Changes

              
    

          
          
        
        

            
f
1
{
f
1
{
            
n
2
  "author": "[{\"affiliation\": \"Swiss Federal Research Institute for 
n
2
  "author": "[{\"affiliation\": \"German Centre for Integrative 
            
3
Biodiversity Research Halle\\u2013Jena\\u2013Leipzig\", 
            
4
\"affiliation_02\": \"ETH Zurich\", \"affiliation_03\": \"\", 
            
5
\"data_credit\": [\"collection\", \"validation\", \"curation\", 
            
6
\"software\", \"publication\"], \"email\": \"oskar@hagen.bio\", 
            
7
\"given_name\": \"Oskar\", \"identifier\": \"0000-0002-7931-6571\", 
            
8
\"name\": \"Hagen\"}, {\"affiliation\": \"Swiss Federal Research 
            
3
Forest, Snow and Landscape (WSL)\", \"affiliation_02\": \"ETH 
9
Institute for Forest, Snow and Landscape (WSL)\", \"affiliation_02\": 
            
4
Zurich\", \"affiliation_03\": \"\", \"data_credit\": [\"collection\", 
10
\"ETH Zurich\", \"affiliation_03\": \"\", \"data_credit\": 
            
5
\"validation\", \"curation\", \"software\", \"publication\"], 
11
[\"collection\", \"validation\", \"curation\", \"software\", 
            
6
\"email\": \"alexander.skeels@usys.ethz.ch\", \"given_name\": 
12
\"publication\"], \"email\": \"alexander.skeels@usys.ethz.ch\", 
            
7
\"Alexander\", \"identifier\": \"\", \"name\": \"Skeels\"}, 

            
8
{\"affiliation\": \"German Centre for Integrative Biodiversity 

            
9
Research Halle\\u2013Jena\\u2013Leipzig\", \"affiliation_02\": \"ETH 

            
10
Zurich\", \"affiliation_03\": \"\", \"data_credit\": [\"collection\", 

            
11
\"validation\", \"curation\", \"software\", \"publication\"], 

            
12
\"email\": \"oskar@hagen.bio\", \"given_name\": \"Oskar\", 

            
13
\"identifier\": \"0000-0002-7931-6571\", \"name\": \"Hagen\"}, 

            
14
{\"affiliation\": \"ETH Zurich\", \"affiliation_02\": \"Swiss Federal 

            
15
Research Institute for Forest, Snow and Landscape (WSL)\", 

            
16
\"affiliation_03\": \"\", \"data_credit\": [\"collection\", 

            
17
\"validation\", \"curation\", \"software\", \"publication\", 

            
18
\"supervision\"], \"email\": \"loic.pellissier@usys.ethz.ch\", 

            
19
\"given_name\": \"Loic\", \"identifier\": \"\", \"name\": 
13
\"given_name\": \"Alexander\", \"identifier\": \"\", \"name\": 
            
20
\"Pellissier\"}, {\"affiliation\": \"German Centre for Integrative 
14
\"Skeels\"}, {\"affiliation\": \"German Centre for Integrative 
            
21
Biodiversity Research Halle\\u2013Jena\\u2013Leipzig\", 
15
Biodiversity Research Halle\\u2013Jena\\u2013Leipzig\", 
            
22
\"affiliation_02\": \"\", \"affiliation_03\": \"\", \"data_credit\": 
16
\"affiliation_02\": \"\", \"affiliation_03\": \"\", \"data_credit\": 
            
23
[\"collection\", \"publication\"], \"email\": 
17
[\"collection\", \"publication\"], \"email\": 
            
24
\"renske.onstein@idiv.de\", \"given_name\": \"Renske\", 
18
\"renske.onstein@idiv.de\", \"given_name\": \"Renske\", 
            
25
\"identifier\": \"0000-0002-2295-3510\", \"name\": \"Onstein\"}, 
19
\"identifier\": \"0000-0002-2295-3510\", \"name\": \"Onstein\"}, 
            
26
{\"affiliation\": \"Department of Ecology and Evolutionary Biology, 
20
{\"affiliation\": \"Department of Ecology and Evolutionary Biology, 
            
27
Yale University\", \"affiliation_02\": \"\", \"affiliation_03\": \"\", 
21
Yale University\", \"affiliation_02\": \"\", \"affiliation_03\": \"\", 
            
28
\"data_credit\": [\"collection\", \"validation\", \"publication\"], 
22
\"data_credit\": [\"collection\", \"validation\", \"publication\"], 
            
29
\"email\": \"walter.jetz@yale.edu\", \"given_name\": \"Walter\", 
23
\"email\": \"walter.jetz@yale.edu\", \"given_name\": \"Walter\", 
            
n
30
\"identifier\": \"0000-0002-1971-7277\", \"name\": \"Jetz\"}]",
n
24
\"identifier\": \"0000-0002-1971-7277\", \"name\": \"Jetz\"}, 
            
25
{\"affiliation\": \"ETH Zurich\", \"affiliation_02\": \"Swiss Federal 
            
26
Research Institute for Forest, Snow and Landscape (WSL)\", 
            
27
\"affiliation_03\": \"\", \"data_credit\": [\"collection\", 
            
28
\"validation\", \"curation\", \"software\", \"publication\", 
            
29
\"supervision\"], \"email\": \"loic.pellissier@usys.ethz.ch\", 
            
30
\"given_name\": \"Loic\", \"identifier\": \"\", \"name\": 
            
31
\"Pellissier\"}]",
            
31
  "author_email": null,
32
  "author_email": null,
            
32
  "creator_user_id": "93fd6aa4-4bae-4c26-9561-c54eb9142d42",
33
  "creator_user_id": "93fd6aa4-4bae-4c26-9561-c54eb9142d42",
            
33
  "date": "[{\"date\": \"2020-04-15\", \"date_type\": \"collected\", 
34
  "date": "[{\"date\": \"2020-04-15\", \"date_type\": \"collected\", 
            
34
\"end_date\": \"2021-09-15\"}]",
35
\"end_date\": \"2021-09-15\"}]",
            
35
  "doi": "",
36
  "doi": "",
            
36
  "funding": "[{\"grant_number\": \"310030-188550\", \"institution\": 
37
  "funding": "[{\"grant_number\": \"310030-188550\", \"institution\": 
            
37
\"Schweizerischer Nationalfonds zur F\u00f6rderung der 
38
\"Schweizerischer Nationalfonds zur F\u00f6rderung der 
            
38
Wissenschaftlichen Forschung\", \"institution_url\": \"\"}]",
39
Wissenschaftlichen Forschung\", \"institution_url\": \"\"}]",
            
39
  "groups": [],
40
  "groups": [],
            
40
  "id": "b7783edd-a5bc-4854-8e7d-1698afc875b9",
41
  "id": "b7783edd-a5bc-4854-8e7d-1698afc875b9",
            
41
  "isopen": false,
42
  "isopen": false,
            
42
  "language": "en",
43
  "language": "en",
            
43
  "license_id": "wsl-data",
44
  "license_id": "wsl-data",
            
44
  "license_title": "WSL Data Policy",
45
  "license_title": "WSL Data Policy",
            
45
  "license_url": 
46
  "license_url": 
            
46
ps://www.wsl.ch/en/about-wsl/programmes-and-initiatives/envidat.html",
47
ps://www.wsl.ch/en/about-wsl/programmes-and-initiatives/envidat.html",
            
47
  "maintainer": "{\"affiliation\": \"WSL / ETH\", \"email\": 
48
  "maintainer": "{\"affiliation\": \"WSL / ETH\", \"email\": 
            
48
\"loic.pellissier@usys.ethz.ch\", \"given_name\": \"Loic\", 
49
\"loic.pellissier@usys.ethz.ch\", \"given_name\": \"Loic\", 
            
49
\"identifier\": \"\", \"name\": \"Pellissier\"}",
50
\"identifier\": \"\", \"name\": \"Pellissier\"}",
            
50
  "maintainer_email": null,
51
  "maintainer_email": null,
            
51
  "metadata_created": "2021-09-15T11:44:16.660831",
52
  "metadata_created": "2021-09-15T11:44:16.660831",
            
t
52
  "metadata_modified": "2021-09-15T11:55:28.777168",
t
53
  "metadata_modified": "2021-09-15T12:00:17.420190",
            
53
  "name": "data-from-hagen_etal_pnas",
54
  "name": "data-from-hagen_skeels_etal_2021_pnas",
            
54
  "notes": "Datasets and R scripts 
55
  "notes": "Datasets and R scripts 
            
55
\r\n\r\n~~~~~Datasets\r\n\r\nDataset_S1.csv includes species diversity 
56
\r\n\r\n~~~~~Datasets\r\n\r\nDataset_S1.csv includes species diversity 
            
56
counts for 237 clades in tropical moist forests (TMF) in the 
57
counts for 237 clades in tropical moist forests (TMF) in the 
            
57
Neotropics (NeotropicalTMF), Indomalaya (IndomalayanTMF), Afrotropics 
58
Neotropics (NeotropicalTMF), Indomalaya (IndomalayanTMF), Afrotropics 
            
58
(AfrotropicalTMF), All three TMF regions together (AllTMF), all 
59
(AfrotropicalTMF), All three TMF regions together (AllTMF), all 
            
59
non-TMF regions (NonTMF), and in total (Total). As well as whether the 
60
non-TMF regions (NonTMF), and in total (Total). As well as whether the 
            
60
clade is pantropical  (Pantropical_clade) and shows the pantropical 
61
clade is pantropical  (Pantropical_clade) and shows the pantropical 
            
61
diversity disparity (PDD_clade). \r\n\r\nDataset_S2.csv: environmental 
62
diversity disparity (PDD_clade). \r\n\r\nDataset_S2.csv: environmental 
            
62
and species richness data. Longitude (x), latitude (y), potential 
63
and species richness data. Longitude (x), latitude (y), potential 
            
63
evapotranspiration (PET), mean annual temperature (MAT), mean annual 
64
evapotranspiration (PET), mean annual temperature (MAT), mean annual 
            
64
precipitation), amphibian, bird, mammal, and reptile species richness, 
65
precipitation), amphibian, bird, mammal, and reptile species richness, 
            
65
PC1 and PC2 of environmental PCA and the region. Environmental data 
66
PC1 and PC2 of environmental PCA and the region. Environmental data 
            
66
(from CHELSA and ENVIREM) and species richness summarised from 
67
(from CHELSA and ENVIREM) and species richness summarised from 
            
67
published data (vertLife, MOL, IUCN, GARD).\r\n\r\nDataset_S3.csv: - 
68
published data (vertLife, MOL, IUCN, GARD).\r\n\r\nDataset_S3.csv: - 
            
68
Paleoenvironmental reconstructions (details in the associated SI 
69
Paleoenvironmental reconstructions (details in the associated SI 
            
69
appendix) including latitude (y), longitude (x), and temperature data 
70
appendix) including latitude (y), longitude (x), and temperature data 
            
70
across 200 myrs at 170 kyr intervals.\r\n\r\nDataset_S4.csv: 
71
across 200 myrs at 170 kyr intervals.\r\n\r\nDataset_S4.csv: 
            
71
simulation model parameters and diversity summary statistics. 
72
simulation model parameters and diversity summary statistics. 
            
72
Including rate of temperature niche evolution (Tev), temperature niche 
73
Including rate of temperature niche evolution (Tev), temperature niche 
            
73
width (TW), divergence threshold (S), Dispersal probability 
74
width (TW), divergence threshold (S), Dispersal probability 
            
74
distribution shape (WeibullShape) and information on number of extinct 
75
distribution shape (WeibullShape) and information on number of extinct 
            
75
species, number of extant species, total species, Spearman correlation 
76
species, number of extant species, total species, Spearman correlation 
            
76
coefficient between absolute latitude and species richness 
77
coefficient between absolute latitude and species richness 
            
77
(latitude_richness_cor), and diversity in the Neotropics, Indomalaya, 
78
(latitude_richness_cor), and diversity in the Neotropics, Indomalaya, 
            
78
Afrotropics. Also, whether the simulation generated pantropical 
79
Afrotropics. Also, whether the simulation generated pantropical 
            
79
distribution of species (pantropicality_index), or the pantropical 
80
distribution of species (pantropicality_index), or the pantropical 
            
80
diversity disparity (PDD_index). Finally what time step the simulation 
81
diversity disparity (PDD_index). Finally what time step the simulation 
            
81
exited at (0 for complete simulations).\r\n\r\nDataset_S5.csv: Net 
82
exited at (0 for complete simulations).\r\n\r\nDataset_S5.csv: Net 
            
82
relatedness index (NRI) in three tropical moist forest regions and 
83
relatedness index (NRI) in three tropical moist forest regions and 
            
83
associated p-values for pantropically distributed 
84
associated p-values for pantropically distributed 
            
84
taxa.\r\n\r\n~~~~~Scripts\r\n\r\nGen3sis_config_creator.R and 
85
taxa.\r\n\r\n~~~~~Scripts\r\n\r\nGen3sis_config_creator.R and 
            
85
Gen3sis_config_template.R scripts generate the configurations files to 
86
Gen3sis_config_template.R scripts generate the configurations files to 
            
86
run the simulation experiment.\r\n\r\nGLS.R R script to replicate the 
87
run the simulation experiment.\r\n\r\nGLS.R R script to replicate the 
            
87
linear modelling analyses.\r\n\r\n",
88
linear modelling analyses.\r\n\r\n",
            
88
  "num_resources": 5,
89
  "num_resources": 5,
            
89
  "num_tags": 5,
90
  "num_tags": 5,
            
90
  "organization": {
91
  "organization": {
            
91
    "approval_status": "approved",
92
    "approval_status": "approved",
            
92
    "created": "2018-12-01T11:42:44.590217",
93
    "created": "2018-12-01T11:42:44.590217",
            
93
    "description": "Our laboratory aims at understanding and 
94
    "description": "Our laboratory aims at understanding and 
            
94
forecasting the response of biodiversity to landscape changes. We 
95
forecasting the response of biodiversity to landscape changes. We 
            
95
investigate the historical responses of species to past changes such 
96
investigate the historical responses of species to past changes such 
            
96
as plate tectonics or the glaciations of the Quaternary and 
97
as plate tectonics or the glaciations of the Quaternary and 
            
97
contemporary responses to ongoing global changes. We develop spatial 
98
contemporary responses to ongoing global changes. We develop spatial 
            
98
mechanistic models of biodiversity that account for processes such as 
99
mechanistic models of biodiversity that account for processes such as 
            
99
dispersal and biotic interactions.",
100
dispersal and biotic interactions.",
            
100
    "id": "3b0fde83-e15c-4f8b-a451-9778f5309a84",
101
    "id": "3b0fde83-e15c-4f8b-a451-9778f5309a84",
            
101
    "image_url": 
102
    "image_url": 
            
102
ww.ites.ethz.ch/_jcr_content/orgLogo.imageformat.logo.1518520524.jpg",
103
ww.ites.ethz.ch/_jcr_content/orgLogo.imageformat.logo.1518520524.jpg",
            
103
    "is_organization": true,
104
    "is_organization": true,
            
104
    "name": "landscape-ecology",
105
    "name": "landscape-ecology",
            
105
    "state": "active",
106
    "state": "active",
            
106
    "title": "Landscape Ecology",
107
    "title": "Landscape Ecology",
            
107
    "type": "organization"
108
    "type": "organization"
            
108
  },
109
  },
            
109
  "owner_org": "3b0fde83-e15c-4f8b-a451-9778f5309a84",
110
  "owner_org": "3b0fde83-e15c-4f8b-a451-9778f5309a84",
            
110
  "private": false,
111
  "private": false,
            
111
  "publication": "{\"publication_year\": \"2021\", \"publisher\": 
112
  "publication": "{\"publication_year\": \"2021\", \"publisher\": 
            
112
\"EnviDat\"}",
113
\"EnviDat\"}",
            
113
  "publication_state": "",
114
  "publication_state": "",
            
114
  "related_datasets": "",
115
  "related_datasets": "",
            
115
  "related_publications": "",
116
  "related_publications": "",
            
116
  "relationships_as_object": [],
117
  "relationships_as_object": [],
            
117
  "relationships_as_subject": [],
118
  "relationships_as_subject": [],
            
118
  "resource_type": "dataset",
119
  "resource_type": "dataset",
            
119
  "resource_type_general": "dataset",
120
  "resource_type_general": "dataset",
            
120
  "resources": [
121
  "resources": [
            
121
    {
122
    {
            
122
      "cache_last_updated": null,
123
      "cache_last_updated": null,
            
123
      "cache_url": null,
124
      "cache_url": null,
            
124
      "created": "2021-09-15T11:45:27.749059",
125
      "created": "2021-09-15T11:45:27.749059",
            
125
      "description": "Gen3sis_config_creator.R and 
126
      "description": "Gen3sis_config_creator.R and 
            
126
Gen3sis_config_template.R scripts generate the configurations files to 
127
Gen3sis_config_template.R scripts generate the configurations files to 
            
127
run the simulation experiment.",
128
run the simulation experiment.",
            
128
      "doi": "",
129
      "doi": "",
            
129
      "format": "R",
130
      "format": "R",
            
130
      "hash": "",
131
      "hash": "",
            
131
      "id": "a571cd80-2302-4fd8-aa60-2c3176654bb5",
132
      "id": "a571cd80-2302-4fd8-aa60-2c3176654bb5",
            
132
      "last_modified": null,
133
      "last_modified": null,
            
133
      "metadata_modified": "2021-09-15T11:45:27.723569",
134
      "metadata_modified": "2021-09-15T11:45:27.723569",
            
134
      "mimetype": null,
135
      "mimetype": null,
            
135
      "mimetype_inner": null,
136
      "mimetype_inner": null,
            
136
      "name": "Gen3sis config creator",
137
      "name": "Gen3sis config creator",
            
137
      "package_id": "b7783edd-a5bc-4854-8e7d-1698afc875b9",
138
      "package_id": "b7783edd-a5bc-4854-8e7d-1698afc875b9",
            
138
      "position": 0,
139
      "position": 0,
            
139
      "publication_state": "",
140
      "publication_state": "",
            
140
      "resource_size": "{\"size_value\": \"\", \"size_units\": 
141
      "resource_size": "{\"size_value\": \"\", \"size_units\": 
            
141
\"kb\"}",
142
\"kb\"}",
            
142
      "resource_type": null,
143
      "resource_type": null,
            
143
      "restricted": "{\"level\": \"public\", \"allowed_users\": \"\", 
144
      "restricted": "{\"level\": \"public\", \"allowed_users\": \"\", 
            
144
\"shared_secret\": \"\"}",
145
\"shared_secret\": \"\"}",
            
145
      "size": 3070,
146
      "size": 3070,
            
146
      "state": "active",
147
      "state": "active",
            
147
      "url": 
148
      "url": 
            
148
71cd80-2302-4fd8-aa60-2c3176654bb5/download/gen3sis_config_creator.r",
149
71cd80-2302-4fd8-aa60-2c3176654bb5/download/gen3sis_config_creator.r",
            
149
      "url_type": "upload"
150
      "url_type": "upload"
            
150
    },
151
    },
            
151
    {
152
    {
            
152
      "cache_last_updated": null,
153
      "cache_last_updated": null,
            
153
      "cache_url": null,
154
      "cache_url": null,
            
154
      "created": "2021-09-15T11:48:21.670609",
155
      "created": "2021-09-15T11:48:21.670609",
            
155
      "description": "Zip folder containing:\r\n\r\nDataset_S1.csv: 
156
      "description": "Zip folder containing:\r\n\r\nDataset_S1.csv: 
            
156
includes species diversity counts for 237 clades in tropical moist 
157
includes species diversity counts for 237 clades in tropical moist 
            
157
forests (TMF) in the Neotropics (NeotropicalTMF), Indomalaya 
158
forests (TMF) in the Neotropics (NeotropicalTMF), Indomalaya 
            
158
(IndomalayanTMF), Afrotropics (AfrotropicalTMF), All three TMF regions 
159
(IndomalayanTMF), Afrotropics (AfrotropicalTMF), All three TMF regions 
            
159
together (AllTMF), all non-TMF regions (NonTMF), and in total (Total). 
160
together (AllTMF), all non-TMF regions (NonTMF), and in total (Total). 
            
160
As well as whether the clade is pantropical  (Pantropical_clade) and 
161
As well as whether the clade is pantropical  (Pantropical_clade) and 
            
161
shows the pantropical diversity disparity (PDD_clade). 
162
shows the pantropical diversity disparity (PDD_clade). 
            
162
\r\nDataset_S2.csv: environmental and species richness data. Longitude 
163
\r\nDataset_S2.csv: environmental and species richness data. Longitude 
            
163
(x), latitude (y), potential evapotranspiration (PET), mean annual 
164
(x), latitude (y), potential evapotranspiration (PET), mean annual 
            
164
temperature (MAT), mean annual precipitation), amphibian, bird, 
165
temperature (MAT), mean annual precipitation), amphibian, bird, 
            
165
mammal, and reptile species richness, PC1 and PC2 of environmental PCA 
166
mammal, and reptile species richness, PC1 and PC2 of environmental PCA 
            
166
and the region. Environmental data (from CHELSA and ENVIREM) and 
167
and the region. Environmental data (from CHELSA and ENVIREM) and 
            
167
species richness summarised from published data (vertLife, MOL, IUCN, 
168
species richness summarised from published data (vertLife, MOL, IUCN, 
            
168
GARD).\r\nDataset_S3.csv: - Paleoenvironmental reconstructions 
169
GARD).\r\nDataset_S3.csv: - Paleoenvironmental reconstructions 
            
169
(details in the associated SI appendix) including latitude (y), 
170
(details in the associated SI appendix) including latitude (y), 
            
170
longitude (x), and temperature data across 200 myrs at 170 kyr 
171
longitude (x), and temperature data across 200 myrs at 170 kyr 
            
171
intervals.\r\nDataset_S4.csv: simulation model parameters and 
172
intervals.\r\nDataset_S4.csv: simulation model parameters and 
            
172
diversity summary statistics. Including rate of temperature niche 
173
diversity summary statistics. Including rate of temperature niche 
            
173
evolution (Tev), temperature niche width (TW), divergence threshold 
174
evolution (Tev), temperature niche width (TW), divergence threshold 
            
174
(S), Dispersal probability distribution shape (WeibullShape) and 
175
(S), Dispersal probability distribution shape (WeibullShape) and 
            
175
information on number of extinct species, number of extant species, 
176
information on number of extinct species, number of extant species, 
            
176
total species, Spearman correlation coefficient between absolute 
177
total species, Spearman correlation coefficient between absolute 
            
177
latitude and species richness (latitude_richness_cor), and diversity 
178
latitude and species richness (latitude_richness_cor), and diversity 
            
178
in the Neotropics, Indomalaya, Afrotropics. Also, whether the 
179
in the Neotropics, Indomalaya, Afrotropics. Also, whether the 
            
179
simulation generated pantropical distribution of species 
180
simulation generated pantropical distribution of species 
            
180
(pantropicality_index), or the pantropical diversity disparity 
181
(pantropicality_index), or the pantropical diversity disparity 
            
181
(PDD_index). Finally what time step the simulation exited at (0 for 
182
(PDD_index). Finally what time step the simulation exited at (0 for 
            
182
complete simulations).\r\nDataset_S5.csv: Net relatedness index (NRI) 
183
complete simulations).\r\nDataset_S5.csv: Net relatedness index (NRI) 
            
183
in three tropical moist forest regions and associated p-values for 
184
in three tropical moist forest regions and associated p-values for 
            
184
pantropically distributed taxa.\r\nGen3sis_config_creator.R and 
185
pantropically distributed taxa.\r\nGen3sis_config_creator.R and 
            
185
Gen3sis_config_template.R scripts generate the configurations files to 
186
Gen3sis_config_template.R scripts generate the configurations files to 
            
186
run the simulation experiment.\r\nGLS.R R script to replicate the 
187
run the simulation experiment.\r\nGLS.R R script to replicate the 
            
187
linear modelling analyses.\r\n",
188
linear modelling analyses.\r\n",
            
188
      "doi": "",
189
      "doi": "",
            
189
      "format": ".zip",
190
      "format": ".zip",
            
190
      "hash": "",
191
      "hash": "",
            
191
      "id": "1f9cddb0-7035-4c47-84c7-e2846759f342",
192
      "id": "1f9cddb0-7035-4c47-84c7-e2846759f342",
            
192
      "last_modified": null,
193
      "last_modified": null,
            
193
      "metadata_modified": "2021-09-15T11:48:21.652594",
194
      "metadata_modified": "2021-09-15T11:48:21.652594",
            
194
      "mimetype": null,
195
      "mimetype": null,
            
195
      "mimetype_inner": null,
196
      "mimetype_inner": null,
            
196
      "name": "",
197
      "name": "",
            
197
      "package_id": "b7783edd-a5bc-4854-8e7d-1698afc875b9",
198
      "package_id": "b7783edd-a5bc-4854-8e7d-1698afc875b9",
            
198
      "position": 1,
199
      "position": 1,
            
199
      "publication_state": "",
200
      "publication_state": "",
            
200
      "resource_size": "{\"size_value\": \"\", \"size_units\": 
201
      "resource_size": "{\"size_value\": \"\", \"size_units\": 
            
201
\"kb\"}",
202
\"kb\"}",
            
202
      "resource_type": null,
203
      "resource_type": null,
            
203
      "restricted": "{\"level\": \"public\", \"allowed_users\": \"\", 
204
      "restricted": "{\"level\": \"public\", \"allowed_users\": \"\", 
            
204
\"shared_secret\": \"\"}",
205
\"shared_secret\": \"\"}",
            
205
      "size": 47630797,
206
      "size": 47630797,
            
206
      "state": "active",
207
      "state": "active",
            
207
      "url": 
208
      "url": 
            
208
esource/1f9cddb0-7035-4c47-84c7-e2846759f342/download/envidat_si.zip",
209
esource/1f9cddb0-7035-4c47-84c7-e2846759f342/download/envidat_si.zip",
            
209
      "url_type": "upload"
210
      "url_type": "upload"
            
210
    },
211
    },
            
211
    {
212
    {
            
212
      "cache_last_updated": null,
213
      "cache_last_updated": null,
            
213
      "cache_url": null,
214
      "cache_url": null,
            
214
      "created": "2021-09-15T11:51:54.396594",
215
      "created": "2021-09-15T11:51:54.396594",
            
215
      "description": "",
216
      "description": "",
            
216
      "doi": "",
217
      "doi": "",
            
217
      "format": "",
218
      "format": "",
            
218
      "hash": "",
219
      "hash": "",
            
219
      "id": "5e558880-f6fd-4ec6-ab35-e7d07180d690",
220
      "id": "5e558880-f6fd-4ec6-ab35-e7d07180d690",
            
220
      "last_modified": null,
221
      "last_modified": null,
            
221
      "metadata_modified": "2021-09-15T11:51:54.373347",
222
      "metadata_modified": "2021-09-15T11:51:54.373347",
            
222
      "mimetype": null,
223
      "mimetype": null,
            
223
      "mimetype_inner": null,
224
      "mimetype_inner": null,
            
224
      "name": "",
225
      "name": "",
            
225
      "package_id": "b7783edd-a5bc-4854-8e7d-1698afc875b9",
226
      "package_id": "b7783edd-a5bc-4854-8e7d-1698afc875b9",
            
226
      "position": 2,
227
      "position": 2,
            
227
      "publication_state": "",
228
      "publication_state": "",
            
228
      "resource_size": "{\"size_units\": \"kb\", \"size_value\": 
229
      "resource_size": "{\"size_units\": \"kb\", \"size_value\": 
            
229
\"\"}",
230
\"\"}",
            
230
      "resource_type": null,
231
      "resource_type": null,
            
231
      "restricted": "{\"allowed_users\": \"\", \"level\": \"public\", 
232
      "restricted": "{\"allowed_users\": \"\", \"level\": \"public\", 
            
232
\"shared_secret\": \"\"}",
233
\"shared_secret\": \"\"}",
            
233
      "size": null,
234
      "size": null,
            
234
      "state": "active",
235
      "state": "active",
            
235
      "url": "",
236
      "url": "",
            
236
      "url_type": null
237
      "url_type": null
            
237
    },
238
    },
            
238
    {
239
    {
            
239
      "cache_last_updated": null,
240
      "cache_last_updated": null,
            
240
      "cache_url": null,
241
      "cache_url": null,
            
241
      "created": "2021-09-15T11:53:08.187875",
242
      "created": "2021-09-15T11:53:08.187875",
            
242
      "description": "Gen3sis_config_creator.R and 
243
      "description": "Gen3sis_config_creator.R and 
            
243
Gen3sis_config_template.R scripts generate the configurations files to 
244
Gen3sis_config_template.R scripts generate the configurations files to 
            
244
run the simulation experiment.",
245
run the simulation experiment.",
            
245
      "doi": "",
246
      "doi": "",
            
246
      "format": "",
247
      "format": "",
            
247
      "hash": "",
248
      "hash": "",
            
248
      "id": "60c365f0-90a2-4001-9e46-24071dd08382",
249
      "id": "60c365f0-90a2-4001-9e46-24071dd08382",
            
249
      "last_modified": null,
250
      "last_modified": null,
            
250
      "metadata_modified": "2021-09-15T11:53:08.168593",
251
      "metadata_modified": "2021-09-15T11:53:08.168593",
            
251
      "mimetype": null,
252
      "mimetype": null,
            
252
      "mimetype_inner": null,
253
      "mimetype_inner": null,
            
253
      "name": "Gen3sis config template",
254
      "name": "Gen3sis config template",
            
254
      "package_id": "b7783edd-a5bc-4854-8e7d-1698afc875b9",
255
      "package_id": "b7783edd-a5bc-4854-8e7d-1698afc875b9",
            
255
      "position": 3,
256
      "position": 3,
            
256
      "publication_state": "",
257
      "publication_state": "",
            
257
      "resource_size": "{\"size_value\": \"\", \"size_units\": 
258
      "resource_size": "{\"size_value\": \"\", \"size_units\": 
            
258
\"kb\"}",
259
\"kb\"}",
            
259
      "resource_type": null,
260
      "resource_type": null,
            
260
      "restricted": "{\"level\": \"public\", \"allowed_users\": \"\", 
261
      "restricted": "{\"level\": \"public\", \"allowed_users\": \"\", 
            
261
\"shared_secret\": \"\"}",
262
\"shared_secret\": \"\"}",
            
262
      "size": 6345,
263
      "size": 6345,
            
263
      "state": "active",
264
      "state": "active",
            
264
      "url": 
265
      "url": 
            
265
365f0-90a2-4001-9e46-24071dd08382/download/gen3sis_config_template.r",
266
365f0-90a2-4001-9e46-24071dd08382/download/gen3sis_config_template.r",
            
266
      "url_type": "upload"
267
      "url_type": "upload"
            
267
    },
268
    },
            
268
    {
269
    {
            
269
      "cache_last_updated": null,
270
      "cache_last_updated": null,
            
270
      "cache_url": null,
271
      "cache_url": null,
            
271
      "created": "2021-09-15T11:53:49.193691",
272
      "created": "2021-09-15T11:53:49.193691",
            
272
      "description": "GLS.R R script to replicate the linear modeling 
273
      "description": "GLS.R R script to replicate the linear modeling 
            
273
analyses.",
274
analyses.",
            
274
      "doi": "",
275
      "doi": "",
            
275
      "format": "",
276
      "format": "",
            
276
      "hash": "",
277
      "hash": "",
            
277
      "id": "94e4eef9-a818-4893-a71a-eacf5b4ba867",
278
      "id": "94e4eef9-a818-4893-a71a-eacf5b4ba867",
            
278
      "last_modified": null,
279
      "last_modified": null,
            
279
      "metadata_modified": "2021-09-15T11:53:49.167409",
280
      "metadata_modified": "2021-09-15T11:53:49.167409",
            
280
      "mimetype": null,
281
      "mimetype": null,
            
281
      "mimetype_inner": null,
282
      "mimetype_inner": null,
            
282
      "name": "GLS script",
283
      "name": "GLS script",
            
283
      "package_id": "b7783edd-a5bc-4854-8e7d-1698afc875b9",
284
      "package_id": "b7783edd-a5bc-4854-8e7d-1698afc875b9",
            
284
      "position": 4,
285
      "position": 4,
            
285
      "publication_state": "",
286
      "publication_state": "",
            
286
      "resource_size": "{\"size_value\": \"\", \"size_units\": 
287
      "resource_size": "{\"size_value\": \"\", \"size_units\": 
            
287
\"kb\"}",
288
\"kb\"}",
            
288
      "resource_type": null,
289
      "resource_type": null,
            
289
      "restricted": "{\"level\": \"public\", \"allowed_users\": \"\", 
290
      "restricted": "{\"level\": \"public\", \"allowed_users\": \"\", 
            
290
\"shared_secret\": \"\"}",
291
\"shared_secret\": \"\"}",
            
291
      "size": 8705,
292
      "size": 8705,
            
292
      "state": "active",
293
      "state": "active",
            
293
      "url": 
294
      "url": 
            
294
fc875b9/resource/94e4eef9-a818-4893-a71a-eacf5b4ba867/download/gls.r",
295
fc875b9/resource/94e4eef9-a818-4893-a71a-eacf5b4ba867/download/gls.r",
            
295
      "url_type": "upload"
296
      "url_type": "upload"
            
296
    }
297
    }
            
297
  ],
298
  ],
            
298
  "spatial": "{\"type\": \"Polygon\", \"coordinates\": [[[5.95587, 
299
  "spatial": "{\"type\": \"Polygon\", \"coordinates\": [[[5.95587, 
            
299
45.81802],[5.95587, 47.80838],[10.49203, 47.80838],[10.49203, 
300
45.81802],[5.95587, 47.80838],[10.49203, 47.80838],[10.49203, 
            
300
45.81802],[5.95587, 45.81802]]]}",
301
45.81802],[5.95587, 45.81802]]]}",
            
301
  "spatial_info": "Switzerland",
302
  "spatial_info": "Switzerland",
            
302
  "state": "active",
303
  "state": "active",
            
303
  "subtitle": "",
304
  "subtitle": "",
            
304
  "tags": [
305
  "tags": [
            
305
    {
306
    {
            
306
      "display_name": "GEN3SIS",
307
      "display_name": "GEN3SIS",
            
307
      "id": "7fd8733b-4feb-438b-a363-65cb5ce4b52a",
308
      "id": "7fd8733b-4feb-438b-a363-65cb5ce4b52a",
            
308
      "name": "GEN3SIS",
309
      "name": "GEN3SIS",
            
309
      "state": "active",
310
      "state": "active",
            
310
      "vocabulary_id": null
311
      "vocabulary_id": null
            
311
    },
312
    },
            
312
    {
313
    {
            
313
      "display_name": "MECHANISTIC MODELING",
314
      "display_name": "MECHANISTIC MODELING",
            
314
      "id": "64a80515-5864-4aee-9311-9fa9b13b8b5c",
315
      "id": "64a80515-5864-4aee-9311-9fa9b13b8b5c",
            
315
      "name": "MECHANISTIC MODELING",
316
      "name": "MECHANISTIC MODELING",
            
316
      "state": "active",
317
      "state": "active",
            
317
      "vocabulary_id": null
318
      "vocabulary_id": null
            
318
    },
319
    },
            
319
    {
320
    {
            
320
      "display_name": "PALEOCLIMATE",
321
      "display_name": "PALEOCLIMATE",
            
321
      "id": "5b2c5931-065b-49a9-89a4-b082eaf78e0e",
322
      "id": "5b2c5931-065b-49a9-89a4-b082eaf78e0e",
            
322
      "name": "PALEOCLIMATE",
323
      "name": "PALEOCLIMATE",
            
323
      "state": "active",
324
      "state": "active",
            
324
      "vocabulary_id": null
325
      "vocabulary_id": null
            
325
    },
326
    },
            
326
    {
327
    {
            
327
      "display_name": "PANTROPICAL DIVERSITY DISPARITY",
328
      "display_name": "PANTROPICAL DIVERSITY DISPARITY",
            
328
      "id": "c1a2995c-32b5-4bb6-9de7-e1f29e697791",
329
      "id": "c1a2995c-32b5-4bb6-9de7-e1f29e697791",
            
329
      "name": "PANTROPICAL DIVERSITY DISPARITY",
330
      "name": "PANTROPICAL DIVERSITY DISPARITY",
            
330
      "state": "active",
331
      "state": "active",
            
331
      "vocabulary_id": null
332
      "vocabulary_id": null
            
332
    },
333
    },
            
333
    {
334
    {
            
334
      "display_name": "PLATE TECTONICS",
335
      "display_name": "PLATE TECTONICS",
            
335
      "id": "747956ea-3953-4a5e-b63e-0eb7620dea9e",
336
      "id": "747956ea-3953-4a5e-b63e-0eb7620dea9e",
            
336
      "name": "PLATE TECTONICS",
337
      "name": "PLATE TECTONICS",
            
337
      "state": "active",
338
      "state": "active",
            
338
      "vocabulary_id": null
339
      "vocabulary_id": null
            
339
    }
340
    }
            
340
  ],
341
  ],
            
341
  "title": "Data from: Earth history events shaped the evolution of 
342
  "title": "Data from: Earth history events shaped the evolution of 
            
342
uneven biodiversity across tropical moist forests",
343
uneven biodiversity across tropical moist forests",
            
343
  "type": "dataset",
344
  "type": "dataset",
            
344
  "url": null,
345
  "url": null,
            
345
  "version": "1.0"
346
  "version": "1.0"
            
346
}
347
}