Changes

              
    

          
          
        
        

            
f
1
{
f
1
{
            
2
  "author": "[{\"given_name\": \"Marion\", \"name\": \"Muff\", 
2
  "author": "[{\"given_name\": \"Marion\", \"name\": \"Muff\", 
            
3
\"email\": \"muffm@student.ethz.ch\", \"data_credit\": [], 
3
\"email\": \"muffm@student.ethz.ch\", \"data_credit\": [], 
            
4
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"ETHZ\"}, {\"given_name\": 
4
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"ETHZ\"}, {\"given_name\": 
            
5
\"Melissa\", \"name\": \"Jaquier\", \"email\": 
5
\"Melissa\", \"name\": \"Jaquier\", \"email\": 
            
6
\"melissa@jaquier.blue\", \"data_credit\": [], \"identifier\": \"\", 
6
\"melissa@jaquier.blue\", \"data_credit\": [], \"identifier\": \"\", 
            
7
\"affiliation\": \"ETHZ\"}, {\"given_name\": \"Virginie\", \"name\": 
7
\"affiliation\": \"ETHZ\"}, {\"given_name\": \"Virginie\", \"name\": 
            
8
\"Marques\", \"email\": \"virginie.marques@wsl.ch\", \"data_credit\": 
8
\"Marques\", \"email\": \"virginie.marques@wsl.ch\", \"data_credit\": 
            
9
[]}, {\"given_name\": \"Laurent\", \"name\": \"Ballesta\", \"email\": 
9
[]}, {\"given_name\": \"Laurent\", \"name\": \"Ballesta\", \"email\": 
            
10
\"laurent.ballesta@andromede.fr\", \"data_credit\": [], 
10
\"laurent.ballesta@andromede.fr\", \"data_credit\": [], 
            
11
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"Andromede\"}, 
11
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"Andromede\"}, 
            
12
{\"given_name\": \"Julie\", \"name\": \"Deter\", \"email\": 
12
{\"given_name\": \"Julie\", \"name\": \"Deter\", \"email\": 
            
13
\"julie.deter@andromede-ocean.com\", \"data_credit\": [], 
13
\"julie.deter@andromede-ocean.com\", \"data_credit\": [], 
            
14
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"Andromede\"}, 
14
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"Andromede\"}, 
            
15
{\"given_name\": \"Thomas\", \"name\": \"Bockel\", \"email\": 
15
{\"given_name\": \"Thomas\", \"name\": \"Bockel\", \"email\": 
            
16
\"thomas.bockel@andromede-ocean.com\", \"data_credit\": [], 
16
\"thomas.bockel@andromede-ocean.com\", \"data_credit\": [], 
            
17
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"Andromede\"}, 
17
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"Andromede\"}, 
            
18
{\"given_name\": \"R\\u00e9gis\", \"name\": \"Hocd\\u00e9\", 
18
{\"given_name\": \"R\\u00e9gis\", \"name\": \"Hocd\\u00e9\", 
            
19
\"email\": \"regis.hocde@ird.fr\", \"data_credit\": [], 
19
\"email\": \"regis.hocde@ird.fr\", \"data_credit\": [], 
            
20
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"IRD\"}, {\"given_name\": 
20
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"IRD\"}, {\"given_name\": 
            
21
\"Jean-Baptiste\", \"name\": \"Juhel\", \"email\": 
21
\"Jean-Baptiste\", \"name\": \"Juhel\", \"email\": 
            
22
\"jeanbaptiste.juhel@gmail.com\", \"data_credit\": [], \"identifier\": 
22
\"jeanbaptiste.juhel@gmail.com\", \"data_credit\": [], \"identifier\": 
            
23
\"\", \"affiliation\": \"University of Montpellier\"}, 
23
\"\", \"affiliation\": \"University of Montpellier\"}, 
            
24
{\"given_name\": \"Emilie\", \"name\": \"Boulanger\", \"email\": 
24
{\"given_name\": \"Emilie\", \"name\": \"Boulanger\", \"email\": 
            
25
\"Emilie.boulanger@hotmail.com\", \"data_credit\": [], \"identifier\": 
25
\"Emilie.boulanger@hotmail.com\", \"data_credit\": [], \"identifier\": 
            
26
\"\", \"affiliation\": \"University of Montpellier\"}, 
26
\"\", \"affiliation\": \"University of Montpellier\"}, 
            
27
{\"given_name\": \"Nacim\", \"name\": \"Guellati\", \"email\": 
27
{\"given_name\": \"Nacim\", \"name\": \"Guellati\", \"email\": 
            
28
\"nacim.guellati.1997@gmail.com\", \"data_credit\": [], 
28
\"nacim.guellati.1997@gmail.com\", \"data_credit\": [], 
            
29
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"University of Montpellier\"}, 
29
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"University of Montpellier\"}, 
            
30
{\"given_name\": \"Andrea\", \"name\": \"Polanco\", \"email\": 
30
{\"given_name\": \"Andrea\", \"name\": \"Polanco\", \"email\": 
            
31
\"andrea.polanco@gmail.com\", \"data_credit\": [], \"identifier\": 
31
\"andrea.polanco@gmail.com\", \"data_credit\": [], \"identifier\": 
            
32
\"\", \"affiliation\": \"Biodiversa Colombia Foundation, Colombia\"}, 
32
\"\", \"affiliation\": \"Biodiversa Colombia Foundation, Colombia\"}, 
            
33
{\"given_name\": \"Alice\", \"name\": \"Valentini\", \"email\": 
33
{\"given_name\": \"Alice\", \"name\": \"Valentini\", \"email\": 
            
34
\"alice.valentini@spygen.com\", \"data_credit\": [], \"identifier\": 
34
\"alice.valentini@spygen.com\", \"data_credit\": [], \"identifier\": 
            
35
\"\", \"affiliation\": \"SPYGEN\"}, {\"given_name\": \"Tony\", 
35
\"\", \"affiliation\": \"SPYGEN\"}, {\"given_name\": \"Tony\", 
            
36
\"name\": \"Dejean\", \"email\": \"tony.dejean@spygen.com\", 
36
\"name\": \"Dejean\", \"email\": \"tony.dejean@spygen.com\", 
            
37
\"data_credit\": [], \"identifier\": \"\", \"affiliation\": 
37
\"data_credit\": [], \"identifier\": \"\", \"affiliation\": 
            
38
\"SPYGEN\"}, {\"given_name\": \"Stephanie\", \"name\": \"Manel\", 
38
\"SPYGEN\"}, {\"given_name\": \"Stephanie\", \"name\": \"Manel\", 
            
39
\"email\": \"stephanie.manel@cefe.cnrs.fr\", \"data_credit\": [], 
39
\"email\": \"stephanie.manel@cefe.cnrs.fr\", \"data_credit\": [], 
            
40
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"EPHE\"}, {\"given_name\": 
40
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"EPHE\"}, {\"given_name\": 
            
41
\"Camille\", \"name\": \"Albouy\", \"email\": 
41
\"Camille\", \"name\": \"Albouy\", \"email\": 
            
42
\"camille.albouy@wsl.ch\", \"data_credit\": [], \"identifier\": \"\", 
42
\"camille.albouy@wsl.ch\", \"data_credit\": [], \"identifier\": \"\", 
            
43
\"affiliation\": \"Unit of Land Change Science, 7u Federal Research 
43
\"affiliation\": \"Unit of Land Change Science, 7u Federal Research 
            
44
Institute WSL, Birmensdorf, Switzerland\"}, {\"given_name\": 
44
Institute WSL, Birmensdorf, Switzerland\"}, {\"given_name\": 
            
45
\"Patrick\", \"name\": \"Durville\", \"email\": 
45
\"Patrick\", \"name\": \"Durville\", \"email\": 
            
46
\"patrick.durville.galaxea@gmail.com\", \"data_credit\": [], 
46
\"patrick.durville.galaxea@gmail.com\", \"data_credit\": [], 
            
47
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"GALAXEA\"}, {\"given_name\": 
47
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"GALAXEA\"}, {\"given_name\": 
            
48
\"David\", \"name\": \"Mouillot\", \"email\": 
48
\"David\", \"name\": \"Mouillot\", \"email\": 
            
49
\"david.mouillot@umontpellier.fr\", \"data_credit\": [], 
49
\"david.mouillot@umontpellier.fr\", \"data_credit\": [], 
            
50
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"University of Montpellier\"}, 
50
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"University of Montpellier\"}, 
            
51
{\"given_name\": \"Florian\", \"name\": \"Holon\", \"email\": 
51
{\"given_name\": \"Florian\", \"name\": \"Holon\", \"email\": 
            
52
\"florian.holon@andromede-ocean.com\", \"data_credit\": [], 
52
\"florian.holon@andromede-ocean.com\", \"data_credit\": [], 
            
53
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"Andromede\"}, 
53
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"Andromede\"}, 
            
54
{\"given_name\": \"Loic\", \"name\": \"Pellissier\", \"email\": 
54
{\"given_name\": \"Loic\", \"name\": \"Pellissier\", \"email\": 
            
55
\"loic.pellissier@wsl.ch\", \"data_credit\": [], \"identifier\": 
55
\"loic.pellissier@wsl.ch\", \"data_credit\": [], \"identifier\": 
            
56
\"0000-0002-2289-8259\", \"affiliation\": \"Landscape Ecology, 
56
\"0000-0002-2289-8259\", \"affiliation\": \"Landscape Ecology, 
            
57
Institute of Terrestrial Ecosystems, ETH Z\\u00fcrich, 8049 
57
Institute of Terrestrial Ecosystems, ETH Z\\u00fcrich, 8049 
            
58
Z\\u00fcrich, Switzerland\"}]",
58
Z\\u00fcrich, Switzerland\"}]",
            
59
  "author_email": null,
59
  "author_email": null,
            
60
  "creator_user_id": "382d8fab-f378-477d-88f6-26f77aee50d8",
60
  "creator_user_id": "382d8fab-f378-477d-88f6-26f77aee50d8",
            
61
  "date": 
61
  "date": 
            
62
\":\"created\",\"date\":\"2019-10-27\",\"end_date\":\"2019-11-05\"}]",
62
\":\"created\",\"date\":\"2019-10-27\",\"end_date\":\"2019-11-05\"}]",
            
63
  "doi": "10.16904/envidat.567",
63
  "doi": "10.16904/envidat.567",
            
64
  "extras": [
64
  "extras": [
            
65
    {
65
    {
            
66
      "key": "edna_type",
66
      "key": "edna_type",
            
67
      "value": "marine"
67
      "value": "marine"
            
68
    },
68
    },
            
69
    {
69
    {
            
70
      "key": "metadata",
70
      "key": "metadata",
            
71
      "value": 
71
      "value": 
            
72
ma_fr/ma_fr_lapero_2019/metadata/metadata_field_ma_fr_lapero_2019.csv"
72
ma_fr/ma_fr_lapero_2019/metadata/metadata_field_ma_fr_lapero_2019.csv"
            
73
    }
73
    }
            
74
  ],
74
  ],
            
75
  "funding": "[{\"institution\":\"Internal Funding ELE group 
75
  "funding": "[{\"institution\":\"Internal Funding ELE group 
            
76
\",\"grant_number\":\"\",\"institution_url\":\"\"},{\"institution\":\" 
76
\",\"grant_number\":\"\",\"institution_url\":\"\"},{\"institution\":\" 
            
77
Andromede Oceanologie\",\"grant_number\":\"GOMBESSA 
77
Andromede Oceanologie\",\"grant_number\":\"GOMBESSA 
            
78
5\",\"institution_url\":\"\"},{\"institution\":\"ANR labcom 
78
5\",\"institution_url\":\"\"},{\"institution\":\"ANR labcom 
            
79
2\",\"grant_number\":\"InToSea (Innovative Tools under the Sea) joint 
79
2\",\"grant_number\":\"InToSea (Innovative Tools under the Sea) joint 
            
80
laboratory\",\"institution_url\":\"\"},{\"institution\":\"Manufacture 
80
laboratory\",\"institution_url\":\"\"},{\"institution\":\"Manufacture 
            
81
de Haute Horlogerie Suisse Blancpain and Blancpain Ocean 
81
de Haute Horlogerie Suisse Blancpain and Blancpain Ocean 
            
82
rant_number\":\"\",\"institution_url\":\"\"},{\"institution\":\"Prince 
82
rant_number\":\"\",\"institution_url\":\"\"},{\"institution\":\"Prince 
            
83
Albert II de Monaco 
83
Albert II de Monaco 
            
n
n
84
\":\"\",\"institution_url\":\"\"},{\"institution\":\"Soci\u00e9t\u00e9 
            
85
des explorations de 
            
84
Foundation\",\"grant_number\":\"\",\"institution_url\":\"\"}]",
86
Monaco\",\"grant_number\":\"\",\"institution_url\":\"\"}]",
            
85
  "groups": [
87
  "groups": [
            
86
    {
88
    {
            
87
      "description": "",
89
      "description": "",
            
88
      "display_name": "eDNA",
90
      "display_name": "eDNA",
            
89
      "id": "c2176351-3002-4d7a-b2aa-d8509f7dbfbe",
91
      "id": "c2176351-3002-4d7a-b2aa-d8509f7dbfbe",
            
90
      "image_display_url": "",
92
      "image_display_url": "",
            
91
      "name": "edna",
93
      "name": "edna",
            
92
      "title": "eDNA"
94
      "title": "eDNA"
            
93
    }
95
    }
            
94
  ],
96
  ],
            
95
  "id": "27331019-15d4-41c5-b9e4-866c6bc0a96a",
97
  "id": "27331019-15d4-41c5-b9e4-866c6bc0a96a",
            
96
  "isopen": true,
98
  "isopen": true,
            
97
  "license_id": "cc-by",
99
  "license_id": "cc-by",
            
98
  "license_title": "Creative Commons Attribution",
100
  "license_title": "Creative Commons Attribution",
            
99
  "license_url": "https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/",
101
  "license_url": "https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/",
            
100
  "maintainer": 
102
  "maintainer": 
            
101
e.marques@wsl.ch\",\"given_name\":\"Virginie\",\"name\":\"Marques\"}",
103
e.marques@wsl.ch\",\"given_name\":\"Virginie\",\"name\":\"Marques\"}",
            
102
  "maintainer_email": null,
104
  "maintainer_email": null,
            
103
  "metadata_created": "2024-12-10T15:08:00.727653",
105
  "metadata_created": "2024-12-10T15:08:00.727653",
            
t
104
  "metadata_modified": "2024-12-12T13:50:27.851275",
t
106
  "metadata_modified": "2024-12-12T13:50:36.395777",
            
105
  "name": "environmental-dna-marine-france-laperouse-2019",
107
  "name": "environmental-dna-marine-france-laperouse-2019",
            
106
  "notes": "Fish environmental DNA data set collected in the shallow 
108
  "notes": "Fish environmental DNA data set collected in the shallow 
            
107
seamount of La P\u00e9rouse located between Madagascar and 
109
seamount of La P\u00e9rouse located between Madagascar and 
            
108
R\u00e9union Island \n\n\nIn 2019, we sampled the shallow seamount of 
110
R\u00e9union Island \n\n\nIn 2019, we sampled the shallow seamount of 
            
109
La P\u00e9rouse, located between Madagascar and R\u00e9union Island in 
111
La P\u00e9rouse, located between Madagascar and R\u00e9union Island in 
            
110
the WIO. La P\u00e9rouse is an extinct volcano with a summit depth at 
112
the WIO. La P\u00e9rouse is an extinct volcano with a summit depth at 
            
111
60\u2009m below the sea surface. The plateau of the summit has a 
113
60\u2009m below the sea surface. The plateau of the summit has a 
            
112
maximum length of 12\u2009km and a maximum width of 4 km. One side of 
114
maximum length of 12\u2009km and a maximum width of 4 km. One side of 
            
113
the seamount might have collapsed in the past, leading to a less 
115
the seamount might have collapsed in the past, leading to a less 
            
114
common crescent-shaped summit. The abyssal plains that surround this 
116
common crescent-shaped summit. The abyssal plains that surround this 
            
115
isolated pinnacle are at a depth of 5000\u2009m. Despite its proximity 
117
isolated pinnacle are at a depth of 5000\u2009m. Despite its proximity 
            
116
to R\u00e9union Island (160\u2009km northwest), La P\u00e9rouse and 
118
to R\u00e9union Island (160\u2009km northwest), La P\u00e9rouse and 
            
117
its surroundings are still poorly studied.\n\nTo sample eDNA in this 
119
its surroundings are still poorly studied.\n\nTo sample eDNA in this 
            
118
location we used a submersible pump (Subspace, Geneva, Switzerland; 
120
location we used a submersible pump (Subspace, Geneva, Switzerland; 
            
119
nominal flow of ~\u20091.0 L/min) to collect samples at various depths 
121
nominal flow of ~\u20091.0 L/min) to collect samples at various depths 
            
120
during close circuit rebreather dives. The pump has an internal 
122
during close circuit rebreather dives. The pump has an internal 
            
121
battery and can be activated underwater allowing in situ filtration 
123
battery and can be activated underwater allowing in situ filtration 
            
122
directly at the targeted habitat and depth. The filtration lasted for 
124
directly at the targeted habitat and depth. The filtration lasted for 
            
123
30\u2009min to collect a total water volume of ~\u200930\u2009L. 
125
30\u2009min to collect a total water volume of ~\u200930\u2009L. 
            
124
During close circuit rebreather dives, water samples from various 
126
During close circuit rebreather dives, water samples from various 
            
125
depths, ranging from 60 to 140\u2009m below the sea surface, were 
127
depths, ranging from 60 to 140\u2009m below the sea surface, were 
            
126
collected using only the Submersible method (eight stations: no 
128
collected using only the Submersible method (eight stations: no 
            
127
replicates). Out of the eight water samples, six were collected during 
129
replicates). Out of the eight water samples, six were collected during 
            
128
the day, while two were collected at night (IS2_1 at 62\u2009m and 
130
the day, while two were collected at night (IS2_1 at 62\u2009m and 
            
129
IS7_1 at 100\u2013125\u2009m). We applied this filtration protocols to 
131
IS7_1 at 100\u2013125\u2009m). We applied this filtration protocols to 
            
130
collect and filter water throughout a VigiDNA\u00ae 0.2 \u03bcM 
132
collect and filter water throughout a VigiDNA\u00ae 0.2 \u03bcM 
            
131
cross-flow filtration capsule (SPYGEN, le Bourget du Lac, France) 
133
cross-flow filtration capsule (SPYGEN, le Bourget du Lac, France) 
            
132
using disposable sterile tubing for each filtration capsule. After the 
134
using disposable sterile tubing for each filtration capsule. After the 
            
133
filtration process, the remaining water in the capsules was emptied. 
135
filtration process, the remaining water in the capsules was emptied. 
            
134
The capsules were then filled with 80\u2009ml of lysis conservation 
136
The capsules were then filled with 80\u2009ml of lysis conservation 
            
135
buffer (CL1 buffer SPYGEN, le Bourget du Lac, France) and stored at 
137
buffer (CL1 buffer SPYGEN, le Bourget du Lac, France) and stored at 
            
136
room temperature in the dark. At La P\u00e9rouse, a total of eight 
138
room temperature in the dark. At La P\u00e9rouse, a total of eight 
            
137
water samples were collected during the MONT LA P\u00c9ROUSE 
139
water samples were collected during the MONT LA P\u00c9ROUSE 
            
138
expedition (https://gombessa-expeditions.com/mont-la-perouse/) on 
140
expedition (https://gombessa-expeditions.com/mont-la-perouse/) on 
            
139
board the ship La Curieuse to the seamount La P\u00e9rouse from 
141
board the ship La Curieuse to the seamount La P\u00e9rouse from 
            
140
October 27th to November 5th 2019. We followed a strict contamination 
142
October 27th to November 5th 2019. We followed a strict contamination 
            
141
control protocol in both field and laboratory stages. Each water 
143
control protocol in both field and laboratory stages. Each water 
            
142
sample processing included the use of disposable gloves and single-use 
144
sample processing included the use of disposable gloves and single-use 
            
143
filtration equipment to avoid any risk of contamination. Libraries 
145
filtration equipment to avoid any risk of contamination. Libraries 
            
144
were prepared with ligation using the MetaFast protocol 
146
were prepared with ligation using the MetaFast protocol 
            
145
(Fasteris).\n\nData content: \n\t* rawdata/: contains the raw reads 
147
(Fasteris).\n\nData content: \n\t* rawdata/: contains the raw reads 
            
146
for each individual sample. One archive contains the paired-end reads 
148
for each individual sample. One archive contains the paired-end reads 
            
147
specified by the _R1 or _R2 suffix as well as individually tagged PCR 
149
specified by the _R1 or _R2 suffix as well as individually tagged PCR 
            
148
replicates (if available) together with an archive containing all 
150
replicates (if available) together with an archive containing all 
            
149
extraction and PCR blank samples of the library. Reads have been 
151
extraction and PCR blank samples of the library. Reads have been 
            
150
demultiplexed using cutadapt but not trimmed, individual 
152
demultiplexed using cutadapt but not trimmed, individual 
            
151
demultiplexing tags and primers remain present in the sequences.  
153
demultiplexing tags and primers remain present in the sequences.  
            
152
\n\t* taxadata/: contains the table with all detected taxonomy for 
154
\n\t* taxadata/: contains the table with all detected taxonomy for 
            
153
each sample after bioinformatic processing (see Polanco et al. 2020 
155
each sample after bioinformatic processing (see Polanco et al. 2020 
            
154
for details; https://doi.org/10.1002/edn3.140) and associated field 
156
for details; https://doi.org/10.1002/edn3.140) and associated field 
            
155
metadata. \n\t* metadata/: contains two metadata files, one related to 
157
metadata. \n\t* metadata/: contains two metadata files, one related to 
            
156
the data collected in the field for each filter, and the second 
158
the data collected in the field for each filter, and the second 
            
157
related to the sequencing process in the lab (including the tag 
159
related to the sequencing process in the lab (including the tag 
            
158
sequence, library name, and marker information for each sample)\n",
160
sequence, library name, and marker information for each sample)\n",
            
159
  "num_resources": 1,
161
  "num_resources": 1,
            
160
  "num_tags": 7,
162
  "num_tags": 7,
            
161
  "organization": {
163
  "organization": {
            
162
    "approval_status": "approved",
164
    "approval_status": "approved",
            
163
    "created": "2018-12-01T11:59:01.791513",
165
    "created": "2018-12-01T11:59:01.791513",
            
164
    "description": "We are an international research team with diverse 
166
    "description": "We are an international research team with diverse 
            
165
scientific expertise and backgrounds, connected by the goal to 
167
scientific expertise and backgrounds, connected by the goal to 
            
166
understand biodiversity. We study the mechanisms that shape 
168
understand biodiversity. We study the mechanisms that shape 
            
167
biodiversity patterns across spatial and temporal scales - in both 
169
biodiversity patterns across spatial and temporal scales - in both 
            
168
terrestrial and aquatic ecosystems -\u200bsuch as mountain ranges and 
170
terrestrial and aquatic ecosystems -\u200bsuch as mountain ranges and 
            
169
tropical reefs. We use an interdisciplinary approach, whereby we 
171
tropical reefs. We use an interdisciplinary approach, whereby we 
            
170
bridge ecology, evolution, Earth history and global change.\r\nTo make 
172
bridge ecology, evolution, Earth history and global change.\r\nTo make 
            
171
these connections, we collect data through biological monitoring, 
173
these connections, we collect data through biological monitoring, 
            
172
environmental DNA methods, remote sensing, and field sampling, and use 
174
environmental DNA methods, remote sensing, and field sampling, and use 
            
173
these data to answer questions with statistical and 
175
these data to answer questions with statistical and 
            
174
process-\u200bbased models of biological diversity.\r\nOur group is 
176
process-\u200bbased models of biological diversity.\r\nOur group is 
            
175
affiliated with ETH and WSL, but is also associated with Agroscope, 
177
affiliated with ETH and WSL, but is also associated with Agroscope, 
            
176
EAWAG, the European Joint Research Centre and Vogelwarte.",
178
EAWAG, the European Joint Research Centre and Vogelwarte.",
            
177
    "id": "153392ee-d556-4b16-a330-dedb177e87f9",
179
    "id": "153392ee-d556-4b16-a330-dedb177e87f9",
            
178
    "image_url": 
180
    "image_url": 
            
179
le.ethz.ch/_jcr_content/orgbox/image.imageformat.logo.1254626489.png",
181
le.ethz.ch/_jcr_content/orgbox/image.imageformat.logo.1254626489.png",
            
180
    "is_organization": true,
182
    "is_organization": true,
            
181
    "name": "ele-group",
183
    "name": "ele-group",
            
182
    "state": "active",
184
    "state": "active",
            
183
    "title": "Ecosystems and Landscape Evolution",
185
    "title": "Ecosystems and Landscape Evolution",
            
184
    "type": "organization"
186
    "type": "organization"
            
185
  },
187
  },
            
186
  "owner_org": "153392ee-d556-4b16-a330-dedb177e87f9",
188
  "owner_org": "153392ee-d556-4b16-a330-dedb177e87f9",
            
187
  "private": false,
189
  "private": false,
            
188
  "publication": 
190
  "publication": 
            
189
"{\"publisher\":\"EnviDat\",\"publication_year\":\"2024\"}",
191
"{\"publisher\":\"EnviDat\",\"publication_year\":\"2024\"}",
            
190
  "publication_state": "published",
192
  "publication_state": "published",
            
191
  "related_publications": "Muff, Marion, et al. \"Environmental DNA 
193
  "related_publications": "Muff, Marion, et al. \"Environmental DNA 
            
192
highlights fish biodiversity in mesophotic ecosystems.\" Environ. DNA, 
194
highlights fish biodiversity in mesophotic ecosystems.\" Environ. DNA, 
            
193
vol. 5, no. 1, 1 Jan. 2023, pp. 56-72, doi:10.1002/edn3.358.",
195
vol. 5, no. 1, 1 Jan. 2023, pp. 56-72, doi:10.1002/edn3.358.",
            
194
  "relationships_as_object": [],
196
  "relationships_as_object": [],
            
195
  "relationships_as_subject": [],
197
  "relationships_as_subject": [],
            
196
  "resource_type": "dataset",
198
  "resource_type": "dataset",
            
197
  "resource_type_general": "dataset",
199
  "resource_type_general": "dataset",
            
198
  "resources": [
200
  "resources": [
            
199
    {
201
    {
            
200
      "cache_last_updated": null,
202
      "cache_last_updated": null,
            
201
      "cache_url": null,
203
      "cache_url": null,
            
202
      "created": "2024-12-10T15:19:34.794121",
204
      "created": "2024-12-10T15:19:34.794121",
            
203
      "description": "Please use cyberduck to download for the 
205
      "description": "Please use cyberduck to download for the 
            
204
moment",
206
moment",
            
205
      "doi": "",
207
      "doi": "",
            
206
      "format": "csv + fasta",
208
      "format": "csv + fasta",
            
207
      "hash": "",
209
      "hash": "",
            
208
      "id": "add08aff-55fa-4e9d-a96f-014465c2436e",
210
      "id": "add08aff-55fa-4e9d-a96f-014465c2436e",
            
209
      "last_modified": "2024-12-10T16:20:42.072000",
211
      "last_modified": "2024-12-10T16:20:42.072000",
            
210
      "metadata_modified": "2024-12-11T12:00:15.003656",
212
      "metadata_modified": "2024-12-11T12:00:15.003656",
            
211
      "mimetype": null,
213
      "mimetype": null,
            
212
      "mimetype_inner": null,
214
      "mimetype_inner": null,
            
213
      "name": "Data access",
215
      "name": "Data access",
            
214
      "package_id": "27331019-15d4-41c5-b9e4-866c6bc0a96a",
216
      "package_id": "27331019-15d4-41c5-b9e4-866c6bc0a96a",
            
215
      "position": 0,
217
      "position": 0,
            
216
      "publication_state": "",
218
      "publication_state": "",
            
217
      "resource_size": "{\"size_units\": \"gb\", \"size_value\": 
219
      "resource_size": "{\"size_units\": \"gb\", \"size_value\": 
            
218
\"1.6\"}",
220
\"1.6\"}",
            
219
      "resource_type": null,
221
      "resource_type": null,
            
220
      "restricted": "{\"allowed_users\": \"\", \"level\": \"public\", 
222
      "restricted": "{\"allowed_users\": \"\", \"level\": \"public\", 
            
221
\"shared_secret\": \"\"}",
223
\"shared_secret\": \"\"}",
            
222
      "size": null,
224
      "size": null,
            
223
      "state": "active",
225
      "state": "active",
            
224
      "url": 
226
      "url": 
            
225
cket=https://envicloud.wsl.ch/edna/&prefix=/ma_fr/ma_fr_lapero_2019/",
227
cket=https://envicloud.wsl.ch/edna/&prefix=/ma_fr/ma_fr_lapero_2019/",
            
226
      "url_type": null
228
      "url_type": null
            
227
    }
229
    }
            
228
  ],
230
  ],
            
229
  "spatial": 
231
  "spatial": 
            
230
ies\":{\"name\":\"environmental-dna-marine-france-laperouse-2019\"}}",
232
ies\":{\"name\":\"environmental-dna-marine-france-laperouse-2019\"}}",
            
231
  "state": "active",
233
  "state": "active",
            
232
  "subtitle": "",
234
  "subtitle": "",
            
233
  "tags": [
235
  "tags": [
            
234
    {
236
    {
            
235
      "display_name": "CORAL REEF",
237
      "display_name": "CORAL REEF",
            
236
      "id": "63718352-c39f-4313-9ca3-bdb1d680dbef",
238
      "id": "63718352-c39f-4313-9ca3-bdb1d680dbef",
            
237
      "name": "CORAL REEF",
239
      "name": "CORAL REEF",
            
238
      "state": "active",
240
      "state": "active",
            
239
      "vocabulary_id": null
241
      "vocabulary_id": null
            
240
    },
242
    },
            
241
    {
243
    {
            
242
      "display_name": "ENVIRONMENTAL DNA",
244
      "display_name": "ENVIRONMENTAL DNA",
            
243
      "id": "db7d5622-d1fc-4d24-91f7-73842c6743b6",
245
      "id": "db7d5622-d1fc-4d24-91f7-73842c6743b6",
            
244
      "name": "ENVIRONMENTAL DNA",
246
      "name": "ENVIRONMENTAL DNA",
            
245
      "state": "active",
247
      "state": "active",
            
246
      "vocabulary_id": null
248
      "vocabulary_id": null
            
247
    },
249
    },
            
248
    {
250
    {
            
249
      "display_name": "FISH COMPOSITION",
251
      "display_name": "FISH COMPOSITION",
            
250
      "id": "4c441df2-c810-49ad-81a3-483b6a9ff2bb",
252
      "id": "4c441df2-c810-49ad-81a3-483b6a9ff2bb",
            
251
      "name": "FISH COMPOSITION",
253
      "name": "FISH COMPOSITION",
            
252
      "state": "active",
254
      "state": "active",
            
253
      "vocabulary_id": null
255
      "vocabulary_id": null
            
254
    },
256
    },
            
255
    {
257
    {
            
256
      "display_name": "INDIAN OCEAN",
258
      "display_name": "INDIAN OCEAN",
            
257
      "id": "064cc0db-d544-453d-98f9-54b9f46fba27",
259
      "id": "064cc0db-d544-453d-98f9-54b9f46fba27",
            
258
      "name": "INDIAN OCEAN",
260
      "name": "INDIAN OCEAN",
            
259
      "state": "active",
261
      "state": "active",
            
260
      "vocabulary_id": null
262
      "vocabulary_id": null
            
261
    },
263
    },
            
262
    {
264
    {
            
263
      "display_name": "LAPEROUSE",
265
      "display_name": "LAPEROUSE",
            
264
      "id": "b5062b96-2335-4fde-b7e5-0b615d947d89",
266
      "id": "b5062b96-2335-4fde-b7e5-0b615d947d89",
            
265
      "name": "LAPEROUSE",
267
      "name": "LAPEROUSE",
            
266
      "state": "active",
268
      "state": "active",
            
267
      "vocabulary_id": null
269
      "vocabulary_id": null
            
268
    },
270
    },
            
269
    {
271
    {
            
270
      "display_name": "MARINE",
272
      "display_name": "MARINE",
            
271
      "id": "1f05d702-5580-40ac-9c9a-47127e050fa7",
273
      "id": "1f05d702-5580-40ac-9c9a-47127e050fa7",
            
272
      "name": "MARINE",
274
      "name": "MARINE",
            
273
      "state": "active",
275
      "state": "active",
            
274
      "vocabulary_id": null
276
      "vocabulary_id": null
            
275
    },
277
    },
            
276
    {
278
    {
            
277
      "display_name": "TELEO",
279
      "display_name": "TELEO",
            
278
      "id": "d67a8d9b-568f-45dc-ac71-fd05228faa6b",
280
      "id": "d67a8d9b-568f-45dc-ac71-fd05228faa6b",
            
279
      "name": "TELEO",
281
      "name": "TELEO",
            
280
      "state": "active",
282
      "state": "active",
            
281
      "vocabulary_id": null
283
      "vocabulary_id": null
            
282
    }
284
    }
            
283
  ],
285
  ],
            
284
  "title": "Environmental DNA Marine France LaPerouse 2019",
286
  "title": "Environmental DNA Marine France LaPerouse 2019",
            
285
  "type": "dataset",
287
  "type": "dataset",
            
286
  "url": null
288
  "url": null
            
287
}
289
}