Changes

              
    

          
          
        
        

            
f
1
{
f
1
{
            
2
  "author": "[{\"given_name\": \"Marion\", \"name\": \"Muff\", 
2
  "author": "[{\"given_name\": \"Marion\", \"name\": \"Muff\", 
            
3
\"email\": \"muffm@student.ethz.ch\", \"data_credit\": [], 
3
\"email\": \"muffm@student.ethz.ch\", \"data_credit\": [], 
            
4
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"ETHZ\"}, {\"given_name\": 
4
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"ETHZ\"}, {\"given_name\": 
            
5
\"Melissa\", \"name\": \"Jaquier\", \"email\": 
5
\"Melissa\", \"name\": \"Jaquier\", \"email\": 
            
6
\"melissa@jaquier.blue\", \"data_credit\": [], \"identifier\": \"\", 
6
\"melissa@jaquier.blue\", \"data_credit\": [], \"identifier\": \"\", 
            
7
\"affiliation\": \"ETHZ\"}, {\"given_name\": \"Virginie\", \"name\": 
7
\"affiliation\": \"ETHZ\"}, {\"given_name\": \"Virginie\", \"name\": 
            
8
\"Marques\", \"email\": \"virginie.marques@wsl.ch\", \"data_credit\": 
8
\"Marques\", \"email\": \"virginie.marques@wsl.ch\", \"data_credit\": 
            
9
[]}, {\"given_name\": \"Laurent\", \"name\": \"Ballesta\", \"email\": 
9
[]}, {\"given_name\": \"Laurent\", \"name\": \"Ballesta\", \"email\": 
            
10
\"laurent.ballesta@andromede.fr\", \"data_credit\": [], 
10
\"laurent.ballesta@andromede.fr\", \"data_credit\": [], 
            
11
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"Andromede\"}, 
11
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"Andromede\"}, 
            
12
{\"given_name\": \"Julie\", \"name\": \"Deter\", \"email\": 
12
{\"given_name\": \"Julie\", \"name\": \"Deter\", \"email\": 
            
13
\"julie.deter@andromede-ocean.com\", \"data_credit\": [], 
13
\"julie.deter@andromede-ocean.com\", \"data_credit\": [], 
            
14
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"Andromede\"}, 
14
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"Andromede\"}, 
            
15
{\"given_name\": \"Thomas\", \"name\": \"Bockel\", \"email\": 
15
{\"given_name\": \"Thomas\", \"name\": \"Bockel\", \"email\": 
            
16
\"thomas.bockel@andromede-ocean.com\", \"data_credit\": [], 
16
\"thomas.bockel@andromede-ocean.com\", \"data_credit\": [], 
            
17
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"Andromede\"}, 
17
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"Andromede\"}, 
            
18
{\"given_name\": \"R\\u00e9gis\", \"name\": \"Hocd\\u00e9\", 
18
{\"given_name\": \"R\\u00e9gis\", \"name\": \"Hocd\\u00e9\", 
            
19
\"email\": \"regis.hocde@ird.fr\", \"data_credit\": [], 
19
\"email\": \"regis.hocde@ird.fr\", \"data_credit\": [], 
            
20
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"IRD\"}, {\"given_name\": 
20
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"IRD\"}, {\"given_name\": 
            
21
\"Jean-Baptiste\", \"name\": \"Juhel\", \"email\": 
21
\"Jean-Baptiste\", \"name\": \"Juhel\", \"email\": 
            
22
\"jeanbaptiste.juhel@gmail.com\", \"data_credit\": [], \"identifier\": 
22
\"jeanbaptiste.juhel@gmail.com\", \"data_credit\": [], \"identifier\": 
            
23
\"\", \"affiliation\": \"University of Montpellier\"}, 
23
\"\", \"affiliation\": \"University of Montpellier\"}, 
            
24
{\"given_name\": \"Emilie\", \"name\": \"Boulanger\", \"email\": 
24
{\"given_name\": \"Emilie\", \"name\": \"Boulanger\", \"email\": 
            
25
\"Emilie.boulanger@hotmail.com\", \"data_credit\": [], \"identifier\": 
25
\"Emilie.boulanger@hotmail.com\", \"data_credit\": [], \"identifier\": 
            
26
\"\", \"affiliation\": \"University of Montpellier\"}, 
26
\"\", \"affiliation\": \"University of Montpellier\"}, 
            
27
{\"given_name\": \"Nacim\", \"name\": \"Guellati\", \"email\": 
27
{\"given_name\": \"Nacim\", \"name\": \"Guellati\", \"email\": 
            
28
\"nacim.guellati.1997@gmail.com\", \"data_credit\": [], 
28
\"nacim.guellati.1997@gmail.com\", \"data_credit\": [], 
            
29
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"University of Montpellier\"}, 
29
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"University of Montpellier\"}, 
            
30
{\"given_name\": \"Andrea\", \"name\": \"Polanco\", \"email\": 
30
{\"given_name\": \"Andrea\", \"name\": \"Polanco\", \"email\": 
            
31
\"andrea.polanco@gmail.com\", \"data_credit\": [], \"identifier\": 
31
\"andrea.polanco@gmail.com\", \"data_credit\": [], \"identifier\": 
            
32
\"\", \"affiliation\": \"Biodiversa Colombia Foundation, Colombia\"}, 
32
\"\", \"affiliation\": \"Biodiversa Colombia Foundation, Colombia\"}, 
            
33
{\"given_name\": \"Alice\", \"name\": \"Valentini\", \"email\": 
33
{\"given_name\": \"Alice\", \"name\": \"Valentini\", \"email\": 
            
34
\"alice.valentini@spygen.com\", \"data_credit\": [], \"identifier\": 
34
\"alice.valentini@spygen.com\", \"data_credit\": [], \"identifier\": 
            
35
\"\", \"affiliation\": \"SPYGEN\"}, {\"given_name\": \"Tony\", 
35
\"\", \"affiliation\": \"SPYGEN\"}, {\"given_name\": \"Tony\", 
            
36
\"name\": \"Dejean\", \"email\": \"tony.dejean@spygen.com\", 
36
\"name\": \"Dejean\", \"email\": \"tony.dejean@spygen.com\", 
            
37
\"data_credit\": [], \"identifier\": \"\", \"affiliation\": 
37
\"data_credit\": [], \"identifier\": \"\", \"affiliation\": 
            
38
\"SPYGEN\"}, {\"given_name\": \"Stephanie\", \"name\": \"Manel\", 
38
\"SPYGEN\"}, {\"given_name\": \"Stephanie\", \"name\": \"Manel\", 
            
39
\"email\": \"stephanie.manel@cefe.cnrs.fr\", \"data_credit\": [], 
39
\"email\": \"stephanie.manel@cefe.cnrs.fr\", \"data_credit\": [], 
            
40
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"EPHE\"}, {\"given_name\": 
40
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"EPHE\"}, {\"given_name\": 
            
41
\"Camille\", \"name\": \"Albouy\", \"email\": 
41
\"Camille\", \"name\": \"Albouy\", \"email\": 
            
42
\"camille.albouy@wsl.ch\", \"data_credit\": [], \"identifier\": \"\", 
42
\"camille.albouy@wsl.ch\", \"data_credit\": [], \"identifier\": \"\", 
            
43
\"affiliation\": \"Unit of Land Change Science, 7u Federal Research 
43
\"affiliation\": \"Unit of Land Change Science, 7u Federal Research 
            
44
Institute WSL, Birmensdorf, Switzerland\"}, {\"given_name\": 
44
Institute WSL, Birmensdorf, Switzerland\"}, {\"given_name\": 
            
45
\"Patrick\", \"name\": \"Durville\", \"email\": 
45
\"Patrick\", \"name\": \"Durville\", \"email\": 
            
46
\"patrick.durville.galaxea@gmail.com\", \"data_credit\": [], 
46
\"patrick.durville.galaxea@gmail.com\", \"data_credit\": [], 
            
47
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"GALAXEA\"}, {\"given_name\": 
47
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"GALAXEA\"}, {\"given_name\": 
            
48
\"David\", \"name\": \"Mouillot\", \"email\": 
48
\"David\", \"name\": \"Mouillot\", \"email\": 
            
49
\"david.mouillot@umontpellier.fr\", \"data_credit\": [], 
49
\"david.mouillot@umontpellier.fr\", \"data_credit\": [], 
            
50
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"University of Montpellier\"}, 
50
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"University of Montpellier\"}, 
            
51
{\"given_name\": \"Florian\", \"name\": \"Holon\", \"email\": 
51
{\"given_name\": \"Florian\", \"name\": \"Holon\", \"email\": 
            
52
\"florian.holon@andromede-ocean.com\", \"data_credit\": [], 
52
\"florian.holon@andromede-ocean.com\", \"data_credit\": [], 
            
53
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"Andromede\"}, 
53
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"Andromede\"}, 
            
54
{\"given_name\": \"Loic\", \"name\": \"Pellissier\", \"email\": 
54
{\"given_name\": \"Loic\", \"name\": \"Pellissier\", \"email\": 
            
55
\"loic.pellissier@wsl.ch\", \"data_credit\": [], \"identifier\": 
55
\"loic.pellissier@wsl.ch\", \"data_credit\": [], \"identifier\": 
            
56
\"0000-0002-2289-8259\", \"affiliation\": \"Landscape Ecology, 
56
\"0000-0002-2289-8259\", \"affiliation\": \"Landscape Ecology, 
            
57
Institute of Terrestrial Ecosystems, ETH Z\\u00fcrich, 8049 
57
Institute of Terrestrial Ecosystems, ETH Z\\u00fcrich, 8049 
            
58
Z\\u00fcrich, Switzerland\"}]",
58
Z\\u00fcrich, Switzerland\"}]",
            
59
  "author_email": null,
59
  "author_email": null,
            
60
  "creator_user_id": "382d8fab-f378-477d-88f6-26f77aee50d8",
60
  "creator_user_id": "382d8fab-f378-477d-88f6-26f77aee50d8",
            
61
  "date": 
61
  "date": 
            
62
\":\"created\",\"date\":\"2019-10-27\",\"end_date\":\"2019-11-05\"}]",
62
\":\"created\",\"date\":\"2019-10-27\",\"end_date\":\"2019-11-05\"}]",
            
63
  "doi": "10.16904/envidat.567",
63
  "doi": "10.16904/envidat.567",
            
64
  "extras": [
64
  "extras": [
            
65
    {
65
    {
            
66
      "key": "edna_type",
66
      "key": "edna_type",
            
67
      "value": "marine"
67
      "value": "marine"
            
68
    },
68
    },
            
69
    {
69
    {
            
70
      "key": "metadata",
70
      "key": "metadata",
            
71
      "value": 
71
      "value": 
            
72
ma_fr/ma_fr_lapero_2019/metadata/metadata_field_ma_fr_lapero_2019.csv"
72
ma_fr/ma_fr_lapero_2019/metadata/metadata_field_ma_fr_lapero_2019.csv"
            
73
    }
73
    }
            
74
  ],
74
  ],
            
75
  "funding": "[{\"institution\":\"Internal Funding ELE group 
75
  "funding": "[{\"institution\":\"Internal Funding ELE group 
            
76
\",\"grant_number\":\"\",\"institution_url\":\"\"},{\"institution\":\" 
76
\",\"grant_number\":\"\",\"institution_url\":\"\"},{\"institution\":\" 
            
77
Andromede Oceanologie\",\"grant_number\":\"GOMBESSA 
77
Andromede Oceanologie\",\"grant_number\":\"GOMBESSA 
            
78
5\",\"institution_url\":\"\"},{\"institution\":\"ANR labcom 
78
5\",\"institution_url\":\"\"},{\"institution\":\"ANR labcom 
            
79
2\",\"grant_number\":\"InToSea (Innovative Tools under the Sea) joint 
79
2\",\"grant_number\":\"InToSea (Innovative Tools under the Sea) joint 
            
80
laboratory\",\"institution_url\":\"\"},{\"institution\":\"Manufacture 
80
laboratory\",\"institution_url\":\"\"},{\"institution\":\"Manufacture 
            
81
de Haute Horlogerie Suisse Blancpain and Blancpain Ocean 
81
de Haute Horlogerie Suisse Blancpain and Blancpain Ocean 
            
82
rant_number\":\"\",\"institution_url\":\"\"},{\"institution\":\"Prince 
82
rant_number\":\"\",\"institution_url\":\"\"},{\"institution\":\"Prince 
            
83
Albert II de Monaco 
83
Albert II de Monaco 
            
84
\":\"\",\"institution_url\":\"\"},{\"institution\":\"Soci\u00e9t\u00e9 
84
\":\"\",\"institution_url\":\"\"},{\"institution\":\"Soci\u00e9t\u00e9 
            
85
des explorations de 
85
des explorations de 
            
86
rant_number\":\"\",\"institution_url\":\"\"},{\"institution\":\"French 
86
rant_number\":\"\",\"institution_url\":\"\"},{\"institution\":\"French 
            
87
Water 
87
Water 
            
88
nt_number\":\"\",\"institution_url\":\"\"},{\"institution\":\"Ministry 
88
nt_number\":\"\",\"institution_url\":\"\"},{\"institution\":\"Ministry 
            
n
89
of Overseas 
n
89
of Overseas France\",\"grant_number\":\"Convergence and Transformation 
            
90
France\",\"grant_number\":\"\",\"institution_url\":\"\"}]",
90
Contract 2019-2022, measure 3.5.1.1 of the \u201cResilient 
            
91
Territories\u201d section\",\"institution_url\":\"\"}]",
            
91
  "groups": [
92
  "groups": [
            
92
    {
93
    {
            
93
      "description": "",
94
      "description": "",
            
94
      "display_name": "eDNA",
95
      "display_name": "eDNA",
            
95
      "id": "c2176351-3002-4d7a-b2aa-d8509f7dbfbe",
96
      "id": "c2176351-3002-4d7a-b2aa-d8509f7dbfbe",
            
96
      "image_display_url": "",
97
      "image_display_url": "",
            
97
      "name": "edna",
98
      "name": "edna",
            
98
      "title": "eDNA"
99
      "title": "eDNA"
            
99
    }
100
    }
            
100
  ],
101
  ],
            
101
  "id": "27331019-15d4-41c5-b9e4-866c6bc0a96a",
102
  "id": "27331019-15d4-41c5-b9e4-866c6bc0a96a",
            
102
  "isopen": true,
103
  "isopen": true,
            
103
  "license_id": "cc-by",
104
  "license_id": "cc-by",
            
104
  "license_title": "Creative Commons Attribution",
105
  "license_title": "Creative Commons Attribution",
            
105
  "license_url": "https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/",
106
  "license_url": "https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/",
            
106
  "maintainer": 
107
  "maintainer": 
            
107
e.marques@wsl.ch\",\"given_name\":\"Virginie\",\"name\":\"Marques\"}",
108
e.marques@wsl.ch\",\"given_name\":\"Virginie\",\"name\":\"Marques\"}",
            
108
  "maintainer_email": null,
109
  "maintainer_email": null,
            
109
  "metadata_created": "2024-12-10T15:08:00.727653",
110
  "metadata_created": "2024-12-10T15:08:00.727653",
            
t
110
  "metadata_modified": "2024-12-12T13:51:33.674937",
t
111
  "metadata_modified": "2024-12-12T13:51:45.659650",
            
111
  "name": "environmental-dna-marine-france-laperouse-2019",
112
  "name": "environmental-dna-marine-france-laperouse-2019",
            
112
  "notes": "Fish environmental DNA data set collected in the shallow 
113
  "notes": "Fish environmental DNA data set collected in the shallow 
            
113
seamount of La P\u00e9rouse located between Madagascar and 
114
seamount of La P\u00e9rouse located between Madagascar and 
            
114
R\u00e9union Island \n\n\nIn 2019, we sampled the shallow seamount of 
115
R\u00e9union Island \n\n\nIn 2019, we sampled the shallow seamount of 
            
115
La P\u00e9rouse, located between Madagascar and R\u00e9union Island in 
116
La P\u00e9rouse, located between Madagascar and R\u00e9union Island in 
            
116
the WIO. La P\u00e9rouse is an extinct volcano with a summit depth at 
117
the WIO. La P\u00e9rouse is an extinct volcano with a summit depth at 
            
117
60\u2009m below the sea surface. The plateau of the summit has a 
118
60\u2009m below the sea surface. The plateau of the summit has a 
            
118
maximum length of 12\u2009km and a maximum width of 4 km. One side of 
119
maximum length of 12\u2009km and a maximum width of 4 km. One side of 
            
119
the seamount might have collapsed in the past, leading to a less 
120
the seamount might have collapsed in the past, leading to a less 
            
120
common crescent-shaped summit. The abyssal plains that surround this 
121
common crescent-shaped summit. The abyssal plains that surround this 
            
121
isolated pinnacle are at a depth of 5000\u2009m. Despite its proximity 
122
isolated pinnacle are at a depth of 5000\u2009m. Despite its proximity 
            
122
to R\u00e9union Island (160\u2009km northwest), La P\u00e9rouse and 
123
to R\u00e9union Island (160\u2009km northwest), La P\u00e9rouse and 
            
123
its surroundings are still poorly studied.\n\nTo sample eDNA in this 
124
its surroundings are still poorly studied.\n\nTo sample eDNA in this 
            
124
location we used a submersible pump (Subspace, Geneva, Switzerland; 
125
location we used a submersible pump (Subspace, Geneva, Switzerland; 
            
125
nominal flow of ~\u20091.0 L/min) to collect samples at various depths 
126
nominal flow of ~\u20091.0 L/min) to collect samples at various depths 
            
126
during close circuit rebreather dives. The pump has an internal 
127
during close circuit rebreather dives. The pump has an internal 
            
127
battery and can be activated underwater allowing in situ filtration 
128
battery and can be activated underwater allowing in situ filtration 
            
128
directly at the targeted habitat and depth. The filtration lasted for 
129
directly at the targeted habitat and depth. The filtration lasted for 
            
129
30\u2009min to collect a total water volume of ~\u200930\u2009L. 
130
30\u2009min to collect a total water volume of ~\u200930\u2009L. 
            
130
During close circuit rebreather dives, water samples from various 
131
During close circuit rebreather dives, water samples from various 
            
131
depths, ranging from 60 to 140\u2009m below the sea surface, were 
132
depths, ranging from 60 to 140\u2009m below the sea surface, were 
            
132
collected using only the Submersible method (eight stations: no 
133
collected using only the Submersible method (eight stations: no 
            
133
replicates). Out of the eight water samples, six were collected during 
134
replicates). Out of the eight water samples, six were collected during 
            
134
the day, while two were collected at night (IS2_1 at 62\u2009m and 
135
the day, while two were collected at night (IS2_1 at 62\u2009m and 
            
135
IS7_1 at 100\u2013125\u2009m). We applied this filtration protocols to 
136
IS7_1 at 100\u2013125\u2009m). We applied this filtration protocols to 
            
136
collect and filter water throughout a VigiDNA\u00ae 0.2 \u03bcM 
137
collect and filter water throughout a VigiDNA\u00ae 0.2 \u03bcM 
            
137
cross-flow filtration capsule (SPYGEN, le Bourget du Lac, France) 
138
cross-flow filtration capsule (SPYGEN, le Bourget du Lac, France) 
            
138
using disposable sterile tubing for each filtration capsule. After the 
139
using disposable sterile tubing for each filtration capsule. After the 
            
139
filtration process, the remaining water in the capsules was emptied. 
140
filtration process, the remaining water in the capsules was emptied. 
            
140
The capsules were then filled with 80\u2009ml of lysis conservation 
141
The capsules were then filled with 80\u2009ml of lysis conservation 
            
141
buffer (CL1 buffer SPYGEN, le Bourget du Lac, France) and stored at 
142
buffer (CL1 buffer SPYGEN, le Bourget du Lac, France) and stored at 
            
142
room temperature in the dark. At La P\u00e9rouse, a total of eight 
143
room temperature in the dark. At La P\u00e9rouse, a total of eight 
            
143
water samples were collected during the MONT LA P\u00c9ROUSE 
144
water samples were collected during the MONT LA P\u00c9ROUSE 
            
144
expedition (https://gombessa-expeditions.com/mont-la-perouse/) on 
145
expedition (https://gombessa-expeditions.com/mont-la-perouse/) on 
            
145
board the ship La Curieuse to the seamount La P\u00e9rouse from 
146
board the ship La Curieuse to the seamount La P\u00e9rouse from 
            
146
October 27th to November 5th 2019. We followed a strict contamination 
147
October 27th to November 5th 2019. We followed a strict contamination 
            
147
control protocol in both field and laboratory stages. Each water 
148
control protocol in both field and laboratory stages. Each water 
            
148
sample processing included the use of disposable gloves and single-use 
149
sample processing included the use of disposable gloves and single-use 
            
149
filtration equipment to avoid any risk of contamination. Libraries 
150
filtration equipment to avoid any risk of contamination. Libraries 
            
150
were prepared with ligation using the MetaFast protocol 
151
were prepared with ligation using the MetaFast protocol 
            
151
(Fasteris).\n\nData content: \n\t* rawdata/: contains the raw reads 
152
(Fasteris).\n\nData content: \n\t* rawdata/: contains the raw reads 
            
152
for each individual sample. One archive contains the paired-end reads 
153
for each individual sample. One archive contains the paired-end reads 
            
153
specified by the _R1 or _R2 suffix as well as individually tagged PCR 
154
specified by the _R1 or _R2 suffix as well as individually tagged PCR 
            
154
replicates (if available) together with an archive containing all 
155
replicates (if available) together with an archive containing all 
            
155
extraction and PCR blank samples of the library. Reads have been 
156
extraction and PCR blank samples of the library. Reads have been 
            
156
demultiplexed using cutadapt but not trimmed, individual 
157
demultiplexed using cutadapt but not trimmed, individual 
            
157
demultiplexing tags and primers remain present in the sequences.  
158
demultiplexing tags and primers remain present in the sequences.  
            
158
\n\t* taxadata/: contains the table with all detected taxonomy for 
159
\n\t* taxadata/: contains the table with all detected taxonomy for 
            
159
each sample after bioinformatic processing (see Polanco et al. 2020 
160
each sample after bioinformatic processing (see Polanco et al. 2020 
            
160
for details; https://doi.org/10.1002/edn3.140) and associated field 
161
for details; https://doi.org/10.1002/edn3.140) and associated field 
            
161
metadata. \n\t* metadata/: contains two metadata files, one related to 
162
metadata. \n\t* metadata/: contains two metadata files, one related to 
            
162
the data collected in the field for each filter, and the second 
163
the data collected in the field for each filter, and the second 
            
163
related to the sequencing process in the lab (including the tag 
164
related to the sequencing process in the lab (including the tag 
            
164
sequence, library name, and marker information for each sample)\n",
165
sequence, library name, and marker information for each sample)\n",
            
165
  "num_resources": 1,
166
  "num_resources": 1,
            
166
  "num_tags": 7,
167
  "num_tags": 7,
            
167
  "organization": {
168
  "organization": {
            
168
    "approval_status": "approved",
169
    "approval_status": "approved",
            
169
    "created": "2018-12-01T11:59:01.791513",
170
    "created": "2018-12-01T11:59:01.791513",
            
170
    "description": "We are an international research team with diverse 
171
    "description": "We are an international research team with diverse 
            
171
scientific expertise and backgrounds, connected by the goal to 
172
scientific expertise and backgrounds, connected by the goal to 
            
172
understand biodiversity. We study the mechanisms that shape 
173
understand biodiversity. We study the mechanisms that shape 
            
173
biodiversity patterns across spatial and temporal scales - in both 
174
biodiversity patterns across spatial and temporal scales - in both 
            
174
terrestrial and aquatic ecosystems -\u200bsuch as mountain ranges and 
175
terrestrial and aquatic ecosystems -\u200bsuch as mountain ranges and 
            
175
tropical reefs. We use an interdisciplinary approach, whereby we 
176
tropical reefs. We use an interdisciplinary approach, whereby we 
            
176
bridge ecology, evolution, Earth history and global change.\r\nTo make 
177
bridge ecology, evolution, Earth history and global change.\r\nTo make 
            
177
these connections, we collect data through biological monitoring, 
178
these connections, we collect data through biological monitoring, 
            
178
environmental DNA methods, remote sensing, and field sampling, and use 
179
environmental DNA methods, remote sensing, and field sampling, and use 
            
179
these data to answer questions with statistical and 
180
these data to answer questions with statistical and 
            
180
process-\u200bbased models of biological diversity.\r\nOur group is 
181
process-\u200bbased models of biological diversity.\r\nOur group is 
            
181
affiliated with ETH and WSL, but is also associated with Agroscope, 
182
affiliated with ETH and WSL, but is also associated with Agroscope, 
            
182
EAWAG, the European Joint Research Centre and Vogelwarte.",
183
EAWAG, the European Joint Research Centre and Vogelwarte.",
            
183
    "id": "153392ee-d556-4b16-a330-dedb177e87f9",
184
    "id": "153392ee-d556-4b16-a330-dedb177e87f9",
            
184
    "image_url": 
185
    "image_url": 
            
185
le.ethz.ch/_jcr_content/orgbox/image.imageformat.logo.1254626489.png",
186
le.ethz.ch/_jcr_content/orgbox/image.imageformat.logo.1254626489.png",
            
186
    "is_organization": true,
187
    "is_organization": true,
            
187
    "name": "ele-group",
188
    "name": "ele-group",
            
188
    "state": "active",
189
    "state": "active",
            
189
    "title": "Ecosystems and Landscape Evolution",
190
    "title": "Ecosystems and Landscape Evolution",
            
190
    "type": "organization"
191
    "type": "organization"
            
191
  },
192
  },
            
192
  "owner_org": "153392ee-d556-4b16-a330-dedb177e87f9",
193
  "owner_org": "153392ee-d556-4b16-a330-dedb177e87f9",
            
193
  "private": false,
194
  "private": false,
            
194
  "publication": 
195
  "publication": 
            
195
"{\"publisher\":\"EnviDat\",\"publication_year\":\"2024\"}",
196
"{\"publisher\":\"EnviDat\",\"publication_year\":\"2024\"}",
            
196
  "publication_state": "published",
197
  "publication_state": "published",
            
197
  "related_publications": "Muff, Marion, et al. \"Environmental DNA 
198
  "related_publications": "Muff, Marion, et al. \"Environmental DNA 
            
198
highlights fish biodiversity in mesophotic ecosystems.\" Environ. DNA, 
199
highlights fish biodiversity in mesophotic ecosystems.\" Environ. DNA, 
            
199
vol. 5, no. 1, 1 Jan. 2023, pp. 56-72, doi:10.1002/edn3.358.",
200
vol. 5, no. 1, 1 Jan. 2023, pp. 56-72, doi:10.1002/edn3.358.",
            
200
  "relationships_as_object": [],
201
  "relationships_as_object": [],
            
201
  "relationships_as_subject": [],
202
  "relationships_as_subject": [],
            
202
  "resource_type": "dataset",
203
  "resource_type": "dataset",
            
203
  "resource_type_general": "dataset",
204
  "resource_type_general": "dataset",
            
204
  "resources": [
205
  "resources": [
            
205
    {
206
    {
            
206
      "cache_last_updated": null,
207
      "cache_last_updated": null,
            
207
      "cache_url": null,
208
      "cache_url": null,
            
208
      "created": "2024-12-10T15:19:34.794121",
209
      "created": "2024-12-10T15:19:34.794121",
            
209
      "description": "Please use cyberduck to download for the 
210
      "description": "Please use cyberduck to download for the 
            
210
moment",
211
moment",
            
211
      "doi": "",
212
      "doi": "",
            
212
      "format": "csv + fasta",
213
      "format": "csv + fasta",
            
213
      "hash": "",
214
      "hash": "",
            
214
      "id": "add08aff-55fa-4e9d-a96f-014465c2436e",
215
      "id": "add08aff-55fa-4e9d-a96f-014465c2436e",
            
215
      "last_modified": "2024-12-10T16:20:42.072000",
216
      "last_modified": "2024-12-10T16:20:42.072000",
            
216
      "metadata_modified": "2024-12-11T12:00:15.003656",
217
      "metadata_modified": "2024-12-11T12:00:15.003656",
            
217
      "mimetype": null,
218
      "mimetype": null,
            
218
      "mimetype_inner": null,
219
      "mimetype_inner": null,
            
219
      "name": "Data access",
220
      "name": "Data access",
            
220
      "package_id": "27331019-15d4-41c5-b9e4-866c6bc0a96a",
221
      "package_id": "27331019-15d4-41c5-b9e4-866c6bc0a96a",
            
221
      "position": 0,
222
      "position": 0,
            
222
      "publication_state": "",
223
      "publication_state": "",
            
223
      "resource_size": "{\"size_units\": \"gb\", \"size_value\": 
224
      "resource_size": "{\"size_units\": \"gb\", \"size_value\": 
            
224
\"1.6\"}",
225
\"1.6\"}",
            
225
      "resource_type": null,
226
      "resource_type": null,
            
226
      "restricted": "{\"allowed_users\": \"\", \"level\": \"public\", 
227
      "restricted": "{\"allowed_users\": \"\", \"level\": \"public\", 
            
227
\"shared_secret\": \"\"}",
228
\"shared_secret\": \"\"}",
            
228
      "size": null,
229
      "size": null,
            
229
      "state": "active",
230
      "state": "active",
            
230
      "url": 
231
      "url": 
            
231
cket=https://envicloud.wsl.ch/edna/&prefix=/ma_fr/ma_fr_lapero_2019/",
232
cket=https://envicloud.wsl.ch/edna/&prefix=/ma_fr/ma_fr_lapero_2019/",
            
232
      "url_type": null
233
      "url_type": null
            
233
    }
234
    }
            
234
  ],
235
  ],
            
235
  "spatial": 
236
  "spatial": 
            
236
ies\":{\"name\":\"environmental-dna-marine-france-laperouse-2019\"}}",
237
ies\":{\"name\":\"environmental-dna-marine-france-laperouse-2019\"}}",
            
237
  "state": "active",
238
  "state": "active",
            
238
  "subtitle": "",
239
  "subtitle": "",
            
239
  "tags": [
240
  "tags": [
            
240
    {
241
    {
            
241
      "display_name": "CORAL REEF",
242
      "display_name": "CORAL REEF",
            
242
      "id": "63718352-c39f-4313-9ca3-bdb1d680dbef",
243
      "id": "63718352-c39f-4313-9ca3-bdb1d680dbef",
            
243
      "name": "CORAL REEF",
244
      "name": "CORAL REEF",
            
244
      "state": "active",
245
      "state": "active",
            
245
      "vocabulary_id": null
246
      "vocabulary_id": null
            
246
    },
247
    },
            
247
    {
248
    {
            
248
      "display_name": "ENVIRONMENTAL DNA",
249
      "display_name": "ENVIRONMENTAL DNA",
            
249
      "id": "db7d5622-d1fc-4d24-91f7-73842c6743b6",
250
      "id": "db7d5622-d1fc-4d24-91f7-73842c6743b6",
            
250
      "name": "ENVIRONMENTAL DNA",
251
      "name": "ENVIRONMENTAL DNA",
            
251
      "state": "active",
252
      "state": "active",
            
252
      "vocabulary_id": null
253
      "vocabulary_id": null
            
253
    },
254
    },
            
254
    {
255
    {
            
255
      "display_name": "FISH COMPOSITION",
256
      "display_name": "FISH COMPOSITION",
            
256
      "id": "4c441df2-c810-49ad-81a3-483b6a9ff2bb",
257
      "id": "4c441df2-c810-49ad-81a3-483b6a9ff2bb",
            
257
      "name": "FISH COMPOSITION",
258
      "name": "FISH COMPOSITION",
            
258
      "state": "active",
259
      "state": "active",
            
259
      "vocabulary_id": null
260
      "vocabulary_id": null
            
260
    },
261
    },
            
261
    {
262
    {
            
262
      "display_name": "INDIAN OCEAN",
263
      "display_name": "INDIAN OCEAN",
            
263
      "id": "064cc0db-d544-453d-98f9-54b9f46fba27",
264
      "id": "064cc0db-d544-453d-98f9-54b9f46fba27",
            
264
      "name": "INDIAN OCEAN",
265
      "name": "INDIAN OCEAN",
            
265
      "state": "active",
266
      "state": "active",
            
266
      "vocabulary_id": null
267
      "vocabulary_id": null
            
267
    },
268
    },
            
268
    {
269
    {
            
269
      "display_name": "LAPEROUSE",
270
      "display_name": "LAPEROUSE",
            
270
      "id": "b5062b96-2335-4fde-b7e5-0b615d947d89",
271
      "id": "b5062b96-2335-4fde-b7e5-0b615d947d89",
            
271
      "name": "LAPEROUSE",
272
      "name": "LAPEROUSE",
            
272
      "state": "active",
273
      "state": "active",
            
273
      "vocabulary_id": null
274
      "vocabulary_id": null
            
274
    },
275
    },
            
275
    {
276
    {
            
276
      "display_name": "MARINE",
277
      "display_name": "MARINE",
            
277
      "id": "1f05d702-5580-40ac-9c9a-47127e050fa7",
278
      "id": "1f05d702-5580-40ac-9c9a-47127e050fa7",
            
278
      "name": "MARINE",
279
      "name": "MARINE",
            
279
      "state": "active",
280
      "state": "active",
            
280
      "vocabulary_id": null
281
      "vocabulary_id": null
            
281
    },
282
    },
            
282
    {
283
    {
            
283
      "display_name": "TELEO",
284
      "display_name": "TELEO",
            
284
      "id": "d67a8d9b-568f-45dc-ac71-fd05228faa6b",
285
      "id": "d67a8d9b-568f-45dc-ac71-fd05228faa6b",
            
285
      "name": "TELEO",
286
      "name": "TELEO",
            
286
      "state": "active",
287
      "state": "active",
            
287
      "vocabulary_id": null
288
      "vocabulary_id": null
            
288
    }
289
    }
            
289
  ],
290
  ],
            
290
  "title": "Environmental DNA Marine France LaPerouse 2019",
291
  "title": "Environmental DNA Marine France LaPerouse 2019",
            
291
  "type": "dataset",
292
  "type": "dataset",
            
292
  "url": null
293
  "url": null
            
293
}
294
}