Changes

              
    

          
          
        
        

            
f
1
{
f
1
{
            
2
  "author": "[{\"affiliation\": \"WSL\", \"affiliation_02\": \"\", 
2
  "author": "[{\"affiliation\": \"WSL\", \"affiliation_02\": \"\", 
            
3
\"affiliation_03\": \"\", \"data_credit\": [\"software\", 
3
\"affiliation_03\": \"\", \"data_credit\": [\"software\", 
            
4
\"publication\"], \"email\": \"klaus.ecker@wsl.ch\", \"given_name\": 
4
\"publication\"], \"email\": \"klaus.ecker@wsl.ch\", \"given_name\": 
            
5
\"Klaus\", \"identifier\": \"0000-0003-3388-1353\", \"name\": 
5
\"Klaus\", \"identifier\": \"0000-0003-3388-1353\", \"name\": 
            
6
\"Ecker\"}, {\"affiliation\": \"Institute of Statistics, University of 
6
\"Ecker\"}, {\"affiliation\": \"Institute of Statistics, University of 
            
7
Neuchatel\", \"affiliation_02\": \"\", \"affiliation_03\": \"\", 
7
Neuchatel\", \"affiliation_02\": \"\", \"affiliation_03\": \"\", 
            
8
\"data_credit\": [\"software\", \"publication\", \"supervision\"], 
8
\"data_credit\": [\"software\", \"publication\", \"supervision\"], 
            
9
\"email\": \"yves.tille@unine.ch\", \"given_name\": \"Yves\", 
9
\"email\": \"yves.tille@unine.ch\", \"given_name\": \"Yves\", 
            
10
\"identifier\": \"0000-0003-0904-5523\", \"name\": \"Till\\u00e9\"}]",
10
\"identifier\": \"0000-0003-0904-5523\", \"name\": \"Till\\u00e9\"}]",
            
11
  "author_email": null,
11
  "author_email": null,
            
12
  "creator_user_id": "ec8ebbf4-320b-4371-9c5a-998a7cd08c1d",
12
  "creator_user_id": "ec8ebbf4-320b-4371-9c5a-998a7cd08c1d",
            
13
  "date": "[{\"date\": \"2023-11-05\", \"date_type\": \"created\", 
13
  "date": "[{\"date\": \"2023-11-05\", \"date_type\": \"created\", 
            
14
\"end_date\": \"\"}]",
14
\"end_date\": \"\"}]",
            
15
  "doi": "10.16904/envidat.402",
15
  "doi": "10.16904/envidat.402",
            
16
  "funding": "[{\"grant_number\": \"\", \"institution\": \"FOEN\", 
16
  "funding": "[{\"grant_number\": \"\", \"institution\": \"FOEN\", 
            
17
\"institution_url\": \"\"}]",
17
\"institution_url\": \"\"}]",
            
18
  "groups": [],
18
  "groups": [],
            
19
  "id": "0b303fb7-17fc-4910-af8f-dbee54c0d093",
19
  "id": "0b303fb7-17fc-4910-af8f-dbee54c0d093",
            
20
  "isopen": false,
20
  "isopen": false,
            
21
  "language": "en",
21
  "language": "en",
            
22
  "license_id": "other-undefined",
22
  "license_id": "other-undefined",
            
23
  "license_title": "Other (Specified in the description)",
23
  "license_title": "Other (Specified in the description)",
            
24
  "maintainer": "{\"affiliation\": \"WSL\", \"email\": 
24
  "maintainer": "{\"affiliation\": \"WSL\", \"email\": 
            
25
\"klaus.ecker@wsl.ch\", \"given_name\": \"Klaus\", \"identifier\": 
25
\"klaus.ecker@wsl.ch\", \"given_name\": \"Klaus\", \"identifier\": 
            
26
\"0000-0003-3388-1353\", \"name\": \"Ecker\"}",
26
\"0000-0003-3388-1353\", \"name\": \"Ecker\"}",
            
27
  "maintainer_email": null,
27
  "maintainer_email": null,
            
28
  "metadata_created": "2023-05-11T14:32:34.812518",
28
  "metadata_created": "2023-05-11T14:32:34.812518",
            
n
29
  "metadata_modified": "2023-05-15T08:54:42.497967",
n
29
  "metadata_modified": "2023-05-15T09:02:12.843701",
            
30
  "name": "r-script-first-stage-sampling",
30
  "name": "r-script-first-stage-sampling",
            
n
31
  "notes": "License: GPL-v2\r\n\r\nThe R script illustrates an avanced 
n
31
  "notes": "License: GPL-v2\r\n\r\nThe R script presents an advanced 
            
32
sampling approach for monitoring biodiversity on agricultural land by 
32
sampling approach for monitoring biodiversity on agricultural land by 
            
33
combining multiple objectives and integrating environmental and 
33
combining multiple objectives and integrating environmental and 
            
t
34
geographic space for optimal estimation efficiency.\r\n\r\nIn doing 
t
34
geographic space.\r\n\r\nThe example demonstrates the first-stage 
            
35
so, the R script demonstrates the first-stage selection of squares 
35
selection of squares (km2) in the ALL-EMA sampling design using modern 
            
36
(km2) in the ALL-EMA sampling design using modern sampling techniques 
36
sampling techniques such as unequal probability sampling with fixed 
            
37
such as unequal probability sampling with fixed sample size, balanced 
37
sample size, balanced sampling, stratified balancing and geographic 
            
38
sampling, stratified balancing and geographic spreading. Sampling is 
38
spreading. Sampling is done with unequal probabilities and weights 
            
39
done with unequal probabilities and weights defined by power 

            
40
allocation to give equal weight to extrapolations to the total 
39
defined by power allocation to give equal weight to extrapolations to 
            
41
agricultural area of Switzerland and two stratifications of predefined 
40
the total agricultural area of Switzerland and two stratifications of 
            
42
interest (regions and agricultural production zones). Calibration is 
41
predefined interest (regions and agricultural production zones). 
            
43
used to limit the distribution of the sampling  weights. The sample 
42
Calibration is used to limit the distribution of the sampling weights. 
            
44
sizes are almost fixed within the strata and evenly distibuted across 
43
The sample sizes are almost fixed within the strata and evenly 
            
45
the years of a temporal rotation plan, which is favourable for the 
44
distributed across the years of a temporal rotation plan, which is 
            
46
organisation of the field survey. Sampling also ensures an optimal 
45
favourable for the organisation of the field survey. Sampling also 
            
47
(annual) distribution across geographic space, including altitude. 
46
ensures an optimal (annual) distribution across geographic space, 
            
48
Despite the complexity of the sampling, estimation based on 
47
including altitude. Despite the complexity of the sampling, estimation 
            
49
probability theory is straightforward.\r\n\r\nEcker, K., Meier, E. & 
48
based on probability theory is straightforward.\r\n\r\n\r\nEcker, K., 
            
50
Till\u00e9, Y. review. Integrating spatial and ecological information 
49
Meier, E. & Till\u00e9, Y. review. Integrating spatial and ecological 
            
51
into comprehensive biodiversity monitoring on agricultural land. 
50
information into comprehensive biodiversity monitoring on agricultural 
            
52
Environmental Monitoring and Assessment.\r\n",
51
land. Environmental Monitoring and Assessment.\r\n",
            
53
  "num_resources": 2,
52
  "num_resources": 2,
            
54
  "num_tags": 5,
53
  "num_tags": 5,
            
55
  "organization": {
54
  "organization": {
            
56
    "approval_status": "approved",
55
    "approval_status": "approved",
            
57
    "created": "2018-07-18T11:14:04.773731",
56
    "created": "2018-07-18T11:14:04.773731",
            
58
    "description": "We assess and analyse the state of different 
57
    "description": "We assess and analyse the state of different 
            
59
habitat types and their ecological changes with a particular focus on 
58
habitat types and their ecological changes with a particular focus on 
            
60
the habitats of national importance of Switzerland. We concentrate on 
59
the habitats of national importance of Switzerland. We concentrate on 
            
61
ecological changes and their causes in different ecosystems and 
60
ecological changes and their causes in different ecosystems and 
            
62
habitat types of Switzerland. We are especially interested in the 
61
habitat types of Switzerland. We are especially interested in the 
            
63
effects of different management systems, nutrient input, land-use 
62
effects of different management systems, nutrient input, land-use 
            
64
change (e.g. intensification, abandonment), habitat fragmentation as 
63
change (e.g. intensification, abandonment), habitat fragmentation as 
            
65
well as climate change on ecosystem state. We base our research on 
64
well as climate change on ecosystem state. We base our research on 
            
66
systematically assessed floristic and faunistic biodiversity-data, 
65
systematically assessed floristic and faunistic biodiversity-data, 
            
67
modelling and remote sensing information.\r\n\r\nWe strongly engage in 
66
modelling and remote sensing information.\r\n\r\nWe strongly engage in 
            
68
the monitoring and evaluation of qualitative and quantitative changes 
67
the monitoring and evaluation of qualitative and quantitative changes 
            
69
in natural or semi-natural habitats of Switzerland as a basis for 
68
in natural or semi-natural habitats of Switzerland as a basis for 
            
70
decision-making in policy and applied nature conservation. In the 
69
decision-making in policy and applied nature conservation. In the 
            
71
project \"Effectiveness of Habitat Protection in Switzerland\", 
70
project \"Effectiveness of Habitat Protection in Switzerland\", 
            
72
commissioned by the Federal Office of Environment BAFU, we concentrate 
71
commissioned by the Federal Office of Environment BAFU, we concentrate 
            
73
on the habitats of national importance (raised bogs, transitional 
72
on the habitats of national importance (raised bogs, transitional 
            
74
mires and fens, dry meadows, alluvial zones and amphibian spawning 
73
mires and fens, dry meadows, alluvial zones and amphibian spawning 
            
75
areas), i.e. the \"crown jewelry\" of Swiss nature reserves. Moreover, 
74
areas), i.e. the \"crown jewelry\" of Swiss nature reserves. Moreover, 
            
76
we share our knowledge on mire protection through consulting 
75
we share our knowledge on mire protection through consulting 
            
77
activities for the national government and the cantons.",
76
activities for the national government and the cantons.",
            
78
    "id": "0ee5727f-9228-464f-b4c2-a7399e702be2",
77
    "id": "0ee5727f-9228-464f-b4c2-a7399e702be2",
            
79
    "image_url": 
78
    "image_url": 
            
80
"https://upload.wikimedia.org/wikipedia/de/9/94/Logo_WSL.svg",
79
"https://upload.wikimedia.org/wikipedia/de/9/94/Logo_WSL.svg",
            
81
    "is_organization": true,
80
    "is_organization": true,
            
82
    "name": "ecosystems-dynamics",
81
    "name": "ecosystems-dynamics",
            
83
    "state": "active",
82
    "state": "active",
            
84
    "title": "Ecosystems Dynamics",
83
    "title": "Ecosystems Dynamics",
            
85
    "type": "organization"
84
    "type": "organization"
            
86
  },
85
  },
            
87
  "owner_org": "0ee5727f-9228-464f-b4c2-a7399e702be2",
86
  "owner_org": "0ee5727f-9228-464f-b4c2-a7399e702be2",
            
88
  "private": false,
87
  "private": false,
            
89
  "publication": "{\"publication_year\": \"2023\", \"publisher\": 
88
  "publication": "{\"publication_year\": \"2023\", \"publisher\": 
            
90
\"EnviDat\"}",
89
\"EnviDat\"}",
            
91
  "publication_state": "published",
90
  "publication_state": "published",
            
92
  "related_datasets": "",
91
  "related_datasets": "",
            
93
  "related_publications": "",
92
  "related_publications": "",
            
94
  "relationships_as_object": [],
93
  "relationships_as_object": [],
            
95
  "relationships_as_subject": [],
94
  "relationships_as_subject": [],
            
96
  "resource_type": "dataset",
95
  "resource_type": "dataset",
            
97
  "resource_type_general": "dataset",
96
  "resource_type_general": "dataset",
            
98
  "resources": [
97
  "resources": [
            
99
    {
98
    {
            
100
      "cache_last_updated": null,
99
      "cache_last_updated": null,
            
101
      "cache_url": null,
100
      "cache_url": null,
            
102
      "created": "2023-05-11T14:34:56.984148",
101
      "created": "2023-05-11T14:34:56.984148",
            
103
      "description": "",
102
      "description": "",
            
104
      "doi": "",
103
      "doi": "",
            
105
      "format": ".txt",
104
      "format": ".txt",
            
106
      "hash": "",
105
      "hash": "",
            
107
      "id": "89264e93-545c-4794-b6eb-46247ec92310",
106
      "id": "89264e93-545c-4794-b6eb-46247ec92310",
            
108
      "last_modified": "2023-05-15T07:49:49.495263",
107
      "last_modified": "2023-05-15T07:49:49.495263",
            
109
      "metadata_modified": "2023-05-15T08:54:42.508546",
108
      "metadata_modified": "2023-05-15T08:54:42.508546",
            
110
      "mimetype": null,
109
      "mimetype": null,
            
111
      "mimetype_inner": null,
110
      "mimetype_inner": null,
            
112
      "name": "data",
111
      "name": "data",
            
113
      "package_id": "0b303fb7-17fc-4910-af8f-dbee54c0d093",
112
      "package_id": "0b303fb7-17fc-4910-af8f-dbee54c0d093",
            
114
      "position": 0,
113
      "position": 0,
            
115
      "publication_state": "",
114
      "publication_state": "",
            
116
      "resource_size": "{\"size_units\": \"kb\", \"size_value\": 
115
      "resource_size": "{\"size_units\": \"kb\", \"size_value\": 
            
117
\"\"}",
116
\"\"}",
            
118
      "resource_type": null,
117
      "resource_type": null,
            
119
      "restricted": "{\"allowed_users\": \"\", \"level\": \"public\", 
118
      "restricted": "{\"allowed_users\": \"\", \"level\": \"public\", 
            
120
\"shared_secret\": \"\"}",
119
\"shared_secret\": \"\"}",
            
121
      "size": 22605,
120
      "size": 22605,
            
122
      "state": "active",
121
      "state": "active",
            
123
      "url": 
122
      "url": 
            
124
c0d093/resource/89264e93-545c-4794-b6eb-46247ec92310/download/s0.csv",
123
c0d093/resource/89264e93-545c-4794-b6eb-46247ec92310/download/s0.csv",
            
125
      "url_type": "upload"
124
      "url_type": "upload"
            
126
    },
125
    },
            
127
    {
126
    {
            
128
      "cache_last_updated": null,
127
      "cache_last_updated": null,
            
129
      "cache_url": null,
128
      "cache_url": null,
            
130
      "created": "2023-05-11T14:37:38.630324",
129
      "created": "2023-05-11T14:37:38.630324",
            
131
      "description": "",
130
      "description": "",
            
132
      "doi": "",
131
      "doi": "",
            
133
      "format": ".R",
132
      "format": ".R",
            
134
      "hash": "",
133
      "hash": "",
            
135
      "id": "2fa8e0c9-acbb-4a25-bb8e-79c76908a3b7",
134
      "id": "2fa8e0c9-acbb-4a25-bb8e-79c76908a3b7",
            
136
      "last_modified": "2023-05-15T08:36:12.905454",
135
      "last_modified": "2023-05-15T08:36:12.905454",
            
137
      "metadata_modified": "2023-05-15T08:36:13.298840",
136
      "metadata_modified": "2023-05-15T08:36:13.298840",
            
138
      "mimetype": null,
137
      "mimetype": null,
            
139
      "mimetype_inner": null,
138
      "mimetype_inner": null,
            
140
      "name": "R script",
139
      "name": "R script",
            
141
      "package_id": "0b303fb7-17fc-4910-af8f-dbee54c0d093",
140
      "package_id": "0b303fb7-17fc-4910-af8f-dbee54c0d093",
            
142
      "position": 1,
141
      "position": 1,
            
143
      "publication_state": "",
142
      "publication_state": "",
            
144
      "resource_size": "{\"size_value\": \"\", \"size_units\": 
143
      "resource_size": "{\"size_value\": \"\", \"size_units\": 
            
145
\"kb\"}",
144
\"kb\"}",
            
146
      "resource_type": null,
145
      "resource_type": null,
            
147
      "restricted": "{\"level\": \"public\", \"allowed_users\": \"\", 
146
      "restricted": "{\"level\": \"public\", \"allowed_users\": \"\", 
            
148
\"shared_secret\": \"\"}",
147
\"shared_secret\": \"\"}",
            
149
      "size": 10106,
148
      "size": 10106,
            
150
      "state": "active",
149
      "state": "active",
            
151
      "url": 
150
      "url": 
            
152
/2fa8e0c9-acbb-4a25-bb8e-79c76908a3b7/download/sample_selection_s1.r",
151
/2fa8e0c9-acbb-4a25-bb8e-79c76908a3b7/download/sample_selection_s1.r",
            
153
      "url_type": "upload"
152
      "url_type": "upload"
            
154
    }
153
    }
            
155
  ],
154
  ],
            
156
  "spatial": "{\"type\": \"Polygon\", \"coordinates\": [[[5.95587, 
155
  "spatial": "{\"type\": \"Polygon\", \"coordinates\": [[[5.95587, 
            
157
45.81802],[5.95587, 47.80838],[10.49203, 47.80838],[10.49203, 
156
45.81802],[5.95587, 47.80838],[10.49203, 47.80838],[10.49203, 
            
158
45.81802],[5.95587, 45.81802]]]}",
157
45.81802],[5.95587, 45.81802]]]}",
            
159
  "spatial_info": "Switzerland",
158
  "spatial_info": "Switzerland",
            
160
  "state": "active",
159
  "state": "active",
            
161
  "subtitle": "",
160
  "subtitle": "",
            
162
  "tags": [
161
  "tags": [
            
163
    {
162
    {
            
164
      "display_name": "BALANCED SAMPLING",
163
      "display_name": "BALANCED SAMPLING",
            
165
      "id": "64aaea7f-cd25-4c75-a37b-bc4c342510d6",
164
      "id": "64aaea7f-cd25-4c75-a37b-bc4c342510d6",
            
166
      "name": "BALANCED SAMPLING",
165
      "name": "BALANCED SAMPLING",
            
167
      "state": "active",
166
      "state": "active",
            
168
      "vocabulary_id": null
167
      "vocabulary_id": null
            
169
    },
168
    },
            
170
    {
169
    {
            
171
      "display_name": "HABITAT",
170
      "display_name": "HABITAT",
            
172
      "id": "af968922-763a-4f34-b156-a33745dc1852",
171
      "id": "af968922-763a-4f34-b156-a33745dc1852",
            
173
      "name": "HABITAT",
172
      "name": "HABITAT",
            
174
      "state": "active",
173
      "state": "active",
            
175
      "vocabulary_id": null
174
      "vocabulary_id": null
            
176
    },
175
    },
            
177
    {
176
    {
            
178
      "display_name": "MULTI-STAGE",
177
      "display_name": "MULTI-STAGE",
            
179
      "id": "0104f31b-7abc-425e-b5b2-e892c24113a3",
178
      "id": "0104f31b-7abc-425e-b5b2-e892c24113a3",
            
180
      "name": "MULTI-STAGE",
179
      "name": "MULTI-STAGE",
            
181
      "state": "active",
180
      "state": "active",
            
182
      "vocabulary_id": null
181
      "vocabulary_id": null
            
183
    },
182
    },
            
184
    {
183
    {
            
185
      "display_name": "UNEQUAL PROBABILITY",
184
      "display_name": "UNEQUAL PROBABILITY",
            
186
      "id": "ab7374b6-8cb8-4394-b06e-ce172c867317",
185
      "id": "ab7374b6-8cb8-4394-b06e-ce172c867317",
            
187
      "name": "UNEQUAL PROBABILITY",
186
      "name": "UNEQUAL PROBABILITY",
            
188
      "state": "active",
187
      "state": "active",
            
189
      "vocabulary_id": null
188
      "vocabulary_id": null
            
190
    },
189
    },
            
191
    {
190
    {
            
192
      "display_name": "VEGETATION",
191
      "display_name": "VEGETATION",
            
193
      "id": "d2f171f0-87f1-4e4a-aa7d-535d103ce617",
192
      "id": "d2f171f0-87f1-4e4a-aa7d-535d103ce617",
            
194
      "name": "VEGETATION",
193
      "name": "VEGETATION",
            
195
      "state": "active",
194
      "state": "active",
            
196
      "vocabulary_id": null
195
      "vocabulary_id": null
            
197
    }
196
    }
            
198
  ],
197
  ],
            
199
  "title": "R script and input data for \"ALL-EMA sampling design\"",
198
  "title": "R script and input data for \"ALL-EMA sampling design\"",
            
200
  "type": "dataset",
199
  "type": "dataset",
            
201
  "url": null,
200
  "url": null,
            
202
  "version": "1.0"
201
  "version": "1.0"
            
203
}
202
}