Changes

              
    

          
          
        
        

            
f
1
{
f
1
{
            
2
  "author": "[{\"given_name\": \"Marion\", \"name\": \"Muff\", 
2
  "author": "[{\"given_name\": \"Marion\", \"name\": \"Muff\", 
            
3
\"email\": \"muffm@student.ethz.ch\", \"data_credit\": [], 
3
\"email\": \"muffm@student.ethz.ch\", \"data_credit\": [], 
            
4
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"ETHZ\"}, {\"given_name\": 
4
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"ETHZ\"}, {\"given_name\": 
            
5
\"Melissa\", \"name\": \"Jaquier\", \"email\": 
5
\"Melissa\", \"name\": \"Jaquier\", \"email\": 
            
6
\"melissa@jaquier.blue\", \"data_credit\": [], \"identifier\": \"\", 
6
\"melissa@jaquier.blue\", \"data_credit\": [], \"identifier\": \"\", 
            
7
\"affiliation\": \"ETHZ\"}, {\"given_name\": \"Virginie\", \"name\": 
7
\"affiliation\": \"ETHZ\"}, {\"given_name\": \"Virginie\", \"name\": 
            
8
\"Marques\", \"email\": \"virginie.marques@wsl.ch\", \"data_credit\": 
8
\"Marques\", \"email\": \"virginie.marques@wsl.ch\", \"data_credit\": 
            
9
[]}, {\"given_name\": \"Laurent\", \"name\": \"Ballesta\", \"email\": 
9
[]}, {\"given_name\": \"Laurent\", \"name\": \"Ballesta\", \"email\": 
            
10
\"laurent.ballesta@andromede.fr\", \"data_credit\": [], 
10
\"laurent.ballesta@andromede.fr\", \"data_credit\": [], 
            
11
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"Andromede\"}, 
11
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"Andromede\"}, 
            
12
{\"given_name\": \"Julie\", \"name\": \"Deter\", \"email\": 
12
{\"given_name\": \"Julie\", \"name\": \"Deter\", \"email\": 
            
13
\"julie.deter@andromede-ocean.com\", \"data_credit\": [], 
13
\"julie.deter@andromede-ocean.com\", \"data_credit\": [], 
            
14
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"Andromede\"}, 
14
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"Andromede\"}, 
            
15
{\"given_name\": \"Thomas\", \"name\": \"Bockel\", \"email\": 
15
{\"given_name\": \"Thomas\", \"name\": \"Bockel\", \"email\": 
            
16
\"thomas.bockel@andromede-ocean.com\", \"data_credit\": [], 
16
\"thomas.bockel@andromede-ocean.com\", \"data_credit\": [], 
            
17
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"Andromede\"}, 
17
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"Andromede\"}, 
            
18
{\"given_name\": \"R\\u00e9gis\", \"name\": \"Hocd\\u00e9\", 
18
{\"given_name\": \"R\\u00e9gis\", \"name\": \"Hocd\\u00e9\", 
            
19
\"email\": \"regis.hocde@ird.fr\", \"data_credit\": [], 
19
\"email\": \"regis.hocde@ird.fr\", \"data_credit\": [], 
            
20
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"IRD\"}, {\"given_name\": 
20
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"IRD\"}, {\"given_name\": 
            
21
\"Jean-Baptiste\", \"name\": \"Juhel\", \"email\": 
21
\"Jean-Baptiste\", \"name\": \"Juhel\", \"email\": 
            
22
\"jeanbaptiste.juhel@gmail.com\", \"data_credit\": [], \"identifier\": 
22
\"jeanbaptiste.juhel@gmail.com\", \"data_credit\": [], \"identifier\": 
            
23
\"\", \"affiliation\": \"University of Montpellier\"}, 
23
\"\", \"affiliation\": \"University of Montpellier\"}, 
            
24
{\"given_name\": \"Emilie\", \"name\": \"Boulanger\", \"email\": 
24
{\"given_name\": \"Emilie\", \"name\": \"Boulanger\", \"email\": 
            
25
\"Emilie.boulanger@hotmail.com\", \"data_credit\": [], \"identifier\": 
25
\"Emilie.boulanger@hotmail.com\", \"data_credit\": [], \"identifier\": 
            
26
\"\", \"affiliation\": \"University of Montpellier\"}, 
26
\"\", \"affiliation\": \"University of Montpellier\"}, 
            
27
{\"given_name\": \"Nacim\", \"name\": \"Guellati\", \"email\": 
27
{\"given_name\": \"Nacim\", \"name\": \"Guellati\", \"email\": 
            
28
\"nacim.guellati.1997@gmail.com\", \"data_credit\": [], 
28
\"nacim.guellati.1997@gmail.com\", \"data_credit\": [], 
            
29
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"University of Montpellier\"}, 
29
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"University of Montpellier\"}, 
            
30
{\"given_name\": \"Andrea\", \"name\": \"Polanco\", \"email\": 
30
{\"given_name\": \"Andrea\", \"name\": \"Polanco\", \"email\": 
            
31
\"andrea.polanco@gmail.com\", \"data_credit\": [], \"identifier\": 
31
\"andrea.polanco@gmail.com\", \"data_credit\": [], \"identifier\": 
            
32
\"\", \"affiliation\": \"Biodiversa Colombia Foundation, Colombia\"}, 
32
\"\", \"affiliation\": \"Biodiversa Colombia Foundation, Colombia\"}, 
            
33
{\"given_name\": \"Alice\", \"name\": \"Valentini\", \"email\": 
33
{\"given_name\": \"Alice\", \"name\": \"Valentini\", \"email\": 
            
34
\"alice.valentini@spygen.com\", \"data_credit\": [], \"identifier\": 
34
\"alice.valentini@spygen.com\", \"data_credit\": [], \"identifier\": 
            
35
\"\", \"affiliation\": \"SPYGEN\"}, {\"given_name\": \"Tony\", 
35
\"\", \"affiliation\": \"SPYGEN\"}, {\"given_name\": \"Tony\", 
            
36
\"name\": \"Dejean\", \"email\": \"tony.dejean@spygen.com\", 
36
\"name\": \"Dejean\", \"email\": \"tony.dejean@spygen.com\", 
            
37
\"data_credit\": [], \"identifier\": \"\", \"affiliation\": 
37
\"data_credit\": [], \"identifier\": \"\", \"affiliation\": 
            
38
\"SPYGEN\"}, {\"given_name\": \"Stephanie\", \"name\": \"Manel\", 
38
\"SPYGEN\"}, {\"given_name\": \"Stephanie\", \"name\": \"Manel\", 
            
39
\"email\": \"stephanie.manel@cefe.cnrs.fr\", \"data_credit\": [], 
39
\"email\": \"stephanie.manel@cefe.cnrs.fr\", \"data_credit\": [], 
            
40
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"EPHE\"}, {\"given_name\": 
40
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"EPHE\"}, {\"given_name\": 
            
41
\"Camille\", \"name\": \"Albouy\", \"email\": 
41
\"Camille\", \"name\": \"Albouy\", \"email\": 
            
42
\"camille.albouy@wsl.ch\", \"data_credit\": [], \"identifier\": \"\", 
42
\"camille.albouy@wsl.ch\", \"data_credit\": [], \"identifier\": \"\", 
            
43
\"affiliation\": \"Unit of Land Change Science, 7u Federal Research 
43
\"affiliation\": \"Unit of Land Change Science, 7u Federal Research 
            
44
Institute WSL, Birmensdorf, Switzerland\"}, {\"given_name\": 
44
Institute WSL, Birmensdorf, Switzerland\"}, {\"given_name\": 
            
45
\"Patrick\", \"name\": \"Durville\", \"email\": 
45
\"Patrick\", \"name\": \"Durville\", \"email\": 
            
46
\"patrick.durville.galaxea@gmail.com\", \"data_credit\": [], 
46
\"patrick.durville.galaxea@gmail.com\", \"data_credit\": [], 
            
47
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"GALAXEA\"}, {\"given_name\": 
47
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"GALAXEA\"}, {\"given_name\": 
            
48
\"David\", \"name\": \"Mouillot\", \"email\": 
48
\"David\", \"name\": \"Mouillot\", \"email\": 
            
49
\"david.mouillot@umontpellier.fr\", \"data_credit\": [], 
49
\"david.mouillot@umontpellier.fr\", \"data_credit\": [], 
            
50
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"University of Montpellier\"}, 
50
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"University of Montpellier\"}, 
            
51
{\"given_name\": \"Florian\", \"name\": \"Holon\", \"email\": 
51
{\"given_name\": \"Florian\", \"name\": \"Holon\", \"email\": 
            
52
\"florian.holon@andromede-ocean.com\", \"data_credit\": [], 
52
\"florian.holon@andromede-ocean.com\", \"data_credit\": [], 
            
53
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"Andromede\"}, 
53
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"Andromede\"}, 
            
54
{\"given_name\": \"Loic\", \"name\": \"Pellissier\", \"email\": 
54
{\"given_name\": \"Loic\", \"name\": \"Pellissier\", \"email\": 
            
55
\"loic.pellissier@wsl.ch\", \"data_credit\": [], \"identifier\": 
55
\"loic.pellissier@wsl.ch\", \"data_credit\": [], \"identifier\": 
            
56
\"0000-0002-2289-8259\", \"affiliation\": \"Landscape Ecology, 
56
\"0000-0002-2289-8259\", \"affiliation\": \"Landscape Ecology, 
            
57
Institute of Terrestrial Ecosystems, ETH Z\\u00fcrich, 8049 
57
Institute of Terrestrial Ecosystems, ETH Z\\u00fcrich, 8049 
            
58
Z\\u00fcrich, Switzerland\"}]",
58
Z\\u00fcrich, Switzerland\"}]",
            
59
  "author_email": null,
59
  "author_email": null,
            
60
  "creator_user_id": "382d8fab-f378-477d-88f6-26f77aee50d8",
60
  "creator_user_id": "382d8fab-f378-477d-88f6-26f77aee50d8",
            
61
  "date": 
61
  "date": 
            
62
\":\"created\",\"date\":\"2019-10-27\",\"end_date\":\"2019-11-05\"}]",
62
\":\"created\",\"date\":\"2019-10-27\",\"end_date\":\"2019-11-05\"}]",
            
63
  "doi": "10.16904/envidat.567",
63
  "doi": "10.16904/envidat.567",
            
64
  "extras": [
64
  "extras": [
            
65
    {
65
    {
            
66
      "key": "edna_type",
66
      "key": "edna_type",
            
67
      "value": "marine"
67
      "value": "marine"
            
68
    },
68
    },
            
69
    {
69
    {
            
70
      "key": "metadata",
70
      "key": "metadata",
            
71
      "value": 
71
      "value": 
            
72
ma_fr/ma_fr_lapero_2019/metadata/metadata_field_ma_fr_lapero_2019.csv"
72
ma_fr/ma_fr_lapero_2019/metadata/metadata_field_ma_fr_lapero_2019.csv"
            
73
    }
73
    }
            
74
  ],
74
  ],
            
75
  "funding": "[{\"institution\":\"Internal Funding ELE group 
75
  "funding": "[{\"institution\":\"Internal Funding ELE group 
            
76
nt_number\":\"\",\"institution_url\":\"\"},{\"institution\":\"Internal 
76
nt_number\":\"\",\"institution_url\":\"\"},{\"institution\":\"Internal 
            
77
funding Andromede\",\"grant_number\":\"GOMBESSA 
77
funding Andromede\",\"grant_number\":\"GOMBESSA 
            
78
5\",\"institution_url\":\"\"},{\"institution\":\"ANR labcom 
78
5\",\"institution_url\":\"\"},{\"institution\":\"ANR labcom 
            
n
79
2\",\"grant_number\":\"\",\"institution_url\":\"\"}]",
n
79
2\",\"grant_number\":\"InToSea (Innovative Tools under the Sea) joint 
            
80
laboratory\",\"institution_url\":\"\"}]",
            
80
  "groups": [
81
  "groups": [
            
81
    {
82
    {
            
82
      "description": "",
83
      "description": "",
            
83
      "display_name": "eDNA",
84
      "display_name": "eDNA",
            
84
      "id": "c2176351-3002-4d7a-b2aa-d8509f7dbfbe",
85
      "id": "c2176351-3002-4d7a-b2aa-d8509f7dbfbe",
            
85
      "image_display_url": "",
86
      "image_display_url": "",
            
86
      "name": "edna",
87
      "name": "edna",
            
87
      "title": "eDNA"
88
      "title": "eDNA"
            
88
    }
89
    }
            
89
  ],
90
  ],
            
90
  "id": "27331019-15d4-41c5-b9e4-866c6bc0a96a",
91
  "id": "27331019-15d4-41c5-b9e4-866c6bc0a96a",
            
91
  "isopen": true,
92
  "isopen": true,
            
92
  "license_id": "cc-by",
93
  "license_id": "cc-by",
            
93
  "license_title": "Creative Commons Attribution",
94
  "license_title": "Creative Commons Attribution",
            
94
  "license_url": "https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/",
95
  "license_url": "https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/",
            
95
  "maintainer": 
96
  "maintainer": 
            
96
e.marques@wsl.ch\",\"given_name\":\"Virginie\",\"name\":\"Marques\"}",
97
e.marques@wsl.ch\",\"given_name\":\"Virginie\",\"name\":\"Marques\"}",
            
97
  "maintainer_email": null,
98
  "maintainer_email": null,
            
98
  "metadata_created": "2024-12-10T15:08:00.727653",
99
  "metadata_created": "2024-12-10T15:08:00.727653",
            
t
99
  "metadata_modified": "2024-12-12T13:38:19.096176",
t
100
  "metadata_modified": "2024-12-12T13:49:47.184748",
            
100
  "name": "environmental-dna-marine-france-laperouse-2019",
101
  "name": "environmental-dna-marine-france-laperouse-2019",
            
101
  "notes": "Fish environmental DNA data set collected in the shallow 
102
  "notes": "Fish environmental DNA data set collected in the shallow 
            
102
seamount of La P\u00e9rouse located between Madagascar and 
103
seamount of La P\u00e9rouse located between Madagascar and 
            
103
R\u00e9union Island \n\n\nIn 2019, we sampled the shallow seamount of 
104
R\u00e9union Island \n\n\nIn 2019, we sampled the shallow seamount of 
            
104
La P\u00e9rouse, located between Madagascar and R\u00e9union Island in 
105
La P\u00e9rouse, located between Madagascar and R\u00e9union Island in 
            
105
the WIO. La P\u00e9rouse is an extinct volcano with a summit depth at 
106
the WIO. La P\u00e9rouse is an extinct volcano with a summit depth at 
            
106
60\u2009m below the sea surface. The plateau of the summit has a 
107
60\u2009m below the sea surface. The plateau of the summit has a 
            
107
maximum length of 12\u2009km and a maximum width of 4 km. One side of 
108
maximum length of 12\u2009km and a maximum width of 4 km. One side of 
            
108
the seamount might have collapsed in the past, leading to a less 
109
the seamount might have collapsed in the past, leading to a less 
            
109
common crescent-shaped summit. The abyssal plains that surround this 
110
common crescent-shaped summit. The abyssal plains that surround this 
            
110
isolated pinnacle are at a depth of 5000\u2009m. Despite its proximity 
111
isolated pinnacle are at a depth of 5000\u2009m. Despite its proximity 
            
111
to R\u00e9union Island (160\u2009km northwest), La P\u00e9rouse and 
112
to R\u00e9union Island (160\u2009km northwest), La P\u00e9rouse and 
            
112
its surroundings are still poorly studied.\n\nTo sample eDNA in this 
113
its surroundings are still poorly studied.\n\nTo sample eDNA in this 
            
113
location we used a submersible pump (Subspace, Geneva, Switzerland; 
114
location we used a submersible pump (Subspace, Geneva, Switzerland; 
            
114
nominal flow of ~\u20091.0 L/min) to collect samples at various depths 
115
nominal flow of ~\u20091.0 L/min) to collect samples at various depths 
            
115
during close circuit rebreather dives. The pump has an internal 
116
during close circuit rebreather dives. The pump has an internal 
            
116
battery and can be activated underwater allowing in situ filtration 
117
battery and can be activated underwater allowing in situ filtration 
            
117
directly at the targeted habitat and depth. The filtration lasted for 
118
directly at the targeted habitat and depth. The filtration lasted for 
            
118
30\u2009min to collect a total water volume of ~\u200930\u2009L. 
119
30\u2009min to collect a total water volume of ~\u200930\u2009L. 
            
119
During close circuit rebreather dives, water samples from various 
120
During close circuit rebreather dives, water samples from various 
            
120
depths, ranging from 60 to 140\u2009m below the sea surface, were 
121
depths, ranging from 60 to 140\u2009m below the sea surface, were 
            
121
collected using only the Submersible method (eight stations: no 
122
collected using only the Submersible method (eight stations: no 
            
122
replicates). Out of the eight water samples, six were collected during 
123
replicates). Out of the eight water samples, six were collected during 
            
123
the day, while two were collected at night (IS2_1 at 62\u2009m and 
124
the day, while two were collected at night (IS2_1 at 62\u2009m and 
            
124
IS7_1 at 100\u2013125\u2009m). We applied this filtration protocols to 
125
IS7_1 at 100\u2013125\u2009m). We applied this filtration protocols to 
            
125
collect and filter water throughout a VigiDNA\u00ae 0.2 \u03bcM 
126
collect and filter water throughout a VigiDNA\u00ae 0.2 \u03bcM 
            
126
cross-flow filtration capsule (SPYGEN, le Bourget du Lac, France) 
127
cross-flow filtration capsule (SPYGEN, le Bourget du Lac, France) 
            
127
using disposable sterile tubing for each filtration capsule. After the 
128
using disposable sterile tubing for each filtration capsule. After the 
            
128
filtration process, the remaining water in the capsules was emptied. 
129
filtration process, the remaining water in the capsules was emptied. 
            
129
The capsules were then filled with 80\u2009ml of lysis conservation 
130
The capsules were then filled with 80\u2009ml of lysis conservation 
            
130
buffer (CL1 buffer SPYGEN, le Bourget du Lac, France) and stored at 
131
buffer (CL1 buffer SPYGEN, le Bourget du Lac, France) and stored at 
            
131
room temperature in the dark. At La P\u00e9rouse, a total of eight 
132
room temperature in the dark. At La P\u00e9rouse, a total of eight 
            
132
water samples were collected during the MONT LA P\u00c9ROUSE 
133
water samples were collected during the MONT LA P\u00c9ROUSE 
            
133
expedition (https://gombessa-expeditions.com/mont-la-perouse/) on 
134
expedition (https://gombessa-expeditions.com/mont-la-perouse/) on 
            
134
board the ship La Curieuse to the seamount La P\u00e9rouse from 
135
board the ship La Curieuse to the seamount La P\u00e9rouse from 
            
135
October 27th to November 5th 2019. We followed a strict contamination 
136
October 27th to November 5th 2019. We followed a strict contamination 
            
136
control protocol in both field and laboratory stages. Each water 
137
control protocol in both field and laboratory stages. Each water 
            
137
sample processing included the use of disposable gloves and single-use 
138
sample processing included the use of disposable gloves and single-use 
            
138
filtration equipment to avoid any risk of contamination. Libraries 
139
filtration equipment to avoid any risk of contamination. Libraries 
            
139
were prepared with ligation using the MetaFast protocol 
140
were prepared with ligation using the MetaFast protocol 
            
140
(Fasteris).\n\nData content: \n\t* rawdata/: contains the raw reads 
141
(Fasteris).\n\nData content: \n\t* rawdata/: contains the raw reads 
            
141
for each individual sample. One archive contains the paired-end reads 
142
for each individual sample. One archive contains the paired-end reads 
            
142
specified by the _R1 or _R2 suffix as well as individually tagged PCR 
143
specified by the _R1 or _R2 suffix as well as individually tagged PCR 
            
143
replicates (if available) together with an archive containing all 
144
replicates (if available) together with an archive containing all 
            
144
extraction and PCR blank samples of the library. Reads have been 
145
extraction and PCR blank samples of the library. Reads have been 
            
145
demultiplexed using cutadapt but not trimmed, individual 
146
demultiplexed using cutadapt but not trimmed, individual 
            
146
demultiplexing tags and primers remain present in the sequences.  
147
demultiplexing tags and primers remain present in the sequences.  
            
147
\n\t* taxadata/: contains the table with all detected taxonomy for 
148
\n\t* taxadata/: contains the table with all detected taxonomy for 
            
148
each sample after bioinformatic processing (see Polanco et al. 2020 
149
each sample after bioinformatic processing (see Polanco et al. 2020 
            
149
for details; https://doi.org/10.1002/edn3.140) and associated field 
150
for details; https://doi.org/10.1002/edn3.140) and associated field 
            
150
metadata. \n\t* metadata/: contains two metadata files, one related to 
151
metadata. \n\t* metadata/: contains two metadata files, one related to 
            
151
the data collected in the field for each filter, and the second 
152
the data collected in the field for each filter, and the second 
            
152
related to the sequencing process in the lab (including the tag 
153
related to the sequencing process in the lab (including the tag 
            
153
sequence, library name, and marker information for each sample)\n",
154
sequence, library name, and marker information for each sample)\n",
            
154
  "num_resources": 1,
155
  "num_resources": 1,
            
155
  "num_tags": 7,
156
  "num_tags": 7,
            
156
  "organization": {
157
  "organization": {
            
157
    "approval_status": "approved",
158
    "approval_status": "approved",
            
158
    "created": "2018-12-01T11:59:01.791513",
159
    "created": "2018-12-01T11:59:01.791513",
            
159
    "description": "We are an international research team with diverse 
160
    "description": "We are an international research team with diverse 
            
160
scientific expertise and backgrounds, connected by the goal to 
161
scientific expertise and backgrounds, connected by the goal to 
            
161
understand biodiversity. We study the mechanisms that shape 
162
understand biodiversity. We study the mechanisms that shape 
            
162
biodiversity patterns across spatial and temporal scales - in both 
163
biodiversity patterns across spatial and temporal scales - in both 
            
163
terrestrial and aquatic ecosystems -\u200bsuch as mountain ranges and 
164
terrestrial and aquatic ecosystems -\u200bsuch as mountain ranges and 
            
164
tropical reefs. We use an interdisciplinary approach, whereby we 
165
tropical reefs. We use an interdisciplinary approach, whereby we 
            
165
bridge ecology, evolution, Earth history and global change.\r\nTo make 
166
bridge ecology, evolution, Earth history and global change.\r\nTo make 
            
166
these connections, we collect data through biological monitoring, 
167
these connections, we collect data through biological monitoring, 
            
167
environmental DNA methods, remote sensing, and field sampling, and use 
168
environmental DNA methods, remote sensing, and field sampling, and use 
            
168
these data to answer questions with statistical and 
169
these data to answer questions with statistical and 
            
169
process-\u200bbased models of biological diversity.\r\nOur group is 
170
process-\u200bbased models of biological diversity.\r\nOur group is 
            
170
affiliated with ETH and WSL, but is also associated with Agroscope, 
171
affiliated with ETH and WSL, but is also associated with Agroscope, 
            
171
EAWAG, the European Joint Research Centre and Vogelwarte.",
172
EAWAG, the European Joint Research Centre and Vogelwarte.",
            
172
    "id": "153392ee-d556-4b16-a330-dedb177e87f9",
173
    "id": "153392ee-d556-4b16-a330-dedb177e87f9",
            
173
    "image_url": 
174
    "image_url": 
            
174
le.ethz.ch/_jcr_content/orgbox/image.imageformat.logo.1254626489.png",
175
le.ethz.ch/_jcr_content/orgbox/image.imageformat.logo.1254626489.png",
            
175
    "is_organization": true,
176
    "is_organization": true,
            
176
    "name": "ele-group",
177
    "name": "ele-group",
            
177
    "state": "active",
178
    "state": "active",
            
178
    "title": "Ecosystems and Landscape Evolution",
179
    "title": "Ecosystems and Landscape Evolution",
            
179
    "type": "organization"
180
    "type": "organization"
            
180
  },
181
  },
            
181
  "owner_org": "153392ee-d556-4b16-a330-dedb177e87f9",
182
  "owner_org": "153392ee-d556-4b16-a330-dedb177e87f9",
            
182
  "private": false,
183
  "private": false,
            
183
  "publication": 
184
  "publication": 
            
184
"{\"publisher\":\"EnviDat\",\"publication_year\":\"2024\"}",
185
"{\"publisher\":\"EnviDat\",\"publication_year\":\"2024\"}",
            
185
  "publication_state": "published",
186
  "publication_state": "published",
            
186
  "related_publications": "Muff, Marion, et al. \"Environmental DNA 
187
  "related_publications": "Muff, Marion, et al. \"Environmental DNA 
            
187
highlights fish biodiversity in mesophotic ecosystems.\" Environ. DNA, 
188
highlights fish biodiversity in mesophotic ecosystems.\" Environ. DNA, 
            
188
vol. 5, no. 1, 1 Jan. 2023, pp. 56-72, doi:10.1002/edn3.358.",
189
vol. 5, no. 1, 1 Jan. 2023, pp. 56-72, doi:10.1002/edn3.358.",
            
189
  "relationships_as_object": [],
190
  "relationships_as_object": [],
            
190
  "relationships_as_subject": [],
191
  "relationships_as_subject": [],
            
191
  "resource_type": "dataset",
192
  "resource_type": "dataset",
            
192
  "resource_type_general": "dataset",
193
  "resource_type_general": "dataset",
            
193
  "resources": [
194
  "resources": [
            
194
    {
195
    {
            
195
      "cache_last_updated": null,
196
      "cache_last_updated": null,
            
196
      "cache_url": null,
197
      "cache_url": null,
            
197
      "created": "2024-12-10T15:19:34.794121",
198
      "created": "2024-12-10T15:19:34.794121",
            
198
      "description": "Please use cyberduck to download for the 
199
      "description": "Please use cyberduck to download for the 
            
199
moment",
200
moment",
            
200
      "doi": "",
201
      "doi": "",
            
201
      "format": "csv + fasta",
202
      "format": "csv + fasta",
            
202
      "hash": "",
203
      "hash": "",
            
203
      "id": "add08aff-55fa-4e9d-a96f-014465c2436e",
204
      "id": "add08aff-55fa-4e9d-a96f-014465c2436e",
            
204
      "last_modified": "2024-12-10T16:20:42.072000",
205
      "last_modified": "2024-12-10T16:20:42.072000",
            
205
      "metadata_modified": "2024-12-11T12:00:15.003656",
206
      "metadata_modified": "2024-12-11T12:00:15.003656",
            
206
      "mimetype": null,
207
      "mimetype": null,
            
207
      "mimetype_inner": null,
208
      "mimetype_inner": null,
            
208
      "name": "Data access",
209
      "name": "Data access",
            
209
      "package_id": "27331019-15d4-41c5-b9e4-866c6bc0a96a",
210
      "package_id": "27331019-15d4-41c5-b9e4-866c6bc0a96a",
            
210
      "position": 0,
211
      "position": 0,
            
211
      "publication_state": "",
212
      "publication_state": "",
            
212
      "resource_size": "{\"size_units\": \"gb\", \"size_value\": 
213
      "resource_size": "{\"size_units\": \"gb\", \"size_value\": 
            
213
\"1.6\"}",
214
\"1.6\"}",
            
214
      "resource_type": null,
215
      "resource_type": null,
            
215
      "restricted": "{\"allowed_users\": \"\", \"level\": \"public\", 
216
      "restricted": "{\"allowed_users\": \"\", \"level\": \"public\", 
            
216
\"shared_secret\": \"\"}",
217
\"shared_secret\": \"\"}",
            
217
      "size": null,
218
      "size": null,
            
218
      "state": "active",
219
      "state": "active",
            
219
      "url": 
220
      "url": 
            
220
cket=https://envicloud.wsl.ch/edna/&prefix=/ma_fr/ma_fr_lapero_2019/",
221
cket=https://envicloud.wsl.ch/edna/&prefix=/ma_fr/ma_fr_lapero_2019/",
            
221
      "url_type": null
222
      "url_type": null
            
222
    }
223
    }
            
223
  ],
224
  ],
            
224
  "spatial": 
225
  "spatial": 
            
225
ies\":{\"name\":\"environmental-dna-marine-france-laperouse-2019\"}}",
226
ies\":{\"name\":\"environmental-dna-marine-france-laperouse-2019\"}}",
            
226
  "state": "active",
227
  "state": "active",
            
227
  "subtitle": "",
228
  "subtitle": "",
            
228
  "tags": [
229
  "tags": [
            
229
    {
230
    {
            
230
      "display_name": "CORAL REEF",
231
      "display_name": "CORAL REEF",
            
231
      "id": "63718352-c39f-4313-9ca3-bdb1d680dbef",
232
      "id": "63718352-c39f-4313-9ca3-bdb1d680dbef",
            
232
      "name": "CORAL REEF",
233
      "name": "CORAL REEF",
            
233
      "state": "active",
234
      "state": "active",
            
234
      "vocabulary_id": null
235
      "vocabulary_id": null
            
235
    },
236
    },
            
236
    {
237
    {
            
237
      "display_name": "ENVIRONMENTAL DNA",
238
      "display_name": "ENVIRONMENTAL DNA",
            
238
      "id": "db7d5622-d1fc-4d24-91f7-73842c6743b6",
239
      "id": "db7d5622-d1fc-4d24-91f7-73842c6743b6",
            
239
      "name": "ENVIRONMENTAL DNA",
240
      "name": "ENVIRONMENTAL DNA",
            
240
      "state": "active",
241
      "state": "active",
            
241
      "vocabulary_id": null
242
      "vocabulary_id": null
            
242
    },
243
    },
            
243
    {
244
    {
            
244
      "display_name": "FISH COMPOSITION",
245
      "display_name": "FISH COMPOSITION",
            
245
      "id": "4c441df2-c810-49ad-81a3-483b6a9ff2bb",
246
      "id": "4c441df2-c810-49ad-81a3-483b6a9ff2bb",
            
246
      "name": "FISH COMPOSITION",
247
      "name": "FISH COMPOSITION",
            
247
      "state": "active",
248
      "state": "active",
            
248
      "vocabulary_id": null
249
      "vocabulary_id": null
            
249
    },
250
    },
            
250
    {
251
    {
            
251
      "display_name": "INDIAN OCEAN",
252
      "display_name": "INDIAN OCEAN",
            
252
      "id": "064cc0db-d544-453d-98f9-54b9f46fba27",
253
      "id": "064cc0db-d544-453d-98f9-54b9f46fba27",
            
253
      "name": "INDIAN OCEAN",
254
      "name": "INDIAN OCEAN",
            
254
      "state": "active",
255
      "state": "active",
            
255
      "vocabulary_id": null
256
      "vocabulary_id": null
            
256
    },
257
    },
            
257
    {
258
    {
            
258
      "display_name": "LAPEROUSE",
259
      "display_name": "LAPEROUSE",
            
259
      "id": "b5062b96-2335-4fde-b7e5-0b615d947d89",
260
      "id": "b5062b96-2335-4fde-b7e5-0b615d947d89",
            
260
      "name": "LAPEROUSE",
261
      "name": "LAPEROUSE",
            
261
      "state": "active",
262
      "state": "active",
            
262
      "vocabulary_id": null
263
      "vocabulary_id": null
            
263
    },
264
    },
            
264
    {
265
    {
            
265
      "display_name": "MARINE",
266
      "display_name": "MARINE",
            
266
      "id": "1f05d702-5580-40ac-9c9a-47127e050fa7",
267
      "id": "1f05d702-5580-40ac-9c9a-47127e050fa7",
            
267
      "name": "MARINE",
268
      "name": "MARINE",
            
268
      "state": "active",
269
      "state": "active",
            
269
      "vocabulary_id": null
270
      "vocabulary_id": null
            
270
    },
271
    },
            
271
    {
272
    {
            
272
      "display_name": "TELEO",
273
      "display_name": "TELEO",
            
273
      "id": "d67a8d9b-568f-45dc-ac71-fd05228faa6b",
274
      "id": "d67a8d9b-568f-45dc-ac71-fd05228faa6b",
            
274
      "name": "TELEO",
275
      "name": "TELEO",
            
275
      "state": "active",
276
      "state": "active",
            
276
      "vocabulary_id": null
277
      "vocabulary_id": null
            
277
    }
278
    }
            
278
  ],
279
  ],
            
279
  "title": "Environmental DNA Marine France LaPerouse 2019",
280
  "title": "Environmental DNA Marine France LaPerouse 2019",
            
280
  "type": "dataset",
281
  "type": "dataset",
            
281
  "url": null
282
  "url": null
            
282
}
283
}