Changes

              
    

          
          
        
        

            
f
1
{
f
1
{
            
2
  "author": "[{\"affiliation\": \"INVEMAR\", \"affiliation_02\": \"\", 
2
  "author": "[{\"affiliation\": \"INVEMAR\", \"affiliation_02\": \"\", 
            
3
\"affiliation_03\": \"\", \"email\": 
3
\"affiliation_03\": \"\", \"email\": 
            
4
\"andrea.polanco@invemar.org.co\", \"given_name\": \"Andrea\", 
4
\"andrea.polanco@invemar.org.co\", \"given_name\": \"Andrea\", 
            
5
\"identifier\": \"0000-0001-6121-5214\", \"name\": \"Polanco\"}, 
5
\"identifier\": \"0000-0001-6121-5214\", \"name\": \"Polanco\"}, 
            
6
{\"affiliation\": \"Unit of Land Change Science, Swiss Federal 
6
{\"affiliation\": \"Unit of Land Change Science, Swiss Federal 
            
7
Research Institute WSL, Birmensdorf, Switzerland\", 
7
Research Institute WSL, Birmensdorf, Switzerland\", 
            
8
\"affiliation_02\": \"\", \"affiliation_03\": \"\", \"email\": 
8
\"affiliation_02\": \"\", \"affiliation_03\": \"\", \"email\": 
            
9
\"virginie.marques@wsl.ch\", \"given_name\": \"Virginie\", 
9
\"virginie.marques@wsl.ch\", \"given_name\": \"Virginie\", 
            
10
\"identifier\": \"\", \"name\": \"Marques\"}, {\"affiliation\": 
10
\"identifier\": \"\", \"name\": \"Marques\"}, {\"affiliation\": 
            
11
\"WSL\", \"affiliation_02\": \"\", \"affiliation_03\": \"\", 
11
\"WSL\", \"affiliation_02\": \"\", \"affiliation_03\": \"\", 
            
12
\"email\": \"fabian.fopp@wsl.ch\", \"given_name\": \"Fabian\", 
12
\"email\": \"fabian.fopp@wsl.ch\", \"given_name\": \"Fabian\", 
            
13
\"identifier\": \"0000-0003-0648-8484\", \"name\": \"Fopp\"}, 
13
\"identifier\": \"0000-0003-0648-8484\", \"name\": \"Fopp\"}, 
            
14
{\"affiliation\": \"University of Montpellier\", \"affiliation_02\": 
14
{\"affiliation\": \"University of Montpellier\", \"affiliation_02\": 
            
15
\"\", \"affiliation_03\": \"\", \"email\": 
15
\"\", \"affiliation_03\": \"\", \"email\": 
            
16
\"jeanbaptiste.juhel@gmail.com\", \"given_name\": \"Jean-Baptiste\", 
16
\"jeanbaptiste.juhel@gmail.com\", \"given_name\": \"Jean-Baptiste\", 
            
17
\"identifier\": \"\", \"name\": \"Juhel\"}, {\"affiliation\": 
17
\"identifier\": \"\", \"name\": \"Juhel\"}, {\"affiliation\": 
            
18
\"INVEMAR\", \"affiliation_02\": \"\", \"affiliation_03\": \"\", 
18
\"INVEMAR\", \"affiliation_02\": \"\", \"affiliation_03\": \"\", 
            
19
\"email\": \"giomar.borrero@invemar.org.co\", \"given_name\": 
19
\"email\": \"giomar.borrero@invemar.org.co\", \"given_name\": 
            
20
\"Giomar\", \"identifier\": \"\", \"name\": \"Borrero\"}, 
20
\"Giomar\", \"identifier\": \"\", \"name\": \"Borrero\"}, 
            
21
{\"affiliation\": \"University of Montpellier\", \"affiliation_02\": 
21
{\"affiliation\": \"University of Montpellier\", \"affiliation_02\": 
            
22
\"\", \"affiliation_03\": \"\", \"email\": 
22
\"\", \"affiliation_03\": \"\", \"email\": 
            
23
\"marie-charlotte.cheutin@univ-tours.fr\", \"given_name\": 
23
\"marie-charlotte.cheutin@univ-tours.fr\", \"given_name\": 
            
24
\"Marie-Charlotte\", \"identifier\": \"\", \"name\": \"Cheutin\"}, 
24
\"Marie-Charlotte\", \"identifier\": \"\", \"name\": \"Cheutin\"}, 
            
25
{\"affiliation\": \"SPYGEN\", \"affiliation_02\": \"\", 
25
{\"affiliation\": \"SPYGEN\", \"affiliation_02\": \"\", 
            
26
\"affiliation_03\": \"\", \"email\": \"tony.dejean@spygen.com\", 
26
\"affiliation_03\": \"\", \"email\": \"tony.dejean@spygen.com\", 
            
27
\"given_name\": \"Tony\", \"identifier\": \"\", \"name\": \"Dejean\"}, 
27
\"given_name\": \"Tony\", \"identifier\": \"\", \"name\": \"Dejean\"}, 
            
28
{\"affiliation\": \"INVEMAR\", \"affiliation_02\": \"\", 
28
{\"affiliation\": \"INVEMAR\", \"affiliation_02\": \"\", 
            
29
\"affiliation_03\": \"\", \"email\": \"juan.gonzalez@invemar.org.co\", 
29
\"affiliation_03\": \"\", \"email\": \"juan.gonzalez@invemar.org.co\", 
            
30
\"given_name\": \"Juan David Gonzalez\", \"identifier\": \"\", 
30
\"given_name\": \"Juan David Gonzalez\", \"identifier\": \"\", 
            
31
\"name\": \"Corredor\"}, {\"affiliation\": \"INVEMAR\", 
31
\"name\": \"Corredor\"}, {\"affiliation\": \"INVEMAR\", 
            
32
\"affiliation_02\": \"\", \"affiliation_03\": \"\", \"email\": 
32
\"affiliation_02\": \"\", \"affiliation_03\": \"\", \"email\": 
            
33
\"andres.acosta@invemar.org.co\", \"given_name\": \"Andres\", 
33
\"andres.acosta@invemar.org.co\", \"given_name\": \"Andres\", 
            
34
\"identifier\": \"\", \"name\": \"Acosta-Chapparo\"}, 
34
\"identifier\": \"\", \"name\": \"Acosta-Chapparo\"}, 
            
35
{\"affiliation\": \"IRD\", \"affiliation_02\": \"\", 
35
{\"affiliation\": \"IRD\", \"affiliation_02\": \"\", 
            
36
\"affiliation_03\": \"\", \"email\": \"regis.hocde@ird.fr\", 
36
\"affiliation_03\": \"\", \"email\": \"regis.hocde@ird.fr\", 
            
37
\"given_name\": \"R\\u00e9gis\", \"identifier\": \"\", \"name\": 
37
\"given_name\": \"R\\u00e9gis\", \"identifier\": \"\", \"name\": 
            
38
\"Hocd\\u00e9\"}, {\"affiliation\": \"RiverLy Research Unit, National 
38
\"Hocd\\u00e9\"}, {\"affiliation\": \"RiverLy Research Unit, National 
            
39
Research Institute for Agriculture Food and Environment (INRAE), 
39
Research Institute for Agriculture Food and Environment (INRAE), 
            
40
Villeurbanne, France.\", \"affiliation_02\": \"\", \"affiliation_03\": 
40
Villeurbanne, France.\", \"affiliation_02\": \"\", \"affiliation_03\": 
            
41
\"\", \"email\": \"david.eme@inrae.fr\", \"given_name\": \"David\", 
41
\"\", \"email\": \"david.eme@inrae.fr\", \"given_name\": \"David\", 
            
42
\"identifier\": \"\", \"name\": \"Eme\"}, {\"affiliation\": 
42
\"identifier\": \"\", \"name\": \"Eme\"}, {\"affiliation\": 
            
43
\"University of Montpellier\", \"affiliation_02\": \"\", 
43
\"University of Montpellier\", \"affiliation_02\": \"\", 
            
44
\"affiliation_03\": \"\", \"email\": \"eva.maire@ird.fr\", 
44
\"affiliation_03\": \"\", \"email\": \"eva.maire@ird.fr\", 
            
45
\"given_name\": \"Eva\", \"identifier\": \"\", \"name\": \"Maire\"}, 
45
\"given_name\": \"Eva\", \"identifier\": \"\", \"name\": \"Maire\"}, 
            
46
{\"affiliation\": \"ETHZ\", \"affiliation_02\": \"\", 
46
{\"affiliation\": \"ETHZ\", \"affiliation_02\": \"\", 
            
47
\"affiliation_03\": \"\", \"email\": \"spescha.manuel@hotmail.de\", 
47
\"affiliation_03\": \"\", \"email\": \"spescha.manuel@hotmail.de\", 
            
48
\"given_name\": \"Manuel\", \"identifier\": \"\", \"name\": 
48
\"given_name\": \"Manuel\", \"identifier\": \"\", \"name\": 
            
49
\"spescha\"}, {\"affiliation\": \"SPYGEN\", \"affiliation_02\": \"\", 
49
\"spescha\"}, {\"affiliation\": \"SPYGEN\", \"affiliation_02\": \"\", 
            
50
\"affiliation_03\": \"\", \"email\": \"alice.valentini@spygen.com\", 
50
\"affiliation_03\": \"\", \"email\": \"alice.valentini@spygen.com\", 
            
51
\"given_name\": \"Alice\", \"identifier\": \"\", \"name\": 
51
\"given_name\": \"Alice\", \"identifier\": \"\", \"name\": 
            
52
\"Valentini\"}, {\"affiliation\": \"EPHE\", \"affiliation_02\": \"\", 
52
\"Valentini\"}, {\"affiliation\": \"EPHE\", \"affiliation_02\": \"\", 
            
53
\"affiliation_03\": \"\", \"email\": \"stephanie.manel@cefe.cnrs.fr\", 
53
\"affiliation_03\": \"\", \"email\": \"stephanie.manel@cefe.cnrs.fr\", 
            
54
\"given_name\": \"Stephanie\", \"identifier\": \"\", \"name\": 
54
\"given_name\": \"Stephanie\", \"identifier\": \"\", \"name\": 
            
55
\"Manel\"}, {\"affiliation\": \"University of Montpellier\", 
55
\"Manel\"}, {\"affiliation\": \"University of Montpellier\", 
            
56
\"affiliation_02\": \"\", \"affiliation_03\": \"\", \"email\": 
56
\"affiliation_02\": \"\", \"affiliation_03\": \"\", \"email\": 
            
57
\"david.mouillot@umontpellier.fr\", \"given_name\": \"David\", 
57
\"david.mouillot@umontpellier.fr\", \"given_name\": \"David\", 
            
58
\"identifier\": \"\", \"name\": \"Mouillot\"}, {\"affiliation\": 
58
\"identifier\": \"\", \"name\": \"Mouillot\"}, {\"affiliation\": 
            
59
\"ETH\", \"affiliation_02\": \"\", \"affiliation_03\": \"\", 
59
\"ETH\", \"affiliation_02\": \"\", \"affiliation_03\": \"\", 
            
60
\"email\": \"albouycamille@gmail.com\", \"given_name\": \"Camille\", 
60
\"email\": \"albouycamille@gmail.com\", \"given_name\": \"Camille\", 
            
61
\"identifier\": \"0000-0003-1629-2389\", \"name\": \"Albouy\"}, 
61
\"identifier\": \"0000-0003-1629-2389\", \"name\": \"Albouy\"}, 
            
62
{\"affiliation\": \"Ecosystems and Landscape Evolution, Dep. of 
62
{\"affiliation\": \"Ecosystems and Landscape Evolution, Dep. of 
            
63
Environmental Systems Science, ETH Zurich\", \"affiliation_02\": \"\", 
63
Environmental Systems Science, ETH Zurich\", \"affiliation_02\": \"\", 
            
64
\"affiliation_03\": \"\", \"email\": \"loic.pellissier@usys.ethz.ch\", 
64
\"affiliation_03\": \"\", \"email\": \"loic.pellissier@usys.ethz.ch\", 
            
65
\"given_name\": \"Loic\", \"identifier\": \"0000-0002-2289-8259\", 
65
\"given_name\": \"Loic\", \"identifier\": \"0000-0002-2289-8259\", 
            
66
\"name\": \"Pellissier\"}]",
66
\"name\": \"Pellissier\"}]",
            
67
  "author_email": null,
67
  "author_email": null,
            
68
  "creator_user_id": "382d8fab-f378-477d-88f6-26f77aee50d8",
68
  "creator_user_id": "382d8fab-f378-477d-88f6-26f77aee50d8",
            
69
  "date": "[{\"date\": \"2018-06-29\", \"date_type\": \"created\", 
69
  "date": "[{\"date\": \"2018-06-29\", \"date_type\": \"created\", 
            
70
\"end_date\": \"2018-07-05\"}, {\"date\": \"2018-06-29\", 
70
\"end_date\": \"2018-07-05\"}, {\"date\": \"2018-06-29\", 
            
71
\"date_type\": \"collected\", \"end_date\": \"2018-07-05\"}]",
71
\"date_type\": \"collected\", \"end_date\": \"2018-07-05\"}]",
            
72
  "doi": "10.16904/envidat.543",
72
  "doi": "10.16904/envidat.543",
            
73
  "extras": [
73
  "extras": [
            
74
    {
74
    {
            
75
      "key": "edna_type",
75
      "key": "edna_type",
            
76
      "value": "marine"
76
      "value": "marine"
            
77
    },
77
    },
            
78
    {
78
    {
            
79
      "key": "metadata",
79
      "key": "metadata",
            
80
      "value": 
80
      "value": 
            
81
ma_co/ma_co_provid_2019/metadata/metadata_field_ma_co_provid_2019.csv"
81
ma_co/ma_co_provid_2019/metadata/metadata_field_ma_co_provid_2019.csv"
            
82
    }
82
    }
            
83
  ],
83
  ],
            
84
  "funding": "[{\"grant_number\": \"\", \"institution\": \"Internal 
84
  "funding": "[{\"grant_number\": \"\", \"institution\": \"Internal 
            
85
Funding ELE group (ETHZ/WSL)\", \"institution_url\": \"\"}]",
85
Funding ELE group (ETHZ/WSL)\", \"institution_url\": \"\"}]",
            
86
  "groups": [
86
  "groups": [
            
87
    {
87
    {
            
88
      "description": "",
88
      "description": "",
            
89
      "display_name": "eDNA",
89
      "display_name": "eDNA",
            
90
      "id": "c2176351-3002-4d7a-b2aa-d8509f7dbfbe",
90
      "id": "c2176351-3002-4d7a-b2aa-d8509f7dbfbe",
            
91
      "image_display_url": "",
91
      "image_display_url": "",
            
92
      "name": "edna",
92
      "name": "edna",
            
93
      "title": "eDNA"
93
      "title": "eDNA"
            
94
    }
94
    }
            
95
  ],
95
  ],
            
96
  "id": "727198ac-8d35-40a5-91ba-16f1a743684c",
96
  "id": "727198ac-8d35-40a5-91ba-16f1a743684c",
            
97
  "isopen": false,
97
  "isopen": false,
            
98
  "language": "en",
98
  "language": "en",
            
99
  "license_id": "wsl-data",
99
  "license_id": "wsl-data",
            
100
  "license_title": "WSL Data Policy",
100
  "license_title": "WSL Data Policy",
            
101
  "license_url": 
101
  "license_url": 
            
102
ps://www.wsl.ch/en/about-wsl/programmes-and-initiatives/envidat.html",
102
ps://www.wsl.ch/en/about-wsl/programmes-and-initiatives/envidat.html",
            
103
  "maintainer": "{\"affiliation\": \"\", \"email\": 
103
  "maintainer": "{\"affiliation\": \"\", \"email\": 
            
104
\"virginie.marques@wsl.ch\", \"given_name\": \"Virginie\", 
104
\"virginie.marques@wsl.ch\", \"given_name\": \"Virginie\", 
            
105
\"identifier\": \"\", \"name\": \"Marques\"}",
105
\"identifier\": \"\", \"name\": \"Marques\"}",
            
106
  "maintainer_email": null,
106
  "maintainer_email": null,
            
107
  "metadata_created": "2024-09-20T08:19:51.566223",
107
  "metadata_created": "2024-09-20T08:19:51.566223",
            
t
108
  "metadata_modified": "2024-09-23T14:28:31.266478",
t
108
  "metadata_modified": "2024-09-24T06:06:00.027786",
            
109
  "name": "environmental-dna-marine-columbia-providencia-2019",
109
  "name": "environmental-dna-marine-colombia-providencia-2019",
            
110
  "notes": "Comparing environmental DNA metabarcoding and underwater 
110
  "notes": "Comparing environmental DNA metabarcoding and underwater 
            
111
visual census to monitor tropical reef fishes, the Providencia island 
111
visual census to monitor tropical reef fishes, the Providencia island 
            
112
data set.\r\n\r\n\r\nBetween June 29 and July 5, 2018, we collected a 
112
data set.\r\n\r\n\r\nBetween June 29 and July 5, 2018, we collected a 
            
113
total of 20 water samples from 10 stations around Providencia Island, 
113
total of 20 water samples from 10 stations around Providencia Island, 
            
114
with two filtration replicates per station. Providencia Island is 
114
with two filtration replicates per station. Providencia Island is 
            
115
located in the southwestern Caribbean Sea and forms part of the UNESCO 
115
located in the southwestern Caribbean Sea and forms part of the UNESCO 
            
116
Seaflower Biosphere Reserve in Colombia. This island, which belongs to 
116
Seaflower Biosphere Reserve in Colombia. This island, which belongs to 
            
117
the San Andr\u00e9s, Providencia, and Santa Catalina Archipelago, is 
117
the San Andr\u00e9s, Providencia, and Santa Catalina Archipelago, is 
            
118
characterized by a complex barrier reef on a calcareous platform 
118
characterized by a complex barrier reef on a calcareous platform 
            
119
surrounding an extinct Miocene volcano. The high habitat diversity 
119
surrounding an extinct Miocene volcano. The high habitat diversity 
            
120
provides a range of substratum types and coral reefs, influencing the 
120
provides a range of substratum types and coral reefs, influencing the 
            
121
diversity, abundance, and distribution of coral reef fishes. Each 
121
diversity, abundance, and distribution of coral reef fishes. Each 
            
122
station consisted of a transect of 2\u2009km at an overall constant 
122
station consisted of a transect of 2\u2009km at an overall constant 
            
123
distance from the coast. We recorded the GPS coordinates at the start 
123
distance from the coast. We recorded the GPS coordinates at the start 
            
124
and end of the transect. We conducted eDNA sampling by using a 
124
and end of the transect. We conducted eDNA sampling by using a 
            
125
filtration device composed of an Athena\u00ae peristaltic pump 
125
filtration device composed of an Athena\u00ae peristaltic pump 
            
126
(Proactive Environmental Products LLC, Bradenton, Florida, USA; 
126
(Proactive Environmental Products LLC, Bradenton, Florida, USA; 
            
127
nominal flow of 1.0\u2009L/min), a VigiDNA\u00ae 0.20\u2009\u03bcM 
127
nominal flow of 1.0\u2009L/min), a VigiDNA\u00ae 0.20\u2009\u03bcM 
            
128
cross-flow filtration capsule (SPYGEN, le Bourget du Lac, France) and 
128
cross-flow filtration capsule (SPYGEN, le Bourget du Lac, France) and 
            
129
disposable sterile tubing for each filtration capsule. We performed 
129
disposable sterile tubing for each filtration capsule. We performed 
            
130
two filtration replicates in parallel on each side of a boat, at each 
130
two filtration replicates in parallel on each side of a boat, at each 
            
131
station, for 30\u2009min corresponding to a volume of ~30\u2009L of 
131
station, for 30\u2009min corresponding to a volume of ~30\u2009L of 
            
132
water filtered by each capsule. At the end of each filtration, the 
132
water filtered by each capsule. At the end of each filtration, the 
            
133
water inside the capsules was emptied, and we filled the capsules with 
133
water inside the capsules was emptied, and we filled the capsules with 
            
134
80\u2009ml of CL1 Conservation buffer (SPYGEN, le Bourget du Lac, 
134
80\u2009ml of CL1 Conservation buffer (SPYGEN, le Bourget du Lac, 
            
135
France) and stored at room temperature. We followed a strict 
135
France) and stored at room temperature. We followed a strict 
            
136
contamination control protocol in both field and laboratory stages 
136
contamination control protocol in both field and laboratory stages 
            
137
(Valentini et al., 2016). Each water sample processing included the 
137
(Valentini et al., 2016). Each water sample processing included the 
            
138
use of disposable gloves and single-use filtration equipment to avoid 
138
use of disposable gloves and single-use filtration equipment to avoid 
            
139
any risk of contamination. Libraries were prepared with ligation using 
139
any risk of contamination. Libraries were prepared with ligation using 
            
140
the MetaFast protocol (Fasteris).\r\n\r\nData content: \r\n\t* 
140
the MetaFast protocol (Fasteris).\r\n\r\nData content: \r\n\t* 
            
141
rawdata/: contains the raw reads for each individual sample. One 
141
rawdata/: contains the raw reads for each individual sample. One 
            
142
archive contains the paired-end reads specified by the _R1 or _R2 
142
archive contains the paired-end reads specified by the _R1 or _R2 
            
143
suffix as well as individually tagged PCR replicates (if available) 
143
suffix as well as individually tagged PCR replicates (if available) 
            
144
together with an archive containing all extraction and PCR blank 
144
together with an archive containing all extraction and PCR blank 
            
145
samples of the library. Reads have been demultiplexed using cutadapt 
145
samples of the library. Reads have been demultiplexed using cutadapt 
            
146
but not trimmed, individual demultiplexing tags and primers remain 
146
but not trimmed, individual demultiplexing tags and primers remain 
            
147
present in the sequences.  \r\n\t* taxadata/: contains the table with 
147
present in the sequences.  \r\n\t* taxadata/: contains the table with 
            
148
all detected taxonomy for each sample after bioinformatic processing 
148
all detected taxonomy for each sample after bioinformatic processing 
            
149
(see Polanco et al. 2020 for details; 
149
(see Polanco et al. 2020 for details; 
            
150
https://doi.org/10.1002/edn3.140) and associated field metadata. 
150
https://doi.org/10.1002/edn3.140) and associated field metadata. 
            
151
\r\n\t* metadata/: contains two metadata files, one related to the 
151
\r\n\t* metadata/: contains two metadata files, one related to the 
            
152
data collected in the field for each filter, and the second related to 
152
data collected in the field for each filter, and the second related to 
            
153
the sequencing process in the lab (including the tag sequence, library 
153
the sequencing process in the lab (including the tag sequence, library 
            
154
name, and marker information for each sample)\r\n  \r\n",
154
name, and marker information for each sample)\r\n  \r\n",
            
155
  "num_resources": 1,
155
  "num_resources": 1,
            
156
  "num_tags": 8,
156
  "num_tags": 8,
            
157
  "organization": {
157
  "organization": {
            
158
    "approval_status": "approved",
158
    "approval_status": "approved",
            
159
    "created": "2018-12-01T11:59:01.791513",
159
    "created": "2018-12-01T11:59:01.791513",
            
160
    "description": "We are an international research team with diverse 
160
    "description": "We are an international research team with diverse 
            
161
scientific expertise and backgrounds, connected by the goal to 
161
scientific expertise and backgrounds, connected by the goal to 
            
162
understand biodiversity. We study the mechanisms that shape 
162
understand biodiversity. We study the mechanisms that shape 
            
163
biodiversity patterns across spatial and temporal scales - in both 
163
biodiversity patterns across spatial and temporal scales - in both 
            
164
terrestrial and aquatic ecosystems -\u200bsuch as mountain ranges and 
164
terrestrial and aquatic ecosystems -\u200bsuch as mountain ranges and 
            
165
tropical reefs. We use an interdisciplinary approach, whereby we 
165
tropical reefs. We use an interdisciplinary approach, whereby we 
            
166
bridge ecology, evolution, Earth history and global change.\r\nTo make 
166
bridge ecology, evolution, Earth history and global change.\r\nTo make 
            
167
these connections, we collect data through biological monitoring, 
167
these connections, we collect data through biological monitoring, 
            
168
environmental DNA methods, remote sensing, and field sampling, and use 
168
environmental DNA methods, remote sensing, and field sampling, and use 
            
169
these data to answer questions with statistical and 
169
these data to answer questions with statistical and 
            
170
process-\u200bbased models of biological diversity.\r\nOur group is 
170
process-\u200bbased models of biological diversity.\r\nOur group is 
            
171
affiliated with ETH and WSL, but is also associated with Agroscope, 
171
affiliated with ETH and WSL, but is also associated with Agroscope, 
            
172
EAWAG, the European Joint Research Centre and Vogelwarte.",
172
EAWAG, the European Joint Research Centre and Vogelwarte.",
            
173
    "id": "153392ee-d556-4b16-a330-dedb177e87f9",
173
    "id": "153392ee-d556-4b16-a330-dedb177e87f9",
            
174
    "image_url": 
174
    "image_url": 
            
175
le.ethz.ch/_jcr_content/orgbox/image.imageformat.logo.1254626489.png",
175
le.ethz.ch/_jcr_content/orgbox/image.imageformat.logo.1254626489.png",
            
176
    "is_organization": true,
176
    "is_organization": true,
            
177
    "name": "ele-group",
177
    "name": "ele-group",
            
178
    "state": "active",
178
    "state": "active",
            
179
    "title": "Ecosystems and Landscape Evolution",
179
    "title": "Ecosystems and Landscape Evolution",
            
180
    "type": "organization"
180
    "type": "organization"
            
181
  },
181
  },
            
182
  "owner_org": "153392ee-d556-4b16-a330-dedb177e87f9",
182
  "owner_org": "153392ee-d556-4b16-a330-dedb177e87f9",
            
183
  "private": false,
183
  "private": false,
            
184
  "publication": "{\"publication_year\": \"2024\", \"publisher\": 
184
  "publication": "{\"publication_year\": \"2024\", \"publisher\": 
            
185
\"EnviDat\"}",
185
\"EnviDat\"}",
            
186
  "publication_state": "published",
186
  "publication_state": "published",
            
187
  "related_datasets": "",
187
  "related_datasets": "",
            
188
  "related_publications": "Polanco A., Marques, V., Fopp, F., Juhel, 
188
  "related_publications": "Polanco A., Marques, V., Fopp, F., Juhel, 
            
189
J.B., Borrero-P\u00e9rez, G.H., Cheutin, M.C., Dejean, T., 
189
J.B., Borrero-P\u00e9rez, G.H., Cheutin, M.C., Dejean, T., 
            
190
Gonz\u00e1lez Corredor J.D., Acosta-Chaparro, A., Hocd\u00e9, R., Eme, 
190
Gonz\u00e1lez Corredor J.D., Acosta-Chaparro, A., Hocd\u00e9, R., Eme, 
            
191
D., Maire, E., Spescha, M., Valentini, A., Manel, S., Mouillot, D., 
191
D., Maire, E., Spescha, M., Valentini, A., Manel, S., Mouillot, D., 
            
192
Albouy, C., & Pellissier, L. (2020). Comparing environmental DNA 
192
Albouy, C., & Pellissier, L. (2020). Comparing environmental DNA 
            
193
metabarcoding and underwater visual census to monitor tropical reef 
193
metabarcoding and underwater visual census to monitor tropical reef 
            
194
fishes; environmental DNA, 3: 142\u2013156. 
194
fishes; environmental DNA, 3: 142\u2013156. 
            
195
https://doi.org/10.1002/edn3.140.",
195
https://doi.org/10.1002/edn3.140.",
            
196
  "relationships_as_object": [],
196
  "relationships_as_object": [],
            
197
  "relationships_as_subject": [],
197
  "relationships_as_subject": [],
            
198
  "resource_type": "dataset",
198
  "resource_type": "dataset",
            
199
  "resource_type_general": "dataset",
199
  "resource_type_general": "dataset",
            
200
  "resources": [
200
  "resources": [
            
201
    {
201
    {
            
202
      "cache_last_updated": null,
202
      "cache_last_updated": null,
            
203
      "cache_url": null,
203
      "cache_url": null,
            
204
      "created": "2024-09-20T08:21:55.099898",
204
      "created": "2024-09-20T08:21:55.099898",
            
205
      "description": "",
205
      "description": "",
            
206
      "doi": "",
206
      "doi": "",
            
207
      "format": "csv + fastq",
207
      "format": "csv + fastq",
            
208
      "hash": "",
208
      "hash": "",
            
209
      "id": "533553e4-c750-4573-8deb-7f0a3cd01933",
209
      "id": "533553e4-c750-4573-8deb-7f0a3cd01933",
            
210
      "last_modified": "2024-09-23T15:48:09.534000",
210
      "last_modified": "2024-09-23T15:48:09.534000",
            
211
      "metadata_modified": "2024-09-23T13:48:09.850895",
211
      "metadata_modified": "2024-09-23T13:48:09.850895",
            
212
      "mimetype": null,
212
      "mimetype": null,
            
213
      "mimetype_inner": null,
213
      "mimetype_inner": null,
            
214
      "name": "Data access",
214
      "name": "Data access",
            
215
      "package_id": "727198ac-8d35-40a5-91ba-16f1a743684c",
215
      "package_id": "727198ac-8d35-40a5-91ba-16f1a743684c",
            
216
      "position": 0,
216
      "position": 0,
            
217
      "publication_state": "",
217
      "publication_state": "",
            
218
      "resource_size": 
218
      "resource_size": 
            
219
"{\"size_value\":\"29\",\"size_units\":\"gb\"}",
219
"{\"size_value\":\"29\",\"size_units\":\"gb\"}",
            
220
      "resource_type": null,
220
      "resource_type": null,
            
221
      "restricted": 
221
      "restricted": 
            
222
{\"level\":\"public\",\"allowed_users\":\"\",\"shared_secret\":\"\"}",
222
{\"level\":\"public\",\"allowed_users\":\"\",\"shared_secret\":\"\"}",
            
223
      "size": null,
223
      "size": null,
            
224
      "state": "active",
224
      "state": "active",
            
225
      "url": 
225
      "url": 
            
226
%3A%2F%2Fenvicloud.wsl.ch%2Fedna%2F&prefix=ma_co%2Fma_co_provid_2019",
226
%3A%2F%2Fenvicloud.wsl.ch%2Fedna%2F&prefix=ma_co%2Fma_co_provid_2019",
            
227
      "url_type": null
227
      "url_type": null
            
228
    }
228
    }
            
229
  ],
229
  ],
            
230
  "spatial": 
230
  "spatial": 
            
231
rties\":{\"name\":\"environmental-dna-marine-columbia-evhoe-2020\"}}",
231
rties\":{\"name\":\"environmental-dna-marine-columbia-evhoe-2020\"}}",
            
232
  "spatial_info": "Switzerland",
232
  "spatial_info": "Switzerland",
            
233
  "state": "active",
233
  "state": "active",
            
234
  "subtitle": "",
234
  "subtitle": "",
            
235
  "tags": [
235
  "tags": [
            
236
    {
236
    {
            
237
      "display_name": "BIODIVERSITY",
237
      "display_name": "BIODIVERSITY",
            
238
      "id": "cb53f136-b0e5-418c-a3d3-cda8d0945ec6",
238
      "id": "cb53f136-b0e5-418c-a3d3-cda8d0945ec6",
            
239
      "name": "BIODIVERSITY",
239
      "name": "BIODIVERSITY",
            
240
      "state": "active",
240
      "state": "active",
            
241
      "vocabulary_id": null
241
      "vocabulary_id": null
            
242
    },
242
    },
            
243
    {
243
    {
            
244
      "display_name": "BIOMONITORING",
244
      "display_name": "BIOMONITORING",
            
245
      "id": "941af5e5-e550-4178-bc69-9a7e7ab8d311",
245
      "id": "941af5e5-e550-4178-bc69-9a7e7ab8d311",
            
246
      "name": "BIOMONITORING",
246
      "name": "BIOMONITORING",
            
247
      "state": "active",
247
      "state": "active",
            
248
      "vocabulary_id": null
248
      "vocabulary_id": null
            
249
    },
249
    },
            
250
    {
250
    {
            
251
      "display_name": "CARIBBEAN REGION",
251
      "display_name": "CARIBBEAN REGION",
            
252
      "id": "8844223b-bb3e-40e8-9f26-68647209ca79",
252
      "id": "8844223b-bb3e-40e8-9f26-68647209ca79",
            
253
      "name": "CARIBBEAN REGION",
253
      "name": "CARIBBEAN REGION",
            
254
      "state": "active",
254
      "state": "active",
            
255
      "vocabulary_id": null
255
      "vocabulary_id": null
            
256
    },
256
    },
            
257
    {
257
    {
            
258
      "display_name": "EDNA",
258
      "display_name": "EDNA",
            
259
      "id": "dab1a17e-9bf9-4e0a-9a60-c3ca8f8a9154",
259
      "id": "dab1a17e-9bf9-4e0a-9a60-c3ca8f8a9154",
            
260
      "name": "EDNA",
260
      "name": "EDNA",
            
261
      "state": "active",
261
      "state": "active",
            
262
      "vocabulary_id": null
262
      "vocabulary_id": null
            
263
    },
263
    },
            
264
    {
264
    {
            
265
      "display_name": "ENVIRONMENTAL DNA",
265
      "display_name": "ENVIRONMENTAL DNA",
            
266
      "id": "db7d5622-d1fc-4d24-91f7-73842c6743b6",
266
      "id": "db7d5622-d1fc-4d24-91f7-73842c6743b6",
            
267
      "name": "ENVIRONMENTAL DNA",
267
      "name": "ENVIRONMENTAL DNA",
            
268
      "state": "active",
268
      "state": "active",
            
269
      "vocabulary_id": null
269
      "vocabulary_id": null
            
270
    },
270
    },
            
271
    {
271
    {
            
272
      "display_name": "MARINE",
272
      "display_name": "MARINE",
            
273
      "id": "1f05d702-5580-40ac-9c9a-47127e050fa7",
273
      "id": "1f05d702-5580-40ac-9c9a-47127e050fa7",
            
274
      "name": "MARINE",
274
      "name": "MARINE",
            
275
      "state": "active",
275
      "state": "active",
            
276
      "vocabulary_id": null
276
      "vocabulary_id": null
            
277
    },
277
    },
            
278
    {
278
    {
            
279
      "display_name": "REEF FISH",
279
      "display_name": "REEF FISH",
            
280
      "id": "9c505aa1-e9b4-4120-a152-49aadf53617a",
280
      "id": "9c505aa1-e9b4-4120-a152-49aadf53617a",
            
281
      "name": "REEF FISH",
281
      "name": "REEF FISH",
            
282
      "state": "active",
282
      "state": "active",
            
283
      "vocabulary_id": null
283
      "vocabulary_id": null
            
284
    },
284
    },
            
285
    {
285
    {
            
286
      "display_name": "TELEO",
286
      "display_name": "TELEO",
            
287
      "id": "d67a8d9b-568f-45dc-ac71-fd05228faa6b",
287
      "id": "d67a8d9b-568f-45dc-ac71-fd05228faa6b",
            
288
      "name": "TELEO",
288
      "name": "TELEO",
            
289
      "state": "active",
289
      "state": "active",
            
290
      "vocabulary_id": null
290
      "vocabulary_id": null
            
291
    }
291
    }
            
292
  ],
292
  ],
            
293
  "title": "Environmental DNA Marine Colombia Providencia 2019",
293
  "title": "Environmental DNA Marine Colombia Providencia 2019",
            
294
  "type": "dataset",
294
  "type": "dataset",
            
295
  "url": null,
295
  "url": null,
            
296
  "version": "1.0"
296
  "version": "1.0"
            
297
}
297
}