Changes

              
    

          
          
        
        

            
f
1
{
f
1
{
            
2
  "author": "[{\"given_name\": \"Merin\", \"name\": \"Reji Chacko\", 
2
  "author": "[{\"given_name\": \"Merin\", \"name\": \"Reji Chacko\", 
            
3
\"email\": \"merin.rejichacko@gmail.com\", \"data_credit\": 
3
\"email\": \"merin.rejichacko@gmail.com\", \"data_credit\": 
            
4
[\"curation\", \"collection\", \"validation\", \"publication\", 
4
[\"curation\", \"collection\", \"validation\", \"publication\", 
            
5
\"software\"], \"identifier\": \"0000-0002-6069-4281\", 
5
\"software\"], \"identifier\": \"0000-0002-6069-4281\", 
            
6
\"affiliation\": \"WSL\"}, {\"given_name\": \"Camille\", \"name\": 
6
\"affiliation\": \"WSL\"}, {\"given_name\": \"Camille\", \"name\": 
            
7
\"Albouy\", \"email\": \"albouycamille@gmail.com\", \"data_credit\": 
7
\"Albouy\", \"email\": \"albouycamille@gmail.com\", \"data_credit\": 
            
8
[\"supervision\", \"publication\"], \"identifier\": 
8
[\"supervision\", \"publication\"], \"identifier\": 
            
9
\"0000-0003-1629-2389\", \"affiliation\": \"ETH\"}, {\"given_name\": 
9
\"0000-0003-1629-2389\", \"affiliation\": \"ETH\"}, {\"given_name\": 
            
10
\"Florian\", \"name\": \"Altermatt\", \"email\": 
10
\"Florian\", \"name\": \"Altermatt\", \"email\": 
            
11
\"florian.altermatt@ieu.uzh.ch\", \"data_credit\": [\"supervision\", 
11
\"florian.altermatt@ieu.uzh.ch\", \"data_credit\": [\"supervision\", 
            
12
\"curation\", \"collection\", \"publication\"], \"identifier\": \"\", 
12
\"curation\", \"collection\", \"publication\"], \"identifier\": \"\", 
            
13
\"affiliation\": \"Univ Zurich\"}, {\"given_name\": \"Martin\", 
13
\"affiliation\": \"Univ Zurich\"}, {\"given_name\": \"Martin\", 
            
14
\"name\": \"Br\\u00e4ndle\", \"email\": 
14
\"name\": \"Br\\u00e4ndle\", \"email\": 
            
15
\"braendle@biologie.uni-marburg.de\", \"data_credit\": 
15
\"braendle@biologie.uni-marburg.de\", \"data_credit\": 
            
16
[\"collection\", \"publication\"], \"identifier\": \"\", 
16
[\"collection\", \"publication\"], \"identifier\": \"\", 
            
17
\"affiliation\": \"Philipps-Universit\\u00e4t Marburg\"}, 
17
\"affiliation\": \"Philipps-Universit\\u00e4t Marburg\"}, 
            
18
{\"given_name\": \"Joan\", \"name\": \"Casanelles Abella\", \"email\": 
18
{\"given_name\": \"Joan\", \"name\": \"Casanelles Abella\", \"email\": 
            
19
\"joan.casanelles@wsl.ch\", \"data_credit\": [\"collection\", 
19
\"joan.casanelles@wsl.ch\", \"data_credit\": [\"collection\", 
            
20
\"publication\"], \"identifier\": \"0000-0003-1924-9298\", 
20
\"publication\"], \"identifier\": \"0000-0003-1924-9298\", 
            
21
\"affiliation\": \"WSL\"}, {\"given_name\": \"Victor\", \"name\": 
21
\"affiliation\": \"WSL\"}, {\"given_name\": \"Victor\", \"name\": 
            
22
\"Boussange\", \"email\": \"victor.boussange@wsl.ch\", 
22
\"Boussange\", \"email\": \"victor.boussange@wsl.ch\", 
            
23
\"data_credit\": [\"validation\", \"publication\"], \"identifier\": 
23
\"data_credit\": [\"validation\", \"publication\"], \"identifier\": 
            
24
\"\", \"affiliation\": \"WSL\"}, {\"given_name\": \"Fadri\", \"name\": 
24
\"\", \"affiliation\": \"WSL\"}, {\"given_name\": \"Fadri\", \"name\": 
            
25
\"Campell\", \"email\": \"fadri.campell@hotmail.com\", 
25
\"Campell\", \"email\": \"fadri.campell@hotmail.com\", 
            
26
\"data_credit\": [\"publication\", \"software\", \"collection\"], 
26
\"data_credit\": [\"publication\", \"software\", \"collection\"], 
            
27
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"WSL\"}, {\"given_name\": 
27
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"WSL\"}, {\"given_name\": 
            
28
\"Willem N\", \"name\": \"Ellis\", \"email\": 
28
\"Willem N\", \"name\": \"Ellis\", \"email\": 
            
29
\"wnellis@bladmineerders.nl\", \"data_credit\": [\"collection\", 
29
\"wnellis@bladmineerders.nl\", \"data_credit\": [\"collection\", 
            
30
\"curation\", \"publication\"], \"identifier\": \"\", \"affiliation\": 
30
\"curation\", \"publication\"], \"identifier\": \"\", \"affiliation\": 
            
31
\"Independent Researcher\"}, {\"given_name\": \"Fabian\", \"name\": 
31
\"Independent Researcher\"}, {\"given_name\": \"Fabian\", \"name\": 
            
32
\"Fopp\", \"email\": \"fabian.fopp@wsl.ch\", \"data_credit\": 
32
\"Fopp\", \"email\": \"fabian.fopp@wsl.ch\", \"data_credit\": 
            
33
[\"publication\", \"curation\", \"collection\"], \"identifier\": 
33
[\"publication\", \"curation\", \"collection\"], \"identifier\": 
            
34
\"0000-0003-0648-8484\", \"affiliation\": \"WSL\"}, {\"given_name\": 
34
\"0000-0003-0648-8484\", \"affiliation\": \"WSL\"}, {\"given_name\": 
            
35
\"Martin M.\", \"name\": \"Gossner\", \"email\": 
35
\"Martin M.\", \"name\": \"Gossner\", \"email\": 
            
36
\"martin.gossner@wsl.ch\", \"data_credit\": [\"collection\", 
36
\"martin.gossner@wsl.ch\", \"data_credit\": [\"collection\", 
            
37
\"validation\", \"publication\"], \"identifier\": 
37
\"validation\", \"publication\"], \"identifier\": 
            
38
\"0000-0003-1516-6364\", \"affiliation\": \"WSL\"}, {\"given_name\": 
38
\"0000-0003-1516-6364\", \"affiliation\": \"WSL\"}, {\"given_name\": 
            
39
\"Hsi-Cheng\", \"name\": \"Ho.\", \"email\": \"hsichengho@gmail.com\", 
39
\"Hsi-Cheng\", \"name\": \"Ho.\", \"email\": \"hsichengho@gmail.com\", 
            
40
\"data_credit\": [\"publication\", \"supervision\"], \"identifier\": 
40
\"data_credit\": [\"publication\", \"supervision\"], \"identifier\": 
            
41
\"\", \"affiliation\": \"National Taiwan University\"}, 
41
\"\", \"affiliation\": \"National Taiwan University\"}, 
            
42
{\"given_name\": \"Alain\", \"name\": \"Joss\", \"email\": 
42
{\"given_name\": \"Alain\", \"name\": \"Joss\", \"email\": 
            
43
\"alain.joss.1998@gmail.com\", \"data_credit\": [\"curation\", 
43
\"alain.joss.1998@gmail.com\", \"data_credit\": [\"curation\", 
            
44
\"publication\", \"validation\", \"collection\", \"software\"], 
44
\"publication\", \"validation\", \"collection\", \"software\"], 
            
45
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"WSL\"}, {\"given_name\": 
45
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"WSL\"}, {\"given_name\": 
            
46
\"Pascal\", \"name\": \"Kipf\", \"email\": \"pascal.kipf@wsl.ch\", 
46
\"Pascal\", \"name\": \"Kipf\", \"email\": \"pascal.kipf@wsl.ch\", 
            
47
\"data_credit\": [\"collection\", \"publication\", \"curation\"], 
47
\"data_credit\": [\"collection\", \"publication\", \"curation\"], 
            
48
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"WSL\"}, {\"given_name\": 
48
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"WSL\"}, {\"given_name\": 
            
49
\"Felix\", \"name\": \"Neff\", \"email\": \"felix.neff@wsl.ch\", 
49
\"Felix\", \"name\": \"Neff\", \"email\": \"felix.neff@wsl.ch\", 
            
50
\"data_credit\": [\"curation\", \"collection\", \"publication\"], 
50
\"data_credit\": [\"curation\", \"collection\", \"publication\"], 
            
51
\"identifier\": \"0000-0001-7266-2589\", \"affiliation\": 
51
\"identifier\": \"0000-0001-7266-2589\", \"affiliation\": 
            
52
\"Agroscope\"}, {\"given_name\": \"Andjeljko\", \"name\": 
52
\"Agroscope\"}, {\"given_name\": \"Andjeljko\", \"name\": 
            
53
\"Petrovi\\u0107\", \"email\": \"andjeljko@bio.bg.ac.rs\", 
53
\"Petrovi\\u0107\", \"email\": \"andjeljko@bio.bg.ac.rs\", 
            
54
\"data_credit\": [\"collection\", \"publication\"], \"identifier\": 
54
\"data_credit\": [\"collection\", \"publication\"], \"identifier\": 
            
55
\"\", \"affiliation\": \"University of Belgrade\"}, {\"given_name\": 
55
\"\", \"affiliation\": \"University of Belgrade\"}, {\"given_name\": 
            
56
\"Vincent\", \"name\": \"Pri\\u00e9\", \"email\": 
56
\"Vincent\", \"name\": \"Pri\\u00e9\", \"email\": 
            
57
\"vincent.prie@spygen.com\", \"data_credit\": [\"collection\", 
57
\"vincent.prie@spygen.com\", \"data_credit\": [\"collection\", 
            
58
\"publication\"], \"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"SPYGEN\"}, 
58
\"publication\"], \"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"SPYGEN\"}, 
            
59
{\"given_name\": \"\\u017deljko\", \"name\": \"Tomanovi\\u0107\", 
59
{\"given_name\": \"\\u017deljko\", \"name\": \"Tomanovi\\u0107\", 
            
60
\"email\": \"ztoman@bio.bg.ac.rs\", \"data_credit\": [\"curation\", 
60
\"email\": \"ztoman@bio.bg.ac.rs\", \"data_credit\": [\"curation\", 
            
61
\"publication\", \"collection\"], \"identifier\": \"\", 
61
\"publication\", \"collection\"], \"identifier\": \"\", 
            
62
\"affiliation\": \"University of Belgrade, Mus\\u00e9um national 
62
\"affiliation\": \"University of Belgrade, Mus\\u00e9um national 
            
63
d\\u2019Histoire naturelle\"}, {\"given_name\": \"Nik\", \"name\": 
63
d\\u2019Histoire naturelle\"}, {\"given_name\": \"Nik\", \"name\": 
            
64
\"Zimmerli\", \"email\": \"nik_zimmerli@bluewin.ch\", \"data_credit\": 
64
\"Zimmerli\", \"email\": \"nik_zimmerli@bluewin.ch\", \"data_credit\": 
            
65
[\"collection\", \"software\", \"publication\"], \"identifier\": \"\", 
65
[\"collection\", \"software\", \"publication\"], \"identifier\": \"\", 
            
66
\"affiliation\": \"WSL\"}, {\"given_name\": \"Loic\", \"name\": 
66
\"affiliation\": \"WSL\"}, {\"given_name\": \"Loic\", \"name\": 
            
67
\"Pellissier\", \"email\": \"loic.pellissier@wsl.ch\", 
67
\"Pellissier\", \"email\": \"loic.pellissier@wsl.ch\", 
            
68
\"data_credit\": [\"supervision\", \"publication\"], \"identifier\": 
68
\"data_credit\": [\"supervision\", \"publication\"], \"identifier\": 
            
69
\"0000-0002-2289-8259\", \"affiliation\": \"Landscape Ecology, 
69
\"0000-0002-2289-8259\", \"affiliation\": \"Landscape Ecology, 
            
70
Institute of Terrestrial Ecosystems, ETH Z\\u00fcrich, 8049 
70
Institute of Terrestrial Ecosystems, ETH Z\\u00fcrich, 8049 
            
71
Z\\u00fcrich, Switzerland\"}]",
71
Z\\u00fcrich, Switzerland\"}]",
            
72
  "author_email": null,
72
  "author_email": null,
            
73
  "creator_user_id": "adc05669-b377-4101-b441-b9bcb92437df",
73
  "creator_user_id": "adc05669-b377-4101-b441-b9bcb92437df",
            
74
  "date": 
74
  "date": 
            
75
:\"collected\",\"date\":\"2021-01-01\",\"end_date\":\"2023-10-31\"}]",
75
:\"collected\",\"date\":\"2021-01-01\",\"end_date\":\"2023-10-31\"}]",
            
76
  "doi": "10.16904/envidat.467",
76
  "doi": "10.16904/envidat.467",
            
77
  "funding": 
77
  "funding": 
            
78
titution\":\"BAFU\",\"grant_number\":\"\",\"institution_url\":\"\"}]",
78
titution\":\"BAFU\",\"grant_number\":\"\",\"institution_url\":\"\"}]",
            
79
  "groups": [],
79
  "groups": [],
            
80
  "id": "4f9547a1-3018-46f1-a399-09d65a3223f3",
80
  "id": "4f9547a1-3018-46f1-a399-09d65a3223f3",
            
81
  "isopen": true,
81
  "isopen": true,
            
82
  "license_id": "cc-by-sa",
82
  "license_id": "cc-by-sa",
            
83
  "license_title": "Creative Commons Attribution Share-Alike 
83
  "license_title": "Creative Commons Attribution Share-Alike 
            
84
(CC-BY-SA)",
84
(CC-BY-SA)",
            
85
  "license_url": "https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/",
85
  "license_url": "https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/",
            
86
  "maintainer": 
86
  "maintainer": 
            
87
"merin.rejichacko@gmail.com\",\"given_name\":\"Merin\",\"name\":\"Reji 
87
"merin.rejichacko@gmail.com\",\"given_name\":\"Merin\",\"name\":\"Reji 
            
88
Chacko\"}",
88
Chacko\"}",
            
89
  "maintainer_email": null,
89
  "maintainer_email": null,
            
90
  "metadata_created": "2023-12-04T18:01:01.080640",
90
  "metadata_created": "2023-12-04T18:01:01.080640",
            
n
91
  "metadata_modified": "2024-10-16T08:07:09.372472",
n
91
  "metadata_modified": "2025-03-04T10:59:27.288428",
            
92
  "name": "trophich-a-swiss-foodweb",
92
  "name": "trophich-a-swiss-foodweb",
            
93
  "notes": "Environmental pressures on species can cascade within food 
93
  "notes": "Environmental pressures on species can cascade within food 
            
94
webs and even extend beyond individual ecosystems to interconnected 
94
webs and even extend beyond individual ecosystems to interconnected 
            
95
systems at large spatial scales. To facilitate the exploration of 
95
systems at large spatial scales. To facilitate the exploration of 
            
96
these dynamics, we construct a data-based national trophic meta-food 
96
these dynamics, we construct a data-based national trophic meta-food 
            
97
web (henceforth metaweb), that includes well-documented vertebrates, 
97
web (henceforth metaweb), that includes well-documented vertebrates, 
            
98
invertebrates, and vascular plants within Switzerland's national 
98
invertebrates, and vascular plants within Switzerland's national 
            
99
boundaries, and compiles 160 years of ecological knowledge. We 
99
boundaries, and compiles 160 years of ecological knowledge. We 
            
100
additionally use a combination of taxonomic and geographic information 
100
additionally use a combination of taxonomic and geographic information 
            
101
to infer further species-level interactions. Our comprehensive dataset 
101
to infer further species-level interactions. Our comprehensive dataset 
            
102
catalogues 1,112,073 trophic interactions involving 23,151 species and 
102
catalogues 1,112,073 trophic interactions involving 23,151 species and 
            
103
125 feeding guilds (e.g. detritivores, fungivores, etc). While 
103
125 feeding guilds (e.g. detritivores, fungivores, etc). While 
            
104
explorations of large-scale food webs in space and time have often 
104
explorations of large-scale food webs in space and time have often 
            
105
relied on modelling approaches due to limited data availability, this 
105
relied on modelling approaches due to limited data availability, this 
            
106
empirically based metaweb paves the way for data-driven large-scale 
106
empirically based metaweb paves the way for data-driven large-scale 
            
107
studies of real-world food webs. By integrating the metaweb with 
107
studies of real-world food webs. By integrating the metaweb with 
            
108
knowledge of local species assemblages, future studies can gain 
108
knowledge of local species assemblages, future studies can gain 
            
109
insights into the impact of global change drivers, including climate 
109
insights into the impact of global change drivers, including climate 
            
110
change and land-use intensification, on food web structures across 
110
change and land-use intensification, on food web structures across 
            
111
spatial scales.\n\n**Please note that this dataset is under embargo 
111
spatial scales.\n\n**Please note that this dataset is under embargo 
            
112
until publication of the paper.**",
112
until publication of the paper.**",
            
113
  "num_resources": 1,
113
  "num_resources": 1,
            
114
  "num_tags": 7,
114
  "num_tags": 7,
            
115
  "organization": {
115
  "organization": {
            
116
    "approval_status": "approved",
116
    "approval_status": "approved",
            
117
    "created": "2018-12-01T11:59:01.791513",
117
    "created": "2018-12-01T11:59:01.791513",
            
118
    "description": "We are an international research team with diverse 
118
    "description": "We are an international research team with diverse 
            
119
scientific expertise and backgrounds, connected by the goal to 
119
scientific expertise and backgrounds, connected by the goal to 
            
120
understand biodiversity. We study the mechanisms that shape 
120
understand biodiversity. We study the mechanisms that shape 
            
121
biodiversity patterns across spatial and temporal scales - in both 
121
biodiversity patterns across spatial and temporal scales - in both 
            
122
terrestrial and aquatic ecosystems -\u200bsuch as mountain ranges and 
122
terrestrial and aquatic ecosystems -\u200bsuch as mountain ranges and 
            
123
tropical reefs. We use an interdisciplinary approach, whereby we 
123
tropical reefs. We use an interdisciplinary approach, whereby we 
            
124
bridge ecology, evolution, Earth history and global change.\r\nTo make 
124
bridge ecology, evolution, Earth history and global change.\r\nTo make 
            
125
these connections, we collect data through biological monitoring, 
125
these connections, we collect data through biological monitoring, 
            
126
environmental DNA methods, remote sensing, and field sampling, and use 
126
environmental DNA methods, remote sensing, and field sampling, and use 
            
127
these data to answer questions with statistical and 
127
these data to answer questions with statistical and 
            
128
process-\u200bbased models of biological diversity.\r\nOur group is 
128
process-\u200bbased models of biological diversity.\r\nOur group is 
            
129
affiliated with ETH and WSL, but is also associated with Agroscope, 
129
affiliated with ETH and WSL, but is also associated with Agroscope, 
            
130
EAWAG, the European Joint Research Centre and Vogelwarte.",
130
EAWAG, the European Joint Research Centre and Vogelwarte.",
            
131
    "id": "153392ee-d556-4b16-a330-dedb177e87f9",
131
    "id": "153392ee-d556-4b16-a330-dedb177e87f9",
            
132
    "image_url": 
132
    "image_url": 
            
133
le.ethz.ch/_jcr_content/orgbox/image.imageformat.logo.1254626489.png",
133
le.ethz.ch/_jcr_content/orgbox/image.imageformat.logo.1254626489.png",
            
134
    "is_organization": true,
134
    "is_organization": true,
            
135
    "name": "ele-group",
135
    "name": "ele-group",
            
136
    "state": "active",
136
    "state": "active",
            
137
    "title": "Ecosystems and Landscape Evolution",
137
    "title": "Ecosystems and Landscape Evolution",
            
138
    "type": "organization"
138
    "type": "organization"
            
139
  },
139
  },
            
140
  "owner_org": "153392ee-d556-4b16-a330-dedb177e87f9",
140
  "owner_org": "153392ee-d556-4b16-a330-dedb177e87f9",
            
141
  "private": false,
141
  "private": false,
            
142
  "publication": 
142
  "publication": 
            
143
"{\"publisher\":\"EnviDat\",\"publication_year\":\"2024\"}",
143
"{\"publisher\":\"EnviDat\",\"publication_year\":\"2024\"}",
            
144
  "publication_state": "published",
144
  "publication_state": "published",
            
145
  "related_datasets": "The Habitat Map of 
145
  "related_datasets": "The Habitat Map of 
            
146
zerland\n<https://www.envidat.ch/dataset/habitat-map-of-switzerland>",
146
zerland\n<https://www.envidat.ch/dataset/habitat-map-of-switzerland>",
            
147
  "related_publications": "More detail on the generation, validation 
147
  "related_publications": "More detail on the generation, validation 
            
148
and structure of the datasets  can be found in the data paper 
148
and structure of the datasets  can be found in the data paper 
            
149
pre-print here: https://ecoevorxiv.org/repository/view/7294/",
149
pre-print here: https://ecoevorxiv.org/repository/view/7294/",
            
150
  "relationships_as_object": [],
150
  "relationships_as_object": [],
            
151
  "relationships_as_subject": [],
151
  "relationships_as_subject": [],
            
152
  "resource_type": "dataset",
152
  "resource_type": "dataset",
            
153
  "resource_type_general": "dataset",
153
  "resource_type_general": "dataset",
            
154
  "resources": [
154
  "resources": [
            
155
    {
155
    {
            
156
      "cache_last_updated": null,
156
      "cache_last_updated": null,
            
157
      "cache_url": null,
157
      "cache_url": null,
            
158
      "created": "2024-08-13T15:06:22.907844",
158
      "created": "2024-08-13T15:06:22.907844",
            
159
      "description": "We provide seven datasets: 1) the metaweb, 2) 
159
      "description": "We provide seven datasets: 1) the metaweb, 2) 
            
160
the taxa checklist, 3) the data source meta-dataset, 4) the list of 
160
the taxa checklist, 3) the data source meta-dataset, 4) the list of 
            
161
generalist basal and predator families and polylectic species with 
161
generalist basal and predator families and polylectic species with 
            
162
citations and 5) a dataset with citations for the inferences of 
162
citations and 5) a dataset with citations for the inferences of 
            
163
missing predators, 6) a dataset with citations for the parallel 
163
missing predators, 6) a dataset with citations for the parallel 
            
164
inference of diets from similar species and 7) a list of other 
164
inference of diets from similar species and 7) a list of other 
            
165
existing metawebs. The empirical dataset is 00_empirical_metaweb.csv. 
165
existing metawebs. The empirical dataset is 00_empirical_metaweb.csv. 
            
166
To reproduce the final metaweb (01_final_metaweb.csv), start the R 
166
To reproduce the final metaweb (01_final_metaweb.csv), start the R 
            
167
Project file: trophich.Rproj. We provide five scripts, accompanying 
167
Project file: trophich.Rproj. We provide five scripts, accompanying 
            
168
functions, and the raw data required to run these scripts to reproduce 
168
functions, and the raw data required to run these scripts to reproduce 
            
169
the taxonomic expansion and validation of the datasets. In the first 
169
the taxonomic expansion and validation of the datasets. In the first 
            
170
script (01_inferring_interactions.R), we infer interactions using 
170
script (01_inferring_interactions.R), we infer interactions using 
            
171
genus and family level interactions and for basal feeding groups (see 
171
genus and family level interactions and for basal feeding groups (see 
            
172
Methods: Taxonomic expansion). In the second script 
172
Methods: Taxonomic expansion). In the second script 
            
173
(02_inferring_interactions_special_cases.R), we infer further 
173
(02_inferring_interactions_special_cases.R), we infer further 
            
174
interactions for a few special cases with detailed explanations. In 
174
interactions for a few special cases with detailed explanations. In 
            
175
the third script (03_metaweb_comparisons.Rmd), we provide the 
175
the third script (03_metaweb_comparisons.Rmd), we provide the 
            
176
statistical comparisons between our metaweb and other empirical 
176
statistical comparisons between our metaweb and other empirical 
            
177
metawebs as an R Markdown document. We additionally provide a a Python 
177
metawebs as an R Markdown document. We additionally provide a a Python 
            
178
Jupyter Notebook document, outlining the error validation of the data 
178
Jupyter Notebook document, outlining the error validation of the data 
            
179
extraction process (04_error_validation.ipynb and an accompanying 
179
extraction process (04_error_validation.ipynb and an accompanying 
            
180
.html file). Finally, we provide a script to reproduce figure 1 from 
180
.html file). Finally, we provide a script to reproduce figure 1 from 
            
181
the data paper (05_metaweb_summary_figure_1.R). \n",
181
the data paper (05_metaweb_summary_figure_1.R). \n",
            
182
      "doi": "",
182
      "doi": "",
            
183
      "format": "ZIP",
183
      "format": "ZIP",
            
184
      "hash": "",
184
      "hash": "",
            
185
      "id": "fe802436-f927-4243-b199-0829a3e0d21b",
185
      "id": "fe802436-f927-4243-b199-0829a3e0d21b",
            
186
      "last_modified": "2024-10-16T09:29:33.388000",
186
      "last_modified": "2024-10-16T09:29:33.388000",
            
187
      "metadata_modified": "2024-10-16T07:29:33.401296",
187
      "metadata_modified": "2024-10-16T07:29:33.401296",
            
188
      "mimetype": "application/x-zip-compressed",
188
      "mimetype": "application/x-zip-compressed",
            
189
      "mimetype_inner": null,
189
      "mimetype_inner": null,
            
190
      "name": "trophiCH",
190
      "name": "trophiCH",
            
191
      "package_id": "4f9547a1-3018-46f1-a399-09d65a3223f3",
191
      "package_id": "4f9547a1-3018-46f1-a399-09d65a3223f3",
            
192
      "position": 0,
192
      "position": 0,
            
193
      "resource_size": "{\"size_value\":\"\",\"size_units\":\"\"}",
193
      "resource_size": "{\"size_value\":\"\",\"size_units\":\"\"}",
            
194
      "resource_type": null,
194
      "resource_type": null,
            
195
      "restricted": 
195
      "restricted": 
            
196
\"same_organization\",\"allowed_users\":\"\",\"shared_secret\":\"\"}",
196
\"same_organization\",\"allowed_users\":\"\",\"shared_secret\":\"\"}",
            
197
      "size": 34142639,
197
      "size": 34142639,
            
198
      "state": "active",
198
      "state": "active",
            
199
      "url": 
199
      "url": 
            
200
/resource/fe802436-f927-4243-b199-0829a3e0d21b/download/trophich.zip",
200
/resource/fe802436-f927-4243-b199-0829a3e0d21b/download/trophich.zip",
            
201
      "url_type": "upload"
201
      "url_type": "upload"
            
202
    }
202
    }
            
203
  ],
203
  ],
            
204
  "spatial": 
204
  "spatial": 
            
205
838],[10.49203,47.80838],[10.49203,45.81802],[5.95587,45.81802]]]}]}",
205
838],[10.49203,47.80838],[10.49203,45.81802],[5.95587,45.81802]]]}]}",
            
206
  "state": "active",
206
  "state": "active",
            
207
  "subtitle": "",
207
  "subtitle": "",
            
208
  "tags": [
208
  "tags": [
            
209
    {
209
    {
            
210
      "display_name": "FOOD WEBS",
210
      "display_name": "FOOD WEBS",
            
211
      "id": "b7ee3dfe-4be3-4433-9ad2-2bdb180a7aa5",
211
      "id": "b7ee3dfe-4be3-4433-9ad2-2bdb180a7aa5",
            
212
      "name": "FOOD WEBS",
212
      "name": "FOOD WEBS",
            
213
      "state": "active",
213
      "state": "active",
            
214
      "vocabulary_id": null
214
      "vocabulary_id": null
            
215
    },
215
    },
            
216
    {
216
    {
            
217
      "display_name": "INVERTEBARATES",
217
      "display_name": "INVERTEBARATES",
            
218
      "id": "37bd79e8-b448-4c67-b54c-dc391fe23e30",
218
      "id": "37bd79e8-b448-4c67-b54c-dc391fe23e30",
            
219
      "name": "INVERTEBARATES",
219
      "name": "INVERTEBARATES",
            
220
      "state": "active",
220
      "state": "active",
            
221
      "vocabulary_id": null
221
      "vocabulary_id": null
            
222
    },
222
    },
            
223
    {
223
    {
            
224
      "display_name": "METAWEB",
224
      "display_name": "METAWEB",
            
225
      "id": "dd012ba5-7cae-4817-90d8-9503381a0f19",
225
      "id": "dd012ba5-7cae-4817-90d8-9503381a0f19",
            
226
      "name": "METAWEB",
226
      "name": "METAWEB",
            
227
      "state": "active",
227
      "state": "active",
            
228
      "vocabulary_id": null
228
      "vocabulary_id": null
            
229
    },
229
    },
            
230
    {
230
    {
            
231
      "display_name": "SWITZERLAND",
231
      "display_name": "SWITZERLAND",
            
232
      "id": "97ac3564-bb88-46ad-9fe4-b7d606e0aa3a",
232
      "id": "97ac3564-bb88-46ad-9fe4-b7d606e0aa3a",
            
233
      "name": "SWITZERLAND",
233
      "name": "SWITZERLAND",
            
234
      "state": "active",
234
      "state": "active",
            
235
      "vocabulary_id": null
235
      "vocabulary_id": null
            
236
    },
236
    },
            
237
    {
237
    {
            
238
      "display_name": "TROPHIC NETWORKS",
238
      "display_name": "TROPHIC NETWORKS",
            
239
      "id": "73468c26-85fa-4d79-865b-1543f569c03d",
239
      "id": "73468c26-85fa-4d79-865b-1543f569c03d",
            
240
      "name": "TROPHIC NETWORKS",
240
      "name": "TROPHIC NETWORKS",
            
241
      "state": "active",
241
      "state": "active",
            
242
      "vocabulary_id": null
242
      "vocabulary_id": null
            
243
    },
243
    },
            
244
    {
244
    {
            
245
      "display_name": "VASCULAR PLANTS",
245
      "display_name": "VASCULAR PLANTS",
            
246
      "id": "9a4103d4-c32c-4b93-a7d9-49f33fb7cc1d",
246
      "id": "9a4103d4-c32c-4b93-a7d9-49f33fb7cc1d",
            
247
      "name": "VASCULAR PLANTS",
247
      "name": "VASCULAR PLANTS",
            
248
      "state": "active",
248
      "state": "active",
            
249
      "vocabulary_id": null
249
      "vocabulary_id": null
            
250
    },
250
    },
            
251
    {
251
    {
            
252
      "display_name": "VERTEBRATES",
252
      "display_name": "VERTEBRATES",
            
253
      "id": "a8e6e936-d9f5-4c8e-a961-20dafc6da3aa",
253
      "id": "a8e6e936-d9f5-4c8e-a961-20dafc6da3aa",
            
254
      "name": "VERTEBRATES",
254
      "name": "VERTEBRATES",
            
255
      "state": "active",
255
      "state": "active",
            
256
      "vocabulary_id": null
256
      "vocabulary_id": null
            
257
    }
257
    }
            
258
  ],
258
  ],
            
259
  "title": "trophiCH v1 - a food web for Switzerland",
259
  "title": "trophiCH v1 - a food web for Switzerland",
            
260
  "type": "dataset",
260
  "type": "dataset",
            
t
261
  "url": null
t
261
  "url": null,
            
262
  "version": "1.0"
            
262
}
263
}