. The rivers are 
            
141
classified according to their Strahler order.\r\nFood and Agriculture 
141
classified according to their Strahler order.\r\nFood and Agriculture 
            
142
Organization of the United Nations. (2014). Rivers in Europe (Derived 
142
Organization of the United Nations. (2014). Rivers in Europe (Derived 
            
143
from HydroSHEDS). Retrieved January 29, 2020, from 
143
from HydroSHEDS). Retrieved January 29, 2020, from 
            
144
9-487c-8102-45180cf1a99f&layers=AQUAMAPS:37253_rivers_europe\r\n\r\n## 
144
9-487c-8102-45180cf1a99f&layers=AQUAMAPS:37253_rivers_europe\r\n\r\n## 
            
145
Fossil records\r\n* __chamois_fossil_combined_public.xlsx__: list with 
145
Fossil records\r\n* __chamois_fossil_combined_public.xlsx__: list with 
            
146
fossil records until 20,000 years BP from Central Europe, see linked 
146
fossil records until 20,000 years BP from Central Europe, see linked 
            
147
references for citation. \r\n\r\n## Chamois occurrences\r\n* 
147
references for citation. \r\n\r\n## Chamois occurrences\r\n* 
            
148
__chamois_occurrence.csv__: Occurrence records from all sources used 
148
__chamois_occurrence.csv__: Occurrence records from all sources used 
            
149
for the publication (see Suppl. mat. Table S1 for detailed information 
149
for the publication (see Suppl. mat. Table S1 for detailed information 
            
150
and correct citations of the data) aggregated at 0.05\u00b0 resolution 
150
and correct citations of the data) aggregated at 0.05\u00b0 resolution 
            
151
(~5km).\r\n\r\n## Gen3sis\r\n* __config__: folders with all 
151
(~5km).\r\n\r\n## Gen3sis\r\n* __config__: folders with all 
            
152
configuration files used to run the simulations for the publication 
152
configuration files used to run the simulations for the publication 
            
153
(different dispersal divergence parameters).\r\n* __scripts__: scripts 
153
(different dispersal divergence parameters).\r\n* __scripts__: scripts 
            
154
(and helper functions) to run the gen3sis simulations including 
154
(and helper functions) to run the gen3sis simulations including 
            
155
scripts for the beginning of the subsequent analysis.\r\n\r\n## 
155
scripts for the beginning of the subsequent analysis.\r\n\r\n## 
            
156
Genetic\r\n* __populations.snps.light.vcf__: vcf file of the sampled 
156
Genetic\r\n* __populations.snps.light.vcf__: vcf file of the sampled 
            
157
Northern chamois _(Rupicapra rupicapra)_ . The genomic data 
157
Northern chamois _(Rupicapra rupicapra)_ . The genomic data 
            
158
encompasses 20k SNPs (from ddRAD sequencing).\r\n* 
158
encompasses 20k SNPs (from ddRAD sequencing).\r\n* 
            
159
__Sequencing_final_without_slovakia.txt__: sampling locations of 
159
__Sequencing_final_without_slovakia.txt__: sampling locations of 
            
160
Northern chamois _(Rupicapra rupicapra)_\r\n\r\n## HSM\r\n* 
160
Northern chamois _(Rupicapra rupicapra)_\r\n\r\n## HSM\r\n* 
            
161
__habitat_suitability_hindcasting__: Aggregated habitat suitability 
161
__habitat_suitability_hindcasting__: Aggregated habitat suitability 
            
162
raster files (stacks, .grd files) at 0.05\u00b0 resolution and WGS84 
162
raster files (stacks, .grd files) at 0.05\u00b0 resolution and WGS84 
            
163
projection from 20,000 years BP until today in 100 year time steps. 
163
projection from 20,000 years BP until today in 100 year time steps. 
            
164
There are separate folders for each environmental variable scenario 
164
There are separate folders for each environmental variable scenario 
            
165
used (different terrain slope variables) an the different 
165
used (different terrain slope variables) an the different 
            
166
occurrence/pseudo-absence sampling strategy used.\r\n* 
166
occurrence/pseudo-absence sampling strategy used.\r\n* 
            
167
__ODMAP_LeuggerEtAl__2021-10-25.csv__: ODMAP protocol",
167
__ODMAP_LeuggerEtAl__2021-10-25.csv__: ODMAP protocol",
            
n
168
  "num_resources": 7,
n
168
  "num_resources": 8,
            
169
  "num_tags": 6,
169
  "num_tags": 6,
            
170
  "organization": {
170
  "organization": {
            
171
    "approval_status": "approved",
171
    "approval_status": "approved",
            
172
    "created": "2018-12-01T11:42:44.590217",
172
    "created": "2018-12-01T11:42:44.590217",
            
173
    "description": "Our laboratory aims at understanding and 
173
    "description": "Our laboratory aims at understanding and 
            
174
forecasting the response of biodiversity to landscape changes. We 
174
forecasting the response of biodiversity to landscape changes. We 
            
175
investigate the historical responses of species to past changes such 
175
investigate the historical responses of species to past changes such 
            
176
as plate tectonics or the glaciations of the Quaternary and 
176
as plate tectonics or the glaciations of the Quaternary and 
            
177
contemporary responses to ongoing global changes. We develop spatial 
177
contemporary responses to ongoing global changes. We develop spatial 
            
178
mechanistic models of biodiversity that account for processes such as 
178
mechanistic models of biodiversity that account for processes such as 
            
179
dispersal and biotic interactions.",
179
dispersal and biotic interactions.",
            
180
    "id": "3b0fde83-e15c-4f8b-a451-9778f5309a84",
180
    "id": "3b0fde83-e15c-4f8b-a451-9778f5309a84",
            
181
    "image_url": 
181
    "image_url": 
            
182
ww.ites.ethz.ch/_jcr_content/orgLogo.imageformat.logo.1518520524.jpg",
182
ww.ites.ethz.ch/_jcr_content/orgLogo.imageformat.logo.1518520524.jpg",
            
183
    "is_organization": true,
183
    "is_organization": true,
            
184
    "name": "landscape-ecology",
184
    "name": "landscape-ecology",
            
185
    "state": "active",
185
    "state": "active",
            
186
    "title": "Landscape Ecology",
186
    "title": "Landscape Ecology",
            
187
    "type": "organization"
187
    "type": "organization"
            
188
  },
188
  },
            
189
  "owner_org": "3b0fde83-e15c-4f8b-a451-9778f5309a84",
189
  "owner_org": "3b0fde83-e15c-4f8b-a451-9778f5309a84",
            
190
  "private": false,
190
  "private": false,
            
191
  "publication": "{\"publication_year\": \"2022\", \"publisher\": 
191
  "publication": "{\"publication_year\": \"2022\", \"publisher\": 
            
192
\"EnviDat\"}",
192
\"EnviDat\"}",
            
193
  "publication_state": "pub_pending",
193
  "publication_state": "pub_pending",
            
194
  "related_datasets": "",
194
  "related_datasets": "",
            
195
  "related_publications": "* wsl:27918* Hagen, O., Fl\u00fcck, B., 
195
  "related_publications": "* wsl:27918* Hagen, O., Fl\u00fcck, B., 
            
196
Fopp, F., Cabral, J. S., Hartig, F., Pontarp, M., \u2026 Pellissier, 
196
Fopp, F., Cabral, J. S., Hartig, F., Pontarp, M., \u2026 Pellissier, 
            
197
L. (2021). gen3sis: a general engine for eco-evolutionary simulations 
197
L. (2021). gen3sis: a general engine for eco-evolutionary simulations 
            
198
of the processes that shape Earth's biodiversity. PLoS Biology, 19(7), 
198
of the processes that shape Earth's biodiversity. PLoS Biology, 19(7), 
            
199
e3001340 (31 pp.). https://doi.org/10.1371/journal.pbio.3001340",
199
e3001340 (31 pp.). https://doi.org/10.1371/journal.pbio.3001340",
            
200
  "relationships_as_object": [],
200
  "relationships_as_object": [],
            
201
  "relationships_as_subject": [],
201
  "relationships_as_subject": [],
            
202
  "resource_type": "dataset",
202
  "resource_type": "dataset",
            
203
  "resource_type_general": "dataset",
203
  "resource_type_general": "dataset",
            
204
  "resources": [
204
  "resources": [
            
205
    {
205
    {
            
206
      "cache_last_updated": null,
206
      "cache_last_updated": null,
            
207
      "cache_url": null,
207
      "cache_url": null,
            
208
      "created": "2022-02-11T09:43:57.774121",
208
      "created": "2022-02-11T09:43:57.774121",
            
209
      "description": "ddRADseq data (vcf file and sampling locations) 
209
      "description": "ddRADseq data (vcf file and sampling locations) 
            
210
of 449 Northern chamois (Rupicapra rupicapra) sampled across the 
210
of 449 Northern chamois (Rupicapra rupicapra) sampled across the 
            
211
European Alps",
211
European Alps",
            
212
      "doi": "",
212
      "doi": "",
            
213
      "format": "vcf",
213
      "format": "vcf",
            
214
      "hash": "",
214
      "hash": "",
            
215
      "id": "f8447807-22a7-4219-a585-4b514421f2cb",
215
      "id": "f8447807-22a7-4219-a585-4b514421f2cb",
            
216
      "last_modified": null,
216
      "last_modified": null,
            
217
      "metadata_modified": "2022-02-11T09:43:57.752427",
217
      "metadata_modified": "2022-02-11T09:43:57.752427",
            
218
      "mimetype": null,
218
      "mimetype": null,
            
219
      "mimetype_inner": null,
219
      "mimetype_inner": null,
            
220
      "name": "Genetic data Northern chamois across Alps",
220
      "name": "Genetic data Northern chamois across Alps",
            
221
      "package_id": "880eb4ab-2150-44a9-a52a-985ba444a4ac",
221
      "package_id": "880eb4ab-2150-44a9-a52a-985ba444a4ac",
            
222
      "position": 0,
222
      "position": 0,
            
223
      "publication_state": "",
223
      "publication_state": "",
            
224
      "resource_size": "{\"size_value\": \"\", \"size_units\": 
224
      "resource_size": "{\"size_value\": \"\", \"size_units\": 
            
225
\"kb\"}",
225
\"kb\"}",
            
226
      "resource_type": null,
226
      "resource_type": null,
            
227
      "restricted": "{\"level\": \"public\", \"allowed_users\": \"\", 
227
      "restricted": "{\"level\": \"public\", \"allowed_users\": \"\", 
            
228
\"shared_secret\": \"\"}",
228
\"shared_secret\": \"\"}",
            
229
      "size": 82077,
229
      "size": 82077,
            
230
      "state": "active",
230
      "state": "active",
            
231
      "url": 
231
      "url": 
            
232
c/resource/f8447807-22a7-4219-a585-4b514421f2cb/download/gen3sis.zip",
232
c/resource/f8447807-22a7-4219-a585-4b514421f2cb/download/gen3sis.zip",
            
233
      "url_type": "upload"
233
      "url_type": "upload"
            
234
    },
234
    },
            
235
    {
235
    {
            
236
      "cache_last_updated": null,
236
      "cache_last_updated": null,
            
237
      "cache_url": null,
237
      "cache_url": null,
            
238
      "created": "2022-02-11T09:44:42.143222",
238
      "created": "2022-02-11T09:44:42.143222",
            
239
      "description": "Metadata",
239
      "description": "Metadata",
            
240
      "doi": "",
240
      "doi": "",
            
241
      "format": ".txt",
241
      "format": ".txt",
            
242
      "hash": "",
242
      "hash": "",
            
243
      "id": "53239b17-86ec-411a-9909-9072d437aa64",
243
      "id": "53239b17-86ec-411a-9909-9072d437aa64",
            
244
      "last_modified": "2022-02-11T16:48:23.657107",
244
      "last_modified": "2022-02-11T16:48:23.657107",
            
245
      "metadata_modified": "2022-04-06T05:48:48.910771",
245
      "metadata_modified": "2022-04-06T05:48:48.910771",
            
246
      "mimetype": null,
246
      "mimetype": null,
            
247
      "mimetype_inner": null,
247
      "mimetype_inner": null,
            
248
      "name": "Metadata",
248
      "name": "Metadata",
            
249
      "package_id": "880eb4ab-2150-44a9-a52a-985ba444a4ac",
249
      "package_id": "880eb4ab-2150-44a9-a52a-985ba444a4ac",
            
250
      "position": 1,
250
      "position": 1,
            
251
      "publication_state": "",
251
      "publication_state": "",
            
252
      "resource_size": "{\"size_value\": \"\", \"size_units\": 
252
      "resource_size": "{\"size_value\": \"\", \"size_units\": 
            
253
\"kb\"}",
253
\"kb\"}",
            
254
      "resource_type": null,
254
      "resource_type": null,
            
255
      "restricted": "{\"level\": \"public\", \"allowed_users\": \"\", 
255
      "restricted": "{\"level\": \"public\", \"allowed_users\": \"\", 
            
256
\"shared_secret\": \"\"}",
256
\"shared_secret\": \"\"}",
            
257
      "size": 3868,
257
      "size": 3868,
            
258
      "state": "active",
258
      "state": "active",
            
259
      "url": 
259
      "url": 
            
260
/resource/53239b17-86ec-411a-9909-9072d437aa64/download/metadata.txt",
260
/resource/53239b17-86ec-411a-9909-9072d437aa64/download/metadata.txt",
            
261
      "url_type": "upload"
261
      "url_type": "upload"
            
262
    },
262
    },
            
263
    {
263
    {
            
264
      "cache_last_updated": null,
264
      "cache_last_updated": null,
            
265
      "cache_url": null,
265
      "cache_url": null,
            
266
      "created": "2022-02-11T09:45:55.307471",
266
      "created": "2022-02-11T09:45:55.307471",
            
267
      "description": "Input rasters required to set up gen3sis 
267
      "description": "Input rasters required to set up gen3sis 
            
268
simulations",
268
simulations",
            
269
      "doi": "",
269
      "doi": "",
            
270
      "format": ".tif",
270
      "format": ".tif",
            
271
      "hash": "",
271
      "hash": "",
            
272
      "id": "c90c16c5-21ae-494e-b1bf-a367ab38e648",
272
      "id": "c90c16c5-21ae-494e-b1bf-a367ab38e648",
            
273
      "last_modified": null,
273
      "last_modified": null,
            
274
      "metadata_modified": "2022-02-11T09:45:55.287444",
274
      "metadata_modified": "2022-02-11T09:45:55.287444",
            
275
      "mimetype": null,
275
      "mimetype": null,
            
276
      "mimetype_inner": null,
276
      "mimetype_inner": null,
            
277
      "name": "Rivers and glaciers",
277
      "name": "Rivers and glaciers",
            
278
      "package_id": "880eb4ab-2150-44a9-a52a-985ba444a4ac",
278
      "package_id": "880eb4ab-2150-44a9-a52a-985ba444a4ac",
            
279
      "position": 2,
279
      "position": 2,
            
280
      "publication_state": "",
280
      "publication_state": "",
            
281
      "resource_size": "{\"size_value\": \"\", \"size_units\": 
281
      "resource_size": "{\"size_value\": \"\", \"size_units\": 
            
282
\"kb\"}",
282
\"kb\"}",
            
283
      "resource_type": null,
283
      "resource_type": null,
            
284
      "restricted": "{\"level\": \"public\", \"allowed_users\": \"\", 
284
      "restricted": "{\"level\": \"public\", \"allowed_users\": \"\", 
            
285
\"shared_secret\": \"\"}",
285
\"shared_secret\": \"\"}",
            
286
      "size": 143478,
286
      "size": 143478,
            
287
      "state": "active",
287
      "state": "active",
            
288
      "url": 
288
      "url": 
            
289
c/resource/c90c16c5-21ae-494e-b1bf-a367ab38e648/download/abiotic.zip",
289
c/resource/c90c16c5-21ae-494e-b1bf-a367ab38e648/download/abiotic.zip",
            
290
      "url_type": "upload"
290
      "url_type": "upload"
            
291
    },
291
    },
            
292
    {
292
    {
            
293
      "cache_last_updated": null,
293
      "cache_last_updated": null,
            
294
      "cache_url": null,
294
      "cache_url": null,
            
295
      "created": "2022-04-05T06:03:13.197606",
295
      "created": "2022-04-05T06:03:13.197606",
            
296
      "description": "Chamois fossil records with estimated time span 
296
      "description": "Chamois fossil records with estimated time span 
            
297
and coordinates. Please see the sheet \"references_data_sets\" for the 
297
and coordinates. Please see the sheet \"references_data_sets\" for the 
            
298
references and read the read_me.txt file prior to using the data.",
298
references and read the read_me.txt file prior to using the data.",
            
299
      "doi": "",
299
      "doi": "",
            
300
      "format": "XLSX",
300
      "format": "XLSX",
            
301
      "hash": "",
301
      "hash": "",
            
302
      "id": "801413db-9f0f-4147-99c2-8b36dd664e44",
302
      "id": "801413db-9f0f-4147-99c2-8b36dd664e44",
            
303
      "last_modified": null,
303
      "last_modified": null,
            
304
      "metadata_modified": "2022-04-05T06:03:13.175510",
304
      "metadata_modified": "2022-04-05T06:03:13.175510",
            
305
      "mimetype": null,
305
      "mimetype": null,
            
306
      "mimetype_inner": null,
306
      "mimetype_inner": null,
            
307
      "name": "Fossil records",
307
      "name": "Fossil records",
            
308
      "package_id": "880eb4ab-2150-44a9-a52a-985ba444a4ac",
308
      "package_id": "880eb4ab-2150-44a9-a52a-985ba444a4ac",
            
309
      "position": 3,
309
      "position": 3,
            
310
      "publication_state": "",
310
      "publication_state": "",
            
311
      "resource_size": "{\"size_value\": \"\", \"size_units\": 
311
      "resource_size": "{\"size_value\": \"\", \"size_units\": 
            
312
\"kb\"}",
312
\"kb\"}",
            
313
      "resource_type": null,
313
      "resource_type": null,
            
314
      "restricted": "{\"level\": \"public\", \"allowed_users\": \"\", 
314
      "restricted": "{\"level\": \"public\", \"allowed_users\": \"\", 
            
315
\"shared_secret\": \"\"}",
315
\"shared_secret\": \"\"}",
            
316
      "size": 34185,
316
      "size": 34185,
            
317
      "state": "active",
317
      "state": "active",
            
318
      "url": 
318
      "url": 
            
319
rce/801413db-9f0f-4147-99c2-8b36dd664e44/download/fossil_records.zip",
319
rce/801413db-9f0f-4147-99c2-8b36dd664e44/download/fossil_records.zip",
            
320
      "url_type": "upload"
320
      "url_type": "upload"
            
321
    },
321
    },
            
322
    {
322
    {
            
323
      "cache_last_updated": null,
323
      "cache_last_updated": null,
            
324
      "cache_url": null,
324
      "cache_url": null,
            
325
      "created": "2022-04-05T12:17:42.069552",
325
      "created": "2022-04-05T12:17:42.069552",
            
326
      "description": "Coordinates (0.05\u00b0 resolution) of chamois 
326
      "description": "Coordinates (0.05\u00b0 resolution) of chamois 
            
327
occurrences across the Alps. See Suppl. mat. Table S1 for more 
327
occurrences across the Alps. See Suppl. mat. Table S1 for more 
            
328
information and citation of the data sets used.",
328
information and citation of the data sets used.",
            
329
      "doi": "",
329
      "doi": "",
            
330
      "format": ".csv",
330
      "format": ".csv",
            
331
      "hash": "",
331
      "hash": "",
            
332
      "id": "26583b50-5222-4e9c-a69d-062f60965a92",
332
      "id": "26583b50-5222-4e9c-a69d-062f60965a92",
            
333
      "last_modified": "2022-04-06T07:49:49.684855",
333
      "last_modified": "2022-04-06T07:49:49.684855",
            
334
      "metadata_modified": "2022-04-06T05:49:50.090220",
334
      "metadata_modified": "2022-04-06T05:49:50.090220",
            
335
      "mimetype": null,
335
      "mimetype": null,
            
336
      "mimetype_inner": null,
336
      "mimetype_inner": null,
            
337
      "name": "Chamois occurrences",
337
      "name": "Chamois occurrences",
            
338
      "package_id": "880eb4ab-2150-44a9-a52a-985ba444a4ac",
338
      "package_id": "880eb4ab-2150-44a9-a52a-985ba444a4ac",
            
339
      "position": 4,
339
      "position": 4,
            
340
      "publication_state": "",
340
      "publication_state": "",
            
341
      "resource_size": "{\"size_value\": \"\", \"size_units\": 
341
      "resource_size": "{\"size_value\": \"\", \"size_units\": 
            
342
\"kb\"}",
342
\"kb\"}",
            
343
      "resource_type": null,
343
      "resource_type": null,
            
344
      "restricted": "{\"level\": \"public\", \"allowed_users\": \"\", 
344
      "restricted": "{\"level\": \"public\", \"allowed_users\": \"\", 
            
345
\"shared_secret\": \"\"}",
345
\"shared_secret\": \"\"}",
            
346
      "size": 136158,
346
      "size": 136158,
            
347
      "state": "active",
347
      "state": "active",
            
348
      "url": 
348
      "url": 
            
349
26583b50-5222-4e9c-a69d-062f60965a92/download/chamois_occurrence.csv",
349
26583b50-5222-4e9c-a69d-062f60965a92/download/chamois_occurrence.csv",
            
350
      "url_type": "upload"
350
      "url_type": "upload"
            
351
    },
351
    },
            
352
    {
352
    {
            
353
      "cache_last_updated": null,
353
      "cache_last_updated": null,
            
354
      "cache_url": null,
354
      "cache_url": null,
            
355
      "created": "2022-02-11T09:47:30.882770",
355
      "created": "2022-02-11T09:47:30.882770",
            
356
      "description": "Scripts to run gen3sis simulations, including 
356
      "description": "Scripts to run gen3sis simulations, including 
            
357
configs used for the 
357
configs used for the 
            
358
publication.\r\n\r\n__1.2_gen3sis_input_generation.R__ creates the 
358
publication.\r\n\r\n__1.2_gen3sis_input_generation.R__ creates the 
            
359
input files required for __2.2_gen3sis_simulation_chamois.R__, which 
359
input files required for __2.2_gen3sis_simulation_chamois.R__, which 
            
360
is running the gen3sis simulations.\r\n__ 
360
is running the gen3sis simulations.\r\n__ 
            
361
3_gen3sis_track_simulation_over_time.R__ and 
361
3_gen3sis_track_simulation_over_time.R__ and 
            
362
__4_gen3sis_divergence_sampling_locations.R__ can be used to start the 
362
__4_gen3sis_divergence_sampling_locations.R__ can be used to start the 
            
363
analysis.",
363
analysis.",
            
364
      "doi": "",
364
      "doi": "",
            
365
      "format": "R",
365
      "format": "R",
            
366
      "hash": "",
366
      "hash": "",
            
367
      "id": "599ce7b4-0994-42e4-a374-639012aa6c38",
367
      "id": "599ce7b4-0994-42e4-a374-639012aa6c38",
            
368
      "last_modified": "2022-02-11T16:47:39.774586",
368
      "last_modified": "2022-02-11T16:47:39.774586",
            
369
      "metadata_modified": "2022-02-11T15:47:40.173174",
369
      "metadata_modified": "2022-02-11T15:47:40.173174",
            
370
      "mimetype": null,
370
      "mimetype": null,
            
371
      "mimetype_inner": null,
371
      "mimetype_inner": null,
            
372
      "name": "gen3sis simulations",
372
      "name": "gen3sis simulations",
            
373
      "package_id": "880eb4ab-2150-44a9-a52a-985ba444a4ac",
373
      "package_id": "880eb4ab-2150-44a9-a52a-985ba444a4ac",
            
374
      "position": 5,
374
      "position": 5,
            
375
      "publication_state": "",
375
      "publication_state": "",
            
376
      "resource_size": "{\"size_value\": \"\", \"size_units\": 
376
      "resource_size": "{\"size_value\": \"\", \"size_units\": 
            
377
\"kb\"}",
377
\"kb\"}",
            
378
      "resource_type": null,
378
      "resource_type": null,
            
379
      "restricted": "{\"level\": \"public\", \"allowed_users\": \"\", 
379
      "restricted": "{\"level\": \"public\", \"allowed_users\": \"\", 
            
380
\"shared_secret\": \"\"}",
380
\"shared_secret\": \"\"}",
            
381
      "size": 81389,
381
      "size": 81389,
            
382
      "state": "active",
382
      "state": "active",
            
383
      "url": 
383
      "url": 
            
384
c/resource/599ce7b4-0994-42e4-a374-639012aa6c38/download/gen3sis.zip",
384
c/resource/599ce7b4-0994-42e4-a374-639012aa6c38/download/gen3sis.zip",
            
385
      "url_type": "upload"
385
      "url_type": "upload"
            
386
    },
386
    },
            
387
    {
387
    {
            
388
      "cache_last_updated": null,
388
      "cache_last_updated": null,
            
389
      "cache_url": null,
389
      "cache_url": null,
            
390
      "created": "2022-02-11T14:15:16.337216",
390
      "created": "2022-02-11T14:15:16.337216",
            
391
      "description": "Habitat suitability raster stacks (.grd) files 
391
      "description": "Habitat suitability raster stacks (.grd) files 
            
392
for different terrain slope scenarios use (see main publication its 
392
for different terrain slope scenarios use (see main publication its 
            
393
supporting information for details) for Northern chamois until 20,000 
393
supporting information for details) for Northern chamois until 20,000 
            
394
years BP in 100 year time steps.\r\n\r\n### Description of layer 
394
years BP in 100 year time steps.\r\n\r\n### Description of layer 
            
395
names:\r\n* __prob__: habitat suitability ranging continuously from 0 
395
names:\r\n* __prob__: habitat suitability ranging continuously from 0 
            
396
(unsuitable) to 1 (very well suitable).\r\n*__bin__: binary 
396
(unsuitable) to 1 (very well suitable).\r\n*__bin__: binary 
            
397
classification of habitat suitability based on TSS threshold 
397
classification of habitat suitability based on TSS threshold 
            
398
optimization (see main publication and supporting information for 
398
optimization (see main publication and supporting information for 
            
399
details).\r\n*__glm__: generalized linear model (to model and predict 
399
details).\r\n*__glm__: generalized linear model (to model and predict 
            
400
habitat suitability)\r\n*__gam__: generalized additive 
400
habitat suitability)\r\n*__gam__: generalized additive 
            
401
model\r\n*__gbm__: generalized boosted regression model\r\n*__rf__: 
401
model\r\n*__gbm__: generalized boosted regression model\r\n*__rf__: 
            
402
random forest\r\n*__ensemble__: average of all 4 model types\r\n",
402
random forest\r\n*__ensemble__: average of all 4 model types\r\n",
            
403
      "doi": "",
403
      "doi": "",
            
404
      "format": ".grd",
404
      "format": ".grd",
            
405
      "hash": "",
405
      "hash": "",
            
406
      "id": "ff87fdf4-c8d6-47d0-936a-b455c77c26d2",
406
      "id": "ff87fdf4-c8d6-47d0-936a-b455c77c26d2",
            
407
      "last_modified": "2022-02-11T17:15:43.572742",
407
      "last_modified": "2022-02-11T17:15:43.572742",
            
408
      "metadata_modified": "2022-02-11T16:15:43.965484",
408
      "metadata_modified": "2022-02-11T16:15:43.965484",
            
409
      "mimetype": null,
409
      "mimetype": null,
            
410
      "mimetype_inner": null,
410
      "mimetype_inner": null,
            
411
      "name": "Habitat suitability raster",
411
      "name": "Habitat suitability raster",
            
412
      "package_id": "880eb4ab-2150-44a9-a52a-985ba444a4ac",
412
      "package_id": "880eb4ab-2150-44a9-a52a-985ba444a4ac",
            
413
      "position": 6,
413
      "position": 6,
            
414
      "publication_state": "",
414
      "publication_state": "",
            
415
      "resource_size": "{\"size_value\": \"\", \"size_units\": 
415
      "resource_size": "{\"size_value\": \"\", \"size_units\": 
            
416
\"kb\"}",
416
\"kb\"}",
            
417
      "resource_type": null,
417
      "resource_type": null,
            
418
      "restricted": "{\"level\": \"public\", \"allowed_users\": \"\", 
418
      "restricted": "{\"level\": \"public\", \"allowed_users\": \"\", 
            
419
\"shared_secret\": \"\"}",
419
\"shared_secret\": \"\"}",
            
420
      "size": 1908747503,
420
      "size": 1908747503,
            
421
      "state": "active",
421
      "state": "active",
            
422
      "url": 
422
      "url": 
            
423
4a4ac/resource/ff87fdf4-c8d6-47d0-936a-b455c77c26d2/download/hsm.zip",
423
4a4ac/resource/ff87fdf4-c8d6-47d0-936a-b455c77c26d2/download/hsm.zip",
            
424
      "url_type": "upload"
424
      "url_type": "upload"
            
t
t
425
    },
            
426
    {
            
427
      "cache_last_updated": null,
            
428
      "cache_url": null,
            
429
      "created": "2022-04-06T05:49:53.514170",
            
430
      "format": "CSV",
            
431
      "hash": "",
            
432
      "id": "e174f619-c3e8-49e1-a58f-65e6ce6ab988",
            
433
      "last_modified": null,
            
434
      "metadata_modified": "2022-04-06T05:49:53.489054",
            
435
      "mimetype": null,
            
436
      "mimetype_inner": null,
            
437
      "package_id": "880eb4ab-2150-44a9-a52a-985ba444a4ac",
            
438
      "position": 7,
            
439
      "resource_size": "",
            
440
      "resource_type": null,
            
441
      "restricted": "",
            
442
      "size": 136158,
            
443
      "state": "active",
            
444
      "url": 
            
445
e174f619-c3e8-49e1-a58f-65e6ce6ab988/download/chamois_occurrence.csv",
            
446
      "url_type": "upload"
            
425
    }
447
    }
            
426
  ],
448
  ],
            
427
  "spatial": "{\"type\": \"Polygon\", \"coordinates\": [[[4.8, 
449
  "spatial": "{\"type\": \"Polygon\", \"coordinates\": [[[4.8, 
            
428
43.5],[4.8, 48.3],[16.3, 48.3],[16.3, 43.5],[4.8, 43.5]]]}",
450
43.5],[4.8, 48.3],[16.3, 48.3],[16.3, 43.5],[4.8, 43.5]]]}",
            
429
  "spatial_info": "Switzerland",
451
  "spatial_info": "Switzerland",
            
430
  "state": "active",
452
  "state": "active",
            
431
  "subtitle": "",
453
  "subtitle": "",
            
432
  "tags": [
454
  "tags": [
            
433
    {
455
    {
            
434
      "display_name": "GEOGENOMICS",
456
      "display_name": "GEOGENOMICS",
            
435
      "id": "1df91b35-d832-4a4e-9dca-6c832448882b",
457
      "id": "1df91b35-d832-4a4e-9dca-6c832448882b",
            
436
      "name": "GEOGENOMICS",
458
      "name": "GEOGENOMICS",
            
437
      "state": "active",
459
      "state": "active",
            
438
      "vocabulary_id": null
460
      "vocabulary_id": null
            
439
    },
461
    },
            
440
    {
462
    {
            
441
      "display_name": "LANDSCAPE GENETICS",
463
      "display_name": "LANDSCAPE GENETICS",
            
442
      "id": "272b6cd2-8dab-4443-8e3f-33ca7d74ff0d",
464
      "id": "272b6cd2-8dab-4443-8e3f-33ca7d74ff0d",
            
443
      "name": "LANDSCAPE GENETICS",
465
      "name": "LANDSCAPE GENETICS",
            
444
      "state": "active",
466
      "state": "active",
            
445
      "vocabulary_id": null
467
      "vocabulary_id": null
            
446
    },
468
    },
            
447
    {
469
    {
            
448
      "display_name": "PALEO-ENVIRONMENTAL MODELING",
470
      "display_name": "PALEO-ENVIRONMENTAL MODELING",
            
449
      "id": "592f9e03-8b22-4ef9-890b-cf6315e36140",
471
      "id": "592f9e03-8b22-4ef9-890b-cf6315e36140",
            
450
      "name": "PALEO-ENVIRONMENTAL MODELING",
472
      "name": "PALEO-ENVIRONMENTAL MODELING",
            
451
      "state": "active",
473
      "state": "active",
            
452
      "vocabulary_id": null
474
      "vocabulary_id": null
            
453
    },
475
    },
            
454
    {
476
    {
            
455
      "display_name": "POPULATION GENETICS",
477
      "display_name": "POPULATION GENETICS",
            
456
      "id": "be6c4eb3-1e68-490e-a95f-313a5121ebd1",
478
      "id": "be6c4eb3-1e68-490e-a95f-313a5121ebd1",
            
457
      "name": "POPULATION GENETICS",
479
      "name": "POPULATION GENETICS",
            
458
      "state": "active",
480
      "state": "active",
            
459
      "vocabulary_id": null
481
      "vocabulary_id": null
            
460
    },
482
    },
            
461
    {
483
    {
            
462
      "display_name": "PROCESS-BASED MODELING",
484
      "display_name": "PROCESS-BASED MODELING",
            
463
      "id": "fafe5712-03ce-4760-9ed0-9203fccb4b24",
485
      "id": "fafe5712-03ce-4760-9ed0-9203fccb4b24",
            
464
      "name": "PROCESS-BASED MODELING",
486
      "name": "PROCESS-BASED MODELING",
            
465
      "state": "active",
487
      "state": "active",
            
466
      "vocabulary_id": null
488
      "vocabulary_id": null
            
467
    },
489
    },
            
468
    {
490
    {
            
469
      "display_name": "RANGE DYNAMICS",
491
      "display_name": "RANGE DYNAMICS",
            
470
      "id": "ef04480a-8566-4d8e-937a-8febe60d2c7a",
492
      "id": "ef04480a-8566-4d8e-937a-8febe60d2c7a",
            
471
      "name": "RANGE DYNAMICS",
493
      "name": "RANGE DYNAMICS",
            
472
      "state": "active",
494
      "state": "active",
            
473
      "vocabulary_id": null
495
      "vocabulary_id": null
            
474
    }
496
    }
            
475
  ],
497
  ],
            
476
  "title": "Simulating population divergence of Northern chamois in 
498
  "title": "Simulating population divergence of Northern chamois in 
            
477
the Alps based on habitat dynamics",
499
the Alps based on habitat dynamics",
            
478
  "type": "dataset",
500
  "type": "dataset",
            
479
  "url": null,
501
  "url": null,
            
480
  "version": "1.0"
502
  "version": "1.0"
            
481
}
503
}