Changes

              
    

          
          
        
        

            
f
1
{
f
1
{
            
2
  "author": "[{\"given_name\": \"Marion\", \"name\": \"Muff\", 
2
  "author": "[{\"given_name\": \"Marion\", \"name\": \"Muff\", 
            
3
\"email\": \"muffm@student.ethz.ch\", \"data_credit\": [], 
3
\"email\": \"muffm@student.ethz.ch\", \"data_credit\": [], 
            
4
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"ETHZ\"}, {\"given_name\": 
4
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"ETHZ\"}, {\"given_name\": 
            
5
\"Melissa\", \"name\": \"Jaquier\", \"email\": 
5
\"Melissa\", \"name\": \"Jaquier\", \"email\": 
            
6
\"melissa@jaquier.blue\", \"data_credit\": [], \"identifier\": \"\", 
6
\"melissa@jaquier.blue\", \"data_credit\": [], \"identifier\": \"\", 
            
7
\"affiliation\": \"ETHZ\"}, {\"given_name\": \"Virginie\", \"name\": 
7
\"affiliation\": \"ETHZ\"}, {\"given_name\": \"Virginie\", \"name\": 
            
8
\"Marques\", \"email\": \"virginie.marques@wsl.ch\", \"data_credit\": 
8
\"Marques\", \"email\": \"virginie.marques@wsl.ch\", \"data_credit\": 
            
9
[]}, {\"given_name\": \"Laurent\", \"name\": \"Ballesta\", \"email\": 
9
[]}, {\"given_name\": \"Laurent\", \"name\": \"Ballesta\", \"email\": 
            
10
\"laurent.ballesta@andromede.fr\", \"data_credit\": [], 
10
\"laurent.ballesta@andromede.fr\", \"data_credit\": [], 
            
11
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"Andromede\"}, 
11
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"Andromede\"}, 
            
12
{\"given_name\": \"Julie\", \"name\": \"Deter\", \"email\": 
12
{\"given_name\": \"Julie\", \"name\": \"Deter\", \"email\": 
            
13
\"julie.deter@andromede-ocean.com\", \"data_credit\": [], 
13
\"julie.deter@andromede-ocean.com\", \"data_credit\": [], 
            
14
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"Andromede\"}, 
14
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"Andromede\"}, 
            
15
{\"given_name\": \"Thomas\", \"name\": \"Bockel\", \"email\": 
15
{\"given_name\": \"Thomas\", \"name\": \"Bockel\", \"email\": 
            
16
\"thomas.bockel@andromede-ocean.com\", \"data_credit\": [], 
16
\"thomas.bockel@andromede-ocean.com\", \"data_credit\": [], 
            
17
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"Andromede\"}, 
17
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"Andromede\"}, 
            
18
{\"given_name\": \"R\\u00e9gis\", \"name\": \"Hocd\\u00e9\", 
18
{\"given_name\": \"R\\u00e9gis\", \"name\": \"Hocd\\u00e9\", 
            
19
\"email\": \"regis.hocde@ird.fr\", \"data_credit\": [], 
19
\"email\": \"regis.hocde@ird.fr\", \"data_credit\": [], 
            
20
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"IRD\"}, {\"given_name\": 
20
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"IRD\"}, {\"given_name\": 
            
21
\"Jean-Baptiste\", \"name\": \"Juhel\", \"email\": 
21
\"Jean-Baptiste\", \"name\": \"Juhel\", \"email\": 
            
22
\"jeanbaptiste.juhel@gmail.com\", \"data_credit\": [], \"identifier\": 
22
\"jeanbaptiste.juhel@gmail.com\", \"data_credit\": [], \"identifier\": 
            
23
\"\", \"affiliation\": \"University of Montpellier\"}, 
23
\"\", \"affiliation\": \"University of Montpellier\"}, 
            
24
{\"given_name\": \"Emilie\", \"name\": \"Boulanger\", \"email\": 
24
{\"given_name\": \"Emilie\", \"name\": \"Boulanger\", \"email\": 
            
25
\"Emilie.boulanger@hotmail.com\", \"data_credit\": [], \"identifier\": 
25
\"Emilie.boulanger@hotmail.com\", \"data_credit\": [], \"identifier\": 
            
26
\"\", \"affiliation\": \"University of Montpellier\"}, 
26
\"\", \"affiliation\": \"University of Montpellier\"}, 
            
27
{\"given_name\": \"Nacim\", \"name\": \"Guellati\", \"email\": 
27
{\"given_name\": \"Nacim\", \"name\": \"Guellati\", \"email\": 
            
28
\"nacim.guellati.1997@gmail.com\", \"data_credit\": [], 
28
\"nacim.guellati.1997@gmail.com\", \"data_credit\": [], 
            
29
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"University of Montpellier\"}, 
29
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"University of Montpellier\"}, 
            
30
{\"given_name\": \"Andrea\", \"name\": \"Polanco\", \"email\": 
30
{\"given_name\": \"Andrea\", \"name\": \"Polanco\", \"email\": 
            
31
\"andrea.polanco@gmail.com\", \"data_credit\": [], \"identifier\": 
31
\"andrea.polanco@gmail.com\", \"data_credit\": [], \"identifier\": 
            
32
\"\", \"affiliation\": \"Biodiversa Colombia Foundation, Colombia\"}, 
32
\"\", \"affiliation\": \"Biodiversa Colombia Foundation, Colombia\"}, 
            
33
{\"given_name\": \"Alice\", \"name\": \"Valentini\", \"email\": 
33
{\"given_name\": \"Alice\", \"name\": \"Valentini\", \"email\": 
            
34
\"alice.valentini@spygen.com\", \"data_credit\": [], \"identifier\": 
34
\"alice.valentini@spygen.com\", \"data_credit\": [], \"identifier\": 
            
35
\"\", \"affiliation\": \"SPYGEN\"}, {\"given_name\": \"Tony\", 
35
\"\", \"affiliation\": \"SPYGEN\"}, {\"given_name\": \"Tony\", 
            
36
\"name\": \"Dejean\", \"email\": \"tony.dejean@spygen.com\", 
36
\"name\": \"Dejean\", \"email\": \"tony.dejean@spygen.com\", 
            
37
\"data_credit\": [], \"identifier\": \"\", \"affiliation\": 
37
\"data_credit\": [], \"identifier\": \"\", \"affiliation\": 
            
38
\"SPYGEN\"}, {\"given_name\": \"Stephanie\", \"name\": \"Manel\", 
38
\"SPYGEN\"}, {\"given_name\": \"Stephanie\", \"name\": \"Manel\", 
            
39
\"email\": \"stephanie.manel@cefe.cnrs.fr\", \"data_credit\": [], 
39
\"email\": \"stephanie.manel@cefe.cnrs.fr\", \"data_credit\": [], 
            
40
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"EPHE\"}, {\"given_name\": 
40
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"EPHE\"}, {\"given_name\": 
            
41
\"Camille\", \"name\": \"Albouy\", \"email\": 
41
\"Camille\", \"name\": \"Albouy\", \"email\": 
            
42
\"camille.albouy@wsl.ch\", \"data_credit\": [], \"identifier\": \"\", 
42
\"camille.albouy@wsl.ch\", \"data_credit\": [], \"identifier\": \"\", 
            
43
\"affiliation\": \"Unit of Land Change Science, 7u Federal Research 
43
\"affiliation\": \"Unit of Land Change Science, 7u Federal Research 
            
44
Institute WSL, Birmensdorf, Switzerland\"}, {\"given_name\": 
44
Institute WSL, Birmensdorf, Switzerland\"}, {\"given_name\": 
            
45
\"Patrick\", \"name\": \"Durville\", \"email\": 
45
\"Patrick\", \"name\": \"Durville\", \"email\": 
            
46
\"patrick.durville.galaxea@gmail.com\", \"data_credit\": [], 
46
\"patrick.durville.galaxea@gmail.com\", \"data_credit\": [], 
            
47
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"GALAXEA\"}, {\"given_name\": 
47
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"GALAXEA\"}, {\"given_name\": 
            
48
\"David\", \"name\": \"Mouillot\", \"email\": 
48
\"David\", \"name\": \"Mouillot\", \"email\": 
            
49
\"david.mouillot@umontpellier.fr\", \"data_credit\": [], 
49
\"david.mouillot@umontpellier.fr\", \"data_credit\": [], 
            
50
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"University of Montpellier\"}, 
50
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"University of Montpellier\"}, 
            
51
{\"given_name\": \"Florian\", \"name\": \"Holon\", \"email\": 
51
{\"given_name\": \"Florian\", \"name\": \"Holon\", \"email\": 
            
52
\"florian.holon@andromede-ocean.com\", \"data_credit\": [], 
52
\"florian.holon@andromede-ocean.com\", \"data_credit\": [], 
            
53
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"Andromede\"}, 
53
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"Andromede\"}, 
            
54
{\"given_name\": \"Loic\", \"name\": \"Pellissier\", \"email\": 
54
{\"given_name\": \"Loic\", \"name\": \"Pellissier\", \"email\": 
            
55
\"loic.pellissier@wsl.ch\", \"data_credit\": [], \"identifier\": 
55
\"loic.pellissier@wsl.ch\", \"data_credit\": [], \"identifier\": 
            
56
\"0000-0002-2289-8259\", \"affiliation\": \"Landscape Ecology, 
56
\"0000-0002-2289-8259\", \"affiliation\": \"Landscape Ecology, 
            
57
Institute of Terrestrial Ecosystems, ETH Z\\u00fcrich, 8049 
57
Institute of Terrestrial Ecosystems, ETH Z\\u00fcrich, 8049 
            
58
Z\\u00fcrich, Switzerland\"}]",
58
Z\\u00fcrich, Switzerland\"}]",
            
59
  "author_email": null,
59
  "author_email": null,
            
60
  "creator_user_id": "382d8fab-f378-477d-88f6-26f77aee50d8",
60
  "creator_user_id": "382d8fab-f378-477d-88f6-26f77aee50d8",
            
61
  "date": 
61
  "date": 
            
62
\":\"created\",\"date\":\"2019-10-27\",\"end_date\":\"2019-11-05\"}]",
62
\":\"created\",\"date\":\"2019-10-27\",\"end_date\":\"2019-11-05\"}]",
            
63
  "doi": "10.16904/envidat.567",
63
  "doi": "10.16904/envidat.567",
            
64
  "extras": [
64
  "extras": [
            
65
    {
65
    {
            
66
      "key": "edna_type",
66
      "key": "edna_type",
            
67
      "value": "marine"
67
      "value": "marine"
            
68
    },
68
    },
            
69
    {
69
    {
            
70
      "key": "metadata",
70
      "key": "metadata",
            
71
      "value": 
71
      "value": 
            
72
ma_fr/ma_fr_lapero_2019/metadata/metadata_field_ma_fr_lapero_2019.csv"
72
ma_fr/ma_fr_lapero_2019/metadata/metadata_field_ma_fr_lapero_2019.csv"
            
73
    }
73
    }
            
74
  ],
74
  ],
            
75
  "funding": "[{\"institution\":\"Internal Funding ELE group 
75
  "funding": "[{\"institution\":\"Internal Funding ELE group 
            
76
\",\"grant_number\":\"\",\"institution_url\":\"\"},{\"institution\":\" 
76
\",\"grant_number\":\"\",\"institution_url\":\"\"},{\"institution\":\" 
            
77
Andromede Oceanologie\",\"grant_number\":\"GOMBESSA 
77
Andromede Oceanologie\",\"grant_number\":\"GOMBESSA 
            
78
5\",\"institution_url\":\"\"},{\"institution\":\"ANR labcom 
78
5\",\"institution_url\":\"\"},{\"institution\":\"ANR labcom 
            
79
2\",\"grant_number\":\"InToSea (Innovative Tools under the Sea) joint 
79
2\",\"grant_number\":\"InToSea (Innovative Tools under the Sea) joint 
            
80
laboratory\",\"institution_url\":\"\"},{\"institution\":\"Manufacture 
80
laboratory\",\"institution_url\":\"\"},{\"institution\":\"Manufacture 
            
81
de Haute Horlogerie Suisse Blancpain and Blancpain Ocean 
81
de Haute Horlogerie Suisse Blancpain and Blancpain Ocean 
            
n
n
82
rant_number\":\"\",\"institution_url\":\"\"},{\"institution\":\"Prince 
            
83
Albert II de Monaco 
            
82
Commitment\",\"grant_number\":\"\",\"institution_url\":\"\"}]",
84
Foundation\",\"grant_number\":\"\",\"institution_url\":\"\"}]",
            
83
  "groups": [
85
  "groups": [
            
84
    {
86
    {
            
85
      "description": "",
87
      "description": "",
            
86
      "display_name": "eDNA",
88
      "display_name": "eDNA",
            
87
      "id": "c2176351-3002-4d7a-b2aa-d8509f7dbfbe",
89
      "id": "c2176351-3002-4d7a-b2aa-d8509f7dbfbe",
            
88
      "image_display_url": "",
90
      "image_display_url": "",
            
89
      "name": "edna",
91
      "name": "edna",
            
90
      "title": "eDNA"
92
      "title": "eDNA"
            
91
    }
93
    }
            
92
  ],
94
  ],
            
93
  "id": "27331019-15d4-41c5-b9e4-866c6bc0a96a",
95
  "id": "27331019-15d4-41c5-b9e4-866c6bc0a96a",
            
94
  "isopen": true,
96
  "isopen": true,
            
95
  "license_id": "cc-by",
97
  "license_id": "cc-by",
            
96
  "license_title": "Creative Commons Attribution",
98
  "license_title": "Creative Commons Attribution",
            
97
  "license_url": "https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/",
99
  "license_url": "https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/",
            
98
  "maintainer": 
100
  "maintainer": 
            
99
e.marques@wsl.ch\",\"given_name\":\"Virginie\",\"name\":\"Marques\"}",
101
e.marques@wsl.ch\",\"given_name\":\"Virginie\",\"name\":\"Marques\"}",
            
100
  "maintainer_email": null,
102
  "maintainer_email": null,
            
101
  "metadata_created": "2024-12-10T15:08:00.727653",
103
  "metadata_created": "2024-12-10T15:08:00.727653",
            
t
102
  "metadata_modified": "2024-12-12T13:50:21.032351",
t
104
  "metadata_modified": "2024-12-12T13:50:27.851275",
            
103
  "name": "environmental-dna-marine-france-laperouse-2019",
105
  "name": "environmental-dna-marine-france-laperouse-2019",
            
104
  "notes": "Fish environmental DNA data set collected in the shallow 
106
  "notes": "Fish environmental DNA data set collected in the shallow 
            
105
seamount of La P\u00e9rouse located between Madagascar and 
107
seamount of La P\u00e9rouse located between Madagascar and 
            
106
R\u00e9union Island \n\n\nIn 2019, we sampled the shallow seamount of 
108
R\u00e9union Island \n\n\nIn 2019, we sampled the shallow seamount of 
            
107
La P\u00e9rouse, located between Madagascar and R\u00e9union Island in 
109
La P\u00e9rouse, located between Madagascar and R\u00e9union Island in 
            
108
the WIO. La P\u00e9rouse is an extinct volcano with a summit depth at 
110
the WIO. La P\u00e9rouse is an extinct volcano with a summit depth at 
            
109
60\u2009m below the sea surface. The plateau of the summit has a 
111
60\u2009m below the sea surface. The plateau of the summit has a 
            
110
maximum length of 12\u2009km and a maximum width of 4 km. One side of 
112
maximum length of 12\u2009km and a maximum width of 4 km. One side of 
            
111
the seamount might have collapsed in the past, leading to a less 
113
the seamount might have collapsed in the past, leading to a less 
            
112
common crescent-shaped summit. The abyssal plains that surround this 
114
common crescent-shaped summit. The abyssal plains that surround this 
            
113
isolated pinnacle are at a depth of 5000\u2009m. Despite its proximity 
115
isolated pinnacle are at a depth of 5000\u2009m. Despite its proximity 
            
114
to R\u00e9union Island (160\u2009km northwest), La P\u00e9rouse and 
116
to R\u00e9union Island (160\u2009km northwest), La P\u00e9rouse and 
            
115
its surroundings are still poorly studied.\n\nTo sample eDNA in this 
117
its surroundings are still poorly studied.\n\nTo sample eDNA in this 
            
116
location we used a submersible pump (Subspace, Geneva, Switzerland; 
118
location we used a submersible pump (Subspace, Geneva, Switzerland; 
            
117
nominal flow of ~\u20091.0 L/min) to collect samples at various depths 
119
nominal flow of ~\u20091.0 L/min) to collect samples at various depths 
            
118
during close circuit rebreather dives. The pump has an internal 
120
during close circuit rebreather dives. The pump has an internal 
            
119
battery and can be activated underwater allowing in situ filtration 
121
battery and can be activated underwater allowing in situ filtration 
            
120
directly at the targeted habitat and depth. The filtration lasted for 
122
directly at the targeted habitat and depth. The filtration lasted for 
            
121
30\u2009min to collect a total water volume of ~\u200930\u2009L. 
123
30\u2009min to collect a total water volume of ~\u200930\u2009L. 
            
122
During close circuit rebreather dives, water samples from various 
124
During close circuit rebreather dives, water samples from various 
            
123
depths, ranging from 60 to 140\u2009m below the sea surface, were 
125
depths, ranging from 60 to 140\u2009m below the sea surface, were 
            
124
collected using only the Submersible method (eight stations: no 
126
collected using only the Submersible method (eight stations: no 
            
125
replicates). Out of the eight water samples, six were collected during 
127
replicates). Out of the eight water samples, six were collected during 
            
126
the day, while two were collected at night (IS2_1 at 62\u2009m and 
128
the day, while two were collected at night (IS2_1 at 62\u2009m and 
            
127
IS7_1 at 100\u2013125\u2009m). We applied this filtration protocols to 
129
IS7_1 at 100\u2013125\u2009m). We applied this filtration protocols to 
            
128
collect and filter water throughout a VigiDNA\u00ae 0.2 \u03bcM 
130
collect and filter water throughout a VigiDNA\u00ae 0.2 \u03bcM 
            
129
cross-flow filtration capsule (SPYGEN, le Bourget du Lac, France) 
131
cross-flow filtration capsule (SPYGEN, le Bourget du Lac, France) 
            
130
using disposable sterile tubing for each filtration capsule. After the 
132
using disposable sterile tubing for each filtration capsule. After the 
            
131
filtration process, the remaining water in the capsules was emptied. 
133
filtration process, the remaining water in the capsules was emptied. 
            
132
The capsules were then filled with 80\u2009ml of lysis conservation 
134
The capsules were then filled with 80\u2009ml of lysis conservation 
            
133
buffer (CL1 buffer SPYGEN, le Bourget du Lac, France) and stored at 
135
buffer (CL1 buffer SPYGEN, le Bourget du Lac, France) and stored at 
            
134
room temperature in the dark. At La P\u00e9rouse, a total of eight 
136
room temperature in the dark. At La P\u00e9rouse, a total of eight 
            
135
water samples were collected during the MONT LA P\u00c9ROUSE 
137
water samples were collected during the MONT LA P\u00c9ROUSE 
            
136
expedition (https://gombessa-expeditions.com/mont-la-perouse/) on 
138
expedition (https://gombessa-expeditions.com/mont-la-perouse/) on 
            
137
board the ship La Curieuse to the seamount La P\u00e9rouse from 
139
board the ship La Curieuse to the seamount La P\u00e9rouse from 
            
138
October 27th to November 5th 2019. We followed a strict contamination 
140
October 27th to November 5th 2019. We followed a strict contamination 
            
139
control protocol in both field and laboratory stages. Each water 
141
control protocol in both field and laboratory stages. Each water 
            
140
sample processing included the use of disposable gloves and single-use 
142
sample processing included the use of disposable gloves and single-use 
            
141
filtration equipment to avoid any risk of contamination. Libraries 
143
filtration equipment to avoid any risk of contamination. Libraries 
            
142
were prepared with ligation using the MetaFast protocol 
144
were prepared with ligation using the MetaFast protocol 
            
143
(Fasteris).\n\nData content: \n\t* rawdata/: contains the raw reads 
145
(Fasteris).\n\nData content: \n\t* rawdata/: contains the raw reads 
            
144
for each individual sample. One archive contains the paired-end reads 
146
for each individual sample. One archive contains the paired-end reads 
            
145
specified by the _R1 or _R2 suffix as well as individually tagged PCR 
147
specified by the _R1 or _R2 suffix as well as individually tagged PCR 
            
146
replicates (if available) together with an archive containing all 
148
replicates (if available) together with an archive containing all 
            
147
extraction and PCR blank samples of the library. Reads have been 
149
extraction and PCR blank samples of the library. Reads have been 
            
148
demultiplexed using cutadapt but not trimmed, individual 
150
demultiplexed using cutadapt but not trimmed, individual 
            
149
demultiplexing tags and primers remain present in the sequences.  
151
demultiplexing tags and primers remain present in the sequences.  
            
150
\n\t* taxadata/: contains the table with all detected taxonomy for 
152
\n\t* taxadata/: contains the table with all detected taxonomy for 
            
151
each sample after bioinformatic processing (see Polanco et al. 2020 
153
each sample after bioinformatic processing (see Polanco et al. 2020 
            
152
for details; https://doi.org/10.1002/edn3.140) and associated field 
154
for details; https://doi.org/10.1002/edn3.140) and associated field 
            
153
metadata. \n\t* metadata/: contains two metadata files, one related to 
155
metadata. \n\t* metadata/: contains two metadata files, one related to 
            
154
the data collected in the field for each filter, and the second 
156
the data collected in the field for each filter, and the second 
            
155
related to the sequencing process in the lab (including the tag 
157
related to the sequencing process in the lab (including the tag 
            
156
sequence, library name, and marker information for each sample)\n",
158
sequence, library name, and marker information for each sample)\n",
            
157
  "num_resources": 1,
159
  "num_resources": 1,
            
158
  "num_tags": 7,
160
  "num_tags": 7,
            
159
  "organization": {
161
  "organization": {
            
160
    "approval_status": "approved",
162
    "approval_status": "approved",
            
161
    "created": "2018-12-01T11:59:01.791513",
163
    "created": "2018-12-01T11:59:01.791513",
            
162
    "description": "We are an international research team with diverse 
164
    "description": "We are an international research team with diverse 
            
163
scientific expertise and backgrounds, connected by the goal to 
165
scientific expertise and backgrounds, connected by the goal to 
            
164
understand biodiversity. We study the mechanisms that shape 
166
understand biodiversity. We study the mechanisms that shape 
            
165
biodiversity patterns across spatial and temporal scales - in both 
167
biodiversity patterns across spatial and temporal scales - in both 
            
166
terrestrial and aquatic ecosystems -\u200bsuch as mountain ranges and 
168
terrestrial and aquatic ecosystems -\u200bsuch as mountain ranges and 
            
167
tropical reefs. We use an interdisciplinary approach, whereby we 
169
tropical reefs. We use an interdisciplinary approach, whereby we 
            
168
bridge ecology, evolution, Earth history and global change.\r\nTo make 
170
bridge ecology, evolution, Earth history and global change.\r\nTo make 
            
169
these connections, we collect data through biological monitoring, 
171
these connections, we collect data through biological monitoring, 
            
170
environmental DNA methods, remote sensing, and field sampling, and use 
172
environmental DNA methods, remote sensing, and field sampling, and use 
            
171
these data to answer questions with statistical and 
173
these data to answer questions with statistical and 
            
172
process-\u200bbased models of biological diversity.\r\nOur group is 
174
process-\u200bbased models of biological diversity.\r\nOur group is 
            
173
affiliated with ETH and WSL, but is also associated with Agroscope, 
175
affiliated with ETH and WSL, but is also associated with Agroscope, 
            
174
EAWAG, the European Joint Research Centre and Vogelwarte.",
176
EAWAG, the European Joint Research Centre and Vogelwarte.",
            
175
    "id": "153392ee-d556-4b16-a330-dedb177e87f9",
177
    "id": "153392ee-d556-4b16-a330-dedb177e87f9",
            
176
    "image_url": 
178
    "image_url": 
            
177
le.ethz.ch/_jcr_content/orgbox/image.imageformat.logo.1254626489.png",
179
le.ethz.ch/_jcr_content/orgbox/image.imageformat.logo.1254626489.png",
            
178
    "is_organization": true,
180
    "is_organization": true,
            
179
    "name": "ele-group",
181
    "name": "ele-group",
            
180
    "state": "active",
182
    "state": "active",
            
181
    "title": "Ecosystems and Landscape Evolution",
183
    "title": "Ecosystems and Landscape Evolution",
            
182
    "type": "organization"
184
    "type": "organization"
            
183
  },
185
  },
            
184
  "owner_org": "153392ee-d556-4b16-a330-dedb177e87f9",
186
  "owner_org": "153392ee-d556-4b16-a330-dedb177e87f9",
            
185
  "private": false,
187
  "private": false,
            
186
  "publication": 
188
  "publication": 
            
187
"{\"publisher\":\"EnviDat\",\"publication_year\":\"2024\"}",
189
"{\"publisher\":\"EnviDat\",\"publication_year\":\"2024\"}",
            
188
  "publication_state": "published",
190
  "publication_state": "published",
            
189
  "related_publications": "Muff, Marion, et al. \"Environmental DNA 
191
  "related_publications": "Muff, Marion, et al. \"Environmental DNA 
            
190
highlights fish biodiversity in mesophotic ecosystems.\" Environ. DNA, 
192
highlights fish biodiversity in mesophotic ecosystems.\" Environ. DNA, 
            
191
vol. 5, no. 1, 1 Jan. 2023, pp. 56-72, doi:10.1002/edn3.358.",
193
vol. 5, no. 1, 1 Jan. 2023, pp. 56-72, doi:10.1002/edn3.358.",
            
192
  "relationships_as_object": [],
194
  "relationships_as_object": [],
            
193
  "relationships_as_subject": [],
195
  "relationships_as_subject": [],
            
194
  "resource_type": "dataset",
196
  "resource_type": "dataset",
            
195
  "resource_type_general": "dataset",
197
  "resource_type_general": "dataset",
            
196
  "resources": [
198
  "resources": [
            
197
    {
199
    {
            
198
      "cache_last_updated": null,
200
      "cache_last_updated": null,
            
199
      "cache_url": null,
201
      "cache_url": null,
            
200
      "created": "2024-12-10T15:19:34.794121",
202
      "created": "2024-12-10T15:19:34.794121",
            
201
      "description": "Please use cyberduck to download for the 
203
      "description": "Please use cyberduck to download for the 
            
202
moment",
204
moment",
            
203
      "doi": "",
205
      "doi": "",
            
204
      "format": "csv + fasta",
206
      "format": "csv + fasta",
            
205
      "hash": "",
207
      "hash": "",
            
206
      "id": "add08aff-55fa-4e9d-a96f-014465c2436e",
208
      "id": "add08aff-55fa-4e9d-a96f-014465c2436e",
            
207
      "last_modified": "2024-12-10T16:20:42.072000",
209
      "last_modified": "2024-12-10T16:20:42.072000",
            
208
      "metadata_modified": "2024-12-11T12:00:15.003656",
210
      "metadata_modified": "2024-12-11T12:00:15.003656",
            
209
      "mimetype": null,
211
      "mimetype": null,
            
210
      "mimetype_inner": null,
212
      "mimetype_inner": null,
            
211
      "name": "Data access",
213
      "name": "Data access",
            
212
      "package_id": "27331019-15d4-41c5-b9e4-866c6bc0a96a",
214
      "package_id": "27331019-15d4-41c5-b9e4-866c6bc0a96a",
            
213
      "position": 0,
215
      "position": 0,
            
214
      "publication_state": "",
216
      "publication_state": "",
            
215
      "resource_size": "{\"size_units\": \"gb\", \"size_value\": 
217
      "resource_size": "{\"size_units\": \"gb\", \"size_value\": 
            
216
\"1.6\"}",
218
\"1.6\"}",
            
217
      "resource_type": null,
219
      "resource_type": null,
            
218
      "restricted": "{\"allowed_users\": \"\", \"level\": \"public\", 
220
      "restricted": "{\"allowed_users\": \"\", \"level\": \"public\", 
            
219
\"shared_secret\": \"\"}",
221
\"shared_secret\": \"\"}",
            
220
      "size": null,
222
      "size": null,
            
221
      "state": "active",
223
      "state": "active",
            
222
      "url": 
224
      "url": 
            
223
cket=https://envicloud.wsl.ch/edna/&prefix=/ma_fr/ma_fr_lapero_2019/",
225
cket=https://envicloud.wsl.ch/edna/&prefix=/ma_fr/ma_fr_lapero_2019/",
            
224
      "url_type": null
226
      "url_type": null
            
225
    }
227
    }
            
226
  ],
228
  ],
            
227
  "spatial": 
229
  "spatial": 
            
228
ies\":{\"name\":\"environmental-dna-marine-france-laperouse-2019\"}}",
230
ies\":{\"name\":\"environmental-dna-marine-france-laperouse-2019\"}}",
            
229
  "state": "active",
231
  "state": "active",
            
230
  "subtitle": "",
232
  "subtitle": "",
            
231
  "tags": [
233
  "tags": [
            
232
    {
234
    {
            
233
      "display_name": "CORAL REEF",
235
      "display_name": "CORAL REEF",
            
234
      "id": "63718352-c39f-4313-9ca3-bdb1d680dbef",
236
      "id": "63718352-c39f-4313-9ca3-bdb1d680dbef",
            
235
      "name": "CORAL REEF",
237
      "name": "CORAL REEF",
            
236
      "state": "active",
238
      "state": "active",
            
237
      "vocabulary_id": null
239
      "vocabulary_id": null
            
238
    },
240
    },
            
239
    {
241
    {
            
240
      "display_name": "ENVIRONMENTAL DNA",
242
      "display_name": "ENVIRONMENTAL DNA",
            
241
      "id": "db7d5622-d1fc-4d24-91f7-73842c6743b6",
243
      "id": "db7d5622-d1fc-4d24-91f7-73842c6743b6",
            
242
      "name": "ENVIRONMENTAL DNA",
244
      "name": "ENVIRONMENTAL DNA",
            
243
      "state": "active",
245
      "state": "active",
            
244
      "vocabulary_id": null
246
      "vocabulary_id": null
            
245
    },
247
    },
            
246
    {
248
    {
            
247
      "display_name": "FISH COMPOSITION",
249
      "display_name": "FISH COMPOSITION",
            
248
      "id": "4c441df2-c810-49ad-81a3-483b6a9ff2bb",
250
      "id": "4c441df2-c810-49ad-81a3-483b6a9ff2bb",
            
249
      "name": "FISH COMPOSITION",
251
      "name": "FISH COMPOSITION",
            
250
      "state": "active",
252
      "state": "active",
            
251
      "vocabulary_id": null
253
      "vocabulary_id": null
            
252
    },
254
    },
            
253
    {
255
    {
            
254
      "display_name": "INDIAN OCEAN",
256
      "display_name": "INDIAN OCEAN",
            
255
      "id": "064cc0db-d544-453d-98f9-54b9f46fba27",
257
      "id": "064cc0db-d544-453d-98f9-54b9f46fba27",
            
256
      "name": "INDIAN OCEAN",
258
      "name": "INDIAN OCEAN",
            
257
      "state": "active",
259
      "state": "active",
            
258
      "vocabulary_id": null
260
      "vocabulary_id": null
            
259
    },
261
    },
            
260
    {
262
    {
            
261
      "display_name": "LAPEROUSE",
263
      "display_name": "LAPEROUSE",
            
262
      "id": "b5062b96-2335-4fde-b7e5-0b615d947d89",
264
      "id": "b5062b96-2335-4fde-b7e5-0b615d947d89",
            
263
      "name": "LAPEROUSE",
265
      "name": "LAPEROUSE",
            
264
      "state": "active",
266
      "state": "active",
            
265
      "vocabulary_id": null
267
      "vocabulary_id": null
            
266
    },
268
    },
            
267
    {
269
    {
            
268
      "display_name": "MARINE",
270
      "display_name": "MARINE",
            
269
      "id": "1f05d702-5580-40ac-9c9a-47127e050fa7",
271
      "id": "1f05d702-5580-40ac-9c9a-47127e050fa7",
            
270
      "name": "MARINE",
272
      "name": "MARINE",
            
271
      "state": "active",
273
      "state": "active",
            
272
      "vocabulary_id": null
274
      "vocabulary_id": null
            
273
    },
275
    },
            
274
    {
276
    {
            
275
      "display_name": "TELEO",
277
      "display_name": "TELEO",
            
276
      "id": "d67a8d9b-568f-45dc-ac71-fd05228faa6b",
278
      "id": "d67a8d9b-568f-45dc-ac71-fd05228faa6b",
            
277
      "name": "TELEO",
279
      "name": "TELEO",
            
278
      "state": "active",
280
      "state": "active",
            
279
      "vocabulary_id": null
281
      "vocabulary_id": null
            
280
    }
282
    }
            
281
  ],
283
  ],
            
282
  "title": "Environmental DNA Marine France LaPerouse 2019",
284
  "title": "Environmental DNA Marine France LaPerouse 2019",
            
283
  "type": "dataset",
285
  "type": "dataset",
            
284
  "url": null
286
  "url": null
            
285
}
287
}