Changes

              
    

          
          
        
        

            
f
1
{
f
1
{
            
2
  "author": "[{\"affiliation\": \"Swiss Federal Research Institute for 
2
  "author": "[{\"affiliation\": \"Swiss Federal Research Institute for 
            
3
Forest, Snow and Landscape (WSL)\", \"affiliation_02\": \"ETH 
3
Forest, Snow and Landscape (WSL)\", \"affiliation_02\": \"ETH 
            
4
Zurich\", \"affiliation_03\": \"\", \"data_credit\": [\"collection\", 
4
Zurich\", \"affiliation_03\": \"\", \"data_credit\": [\"collection\", 
            
5
\"validation\", \"curation\", \"software\", \"publication\"], 
5
\"validation\", \"curation\", \"software\", \"publication\"], 
            
6
\"email\": \"alexander.skeels@usys.ethz.ch\", \"given_name\": 
6
\"email\": \"alexander.skeels@usys.ethz.ch\", \"given_name\": 
            
7
\"Alexander\", \"identifier\": \"\", \"name\": \"Skeels\"}, 
7
\"Alexander\", \"identifier\": \"\", \"name\": \"Skeels\"}, 
            
8
{\"affiliation\": \"German Centre for Integrative Biodiversity 
8
{\"affiliation\": \"German Centre for Integrative Biodiversity 
            
9
Research Halle\\u2013Jena\\u2013Leipzig\", \"affiliation_02\": \"ETH 
9
Research Halle\\u2013Jena\\u2013Leipzig\", \"affiliation_02\": \"ETH 
            
10
Zurich\", \"affiliation_03\": \"\", \"data_credit\": [\"collection\", 
10
Zurich\", \"affiliation_03\": \"\", \"data_credit\": [\"collection\", 
            
11
\"validation\", \"curation\", \"software\", \"publication\"], 
11
\"validation\", \"curation\", \"software\", \"publication\"], 
            
12
\"email\": \"oskar@hagen.bio\", \"given_name\": \"Oskar\", 
12
\"email\": \"oskar@hagen.bio\", \"given_name\": \"Oskar\", 
            
13
\"identifier\": \"0000-0002-7931-6571\", \"name\": \"Hagen\"}, 
13
\"identifier\": \"0000-0002-7931-6571\", \"name\": \"Hagen\"}, 
            
14
{\"affiliation\": \"ETH Zurich\", \"affiliation_02\": \"Swiss Federal 
14
{\"affiliation\": \"ETH Zurich\", \"affiliation_02\": \"Swiss Federal 
            
15
Research Institute for Forest, Snow and Landscape (WSL)\", 
15
Research Institute for Forest, Snow and Landscape (WSL)\", 
            
16
\"affiliation_03\": \"\", \"data_credit\": [\"collection\", 
16
\"affiliation_03\": \"\", \"data_credit\": [\"collection\", 
            
17
\"validation\", \"curation\", \"software\", \"publication\", 
17
\"validation\", \"curation\", \"software\", \"publication\", 
            
18
\"supervision\"], \"email\": \"loic.pellissier@usys.ethz.ch\", 
18
\"supervision\"], \"email\": \"loic.pellissier@usys.ethz.ch\", 
            
19
\"given_name\": \"Loic\", \"identifier\": \"\", \"name\": 
19
\"given_name\": \"Loic\", \"identifier\": \"\", \"name\": 
            
20
\"Pellissier\"}, {\"affiliation\": \"German Centre for Integrative 
20
\"Pellissier\"}, {\"affiliation\": \"German Centre for Integrative 
            
21
Biodiversity Research Halle\\u2013Jena\\u2013Leipzig\", 
21
Biodiversity Research Halle\\u2013Jena\\u2013Leipzig\", 
            
22
\"affiliation_02\": \"\", \"affiliation_03\": \"\", \"data_credit\": 
22
\"affiliation_02\": \"\", \"affiliation_03\": \"\", \"data_credit\": 
            
23
[\"collection\", \"publication\"], \"email\": 
23
[\"collection\", \"publication\"], \"email\": 
            
24
\"renske.onstein@idiv.de\", \"given_name\": \"Renske\", 
24
\"renske.onstein@idiv.de\", \"given_name\": \"Renske\", 
            
25
\"identifier\": \"0000-0002-2295-3510\", \"name\": \"Onstein\"}, 
25
\"identifier\": \"0000-0002-2295-3510\", \"name\": \"Onstein\"}, 
            
26
{\"affiliation\": \"Department of Ecology and Evolutionary Biology, 
26
{\"affiliation\": \"Department of Ecology and Evolutionary Biology, 
            
27
Yale University\", \"affiliation_02\": \"\", \"affiliation_03\": \"\", 
27
Yale University\", \"affiliation_02\": \"\", \"affiliation_03\": \"\", 
            
28
\"data_credit\": [\"collection\", \"validation\", \"publication\"], 
28
\"data_credit\": [\"collection\", \"validation\", \"publication\"], 
            
29
\"email\": \"walter.jetz@yale.edu\", \"given_name\": \"Walter\", 
29
\"email\": \"walter.jetz@yale.edu\", \"given_name\": \"Walter\", 
            
30
\"identifier\": \"0000-0002-1971-7277\", \"name\": \"Jetz\"}]",
30
\"identifier\": \"0000-0002-1971-7277\", \"name\": \"Jetz\"}]",
            
31
  "author_email": null,
31
  "author_email": null,
            
32
  "creator_user_id": "93fd6aa4-4bae-4c26-9561-c54eb9142d42",
32
  "creator_user_id": "93fd6aa4-4bae-4c26-9561-c54eb9142d42",
            
33
  "date": "[{\"date\": \"2020-04-15\", \"date_type\": \"collected\", 
33
  "date": "[{\"date\": \"2020-04-15\", \"date_type\": \"collected\", 
            
34
\"end_date\": \"2021-09-15\"}]",
34
\"end_date\": \"2021-09-15\"}]",
            
35
  "doi": "",
35
  "doi": "",
            
36
  "funding": "[{\"grant_number\": \"310030-188550\", \"institution\": 
36
  "funding": "[{\"grant_number\": \"310030-188550\", \"institution\": 
            
37
\"Schweizerischer Nationalfonds zur F\u00f6rderung der 
37
\"Schweizerischer Nationalfonds zur F\u00f6rderung der 
            
38
Wissenschaftlichen Forschung\", \"institution_url\": \"\"}]",
38
Wissenschaftlichen Forschung\", \"institution_url\": \"\"}]",
            
39
  "groups": [],
39
  "groups": [],
            
40
  "id": "b7783edd-a5bc-4854-8e7d-1698afc875b9",
40
  "id": "b7783edd-a5bc-4854-8e7d-1698afc875b9",
            
41
  "isopen": false,
41
  "isopen": false,
            
42
  "language": "en",
42
  "language": "en",
            
43
  "license_id": "wsl-data",
43
  "license_id": "wsl-data",
            
44
  "license_title": "WSL Data Policy",
44
  "license_title": "WSL Data Policy",
            
45
  "license_url": 
45
  "license_url": 
            
46
ps://www.wsl.ch/en/about-wsl/programmes-and-initiatives/envidat.html",
46
ps://www.wsl.ch/en/about-wsl/programmes-and-initiatives/envidat.html",
            
47
  "maintainer": "{\"affiliation\": \"WSL / ETH\", \"email\": 
47
  "maintainer": "{\"affiliation\": \"WSL / ETH\", \"email\": 
            
48
\"loic.pellissier@usys.ethz.ch\", \"given_name\": \"Loic\", 
48
\"loic.pellissier@usys.ethz.ch\", \"given_name\": \"Loic\", 
            
49
\"identifier\": \"\", \"name\": \"Pellissier\"}",
49
\"identifier\": \"\", \"name\": \"Pellissier\"}",
            
50
  "maintainer_email": null,
50
  "maintainer_email": null,
            
51
  "metadata_created": "2021-09-15T11:44:16.660831",
51
  "metadata_created": "2021-09-15T11:44:16.660831",
            
n
52
  "metadata_modified": "2021-09-15T11:55:28.633213",
n
52
  "metadata_modified": "2021-09-15T11:55:28.777168",
            
53
  "name": "data-from-hagen_etal_pnas",
53
  "name": "data-from-hagen_etal_pnas",
            
54
  "notes": "Datasets and R scripts 
54
  "notes": "Datasets and R scripts 
            
55
\r\n\r\n~~~~~Datasets\r\n\r\nDataset_S1.csv includes species diversity 
55
\r\n\r\n~~~~~Datasets\r\n\r\nDataset_S1.csv includes species diversity 
            
56
counts for 237 clades in tropical moist forests (TMF) in the 
56
counts for 237 clades in tropical moist forests (TMF) in the 
            
57
Neotropics (NeotropicalTMF), Indomalaya (IndomalayanTMF), Afrotropics 
57
Neotropics (NeotropicalTMF), Indomalaya (IndomalayanTMF), Afrotropics 
            
58
(AfrotropicalTMF), All three TMF regions together (AllTMF), all 
58
(AfrotropicalTMF), All three TMF regions together (AllTMF), all 
            
59
non-TMF regions (NonTMF), and in total (Total). As well as whether the 
59
non-TMF regions (NonTMF), and in total (Total). As well as whether the 
            
60
clade is pantropical  (Pantropical_clade) and shows the pantropical 
60
clade is pantropical  (Pantropical_clade) and shows the pantropical 
            
61
diversity disparity (PDD_clade). \r\n\r\nDataset_S2.csv: environmental 
61
diversity disparity (PDD_clade). \r\n\r\nDataset_S2.csv: environmental 
            
62
and species richness data. Longitude (x), latitude (y), potential 
62
and species richness data. Longitude (x), latitude (y), potential 
            
63
evapotranspiration (PET), mean annual temperature (MAT), mean annual 
63
evapotranspiration (PET), mean annual temperature (MAT), mean annual 
            
64
precipitation), amphibian, bird, mammal, and reptile species richness, 
64
precipitation), amphibian, bird, mammal, and reptile species richness, 
            
65
PC1 and PC2 of environmental PCA and the region. Environmental data 
65
PC1 and PC2 of environmental PCA and the region. Environmental data 
            
66
(from CHELSA and ENVIREM) and species richness summarised from 
66
(from CHELSA and ENVIREM) and species richness summarised from 
            
67
published data (vertLife, MOL, IUCN, GARD).\r\n\r\nDataset_S3.csv: - 
67
published data (vertLife, MOL, IUCN, GARD).\r\n\r\nDataset_S3.csv: - 
            
68
Paleoenvironmental reconstructions (details in the associated SI 
68
Paleoenvironmental reconstructions (details in the associated SI 
            
69
appendix) including latitude (y), longitude (x), and temperature data 
69
appendix) including latitude (y), longitude (x), and temperature data 
            
70
across 200 myrs at 170 kyr intervals.\r\n\r\nDataset_S4.csv: 
70
across 200 myrs at 170 kyr intervals.\r\n\r\nDataset_S4.csv: 
            
71
simulation model parameters and diversity summary statistics. 
71
simulation model parameters and diversity summary statistics. 
            
72
Including rate of temperature niche evolution (Tev), temperature niche 
72
Including rate of temperature niche evolution (Tev), temperature niche 
            
73
width (TW), divergence threshold (S), Dispersal probability 
73
width (TW), divergence threshold (S), Dispersal probability 
            
74
distribution shape (WeibullShape) and information on number of extinct 
74
distribution shape (WeibullShape) and information on number of extinct 
            
75
species, number of extant species, total species, Spearman correlation 
75
species, number of extant species, total species, Spearman correlation 
            
76
coefficient between absolute latitude and species richness 
76
coefficient between absolute latitude and species richness 
            
77
(latitude_richness_cor), and diversity in the Neotropics, Indomalaya, 
77
(latitude_richness_cor), and diversity in the Neotropics, Indomalaya, 
            
78
Afrotropics. Also, whether the simulation generated pantropical 
78
Afrotropics. Also, whether the simulation generated pantropical 
            
79
distribution of species (pantropicality_index), or the pantropical 
79
distribution of species (pantropicality_index), or the pantropical 
            
80
diversity disparity (PDD_index). Finally what time step the simulation 
80
diversity disparity (PDD_index). Finally what time step the simulation 
            
81
exited at (0 for complete simulations).\r\n\r\nDataset_S5.csv: Net 
81
exited at (0 for complete simulations).\r\n\r\nDataset_S5.csv: Net 
            
82
relatedness index (NRI) in three tropical moist forest regions and 
82
relatedness index (NRI) in three tropical moist forest regions and 
            
83
associated p-values for pantropically distributed 
83
associated p-values for pantropically distributed 
            
84
taxa.\r\n\r\n~~~~~Scripts\r\n\r\nGen3sis_config_creator.R and 
84
taxa.\r\n\r\n~~~~~Scripts\r\n\r\nGen3sis_config_creator.R and 
            
85
Gen3sis_config_template.R scripts generate the configurations files to 
85
Gen3sis_config_template.R scripts generate the configurations files to 
            
86
run the simulation experiment.\r\n\r\nGLS.R R script to replicate the 
86
run the simulation experiment.\r\n\r\nGLS.R R script to replicate the 
            
87
linear modelling analyses.\r\n\r\n",
87
linear modelling analyses.\r\n\r\n",
            
88
  "num_resources": 5,
88
  "num_resources": 5,
            
89
  "num_tags": 5,
89
  "num_tags": 5,
            
90
  "organization": {
90
  "organization": {
            
91
    "approval_status": "approved",
91
    "approval_status": "approved",
            
92
    "created": "2018-12-01T11:42:44.590217",
92
    "created": "2018-12-01T11:42:44.590217",
            
93
    "description": "Our laboratory aims at understanding and 
93
    "description": "Our laboratory aims at understanding and 
            
94
forecasting the response of biodiversity to landscape changes. We 
94
forecasting the response of biodiversity to landscape changes. We 
            
95
investigate the historical responses of species to past changes such 
95
investigate the historical responses of species to past changes such 
            
96
as plate tectonics or the glaciations of the Quaternary and 
96
as plate tectonics or the glaciations of the Quaternary and 
            
97
contemporary responses to ongoing global changes. We develop spatial 
97
contemporary responses to ongoing global changes. We develop spatial 
            
98
mechanistic models of biodiversity that account for processes such as 
98
mechanistic models of biodiversity that account for processes such as 
            
99
dispersal and biotic interactions.",
99
dispersal and biotic interactions.",
            
100
    "id": "3b0fde83-e15c-4f8b-a451-9778f5309a84",
100
    "id": "3b0fde83-e15c-4f8b-a451-9778f5309a84",
            
101
    "image_url": 
101
    "image_url": 
            
102
ww.ites.ethz.ch/_jcr_content/orgLogo.imageformat.logo.1518520524.jpg",
102
ww.ites.ethz.ch/_jcr_content/orgLogo.imageformat.logo.1518520524.jpg",
            
103
    "is_organization": true,
103
    "is_organization": true,
            
104
    "name": "landscape-ecology",
104
    "name": "landscape-ecology",
            
105
    "state": "active",
105
    "state": "active",
            
106
    "title": "Landscape Ecology",
106
    "title": "Landscape Ecology",
            
107
    "type": "organization"
107
    "type": "organization"
            
108
  },
108
  },
            
109
  "owner_org": "3b0fde83-e15c-4f8b-a451-9778f5309a84",
109
  "owner_org": "3b0fde83-e15c-4f8b-a451-9778f5309a84",
            
110
  "private": false,
110
  "private": false,
            
111
  "publication": "{\"publication_year\": \"2021\", \"publisher\": 
111
  "publication": "{\"publication_year\": \"2021\", \"publisher\": 
            
112
\"EnviDat\"}",
112
\"EnviDat\"}",
            
113
  "publication_state": "",
113
  "publication_state": "",
            
114
  "related_datasets": "",
114
  "related_datasets": "",
            
115
  "related_publications": "",
115
  "related_publications": "",
            
116
  "relationships_as_object": [],
116
  "relationships_as_object": [],
            
117
  "relationships_as_subject": [],
117
  "relationships_as_subject": [],
            
118
  "resource_type": "dataset",
118
  "resource_type": "dataset",
            
119
  "resource_type_general": "dataset",
119
  "resource_type_general": "dataset",
            
120
  "resources": [
120
  "resources": [
            
121
    {
121
    {
            
122
      "cache_last_updated": null,
122
      "cache_last_updated": null,
            
123
      "cache_url": null,
123
      "cache_url": null,
            
124
      "created": "2021-09-15T11:45:27.749059",
124
      "created": "2021-09-15T11:45:27.749059",
            
125
      "description": "Gen3sis_config_creator.R and 
125
      "description": "Gen3sis_config_creator.R and 
            
126
Gen3sis_config_template.R scripts generate the configurations files to 
126
Gen3sis_config_template.R scripts generate the configurations files to 
            
127
run the simulation experiment.",
127
run the simulation experiment.",
            
128
      "doi": "",
128
      "doi": "",
            
129
      "format": "R",
129
      "format": "R",
            
130
      "hash": "",
130
      "hash": "",
            
131
      "id": "a571cd80-2302-4fd8-aa60-2c3176654bb5",
131
      "id": "a571cd80-2302-4fd8-aa60-2c3176654bb5",
            
132
      "last_modified": null,
132
      "last_modified": null,
            
133
      "metadata_modified": "2021-09-15T11:45:27.723569",
133
      "metadata_modified": "2021-09-15T11:45:27.723569",
            
134
      "mimetype": null,
134
      "mimetype": null,
            
135
      "mimetype_inner": null,
135
      "mimetype_inner": null,
            
136
      "name": "Gen3sis config creator",
136
      "name": "Gen3sis config creator",
            
137
      "package_id": "b7783edd-a5bc-4854-8e7d-1698afc875b9",
137
      "package_id": "b7783edd-a5bc-4854-8e7d-1698afc875b9",
            
138
      "position": 0,
138
      "position": 0,
            
139
      "publication_state": "",
139
      "publication_state": "",
            
140
      "resource_size": "{\"size_value\": \"\", \"size_units\": 
140
      "resource_size": "{\"size_value\": \"\", \"size_units\": 
            
141
\"kb\"}",
141
\"kb\"}",
            
142
      "resource_type": null,
142
      "resource_type": null,
            
143
      "restricted": "{\"level\": \"public\", \"allowed_users\": \"\", 
143
      "restricted": "{\"level\": \"public\", \"allowed_users\": \"\", 
            
144
\"shared_secret\": \"\"}",
144
\"shared_secret\": \"\"}",
            
145
      "size": 3070,
145
      "size": 3070,
            
146
      "state": "active",
146
      "state": "active",
            
147
      "url": 
147
      "url": 
            
148
71cd80-2302-4fd8-aa60-2c3176654bb5/download/gen3sis_config_creator.r",
148
71cd80-2302-4fd8-aa60-2c3176654bb5/download/gen3sis_config_creator.r",
            
149
      "url_type": "upload"
149
      "url_type": "upload"
            
150
    },
150
    },
            
151
    {
151
    {
            
152
      "cache_last_updated": null,
152
      "cache_last_updated": null,
            
153
      "cache_url": null,
153
      "cache_url": null,
            
154
      "created": "2021-09-15T11:48:21.670609",
154
      "created": "2021-09-15T11:48:21.670609",
            
155
      "description": "Zip folder containing:\r\n\r\nDataset_S1.csv: 
155
      "description": "Zip folder containing:\r\n\r\nDataset_S1.csv: 
            
156
includes species diversity counts for 237 clades in tropical moist 
156
includes species diversity counts for 237 clades in tropical moist 
            
157
forests (TMF) in the Neotropics (NeotropicalTMF), Indomalaya 
157
forests (TMF) in the Neotropics (NeotropicalTMF), Indomalaya 
            
158
(IndomalayanTMF), Afrotropics (AfrotropicalTMF), All three TMF regions 
158
(IndomalayanTMF), Afrotropics (AfrotropicalTMF), All three TMF regions 
            
159
together (AllTMF), all non-TMF regions (NonTMF), and in total (Total). 
159
together (AllTMF), all non-TMF regions (NonTMF), and in total (Total). 
            
160
As well as whether the clade is pantropical  (Pantropical_clade) and 
160
As well as whether the clade is pantropical  (Pantropical_clade) and 
            
161
shows the pantropical diversity disparity (PDD_clade). 
161
shows the pantropical diversity disparity (PDD_clade). 
            
162
\r\nDataset_S2.csv: environmental and species richness data. Longitude 
162
\r\nDataset_S2.csv: environmental and species richness data. Longitude 
            
163
(x), latitude (y), potential evapotranspiration (PET), mean annual 
163
(x), latitude (y), potential evapotranspiration (PET), mean annual 
            
164
temperature (MAT), mean annual precipitation), amphibian, bird, 
164
temperature (MAT), mean annual precipitation), amphibian, bird, 
            
165
mammal, and reptile species richness, PC1 and PC2 of environmental PCA 
165
mammal, and reptile species richness, PC1 and PC2 of environmental PCA 
            
166
and the region. Environmental data (from CHELSA and ENVIREM) and 
166
and the region. Environmental data (from CHELSA and ENVIREM) and 
            
167
species richness summarised from published data (vertLife, MOL, IUCN, 
167
species richness summarised from published data (vertLife, MOL, IUCN, 
            
168
GARD).\r\nDataset_S3.csv: - Paleoenvironmental reconstructions 
168
GARD).\r\nDataset_S3.csv: - Paleoenvironmental reconstructions 
            
169
(details in the associated SI appendix) including latitude (y), 
169
(details in the associated SI appendix) including latitude (y), 
            
170
longitude (x), and temperature data across 200 myrs at 170 kyr 
170
longitude (x), and temperature data across 200 myrs at 170 kyr 
            
171
intervals.\r\nDataset_S4.csv: simulation model parameters and 
171
intervals.\r\nDataset_S4.csv: simulation model parameters and 
            
172
diversity summary statistics. Including rate of temperature niche 
172
diversity summary statistics. Including rate of temperature niche 
            
173
evolution (Tev), temperature niche width (TW), divergence threshold 
173
evolution (Tev), temperature niche width (TW), divergence threshold 
            
174
(S), Dispersal probability distribution shape (WeibullShape) and 
174
(S), Dispersal probability distribution shape (WeibullShape) and 
            
175
information on number of extinct species, number of extant species, 
175
information on number of extinct species, number of extant species, 
            
176
total species, Spearman correlation coefficient between absolute 
176
total species, Spearman correlation coefficient between absolute 
            
177
latitude and species richness (latitude_richness_cor), and diversity 
177
latitude and species richness (latitude_richness_cor), and diversity 
            
178
in the Neotropics, Indomalaya, Afrotropics. Also, whether the 
178
in the Neotropics, Indomalaya, Afrotropics. Also, whether the 
            
179
simulation generated pantropical distribution of species 
179
simulation generated pantropical distribution of species 
            
180
(pantropicality_index), or the pantropical diversity disparity 
180
(pantropicality_index), or the pantropical diversity disparity 
            
181
(PDD_index). Finally what time step the simulation exited at (0 for 
181
(PDD_index). Finally what time step the simulation exited at (0 for 
            
182
complete simulations).\r\nDataset_S5.csv: Net relatedness index (NRI) 
182
complete simulations).\r\nDataset_S5.csv: Net relatedness index (NRI) 
            
183
in three tropical moist forest regions and associated p-values for 
183
in three tropical moist forest regions and associated p-values for 
            
184
pantropically distributed taxa.\r\nGen3sis_config_creator.R and 
184
pantropically distributed taxa.\r\nGen3sis_config_creator.R and 
            
185
Gen3sis_config_template.R scripts generate the configurations files to 
185
Gen3sis_config_template.R scripts generate the configurations files to 
            
186
run the simulation experiment.\r\nGLS.R R script to replicate the 
186
run the simulation experiment.\r\nGLS.R R script to replicate the 
            
187
linear modelling analyses.\r\n",
187
linear modelling analyses.\r\n",
            
188
      "doi": "",
188
      "doi": "",
            
189
      "format": ".zip",
189
      "format": ".zip",
            
190
      "hash": "",
190
      "hash": "",
            
191
      "id": "1f9cddb0-7035-4c47-84c7-e2846759f342",
191
      "id": "1f9cddb0-7035-4c47-84c7-e2846759f342",
            
192
      "last_modified": null,
192
      "last_modified": null,
            
193
      "metadata_modified": "2021-09-15T11:48:21.652594",
193
      "metadata_modified": "2021-09-15T11:48:21.652594",
            
194
      "mimetype": null,
194
      "mimetype": null,
            
195
      "mimetype_inner": null,
195
      "mimetype_inner": null,
            
196
      "name": "",
196
      "name": "",
            
197
      "package_id": "b7783edd-a5bc-4854-8e7d-1698afc875b9",
197
      "package_id": "b7783edd-a5bc-4854-8e7d-1698afc875b9",
            
198
      "position": 1,
198
      "position": 1,
            
199
      "publication_state": "",
199
      "publication_state": "",
            
200
      "resource_size": "{\"size_value\": \"\", \"size_units\": 
200
      "resource_size": "{\"size_value\": \"\", \"size_units\": 
            
201
\"kb\"}",
201
\"kb\"}",
            
202
      "resource_type": null,
202
      "resource_type": null,
            
203
      "restricted": "{\"level\": \"public\", \"allowed_users\": \"\", 
203
      "restricted": "{\"level\": \"public\", \"allowed_users\": \"\", 
            
204
\"shared_secret\": \"\"}",
204
\"shared_secret\": \"\"}",
            
205
      "size": 47630797,
205
      "size": 47630797,
            
206
      "state": "active",
206
      "state": "active",
            
207
      "url": 
207
      "url": 
            
208
esource/1f9cddb0-7035-4c47-84c7-e2846759f342/download/envidat_si.zip",
208
esource/1f9cddb0-7035-4c47-84c7-e2846759f342/download/envidat_si.zip",
            
209
      "url_type": "upload"
209
      "url_type": "upload"
            
210
    },
210
    },
            
211
    {
211
    {
            
212
      "cache_last_updated": null,
212
      "cache_last_updated": null,
            
213
      "cache_url": null,
213
      "cache_url": null,
            
214
      "created": "2021-09-15T11:51:54.396594",
214
      "created": "2021-09-15T11:51:54.396594",
            
215
      "description": "",
215
      "description": "",
            
216
      "doi": "",
216
      "doi": "",
            
217
      "format": "",
217
      "format": "",
            
218
      "hash": "",
218
      "hash": "",
            
219
      "id": "5e558880-f6fd-4ec6-ab35-e7d07180d690",
219
      "id": "5e558880-f6fd-4ec6-ab35-e7d07180d690",
            
220
      "last_modified": null,
220
      "last_modified": null,
            
221
      "metadata_modified": "2021-09-15T11:51:54.373347",
221
      "metadata_modified": "2021-09-15T11:51:54.373347",
            
222
      "mimetype": null,
222
      "mimetype": null,
            
223
      "mimetype_inner": null,
223
      "mimetype_inner": null,
            
224
      "name": "",
224
      "name": "",
            
225
      "package_id": "b7783edd-a5bc-4854-8e7d-1698afc875b9",
225
      "package_id": "b7783edd-a5bc-4854-8e7d-1698afc875b9",
            
226
      "position": 2,
226
      "position": 2,
            
227
      "publication_state": "",
227
      "publication_state": "",
            
228
      "resource_size": "{\"size_units\": \"kb\", \"size_value\": 
228
      "resource_size": "{\"size_units\": \"kb\", \"size_value\": 
            
229
\"\"}",
229
\"\"}",
            
230
      "resource_type": null,
230
      "resource_type": null,
            
231
      "restricted": "{\"allowed_users\": \"\", \"level\": \"public\", 
231
      "restricted": "{\"allowed_users\": \"\", \"level\": \"public\", 
            
232
\"shared_secret\": \"\"}",
232
\"shared_secret\": \"\"}",
            
233
      "size": null,
233
      "size": null,
            
234
      "state": "active",
234
      "state": "active",
            
235
      "url": "",
235
      "url": "",
            
236
      "url_type": null
236
      "url_type": null
            
237
    },
237
    },
            
238
    {
238
    {
            
239
      "cache_last_updated": null,
239
      "cache_last_updated": null,
            
240
      "cache_url": null,
240
      "cache_url": null,
            
241
      "created": "2021-09-15T11:53:08.187875",
241
      "created": "2021-09-15T11:53:08.187875",
            
242
      "description": "Gen3sis_config_creator.R and 
242
      "description": "Gen3sis_config_creator.R and 
            
243
Gen3sis_config_template.R scripts generate the configurations files to 
243
Gen3sis_config_template.R scripts generate the configurations files to 
            
244
run the simulation experiment.",
244
run the simulation experiment.",
            
245
      "doi": "",
245
      "doi": "",
            
246
      "format": "",
246
      "format": "",
            
247
      "hash": "",
247
      "hash": "",
            
248
      "id": "60c365f0-90a2-4001-9e46-24071dd08382",
248
      "id": "60c365f0-90a2-4001-9e46-24071dd08382",
            
249
      "last_modified": null,
249
      "last_modified": null,
            
250
      "metadata_modified": "2021-09-15T11:53:08.168593",
250
      "metadata_modified": "2021-09-15T11:53:08.168593",
            
251
      "mimetype": null,
251
      "mimetype": null,
            
252
      "mimetype_inner": null,
252
      "mimetype_inner": null,
            
253
      "name": "Gen3sis config template",
253
      "name": "Gen3sis config template",
            
254
      "package_id": "b7783edd-a5bc-4854-8e7d-1698afc875b9",
254
      "package_id": "b7783edd-a5bc-4854-8e7d-1698afc875b9",
            
255
      "position": 3,
255
      "position": 3,
            
256
      "publication_state": "",
256
      "publication_state": "",
            
257
      "resource_size": "{\"size_value\": \"\", \"size_units\": 
257
      "resource_size": "{\"size_value\": \"\", \"size_units\": 
            
258
\"kb\"}",
258
\"kb\"}",
            
259
      "resource_type": null,
259
      "resource_type": null,
            
260
      "restricted": "{\"level\": \"public\", \"allowed_users\": \"\", 
260
      "restricted": "{\"level\": \"public\", \"allowed_users\": \"\", 
            
261
\"shared_secret\": \"\"}",
261
\"shared_secret\": \"\"}",
            
262
      "size": 6345,
262
      "size": 6345,
            
263
      "state": "active",
263
      "state": "active",
            
264
      "url": 
264
      "url": 
            
265
365f0-90a2-4001-9e46-24071dd08382/download/gen3sis_config_template.r",
265
365f0-90a2-4001-9e46-24071dd08382/download/gen3sis_config_template.r",
            
266
      "url_type": "upload"
266
      "url_type": "upload"
            
267
    },
267
    },
            
268
    {
268
    {
            
269
      "cache_last_updated": null,
269
      "cache_last_updated": null,
            
270
      "cache_url": null,
270
      "cache_url": null,
            
271
      "created": "2021-09-15T11:53:49.193691",
271
      "created": "2021-09-15T11:53:49.193691",
            
272
      "description": "GLS.R R script to replicate the linear modeling 
272
      "description": "GLS.R R script to replicate the linear modeling 
            
273
analyses.",
273
analyses.",
            
274
      "doi": "",
274
      "doi": "",
            
275
      "format": "",
275
      "format": "",
            
276
      "hash": "",
276
      "hash": "",
            
277
      "id": "94e4eef9-a818-4893-a71a-eacf5b4ba867",
277
      "id": "94e4eef9-a818-4893-a71a-eacf5b4ba867",
            
278
      "last_modified": null,
278
      "last_modified": null,
            
279
      "metadata_modified": "2021-09-15T11:53:49.167409",
279
      "metadata_modified": "2021-09-15T11:53:49.167409",
            
280
      "mimetype": null,
280
      "mimetype": null,
            
281
      "mimetype_inner": null,
281
      "mimetype_inner": null,
            
282
      "name": "GLS script",
282
      "name": "GLS script",
            
283
      "package_id": "b7783edd-a5bc-4854-8e7d-1698afc875b9",
283
      "package_id": "b7783edd-a5bc-4854-8e7d-1698afc875b9",
            
284
      "position": 4,
284
      "position": 4,
            
285
      "publication_state": "",
285
      "publication_state": "",
            
286
      "resource_size": "{\"size_value\": \"\", \"size_units\": 
286
      "resource_size": "{\"size_value\": \"\", \"size_units\": 
            
287
\"kb\"}",
287
\"kb\"}",
            
288
      "resource_type": null,
288
      "resource_type": null,
            
289
      "restricted": "{\"level\": \"public\", \"allowed_users\": \"\", 
289
      "restricted": "{\"level\": \"public\", \"allowed_users\": \"\", 
            
290
\"shared_secret\": \"\"}",
290
\"shared_secret\": \"\"}",
            
291
      "size": 8705,
291
      "size": 8705,
            
292
      "state": "active",
292
      "state": "active",
            
293
      "url": 
293
      "url": 
            
294
fc875b9/resource/94e4eef9-a818-4893-a71a-eacf5b4ba867/download/gls.r",
294
fc875b9/resource/94e4eef9-a818-4893-a71a-eacf5b4ba867/download/gls.r",
            
295
      "url_type": "upload"
295
      "url_type": "upload"
            
296
    }
296
    }
            
297
  ],
297
  ],
            
298
  "spatial": "{\"type\": \"Polygon\", \"coordinates\": [[[5.95587, 
298
  "spatial": "{\"type\": \"Polygon\", \"coordinates\": [[[5.95587, 
            
299
45.81802],[5.95587, 47.80838],[10.49203, 47.80838],[10.49203, 
299
45.81802],[5.95587, 47.80838],[10.49203, 47.80838],[10.49203, 
            
300
45.81802],[5.95587, 45.81802]]]}",
300
45.81802],[5.95587, 45.81802]]]}",
            
301
  "spatial_info": "Switzerland",
301
  "spatial_info": "Switzerland",
            
t
302
  "state": "draft",
t
302
  "state": "active",
            
303
  "subtitle": "",
303
  "subtitle": "",
            
304
  "tags": [
304
  "tags": [
            
305
    {
305
    {
            
306
      "display_name": "GEN3SIS",
306
      "display_name": "GEN3SIS",
            
307
      "id": "7fd8733b-4feb-438b-a363-65cb5ce4b52a",
307
      "id": "7fd8733b-4feb-438b-a363-65cb5ce4b52a",
            
308
      "name": "GEN3SIS",
308
      "name": "GEN3SIS",
            
309
      "state": "active",
309
      "state": "active",
            
310
      "vocabulary_id": null
310
      "vocabulary_id": null
            
311
    },
311
    },
            
312
    {
312
    {
            
313
      "display_name": "MECHANISTIC MODELING",
313
      "display_name": "MECHANISTIC MODELING",
            
314
      "id": "64a80515-5864-4aee-9311-9fa9b13b8b5c",
314
      "id": "64a80515-5864-4aee-9311-9fa9b13b8b5c",
            
315
      "name": "MECHANISTIC MODELING",
315
      "name": "MECHANISTIC MODELING",
            
316
      "state": "active",
316
      "state": "active",
            
317
      "vocabulary_id": null
317
      "vocabulary_id": null
            
318
    },
318
    },
            
319
    {
319
    {
            
320
      "display_name": "PALEOCLIMATE",
320
      "display_name": "PALEOCLIMATE",
            
321
      "id": "5b2c5931-065b-49a9-89a4-b082eaf78e0e",
321
      "id": "5b2c5931-065b-49a9-89a4-b082eaf78e0e",
            
322
      "name": "PALEOCLIMATE",
322
      "name": "PALEOCLIMATE",
            
323
      "state": "active",
323
      "state": "active",
            
324
      "vocabulary_id": null
324
      "vocabulary_id": null
            
325
    },
325
    },
            
326
    {
326
    {
            
327
      "display_name": "PANTROPICAL DIVERSITY DISPARITY",
327
      "display_name": "PANTROPICAL DIVERSITY DISPARITY",
            
328
      "id": "c1a2995c-32b5-4bb6-9de7-e1f29e697791",
328
      "id": "c1a2995c-32b5-4bb6-9de7-e1f29e697791",
            
329
      "name": "PANTROPICAL DIVERSITY DISPARITY",
329
      "name": "PANTROPICAL DIVERSITY DISPARITY",
            
330
      "state": "active",
330
      "state": "active",
            
331
      "vocabulary_id": null
331
      "vocabulary_id": null
            
332
    },
332
    },
            
333
    {
333
    {
            
334
      "display_name": "PLATE TECTONICS",
334
      "display_name": "PLATE TECTONICS",
            
335
      "id": "747956ea-3953-4a5e-b63e-0eb7620dea9e",
335
      "id": "747956ea-3953-4a5e-b63e-0eb7620dea9e",
            
336
      "name": "PLATE TECTONICS",
336
      "name": "PLATE TECTONICS",
            
337
      "state": "active",
337
      "state": "active",
            
338
      "vocabulary_id": null
338
      "vocabulary_id": null
            
339
    }
339
    }
            
340
  ],
340
  ],
            
341
  "title": "Data from: Earth history events shaped the evolution of 
341
  "title": "Data from: Earth history events shaped the evolution of 
            
342
uneven biodiversity across tropical moist forests",
342
uneven biodiversity across tropical moist forests",
            
343
  "type": "dataset",
343
  "type": "dataset",
            
344
  "url": null,
344
  "url": null,
            
345
  "version": "1.0"
345
  "version": "1.0"
            
346
}
346
}