Changes

              
    

          
          
        
        

            
f
1
{
f
1
{
            
2
  "author": "[{\"affiliation\": \"WSL\", \"affiliation_02\": \"\", 
2
  "author": "[{\"affiliation\": \"WSL\", \"affiliation_02\": \"\", 
            
3
\"affiliation_03\": \"\", \"data_credit\": [\"software\", 
3
\"affiliation_03\": \"\", \"data_credit\": [\"software\", 
            
4
\"publication\"], \"email\": \"klaus.ecker@wsl.ch\", \"given_name\": 
4
\"publication\"], \"email\": \"klaus.ecker@wsl.ch\", \"given_name\": 
            
5
\"Klaus\", \"identifier\": \"0000-0003-3388-1353\", \"name\": 
5
\"Klaus\", \"identifier\": \"0000-0003-3388-1353\", \"name\": 
            
6
\"Ecker\"}, {\"affiliation\": \"Institute of Statistics, University of 
6
\"Ecker\"}, {\"affiliation\": \"Institute of Statistics, University of 
            
7
Neuchatel\", \"affiliation_02\": \"\", \"affiliation_03\": \"\", 
7
Neuchatel\", \"affiliation_02\": \"\", \"affiliation_03\": \"\", 
            
8
\"data_credit\": [\"software\", \"publication\", \"supervision\"], 
8
\"data_credit\": [\"software\", \"publication\", \"supervision\"], 
            
9
\"email\": \"yves.tille@unine.ch\", \"given_name\": \"Yves\", 
9
\"email\": \"yves.tille@unine.ch\", \"given_name\": \"Yves\", 
            
10
\"identifier\": \"0000-0003-0904-5523\", \"name\": \"Till\\u00e9\"}]",
10
\"identifier\": \"0000-0003-0904-5523\", \"name\": \"Till\\u00e9\"}]",
            
11
  "author_email": null,
11
  "author_email": null,
            
12
  "creator_user_id": "ec8ebbf4-320b-4371-9c5a-998a7cd08c1d",
12
  "creator_user_id": "ec8ebbf4-320b-4371-9c5a-998a7cd08c1d",
            
13
  "date": "[{\"date\": \"2023-11-05\", \"date_type\": \"created\", 
13
  "date": "[{\"date\": \"2023-11-05\", \"date_type\": \"created\", 
            
14
\"end_date\": \"\"}]",
14
\"end_date\": \"\"}]",
            
15
  "doi": "10.16904/envidat.402",
15
  "doi": "10.16904/envidat.402",
            
16
  "funding": "[{\"grant_number\": \"\", \"institution\": \"FOEN\", 
16
  "funding": "[{\"grant_number\": \"\", \"institution\": \"FOEN\", 
            
17
\"institution_url\": \"\"}]",
17
\"institution_url\": \"\"}]",
            
18
  "groups": [],
18
  "groups": [],
            
19
  "id": "0b303fb7-17fc-4910-af8f-dbee54c0d093",
19
  "id": "0b303fb7-17fc-4910-af8f-dbee54c0d093",
            
20
  "isopen": false,
20
  "isopen": false,
            
21
  "language": "en",
21
  "language": "en",
            
22
  "license_id": "other-undefined",
22
  "license_id": "other-undefined",
            
23
  "license_title": "Other (Specified in the description)",
23
  "license_title": "Other (Specified in the description)",
            
24
  "maintainer": "{\"affiliation\": \"WSL\", \"email\": 
24
  "maintainer": "{\"affiliation\": \"WSL\", \"email\": 
            
25
\"klaus.ecker@wsl.ch\", \"given_name\": \"Klaus\", \"identifier\": 
25
\"klaus.ecker@wsl.ch\", \"given_name\": \"Klaus\", \"identifier\": 
            
26
\"0000-0003-3388-1353\", \"name\": \"Ecker\"}",
26
\"0000-0003-3388-1353\", \"name\": \"Ecker\"}",
            
27
  "maintainer_email": null,
27
  "maintainer_email": null,
            
28
  "metadata_created": "2023-05-11T14:32:34.812518",
28
  "metadata_created": "2023-05-11T14:32:34.812518",
            
n
29
  "metadata_modified": "2023-05-15T08:36:11.718759",
n
29
  "metadata_modified": "2023-05-15T08:36:13.288865",
            
30
  "name": "r-script-first-stage-sampling",
30
  "name": "r-script-first-stage-sampling",
            
31
  "notes": "License: GPL-v2\r\n\r\nThe R script illustrates an avanced 
31
  "notes": "License: GPL-v2\r\n\r\nThe R script illustrates an avanced 
            
32
sampling approach for monitoring biodiversity on agricultural land by 
32
sampling approach for monitoring biodiversity on agricultural land by 
            
33
combining multiple objectives and integrating environmental and 
33
combining multiple objectives and integrating environmental and 
            
34
geographic space for optimal estimation efficiency.\r\n\r\nIn doing 
34
geographic space for optimal estimation efficiency.\r\n\r\nIn doing 
            
35
so, the R script demonstrates the first-stage selection of squares 
35
so, the R script demonstrates the first-stage selection of squares 
            
36
(km2) in the ALL-EMA sampling design using modern sampling techniques 
36
(km2) in the ALL-EMA sampling design using modern sampling techniques 
            
37
such as unequal probability sampling with fixed sample size, balanced 
37
such as unequal probability sampling with fixed sample size, balanced 
            
38
sampling, stratified balancing and geographic spreading. Sampling is 
38
sampling, stratified balancing and geographic spreading. Sampling is 
            
39
done with unequal probabilities and weights defined by power 
39
done with unequal probabilities and weights defined by power 
            
40
allocation to give equal weight to extrapolations to the total 
40
allocation to give equal weight to extrapolations to the total 
            
41
agricultural area of Switzerland and two stratifications of predefined 
41
agricultural area of Switzerland and two stratifications of predefined 
            
42
interest (regions and agricultural production zones). Calibration is 
42
interest (regions and agricultural production zones). Calibration is 
            
43
used to limit the distribution of the sampling  weights. The sample 
43
used to limit the distribution of the sampling  weights. The sample 
            
44
sizes are almost fixed within the strata and evenly distibuted across 
44
sizes are almost fixed within the strata and evenly distibuted across 
            
45
the years of a temporal rotation plan, which is favourable for the 
45
the years of a temporal rotation plan, which is favourable for the 
            
46
organisation of the field survey. Sampling also ensures an optimal 
46
organisation of the field survey. Sampling also ensures an optimal 
            
47
(annual) distribution across geographic space, including altitude. 
47
(annual) distribution across geographic space, including altitude. 
            
48
Despite the complexity of the sampling, estimation based on 
48
Despite the complexity of the sampling, estimation based on 
            
49
probability theory is straightforward.\r\n\r\nEcker, K., Meier, E. & 
49
probability theory is straightforward.\r\n\r\nEcker, K., Meier, E. & 
            
50
Till\u00e9, Y. review. Integrating spatial and ecological information 
50
Till\u00e9, Y. review. Integrating spatial and ecological information 
            
51
into comprehensive biodiversity monitoring on agricultural land. 
51
into comprehensive biodiversity monitoring on agricultural land. 
            
52
Environmental Monitoring and Assessment.\r\n",
52
Environmental Monitoring and Assessment.\r\n",
            
53
  "num_resources": 2,
53
  "num_resources": 2,
            
54
  "num_tags": 5,
54
  "num_tags": 5,
            
55
  "organization": {
55
  "organization": {
            
56
    "approval_status": "approved",
56
    "approval_status": "approved",
            
57
    "created": "2018-07-18T11:14:04.773731",
57
    "created": "2018-07-18T11:14:04.773731",
            
58
    "description": "We assess and analyse the state of different 
58
    "description": "We assess and analyse the state of different 
            
59
habitat types and their ecological changes with a particular focus on 
59
habitat types and their ecological changes with a particular focus on 
            
60
the habitats of national importance of Switzerland. We concentrate on 
60
the habitats of national importance of Switzerland. We concentrate on 
            
61
ecological changes and their causes in different ecosystems and 
61
ecological changes and their causes in different ecosystems and 
            
62
habitat types of Switzerland. We are especially interested in the 
62
habitat types of Switzerland. We are especially interested in the 
            
63
effects of different management systems, nutrient input, land-use 
63
effects of different management systems, nutrient input, land-use 
            
64
change (e.g. intensification, abandonment), habitat fragmentation as 
64
change (e.g. intensification, abandonment), habitat fragmentation as 
            
65
well as climate change on ecosystem state. We base our research on 
65
well as climate change on ecosystem state. We base our research on 
            
66
systematically assessed floristic and faunistic biodiversity-data, 
66
systematically assessed floristic and faunistic biodiversity-data, 
            
67
modelling and remote sensing information.\r\n\r\nWe strongly engage in 
67
modelling and remote sensing information.\r\n\r\nWe strongly engage in 
            
68
the monitoring and evaluation of qualitative and quantitative changes 
68
the monitoring and evaluation of qualitative and quantitative changes 
            
69
in natural or semi-natural habitats of Switzerland as a basis for 
69
in natural or semi-natural habitats of Switzerland as a basis for 
            
70
decision-making in policy and applied nature conservation. In the 
70
decision-making in policy and applied nature conservation. In the 
            
71
project \"Effectiveness of Habitat Protection in Switzerland\", 
71
project \"Effectiveness of Habitat Protection in Switzerland\", 
            
72
commissioned by the Federal Office of Environment BAFU, we concentrate 
72
commissioned by the Federal Office of Environment BAFU, we concentrate 
            
73
on the habitats of national importance (raised bogs, transitional 
73
on the habitats of national importance (raised bogs, transitional 
            
74
mires and fens, dry meadows, alluvial zones and amphibian spawning 
74
mires and fens, dry meadows, alluvial zones and amphibian spawning 
            
75
areas), i.e. the \"crown jewelry\" of Swiss nature reserves. Moreover, 
75
areas), i.e. the \"crown jewelry\" of Swiss nature reserves. Moreover, 
            
76
we share our knowledge on mire protection through consulting 
76
we share our knowledge on mire protection through consulting 
            
77
activities for the national government and the cantons.",
77
activities for the national government and the cantons.",
            
78
    "id": "0ee5727f-9228-464f-b4c2-a7399e702be2",
78
    "id": "0ee5727f-9228-464f-b4c2-a7399e702be2",
            
79
    "image_url": 
79
    "image_url": 
            
80
"https://upload.wikimedia.org/wikipedia/de/9/94/Logo_WSL.svg",
80
"https://upload.wikimedia.org/wikipedia/de/9/94/Logo_WSL.svg",
            
81
    "is_organization": true,
81
    "is_organization": true,
            
82
    "name": "ecosystems-dynamics",
82
    "name": "ecosystems-dynamics",
            
83
    "state": "active",
83
    "state": "active",
            
84
    "title": "Ecosystems Dynamics",
84
    "title": "Ecosystems Dynamics",
            
85
    "type": "organization"
85
    "type": "organization"
            
86
  },
86
  },
            
87
  "owner_org": "0ee5727f-9228-464f-b4c2-a7399e702be2",
87
  "owner_org": "0ee5727f-9228-464f-b4c2-a7399e702be2",
            
88
  "private": false,
88
  "private": false,
            
89
  "publication": "{\"publication_year\": \"2023\", \"publisher\": 
89
  "publication": "{\"publication_year\": \"2023\", \"publisher\": 
            
90
\"EnviDat\"}",
90
\"EnviDat\"}",
            
91
  "publication_state": "published",
91
  "publication_state": "published",
            
92
  "related_datasets": "",
92
  "related_datasets": "",
            
93
  "related_publications": "",
93
  "related_publications": "",
            
94
  "relationships_as_object": [],
94
  "relationships_as_object": [],
            
95
  "relationships_as_subject": [],
95
  "relationships_as_subject": [],
            
96
  "resource_type": "dataset",
96
  "resource_type": "dataset",
            
97
  "resource_type_general": "dataset",
97
  "resource_type_general": "dataset",
            
98
  "resources": [
98
  "resources": [
            
99
    {
99
    {
            
100
      "cache_last_updated": null,
100
      "cache_last_updated": null,
            
101
      "cache_url": null,
101
      "cache_url": null,
            
102
      "created": "2023-05-11T14:34:56.984148",
102
      "created": "2023-05-11T14:34:56.984148",
            
103
      "description": "",
103
      "description": "",
            
104
      "doi": "",
104
      "doi": "",
            
105
      "format": ".txt",
105
      "format": ".txt",
            
106
      "hash": "",
106
      "hash": "",
            
107
      "id": "89264e93-545c-4794-b6eb-46247ec92310",
107
      "id": "89264e93-545c-4794-b6eb-46247ec92310",
            
108
      "last_modified": "2023-05-15T07:49:49.495263",
108
      "last_modified": "2023-05-15T07:49:49.495263",
            
109
      "metadata_modified": "2023-05-15T07:49:49.899983",
109
      "metadata_modified": "2023-05-15T07:49:49.899983",
            
110
      "mimetype": null,
110
      "mimetype": null,
            
111
      "mimetype_inner": null,
111
      "mimetype_inner": null,
            
112
      "name": "input data for r script",
112
      "name": "input data for r script",
            
113
      "package_id": "0b303fb7-17fc-4910-af8f-dbee54c0d093",
113
      "package_id": "0b303fb7-17fc-4910-af8f-dbee54c0d093",
            
114
      "position": 0,
114
      "position": 0,
            
115
      "publication_state": "",
115
      "publication_state": "",
            
116
      "resource_size": "{\"size_value\": \"\", \"size_units\": 
116
      "resource_size": "{\"size_value\": \"\", \"size_units\": 
            
117
\"kb\"}",
117
\"kb\"}",
            
118
      "resource_type": null,
118
      "resource_type": null,
            
119
      "restricted": "{\"level\": \"public\", \"allowed_users\": \"\", 
119
      "restricted": "{\"level\": \"public\", \"allowed_users\": \"\", 
            
120
\"shared_secret\": \"\"}",
120
\"shared_secret\": \"\"}",
            
121
      "size": 22605,
121
      "size": 22605,
            
122
      "state": "active",
122
      "state": "active",
            
123
      "url": 
123
      "url": 
            
124
c0d093/resource/89264e93-545c-4794-b6eb-46247ec92310/download/s0.csv",
124
c0d093/resource/89264e93-545c-4794-b6eb-46247ec92310/download/s0.csv",
            
125
      "url_type": "upload"
125
      "url_type": "upload"
            
126
    },
126
    },
            
127
    {
127
    {
            
128
      "cache_last_updated": null,
128
      "cache_last_updated": null,
            
129
      "cache_url": null,
129
      "cache_url": null,
            
130
      "created": "2023-05-11T14:37:38.630324",
130
      "created": "2023-05-11T14:37:38.630324",
            
131
      "description": "",
131
      "description": "",
            
132
      "doi": "",
132
      "doi": "",
            
133
      "format": ".R",
133
      "format": ".R",
            
134
      "hash": "",
134
      "hash": "",
            
135
      "id": "2fa8e0c9-acbb-4a25-bb8e-79c76908a3b7",
135
      "id": "2fa8e0c9-acbb-4a25-bb8e-79c76908a3b7",
            
t
136
      "last_modified": "2023-05-15T07:48:52.722853",
t
136
      "last_modified": "2023-05-15T08:36:12.905454",
            
137
      "metadata_modified": "2023-05-15T08:36:11.734456",
137
      "metadata_modified": "2023-05-15T08:36:13.298840",
            
138
      "mimetype": null,
138
      "mimetype": null,
            
139
      "mimetype_inner": null,
139
      "mimetype_inner": null,
            
140
      "name": "R script",
140
      "name": "R script",
            
141
      "package_id": "0b303fb7-17fc-4910-af8f-dbee54c0d093",
141
      "package_id": "0b303fb7-17fc-4910-af8f-dbee54c0d093",
            
142
      "position": 1,
142
      "position": 1,
            
143
      "publication_state": "",
143
      "publication_state": "",
            
144
      "resource_size": "{\"size_value\": \"\", \"size_units\": 
144
      "resource_size": "{\"size_value\": \"\", \"size_units\": 
            
145
\"kb\"}",
145
\"kb\"}",
            
146
      "resource_type": null,
146
      "resource_type": null,
            
147
      "restricted": "{\"level\": \"public\", \"allowed_users\": \"\", 
147
      "restricted": "{\"level\": \"public\", \"allowed_users\": \"\", 
            
148
\"shared_secret\": \"\"}",
148
\"shared_secret\": \"\"}",
            
149
      "size": 10106,
149
      "size": 10106,
            
150
      "state": "active",
150
      "state": "active",
            
151
      "url": 
151
      "url": 
            
152
/2fa8e0c9-acbb-4a25-bb8e-79c76908a3b7/download/sample_selection_s1.r",
152
/2fa8e0c9-acbb-4a25-bb8e-79c76908a3b7/download/sample_selection_s1.r",
            
153
      "url_type": "upload"
153
      "url_type": "upload"
            
154
    }
154
    }
            
155
  ],
155
  ],
            
156
  "spatial": "{\"type\": \"Polygon\", \"coordinates\": [[[5.95587, 
156
  "spatial": "{\"type\": \"Polygon\", \"coordinates\": [[[5.95587, 
            
157
45.81802],[5.95587, 47.80838],[10.49203, 47.80838],[10.49203, 
157
45.81802],[5.95587, 47.80838],[10.49203, 47.80838],[10.49203, 
            
158
45.81802],[5.95587, 45.81802]]]}",
158
45.81802],[5.95587, 45.81802]]]}",
            
159
  "spatial_info": "Switzerland",
159
  "spatial_info": "Switzerland",
            
160
  "state": "active",
160
  "state": "active",
            
161
  "subtitle": "",
161
  "subtitle": "",
            
162
  "tags": [
162
  "tags": [
            
163
    {
163
    {
            
164
      "display_name": "BALANCED SAMPLING",
164
      "display_name": "BALANCED SAMPLING",
            
165
      "id": "64aaea7f-cd25-4c75-a37b-bc4c342510d6",
165
      "id": "64aaea7f-cd25-4c75-a37b-bc4c342510d6",
            
166
      "name": "BALANCED SAMPLING",
166
      "name": "BALANCED SAMPLING",
            
167
      "state": "active",
167
      "state": "active",
            
168
      "vocabulary_id": null
168
      "vocabulary_id": null
            
169
    },
169
    },
            
170
    {
170
    {
            
171
      "display_name": "HABITAT",
171
      "display_name": "HABITAT",
            
172
      "id": "af968922-763a-4f34-b156-a33745dc1852",
172
      "id": "af968922-763a-4f34-b156-a33745dc1852",
            
173
      "name": "HABITAT",
173
      "name": "HABITAT",
            
174
      "state": "active",
174
      "state": "active",
            
175
      "vocabulary_id": null
175
      "vocabulary_id": null
            
176
    },
176
    },
            
177
    {
177
    {
            
178
      "display_name": "MULTI-STAGE",
178
      "display_name": "MULTI-STAGE",
            
179
      "id": "0104f31b-7abc-425e-b5b2-e892c24113a3",
179
      "id": "0104f31b-7abc-425e-b5b2-e892c24113a3",
            
180
      "name": "MULTI-STAGE",
180
      "name": "MULTI-STAGE",
            
181
      "state": "active",
181
      "state": "active",
            
182
      "vocabulary_id": null
182
      "vocabulary_id": null
            
183
    },
183
    },
            
184
    {
184
    {
            
185
      "display_name": "UNEQUAL PROBABILITY",
185
      "display_name": "UNEQUAL PROBABILITY",
            
186
      "id": "ab7374b6-8cb8-4394-b06e-ce172c867317",
186
      "id": "ab7374b6-8cb8-4394-b06e-ce172c867317",
            
187
      "name": "UNEQUAL PROBABILITY",
187
      "name": "UNEQUAL PROBABILITY",
            
188
      "state": "active",
188
      "state": "active",
            
189
      "vocabulary_id": null
189
      "vocabulary_id": null
            
190
    },
190
    },
            
191
    {
191
    {
            
192
      "display_name": "VEGETATION",
192
      "display_name": "VEGETATION",
            
193
      "id": "d2f171f0-87f1-4e4a-aa7d-535d103ce617",
193
      "id": "d2f171f0-87f1-4e4a-aa7d-535d103ce617",
            
194
      "name": "VEGETATION",
194
      "name": "VEGETATION",
            
195
      "state": "active",
195
      "state": "active",
            
196
      "vocabulary_id": null
196
      "vocabulary_id": null
            
197
    }
197
    }
            
198
  ],
198
  ],
            
199
  "title": "R script and input data for \"ALL-EMA sampling design\"",
199
  "title": "R script and input data for \"ALL-EMA sampling design\"",
            
200
  "type": "dataset",
200
  "type": "dataset",
            
201
  "url": null,
201
  "url": null,
            
202
  "version": "1.0"
202
  "version": "1.0"
            
203
}
203
}