Changes

              
    

          
          
        
        

            
f
1
{
f
1
{
            
2
  "author": "[{\"given_name\": \"Marion\", \"name\": \"Muff\", 
2
  "author": "[{\"given_name\": \"Marion\", \"name\": \"Muff\", 
            
3
\"email\": \"muffm@student.ethz.ch\", \"data_credit\": [], 
3
\"email\": \"muffm@student.ethz.ch\", \"data_credit\": [], 
            
4
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"ETHZ\"}, {\"given_name\": 
4
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"ETHZ\"}, {\"given_name\": 
            
5
\"Melissa\", \"name\": \"Jaquier\", \"email\": 
5
\"Melissa\", \"name\": \"Jaquier\", \"email\": 
            
6
\"melissa@jaquier.blue\", \"data_credit\": [], \"identifier\": \"\", 
6
\"melissa@jaquier.blue\", \"data_credit\": [], \"identifier\": \"\", 
            
7
\"affiliation\": \"ETHZ\"}, {\"given_name\": \"Virginie\", \"name\": 
7
\"affiliation\": \"ETHZ\"}, {\"given_name\": \"Virginie\", \"name\": 
            
8
\"Marques\", \"email\": \"virginie.marques@wsl.ch\", \"data_credit\": 
8
\"Marques\", \"email\": \"virginie.marques@wsl.ch\", \"data_credit\": 
            
9
[]}, {\"given_name\": \"Laurent\", \"name\": \"Ballesta\", \"email\": 
9
[]}, {\"given_name\": \"Laurent\", \"name\": \"Ballesta\", \"email\": 
            
10
\"laurent.ballesta@andromede.fr\", \"data_credit\": [], 
10
\"laurent.ballesta@andromede.fr\", \"data_credit\": [], 
            
11
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"Andromede\"}, 
11
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"Andromede\"}, 
            
12
{\"given_name\": \"Julie\", \"name\": \"Deter\", \"email\": 
12
{\"given_name\": \"Julie\", \"name\": \"Deter\", \"email\": 
            
13
\"julie.deter@andromede-ocean.com\", \"data_credit\": [], 
13
\"julie.deter@andromede-ocean.com\", \"data_credit\": [], 
            
14
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"Andromede\"}, 
14
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"Andromede\"}, 
            
15
{\"given_name\": \"Thomas\", \"name\": \"Bockel\", \"email\": 
15
{\"given_name\": \"Thomas\", \"name\": \"Bockel\", \"email\": 
            
16
\"thomas.bockel@andromede-ocean.com\", \"data_credit\": [], 
16
\"thomas.bockel@andromede-ocean.com\", \"data_credit\": [], 
            
17
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"Andromede\"}, 
17
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"Andromede\"}, 
            
18
{\"given_name\": \"R\\u00e9gis\", \"name\": \"Hocd\\u00e9\", 
18
{\"given_name\": \"R\\u00e9gis\", \"name\": \"Hocd\\u00e9\", 
            
19
\"email\": \"regis.hocde@ird.fr\", \"data_credit\": [], 
19
\"email\": \"regis.hocde@ird.fr\", \"data_credit\": [], 
            
20
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"IRD\"}, {\"given_name\": 
20
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"IRD\"}, {\"given_name\": 
            
21
\"Jean-Baptiste\", \"name\": \"Juhel\", \"email\": 
21
\"Jean-Baptiste\", \"name\": \"Juhel\", \"email\": 
            
22
\"jeanbaptiste.juhel@gmail.com\", \"data_credit\": [], \"identifier\": 
22
\"jeanbaptiste.juhel@gmail.com\", \"data_credit\": [], \"identifier\": 
            
23
\"\", \"affiliation\": \"University of Montpellier\"}, 
23
\"\", \"affiliation\": \"University of Montpellier\"}, 
            
24
{\"given_name\": \"Emilie\", \"name\": \"Boulanger\", \"email\": 
24
{\"given_name\": \"Emilie\", \"name\": \"Boulanger\", \"email\": 
            
25
\"Emilie.boulanger@hotmail.com\", \"data_credit\": [], \"identifier\": 
25
\"Emilie.boulanger@hotmail.com\", \"data_credit\": [], \"identifier\": 
            
26
\"\", \"affiliation\": \"University of Montpellier\"}, 
26
\"\", \"affiliation\": \"University of Montpellier\"}, 
            
27
{\"given_name\": \"Nacim\", \"name\": \"Guellati\", \"email\": 
27
{\"given_name\": \"Nacim\", \"name\": \"Guellati\", \"email\": 
            
28
\"nacim.guellati.1997@gmail.com\", \"data_credit\": [], 
28
\"nacim.guellati.1997@gmail.com\", \"data_credit\": [], 
            
29
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"University of Montpellier\"}, 
29
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"University of Montpellier\"}, 
            
30
{\"given_name\": \"Andrea\", \"name\": \"Polanco\", \"email\": 
30
{\"given_name\": \"Andrea\", \"name\": \"Polanco\", \"email\": 
            
31
\"andrea.polanco@gmail.com\", \"data_credit\": [], \"identifier\": 
31
\"andrea.polanco@gmail.com\", \"data_credit\": [], \"identifier\": 
            
32
\"\", \"affiliation\": \"Biodiversa Colombia Foundation, Colombia\"}, 
32
\"\", \"affiliation\": \"Biodiversa Colombia Foundation, Colombia\"}, 
            
33
{\"given_name\": \"Alice\", \"name\": \"Valentini\", \"email\": 
33
{\"given_name\": \"Alice\", \"name\": \"Valentini\", \"email\": 
            
34
\"alice.valentini@spygen.com\", \"data_credit\": [], \"identifier\": 
34
\"alice.valentini@spygen.com\", \"data_credit\": [], \"identifier\": 
            
35
\"\", \"affiliation\": \"SPYGEN\"}, {\"given_name\": \"Tony\", 
35
\"\", \"affiliation\": \"SPYGEN\"}, {\"given_name\": \"Tony\", 
            
36
\"name\": \"Dejean\", \"email\": \"tony.dejean@spygen.com\", 
36
\"name\": \"Dejean\", \"email\": \"tony.dejean@spygen.com\", 
            
37
\"data_credit\": [], \"identifier\": \"\", \"affiliation\": 
37
\"data_credit\": [], \"identifier\": \"\", \"affiliation\": 
            
38
\"SPYGEN\"}, {\"given_name\": \"Stephanie\", \"name\": \"Manel\", 
38
\"SPYGEN\"}, {\"given_name\": \"Stephanie\", \"name\": \"Manel\", 
            
39
\"email\": \"stephanie.manel@cefe.cnrs.fr\", \"data_credit\": [], 
39
\"email\": \"stephanie.manel@cefe.cnrs.fr\", \"data_credit\": [], 
            
40
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"EPHE\"}, {\"given_name\": 
40
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"EPHE\"}, {\"given_name\": 
            
41
\"Camille\", \"name\": \"Albouy\", \"email\": 
41
\"Camille\", \"name\": \"Albouy\", \"email\": 
            
42
\"camille.albouy@wsl.ch\", \"data_credit\": [], \"identifier\": \"\", 
42
\"camille.albouy@wsl.ch\", \"data_credit\": [], \"identifier\": \"\", 
            
43
\"affiliation\": \"Unit of Land Change Science, 7u Federal Research 
43
\"affiliation\": \"Unit of Land Change Science, 7u Federal Research 
            
44
Institute WSL, Birmensdorf, Switzerland\"}, {\"given_name\": 
44
Institute WSL, Birmensdorf, Switzerland\"}, {\"given_name\": 
            
45
\"Patrick\", \"name\": \"Durville\", \"email\": 
45
\"Patrick\", \"name\": \"Durville\", \"email\": 
            
46
\"patrick.durville.galaxea@gmail.com\", \"data_credit\": [], 
46
\"patrick.durville.galaxea@gmail.com\", \"data_credit\": [], 
            
47
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"GALAXEA\"}, {\"given_name\": 
47
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"GALAXEA\"}, {\"given_name\": 
            
48
\"David\", \"name\": \"Mouillot\", \"email\": 
48
\"David\", \"name\": \"Mouillot\", \"email\": 
            
49
\"david.mouillot@umontpellier.fr\", \"data_credit\": [], 
49
\"david.mouillot@umontpellier.fr\", \"data_credit\": [], 
            
50
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"University of Montpellier\"}, 
50
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"University of Montpellier\"}, 
            
51
{\"given_name\": \"Florian\", \"name\": \"Holon\", \"email\": 
51
{\"given_name\": \"Florian\", \"name\": \"Holon\", \"email\": 
            
52
\"florian.holon@andromede-ocean.com\", \"data_credit\": [], 
52
\"florian.holon@andromede-ocean.com\", \"data_credit\": [], 
            
53
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"Andromede\"}, 
53
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"Andromede\"}, 
            
54
{\"given_name\": \"Loic\", \"name\": \"Pellissier\", \"email\": 
54
{\"given_name\": \"Loic\", \"name\": \"Pellissier\", \"email\": 
            
55
\"loic.pellissier@wsl.ch\", \"data_credit\": [], \"identifier\": 
55
\"loic.pellissier@wsl.ch\", \"data_credit\": [], \"identifier\": 
            
56
\"0000-0002-2289-8259\", \"affiliation\": \"Landscape Ecology, 
56
\"0000-0002-2289-8259\", \"affiliation\": \"Landscape Ecology, 
            
57
Institute of Terrestrial Ecosystems, ETH Z\\u00fcrich, 8049 
57
Institute of Terrestrial Ecosystems, ETH Z\\u00fcrich, 8049 
            
58
Z\\u00fcrich, Switzerland\"}]",
58
Z\\u00fcrich, Switzerland\"}]",
            
59
  "author_email": null,
59
  "author_email": null,
            
60
  "creator_user_id": "382d8fab-f378-477d-88f6-26f77aee50d8",
60
  "creator_user_id": "382d8fab-f378-477d-88f6-26f77aee50d8",
            
61
  "date": 
61
  "date": 
            
62
\":\"created\",\"date\":\"2019-10-27\",\"end_date\":\"2019-11-05\"}]",
62
\":\"created\",\"date\":\"2019-10-27\",\"end_date\":\"2019-11-05\"}]",
            
63
  "doi": "10.16904/envidat.567",
63
  "doi": "10.16904/envidat.567",
            
64
  "extras": [
64
  "extras": [
            
65
    {
65
    {
            
66
      "key": "edna_type",
66
      "key": "edna_type",
            
67
      "value": "marine"
67
      "value": "marine"
            
68
    },
68
    },
            
69
    {
69
    {
            
70
      "key": "metadata",
70
      "key": "metadata",
            
71
      "value": 
71
      "value": 
            
72
ma_fr/ma_fr_lapero_2019/metadata/metadata_field_ma_fr_lapero_2019.csv"
72
ma_fr/ma_fr_lapero_2019/metadata/metadata_field_ma_fr_lapero_2019.csv"
            
73
    }
73
    }
            
74
  ],
74
  ],
            
75
  "funding": "[{\"institution\":\"Internal Funding ELE group 
75
  "funding": "[{\"institution\":\"Internal Funding ELE group 
            
76
nt_number\":\"\",\"institution_url\":\"\"},{\"institution\":\"Internal 
76
nt_number\":\"\",\"institution_url\":\"\"},{\"institution\":\"Internal 
            
77
funding Andromede\",\"grant_number\":\"\",\"institution_url\":\"\"}]",
77
funding Andromede\",\"grant_number\":\"\",\"institution_url\":\"\"}]",
            
78
  "groups": [
78
  "groups": [
            
79
    {
79
    {
            
80
      "description": "",
80
      "description": "",
            
81
      "display_name": "eDNA",
81
      "display_name": "eDNA",
            
82
      "id": "c2176351-3002-4d7a-b2aa-d8509f7dbfbe",
82
      "id": "c2176351-3002-4d7a-b2aa-d8509f7dbfbe",
            
83
      "image_display_url": "",
83
      "image_display_url": "",
            
84
      "name": "edna",
84
      "name": "edna",
            
85
      "title": "eDNA"
85
      "title": "eDNA"
            
86
    }
86
    }
            
87
  ],
87
  ],
            
88
  "id": "27331019-15d4-41c5-b9e4-866c6bc0a96a",
88
  "id": "27331019-15d4-41c5-b9e4-866c6bc0a96a",
            
89
  "isopen": true,
89
  "isopen": true,
            
90
  "license_id": "cc-by",
90
  "license_id": "cc-by",
            
91
  "license_title": "Creative Commons Attribution",
91
  "license_title": "Creative Commons Attribution",
            
92
  "license_url": "https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/",
92
  "license_url": "https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/",
            
93
  "maintainer": 
93
  "maintainer": 
            
94
e.marques@wsl.ch\",\"given_name\":\"Virginie\",\"name\":\"Marques\"}",
94
e.marques@wsl.ch\",\"given_name\":\"Virginie\",\"name\":\"Marques\"}",
            
95
  "maintainer_email": null,
95
  "maintainer_email": null,
            
96
  "metadata_created": "2024-12-10T15:08:00.727653",
96
  "metadata_created": "2024-12-10T15:08:00.727653",
            
n
97
  "metadata_modified": "2024-12-11T12:02:09.086005",
n
97
  "metadata_modified": "2024-12-12T13:27:56.891048",
            
98
  "name": "environmental-dna-marine-france-laperouse-2019",
98
  "name": "environmental-dna-marine-france-laperouse-2019",
            
99
  "notes": "Fish environmental DNA data set collected in the shallow 
99
  "notes": "Fish environmental DNA data set collected in the shallow 
            
100
seamount of La P\u00e9rouse located between Madagascar and 
100
seamount of La P\u00e9rouse located between Madagascar and 
            
101
R\u00e9union Island \n\n\nIn 2019, we sampled the shallow seamount of 
101
R\u00e9union Island \n\n\nIn 2019, we sampled the shallow seamount of 
            
102
La P\u00e9rouse, located between Madagascar and R\u00e9union Island in 
102
La P\u00e9rouse, located between Madagascar and R\u00e9union Island in 
            
103
the WIO. La P\u00e9rouse is an extinct volcano with a summit depth at 
103
the WIO. La P\u00e9rouse is an extinct volcano with a summit depth at 
            
104
60\u2009m below the sea surface. The plateau of the summit has a 
104
60\u2009m below the sea surface. The plateau of the summit has a 
            
105
maximum length of 12\u2009km and a maximum width of 4 km. One side of 
105
maximum length of 12\u2009km and a maximum width of 4 km. One side of 
            
106
the seamount might have collapsed in the past, leading to a less 
106
the seamount might have collapsed in the past, leading to a less 
            
107
common crescent-shaped summit. The abyssal plains that surround this 
107
common crescent-shaped summit. The abyssal plains that surround this 
            
108
isolated pinnacle are at a depth of 5000\u2009m. Despite its proximity 
108
isolated pinnacle are at a depth of 5000\u2009m. Despite its proximity 
            
109
to R\u00e9union Island (160\u2009km northwest), La P\u00e9rouse and 
109
to R\u00e9union Island (160\u2009km northwest), La P\u00e9rouse and 
            
110
its surroundings are still poorly studied.\n\nTo sample eDNA in this 
110
its surroundings are still poorly studied.\n\nTo sample eDNA in this 
            
111
location we used a submersible pump (Subspace, Geneva, Switzerland; 
111
location we used a submersible pump (Subspace, Geneva, Switzerland; 
            
112
nominal flow of ~\u20091.0 L/min) to collect samples at various depths 
112
nominal flow of ~\u20091.0 L/min) to collect samples at various depths 
            
113
during close circuit rebreather dives. The pump has an internal 
113
during close circuit rebreather dives. The pump has an internal 
            
114
battery and can be activated underwater allowing in situ filtration 
114
battery and can be activated underwater allowing in situ filtration 
            
115
directly at the targeted habitat and depth. The filtration lasted for 
115
directly at the targeted habitat and depth. The filtration lasted for 
            
116
30\u2009min to collect a total water volume of ~\u200930\u2009L. 
116
30\u2009min to collect a total water volume of ~\u200930\u2009L. 
            
117
During close circuit rebreather dives, water samples from various 
117
During close circuit rebreather dives, water samples from various 
            
118
depths, ranging from 60 to 140\u2009m below the sea surface, were 
118
depths, ranging from 60 to 140\u2009m below the sea surface, were 
            
119
collected using only the Submersible method (eight stations: no 
119
collected using only the Submersible method (eight stations: no 
            
120
replicates). Out of the eight water samples, six were collected during 
120
replicates). Out of the eight water samples, six were collected during 
            
121
the day, while two were collected at night (IS2_1 at 62\u2009m and 
121
the day, while two were collected at night (IS2_1 at 62\u2009m and 
            
122
IS7_1 at 100\u2013125\u2009m). We applied this filtration protocols to 
122
IS7_1 at 100\u2013125\u2009m). We applied this filtration protocols to 
            
123
collect and filter water throughout a VigiDNA\u00ae 0.2 \u03bcM 
123
collect and filter water throughout a VigiDNA\u00ae 0.2 \u03bcM 
            
124
cross-flow filtration capsule (SPYGEN, le Bourget du Lac, France) 
124
cross-flow filtration capsule (SPYGEN, le Bourget du Lac, France) 
            
125
using disposable sterile tubing for each filtration capsule. After the 
125
using disposable sterile tubing for each filtration capsule. After the 
            
126
filtration process, the remaining water in the capsules was emptied. 
126
filtration process, the remaining water in the capsules was emptied. 
            
127
The capsules were then filled with 80\u2009ml of lysis conservation 
127
The capsules were then filled with 80\u2009ml of lysis conservation 
            
128
buffer (CL1 buffer SPYGEN, le Bourget du Lac, France) and stored at 
128
buffer (CL1 buffer SPYGEN, le Bourget du Lac, France) and stored at 
            
129
room temperature in the dark. At La P\u00e9rouse, a total of eight 
129
room temperature in the dark. At La P\u00e9rouse, a total of eight 
            
130
water samples were collected during the MONT LA P\u00c9ROUSE 
130
water samples were collected during the MONT LA P\u00c9ROUSE 
            
131
expedition (https://gombessa-expeditions.com/mont-la-perouse/) on 
131
expedition (https://gombessa-expeditions.com/mont-la-perouse/) on 
            
132
board the ship La Curieuse to the seamount La P\u00e9rouse from 
132
board the ship La Curieuse to the seamount La P\u00e9rouse from 
            
133
October 27th to November 5th 2019. We followed a strict contamination 
133
October 27th to November 5th 2019. We followed a strict contamination 
            
134
control protocol in both field and laboratory stages. Each water 
134
control protocol in both field and laboratory stages. Each water 
            
135
sample processing included the use of disposable gloves and single-use 
135
sample processing included the use of disposable gloves and single-use 
            
136
filtration equipment to avoid any risk of contamination. Libraries 
136
filtration equipment to avoid any risk of contamination. Libraries 
            
137
were prepared with ligation using the MetaFast protocol 
137
were prepared with ligation using the MetaFast protocol 
            
138
(Fasteris).\n\nData content: \n\t* rawdata/: contains the raw reads 
138
(Fasteris).\n\nData content: \n\t* rawdata/: contains the raw reads 
            
139
for each individual sample. One archive contains the paired-end reads 
139
for each individual sample. One archive contains the paired-end reads 
            
140
specified by the _R1 or _R2 suffix as well as individually tagged PCR 
140
specified by the _R1 or _R2 suffix as well as individually tagged PCR 
            
141
replicates (if available) together with an archive containing all 
141
replicates (if available) together with an archive containing all 
            
142
extraction and PCR blank samples of the library. Reads have been 
142
extraction and PCR blank samples of the library. Reads have been 
            
143
demultiplexed using cutadapt but not trimmed, individual 
143
demultiplexed using cutadapt but not trimmed, individual 
            
144
demultiplexing tags and primers remain present in the sequences.  
144
demultiplexing tags and primers remain present in the sequences.  
            
145
\n\t* taxadata/: contains the table with all detected taxonomy for 
145
\n\t* taxadata/: contains the table with all detected taxonomy for 
            
146
each sample after bioinformatic processing (see Polanco et al. 2020 
146
each sample after bioinformatic processing (see Polanco et al. 2020 
            
147
for details; https://doi.org/10.1002/edn3.140) and associated field 
147
for details; https://doi.org/10.1002/edn3.140) and associated field 
            
148
metadata. \n\t* metadata/: contains two metadata files, one related to 
148
metadata. \n\t* metadata/: contains two metadata files, one related to 
            
149
the data collected in the field for each filter, and the second 
149
the data collected in the field for each filter, and the second 
            
150
related to the sequencing process in the lab (including the tag 
150
related to the sequencing process in the lab (including the tag 
            
151
sequence, library name, and marker information for each sample)\n",
151
sequence, library name, and marker information for each sample)\n",
            
152
  "num_resources": 1,
152
  "num_resources": 1,
            
153
  "num_tags": 7,
153
  "num_tags": 7,
            
154
  "organization": {
154
  "organization": {
            
155
    "approval_status": "approved",
155
    "approval_status": "approved",
            
156
    "created": "2018-12-01T11:59:01.791513",
156
    "created": "2018-12-01T11:59:01.791513",
            
157
    "description": "We are an international research team with diverse 
157
    "description": "We are an international research team with diverse 
            
158
scientific expertise and backgrounds, connected by the goal to 
158
scientific expertise and backgrounds, connected by the goal to 
            
159
understand biodiversity. We study the mechanisms that shape 
159
understand biodiversity. We study the mechanisms that shape 
            
160
biodiversity patterns across spatial and temporal scales - in both 
160
biodiversity patterns across spatial and temporal scales - in both 
            
161
terrestrial and aquatic ecosystems -\u200bsuch as mountain ranges and 
161
terrestrial and aquatic ecosystems -\u200bsuch as mountain ranges and 
            
162
tropical reefs. We use an interdisciplinary approach, whereby we 
162
tropical reefs. We use an interdisciplinary approach, whereby we 
            
163
bridge ecology, evolution, Earth history and global change.\r\nTo make 
163
bridge ecology, evolution, Earth history and global change.\r\nTo make 
            
164
these connections, we collect data through biological monitoring, 
164
these connections, we collect data through biological monitoring, 
            
165
environmental DNA methods, remote sensing, and field sampling, and use 
165
environmental DNA methods, remote sensing, and field sampling, and use 
            
166
these data to answer questions with statistical and 
166
these data to answer questions with statistical and 
            
167
process-\u200bbased models of biological diversity.\r\nOur group is 
167
process-\u200bbased models of biological diversity.\r\nOur group is 
            
168
affiliated with ETH and WSL, but is also associated with Agroscope, 
168
affiliated with ETH and WSL, but is also associated with Agroscope, 
            
169
EAWAG, the European Joint Research Centre and Vogelwarte.",
169
EAWAG, the European Joint Research Centre and Vogelwarte.",
            
170
    "id": "153392ee-d556-4b16-a330-dedb177e87f9",
170
    "id": "153392ee-d556-4b16-a330-dedb177e87f9",
            
171
    "image_url": 
171
    "image_url": 
            
172
le.ethz.ch/_jcr_content/orgbox/image.imageformat.logo.1254626489.png",
172
le.ethz.ch/_jcr_content/orgbox/image.imageformat.logo.1254626489.png",
            
173
    "is_organization": true,
173
    "is_organization": true,
            
174
    "name": "ele-group",
174
    "name": "ele-group",
            
175
    "state": "active",
175
    "state": "active",
            
176
    "title": "Ecosystems and Landscape Evolution",
176
    "title": "Ecosystems and Landscape Evolution",
            
177
    "type": "organization"
177
    "type": "organization"
            
178
  },
178
  },
            
179
  "owner_org": "153392ee-d556-4b16-a330-dedb177e87f9",
179
  "owner_org": "153392ee-d556-4b16-a330-dedb177e87f9",
            
180
  "private": false,
180
  "private": false,
            
181
  "publication": 
181
  "publication": 
            
182
"{\"publisher\":\"EnviDat\",\"publication_year\":\"2024\"}",
182
"{\"publisher\":\"EnviDat\",\"publication_year\":\"2024\"}",
            
183
  "publication_state": "published",
183
  "publication_state": "published",
            
t
184
  "related_publications": "\n Muff, M., Jaquier, M., Marques, V., 
t
184
  "related_publications": "Muff, Marion, et al. \"Environmental DNA 
            
185
Ballesta, L., Deter, J., Bockel, T., Hocd\u00e9, R., Juhel, J.-B., 

            
186
Boulanger, E., Guellati, N., Fern\u00e1ndez, A. P., Valentini, A., 

            
187
Dejean, T., Manel, S., Albouy, C., Durville, P., Mouillot, D., Holon, 

            
188
F., & Pellissier, L. (2023). Environmental DNA highlights fish 

            
189
biodiversity in mesophotic ecosystems. Environmental DNA, 5, 
185
highlights fish biodiversity in mesophotic ecosystems.\" Environ. DNA, 
            
190
56\u201372. https://doi.org/10.1002/edn3.358 ",
186
vol. 5, no. 1, 1 Jan. 2023, pp. 56-72, doi:10.1002/edn3.358.",
            
191
  "relationships_as_object": [],
187
  "relationships_as_object": [],
            
192
  "relationships_as_subject": [],
188
  "relationships_as_subject": [],
            
193
  "resource_type": "dataset",
189
  "resource_type": "dataset",
            
194
  "resource_type_general": "dataset",
190
  "resource_type_general": "dataset",
            
195
  "resources": [
191
  "resources": [
            
196
    {
192
    {
            
197
      "cache_last_updated": null,
193
      "cache_last_updated": null,
            
198
      "cache_url": null,
194
      "cache_url": null,
            
199
      "created": "2024-12-10T15:19:34.794121",
195
      "created": "2024-12-10T15:19:34.794121",
            
200
      "description": "Please use cyberduck to download for the 
196
      "description": "Please use cyberduck to download for the 
            
201
moment",
197
moment",
            
202
      "doi": "",
198
      "doi": "",
            
203
      "format": "csv + fasta",
199
      "format": "csv + fasta",
            
204
      "hash": "",
200
      "hash": "",
            
205
      "id": "add08aff-55fa-4e9d-a96f-014465c2436e",
201
      "id": "add08aff-55fa-4e9d-a96f-014465c2436e",
            
206
      "last_modified": "2024-12-10T16:20:42.072000",
202
      "last_modified": "2024-12-10T16:20:42.072000",
            
207
      "metadata_modified": "2024-12-11T12:00:15.003656",
203
      "metadata_modified": "2024-12-11T12:00:15.003656",
            
208
      "mimetype": null,
204
      "mimetype": null,
            
209
      "mimetype_inner": null,
205
      "mimetype_inner": null,
            
210
      "name": "Data access",
206
      "name": "Data access",
            
211
      "package_id": "27331019-15d4-41c5-b9e4-866c6bc0a96a",
207
      "package_id": "27331019-15d4-41c5-b9e4-866c6bc0a96a",
            
212
      "position": 0,
208
      "position": 0,
            
213
      "publication_state": "",
209
      "publication_state": "",
            
214
      "resource_size": "{\"size_units\": \"gb\", \"size_value\": 
210
      "resource_size": "{\"size_units\": \"gb\", \"size_value\": 
            
215
\"1.6\"}",
211
\"1.6\"}",
            
216
      "resource_type": null,
212
      "resource_type": null,
            
217
      "restricted": "{\"allowed_users\": \"\", \"level\": \"public\", 
213
      "restricted": "{\"allowed_users\": \"\", \"level\": \"public\", 
            
218
\"shared_secret\": \"\"}",
214
\"shared_secret\": \"\"}",
            
219
      "size": null,
215
      "size": null,
            
220
      "state": "active",
216
      "state": "active",
            
221
      "url": 
217
      "url": 
            
222
cket=https://envicloud.wsl.ch/edna/&prefix=/ma_fr/ma_fr_lapero_2019/",
218
cket=https://envicloud.wsl.ch/edna/&prefix=/ma_fr/ma_fr_lapero_2019/",
            
223
      "url_type": null
219
      "url_type": null
            
224
    }
220
    }
            
225
  ],
221
  ],
            
226
  "spatial": 
222
  "spatial": 
            
227
ies\":{\"name\":\"environmental-dna-marine-france-laperouse-2019\"}}",
223
ies\":{\"name\":\"environmental-dna-marine-france-laperouse-2019\"}}",
            
228
  "state": "active",
224
  "state": "active",
            
229
  "subtitle": "",
225
  "subtitle": "",
            
230
  "tags": [
226
  "tags": [
            
231
    {
227
    {
            
232
      "display_name": "CORAL REEF",
228
      "display_name": "CORAL REEF",
            
233
      "id": "63718352-c39f-4313-9ca3-bdb1d680dbef",
229
      "id": "63718352-c39f-4313-9ca3-bdb1d680dbef",
            
234
      "name": "CORAL REEF",
230
      "name": "CORAL REEF",
            
235
      "state": "active",
231
      "state": "active",
            
236
      "vocabulary_id": null
232
      "vocabulary_id": null
            
237
    },
233
    },
            
238
    {
234
    {
            
239
      "display_name": "ENVIRONMENTAL DNA",
235
      "display_name": "ENVIRONMENTAL DNA",
            
240
      "id": "db7d5622-d1fc-4d24-91f7-73842c6743b6",
236
      "id": "db7d5622-d1fc-4d24-91f7-73842c6743b6",
            
241
      "name": "ENVIRONMENTAL DNA",
237
      "name": "ENVIRONMENTAL DNA",
            
242
      "state": "active",
238
      "state": "active",
            
243
      "vocabulary_id": null
239
      "vocabulary_id": null
            
244
    },
240
    },
            
245
    {
241
    {
            
246
      "display_name": "FISH COMPOSITION",
242
      "display_name": "FISH COMPOSITION",
            
247
      "id": "4c441df2-c810-49ad-81a3-483b6a9ff2bb",
243
      "id": "4c441df2-c810-49ad-81a3-483b6a9ff2bb",
            
248
      "name": "FISH COMPOSITION",
244
      "name": "FISH COMPOSITION",
            
249
      "state": "active",
245
      "state": "active",
            
250
      "vocabulary_id": null
246
      "vocabulary_id": null
            
251
    },
247
    },
            
252
    {
248
    {
            
253
      "display_name": "INDIAN OCEAN",
249
      "display_name": "INDIAN OCEAN",
            
254
      "id": "064cc0db-d544-453d-98f9-54b9f46fba27",
250
      "id": "064cc0db-d544-453d-98f9-54b9f46fba27",
            
255
      "name": "INDIAN OCEAN",
251
      "name": "INDIAN OCEAN",
            
256
      "state": "active",
252
      "state": "active",
            
257
      "vocabulary_id": null
253
      "vocabulary_id": null
            
258
    },
254
    },
            
259
    {
255
    {
            
260
      "display_name": "LAPEROUSE",
256
      "display_name": "LAPEROUSE",
            
261
      "id": "b5062b96-2335-4fde-b7e5-0b615d947d89",
257
      "id": "b5062b96-2335-4fde-b7e5-0b615d947d89",
            
262
      "name": "LAPEROUSE",
258
      "name": "LAPEROUSE",
            
263
      "state": "active",
259
      "state": "active",
            
264
      "vocabulary_id": null
260
      "vocabulary_id": null
            
265
    },
261
    },
            
266
    {
262
    {
            
267
      "display_name": "MARINE",
263
      "display_name": "MARINE",
            
268
      "id": "1f05d702-5580-40ac-9c9a-47127e050fa7",
264
      "id": "1f05d702-5580-40ac-9c9a-47127e050fa7",
            
269
      "name": "MARINE",
265
      "name": "MARINE",
            
270
      "state": "active",
266
      "state": "active",
            
271
      "vocabulary_id": null
267
      "vocabulary_id": null
            
272
    },
268
    },
            
273
    {
269
    {
            
274
      "display_name": "TELEO",
270
      "display_name": "TELEO",
            
275
      "id": "d67a8d9b-568f-45dc-ac71-fd05228faa6b",
271
      "id": "d67a8d9b-568f-45dc-ac71-fd05228faa6b",
            
276
      "name": "TELEO",
272
      "name": "TELEO",
            
277
      "state": "active",
273
      "state": "active",
            
278
      "vocabulary_id": null
274
      "vocabulary_id": null
            
279
    }
275
    }
            
280
  ],
276
  ],
            
281
  "title": "Environmental DNA Marine France LaPerouse 2019",
277
  "title": "Environmental DNA Marine France LaPerouse 2019",
            
282
  "type": "dataset",
278
  "type": "dataset",
            
283
  "url": null
279
  "url": null
            
284
}
280
}