Changes

              
    

          
          
        
        

            
f
1
{
f
1
{
            
2
  "author": "[{\"given_name\": \"Marion\", \"name\": \"Muff\", 
2
  "author": "[{\"given_name\": \"Marion\", \"name\": \"Muff\", 
            
3
\"email\": \"muffm@student.ethz.ch\", \"data_credit\": [], 
3
\"email\": \"muffm@student.ethz.ch\", \"data_credit\": [], 
            
4
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"ETHZ\"}, {\"given_name\": 
4
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"ETHZ\"}, {\"given_name\": 
            
5
\"Melissa\", \"name\": \"Jaquier\", \"email\": 
5
\"Melissa\", \"name\": \"Jaquier\", \"email\": 
            
6
\"melissa@jaquier.blue\", \"data_credit\": [], \"identifier\": \"\", 
6
\"melissa@jaquier.blue\", \"data_credit\": [], \"identifier\": \"\", 
            
7
\"affiliation\": \"ETHZ\"}, {\"given_name\": \"Virginie\", \"name\": 
7
\"affiliation\": \"ETHZ\"}, {\"given_name\": \"Virginie\", \"name\": 
            
8
\"Marques\", \"email\": \"virginie.marques@wsl.ch\", \"data_credit\": 
8
\"Marques\", \"email\": \"virginie.marques@wsl.ch\", \"data_credit\": 
            
9
[]}, {\"given_name\": \"Laurent\", \"name\": \"Ballesta\", \"email\": 
9
[]}, {\"given_name\": \"Laurent\", \"name\": \"Ballesta\", \"email\": 
            
10
\"laurent.ballesta@andromede.fr\", \"data_credit\": [], 
10
\"laurent.ballesta@andromede.fr\", \"data_credit\": [], 
            
11
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"Andromede\"}, 
11
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"Andromede\"}, 
            
12
{\"given_name\": \"Julie\", \"name\": \"Deter\", \"email\": 
12
{\"given_name\": \"Julie\", \"name\": \"Deter\", \"email\": 
            
13
\"julie.deter@andromede-ocean.com\", \"data_credit\": [], 
13
\"julie.deter@andromede-ocean.com\", \"data_credit\": [], 
            
14
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"Andromede\"}, 
14
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"Andromede\"}, 
            
15
{\"given_name\": \"Thomas\", \"name\": \"Bockel\", \"email\": 
15
{\"given_name\": \"Thomas\", \"name\": \"Bockel\", \"email\": 
            
16
\"thomas.bockel@andromede-ocean.com\", \"data_credit\": [], 
16
\"thomas.bockel@andromede-ocean.com\", \"data_credit\": [], 
            
17
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"Andromede\"}, 
17
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"Andromede\"}, 
            
18
{\"given_name\": \"R\\u00e9gis\", \"name\": \"Hocd\\u00e9\", 
18
{\"given_name\": \"R\\u00e9gis\", \"name\": \"Hocd\\u00e9\", 
            
19
\"email\": \"regis.hocde@ird.fr\", \"data_credit\": [], 
19
\"email\": \"regis.hocde@ird.fr\", \"data_credit\": [], 
            
20
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"IRD\"}, {\"given_name\": 
20
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"IRD\"}, {\"given_name\": 
            
21
\"Jean-Baptiste\", \"name\": \"Juhel\", \"email\": 
21
\"Jean-Baptiste\", \"name\": \"Juhel\", \"email\": 
            
22
\"jeanbaptiste.juhel@gmail.com\", \"data_credit\": [], \"identifier\": 
22
\"jeanbaptiste.juhel@gmail.com\", \"data_credit\": [], \"identifier\": 
            
23
\"\", \"affiliation\": \"University of Montpellier\"}, 
23
\"\", \"affiliation\": \"University of Montpellier\"}, 
            
24
{\"given_name\": \"Emilie\", \"name\": \"Boulanger\", \"email\": 
24
{\"given_name\": \"Emilie\", \"name\": \"Boulanger\", \"email\": 
            
25
\"Emilie.boulanger@hotmail.com\", \"data_credit\": [], \"identifier\": 
25
\"Emilie.boulanger@hotmail.com\", \"data_credit\": [], \"identifier\": 
            
26
\"\", \"affiliation\": \"University of Montpellier\"}, 
26
\"\", \"affiliation\": \"University of Montpellier\"}, 
            
27
{\"given_name\": \"Nacim\", \"name\": \"Guellati\", \"email\": 
27
{\"given_name\": \"Nacim\", \"name\": \"Guellati\", \"email\": 
            
28
\"nacim.guellati.1997@gmail.com\", \"data_credit\": [], 
28
\"nacim.guellati.1997@gmail.com\", \"data_credit\": [], 
            
29
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"University of Montpellier\"}, 
29
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"University of Montpellier\"}, 
            
30
{\"given_name\": \"Andrea\", \"name\": \"Polanco\", \"email\": 
30
{\"given_name\": \"Andrea\", \"name\": \"Polanco\", \"email\": 
            
31
\"andrea.polanco@gmail.com\", \"data_credit\": [], \"identifier\": 
31
\"andrea.polanco@gmail.com\", \"data_credit\": [], \"identifier\": 
            
32
\"\", \"affiliation\": \"Biodiversa Colombia Foundation, Colombia\"}, 
32
\"\", \"affiliation\": \"Biodiversa Colombia Foundation, Colombia\"}, 
            
33
{\"given_name\": \"Alice\", \"name\": \"Valentini\", \"email\": 
33
{\"given_name\": \"Alice\", \"name\": \"Valentini\", \"email\": 
            
34
\"alice.valentini@spygen.com\", \"data_credit\": [], \"identifier\": 
34
\"alice.valentini@spygen.com\", \"data_credit\": [], \"identifier\": 
            
35
\"\", \"affiliation\": \"SPYGEN\"}, {\"given_name\": \"Tony\", 
35
\"\", \"affiliation\": \"SPYGEN\"}, {\"given_name\": \"Tony\", 
            
36
\"name\": \"Dejean\", \"email\": \"tony.dejean@spygen.com\", 
36
\"name\": \"Dejean\", \"email\": \"tony.dejean@spygen.com\", 
            
37
\"data_credit\": [], \"identifier\": \"\", \"affiliation\": 
37
\"data_credit\": [], \"identifier\": \"\", \"affiliation\": 
            
38
\"SPYGEN\"}, {\"given_name\": \"Stephanie\", \"name\": \"Manel\", 
38
\"SPYGEN\"}, {\"given_name\": \"Stephanie\", \"name\": \"Manel\", 
            
39
\"email\": \"stephanie.manel@cefe.cnrs.fr\", \"data_credit\": [], 
39
\"email\": \"stephanie.manel@cefe.cnrs.fr\", \"data_credit\": [], 
            
40
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"EPHE\"}, {\"given_name\": 
40
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"EPHE\"}, {\"given_name\": 
            
41
\"Camille\", \"name\": \"Albouy\", \"email\": 
41
\"Camille\", \"name\": \"Albouy\", \"email\": 
            
42
\"camille.albouy@wsl.ch\", \"data_credit\": [], \"identifier\": \"\", 
42
\"camille.albouy@wsl.ch\", \"data_credit\": [], \"identifier\": \"\", 
            
43
\"affiliation\": \"Unit of Land Change Science, 7u Federal Research 
43
\"affiliation\": \"Unit of Land Change Science, 7u Federal Research 
            
44
Institute WSL, Birmensdorf, Switzerland\"}, {\"given_name\": 
44
Institute WSL, Birmensdorf, Switzerland\"}, {\"given_name\": 
            
45
\"Patrick\", \"name\": \"Durville\", \"email\": 
45
\"Patrick\", \"name\": \"Durville\", \"email\": 
            
46
\"patrick.durville.galaxea@gmail.com\", \"data_credit\": [], 
46
\"patrick.durville.galaxea@gmail.com\", \"data_credit\": [], 
            
47
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"GALAXEA\"}, {\"given_name\": 
47
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"GALAXEA\"}, {\"given_name\": 
            
48
\"David\", \"name\": \"Mouillot\", \"email\": 
48
\"David\", \"name\": \"Mouillot\", \"email\": 
            
49
\"david.mouillot@umontpellier.fr\", \"data_credit\": [], 
49
\"david.mouillot@umontpellier.fr\", \"data_credit\": [], 
            
50
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"University of Montpellier\"}, 
50
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"University of Montpellier\"}, 
            
51
{\"given_name\": \"Florian\", \"name\": \"Holon\", \"email\": 
51
{\"given_name\": \"Florian\", \"name\": \"Holon\", \"email\": 
            
52
\"florian.holon@andromede-ocean.com\", \"data_credit\": [], 
52
\"florian.holon@andromede-ocean.com\", \"data_credit\": [], 
            
53
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"Andromede\"}, 
53
\"identifier\": \"\", \"affiliation\": \"Andromede\"}, 
            
54
{\"given_name\": \"Loic\", \"name\": \"Pellissier\", \"email\": 
54
{\"given_name\": \"Loic\", \"name\": \"Pellissier\", \"email\": 
            
55
\"loic.pellissier@wsl.ch\", \"data_credit\": [], \"identifier\": 
55
\"loic.pellissier@wsl.ch\", \"data_credit\": [], \"identifier\": 
            
56
\"0000-0002-2289-8259\", \"affiliation\": \"Landscape Ecology, 
56
\"0000-0002-2289-8259\", \"affiliation\": \"Landscape Ecology, 
            
57
Institute of Terrestrial Ecosystems, ETH Z\\u00fcrich, 8049 
57
Institute of Terrestrial Ecosystems, ETH Z\\u00fcrich, 8049 
            
58
Z\\u00fcrich, Switzerland\"}]",
58
Z\\u00fcrich, Switzerland\"}]",
            
59
  "author_email": null,
59
  "author_email": null,
            
60
  "creator_user_id": "382d8fab-f378-477d-88f6-26f77aee50d8",
60
  "creator_user_id": "382d8fab-f378-477d-88f6-26f77aee50d8",
            
61
  "date": 
61
  "date": 
            
62
\":\"created\",\"date\":\"2019-10-27\",\"end_date\":\"2019-11-05\"}]",
62
\":\"created\",\"date\":\"2019-10-27\",\"end_date\":\"2019-11-05\"}]",
            
63
  "doi": "10.16904/envidat.567",
63
  "doi": "10.16904/envidat.567",
            
64
  "extras": [
64
  "extras": [
            
65
    {
65
    {
            
66
      "key": "edna_type",
66
      "key": "edna_type",
            
67
      "value": "marine"
67
      "value": "marine"
            
68
    },
68
    },
            
69
    {
69
    {
            
70
      "key": "metadata",
70
      "key": "metadata",
            
71
      "value": 
71
      "value": 
            
72
ma_fr/ma_fr_lapero_2019/metadata/metadata_field_ma_fr_lapero_2019.csv"
72
ma_fr/ma_fr_lapero_2019/metadata/metadata_field_ma_fr_lapero_2019.csv"
            
73
    }
73
    }
            
74
  ],
74
  ],
            
75
  "funding": "[{\"institution\":\"Internal Funding ELE group 
75
  "funding": "[{\"institution\":\"Internal Funding ELE group 
            
76
\",\"grant_number\":\"\",\"institution_url\":\"\"},{\"institution\":\" 
76
\",\"grant_number\":\"\",\"institution_url\":\"\"},{\"institution\":\" 
            
77
Andromede Oceanologie\",\"grant_number\":\"GOMBESSA 
77
Andromede Oceanologie\",\"grant_number\":\"GOMBESSA 
            
78
5\",\"institution_url\":\"\"},{\"institution\":\"ANR labcom 
78
5\",\"institution_url\":\"\"},{\"institution\":\"ANR labcom 
            
79
2\",\"grant_number\":\"InToSea (Innovative Tools under the Sea) joint 
79
2\",\"grant_number\":\"InToSea (Innovative Tools under the Sea) joint 
            
80
laboratory\",\"institution_url\":\"\"},{\"institution\":\"Manufacture 
80
laboratory\",\"institution_url\":\"\"},{\"institution\":\"Manufacture 
            
81
de Haute Horlogerie Suisse Blancpain and Blancpain Ocean 
81
de Haute Horlogerie Suisse Blancpain and Blancpain Ocean 
            
82
rant_number\":\"\",\"institution_url\":\"\"},{\"institution\":\"Prince 
82
rant_number\":\"\",\"institution_url\":\"\"},{\"institution\":\"Prince 
            
83
Albert II de Monaco 
83
Albert II de Monaco 
            
84
\":\"\",\"institution_url\":\"\"},{\"institution\":\"Soci\u00e9t\u00e9 
84
\":\"\",\"institution_url\":\"\"},{\"institution\":\"Soci\u00e9t\u00e9 
            
85
des explorations de 
85
des explorations de 
            
n
n
86
rant_number\":\"\",\"institution_url\":\"\"},{\"institution\":\"French 
            
86
Monaco\",\"grant_number\":\"\",\"institution_url\":\"\"}]",
87
Water Agency\",\"grant_number\":\"\",\"institution_url\":\"\"}]",
            
87
  "groups": [
88
  "groups": [
            
88
    {
89
    {
            
89
      "description": "",
90
      "description": "",
            
90
      "display_name": "eDNA",
91
      "display_name": "eDNA",
            
91
      "id": "c2176351-3002-4d7a-b2aa-d8509f7dbfbe",
92
      "id": "c2176351-3002-4d7a-b2aa-d8509f7dbfbe",
            
92
      "image_display_url": "",
93
      "image_display_url": "",
            
93
      "name": "edna",
94
      "name": "edna",
            
94
      "title": "eDNA"
95
      "title": "eDNA"
            
95
    }
96
    }
            
96
  ],
97
  ],
            
97
  "id": "27331019-15d4-41c5-b9e4-866c6bc0a96a",
98
  "id": "27331019-15d4-41c5-b9e4-866c6bc0a96a",
            
98
  "isopen": true,
99
  "isopen": true,
            
99
  "license_id": "cc-by",
100
  "license_id": "cc-by",
            
100
  "license_title": "Creative Commons Attribution",
101
  "license_title": "Creative Commons Attribution",
            
101
  "license_url": "https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/",
102
  "license_url": "https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/",
            
102
  "maintainer": 
103
  "maintainer": 
            
103
e.marques@wsl.ch\",\"given_name\":\"Virginie\",\"name\":\"Marques\"}",
104
e.marques@wsl.ch\",\"given_name\":\"Virginie\",\"name\":\"Marques\"}",
            
104
  "maintainer_email": null,
105
  "maintainer_email": null,
            
105
  "metadata_created": "2024-12-10T15:08:00.727653",
106
  "metadata_created": "2024-12-10T15:08:00.727653",
            
t
106
  "metadata_modified": "2024-12-12T13:50:36.395777",
t
107
  "metadata_modified": "2024-12-12T13:50:48.030778",
            
107
  "name": "environmental-dna-marine-france-laperouse-2019",
108
  "name": "environmental-dna-marine-france-laperouse-2019",
            
108
  "notes": "Fish environmental DNA data set collected in the shallow 
109
  "notes": "Fish environmental DNA data set collected in the shallow 
            
109
seamount of La P\u00e9rouse located between Madagascar and 
110
seamount of La P\u00e9rouse located between Madagascar and 
            
110
R\u00e9union Island \n\n\nIn 2019, we sampled the shallow seamount of 
111
R\u00e9union Island \n\n\nIn 2019, we sampled the shallow seamount of 
            
111
La P\u00e9rouse, located between Madagascar and R\u00e9union Island in 
112
La P\u00e9rouse, located between Madagascar and R\u00e9union Island in 
            
112
the WIO. La P\u00e9rouse is an extinct volcano with a summit depth at 
113
the WIO. La P\u00e9rouse is an extinct volcano with a summit depth at 
            
113
60\u2009m below the sea surface. The plateau of the summit has a 
114
60\u2009m below the sea surface. The plateau of the summit has a 
            
114
maximum length of 12\u2009km and a maximum width of 4 km. One side of 
115
maximum length of 12\u2009km and a maximum width of 4 km. One side of 
            
115
the seamount might have collapsed in the past, leading to a less 
116
the seamount might have collapsed in the past, leading to a less 
            
116
common crescent-shaped summit. The abyssal plains that surround this 
117
common crescent-shaped summit. The abyssal plains that surround this 
            
117
isolated pinnacle are at a depth of 5000\u2009m. Despite its proximity 
118
isolated pinnacle are at a depth of 5000\u2009m. Despite its proximity 
            
118
to R\u00e9union Island (160\u2009km northwest), La P\u00e9rouse and 
119
to R\u00e9union Island (160\u2009km northwest), La P\u00e9rouse and 
            
119
its surroundings are still poorly studied.\n\nTo sample eDNA in this 
120
its surroundings are still poorly studied.\n\nTo sample eDNA in this 
            
120
location we used a submersible pump (Subspace, Geneva, Switzerland; 
121
location we used a submersible pump (Subspace, Geneva, Switzerland; 
            
121
nominal flow of ~\u20091.0 L/min) to collect samples at various depths 
122
nominal flow of ~\u20091.0 L/min) to collect samples at various depths 
            
122
during close circuit rebreather dives. The pump has an internal 
123
during close circuit rebreather dives. The pump has an internal 
            
123
battery and can be activated underwater allowing in situ filtration 
124
battery and can be activated underwater allowing in situ filtration 
            
124
directly at the targeted habitat and depth. The filtration lasted for 
125
directly at the targeted habitat and depth. The filtration lasted for 
            
125
30\u2009min to collect a total water volume of ~\u200930\u2009L. 
126
30\u2009min to collect a total water volume of ~\u200930\u2009L. 
            
126
During close circuit rebreather dives, water samples from various 
127
During close circuit rebreather dives, water samples from various 
            
127
depths, ranging from 60 to 140\u2009m below the sea surface, were 
128
depths, ranging from 60 to 140\u2009m below the sea surface, were 
            
128
collected using only the Submersible method (eight stations: no 
129
collected using only the Submersible method (eight stations: no 
            
129
replicates). Out of the eight water samples, six were collected during 
130
replicates). Out of the eight water samples, six were collected during 
            
130
the day, while two were collected at night (IS2_1 at 62\u2009m and 
131
the day, while two were collected at night (IS2_1 at 62\u2009m and 
            
131
IS7_1 at 100\u2013125\u2009m). We applied this filtration protocols to 
132
IS7_1 at 100\u2013125\u2009m). We applied this filtration protocols to 
            
132
collect and filter water throughout a VigiDNA\u00ae 0.2 \u03bcM 
133
collect and filter water throughout a VigiDNA\u00ae 0.2 \u03bcM 
            
133
cross-flow filtration capsule (SPYGEN, le Bourget du Lac, France) 
134
cross-flow filtration capsule (SPYGEN, le Bourget du Lac, France) 
            
134
using disposable sterile tubing for each filtration capsule. After the 
135
using disposable sterile tubing for each filtration capsule. After the 
            
135
filtration process, the remaining water in the capsules was emptied. 
136
filtration process, the remaining water in the capsules was emptied. 
            
136
The capsules were then filled with 80\u2009ml of lysis conservation 
137
The capsules were then filled with 80\u2009ml of lysis conservation 
            
137
buffer (CL1 buffer SPYGEN, le Bourget du Lac, France) and stored at 
138
buffer (CL1 buffer SPYGEN, le Bourget du Lac, France) and stored at 
            
138
room temperature in the dark. At La P\u00e9rouse, a total of eight 
139
room temperature in the dark. At La P\u00e9rouse, a total of eight 
            
139
water samples were collected during the MONT LA P\u00c9ROUSE 
140
water samples were collected during the MONT LA P\u00c9ROUSE 
            
140
expedition (https://gombessa-expeditions.com/mont-la-perouse/) on 
141
expedition (https://gombessa-expeditions.com/mont-la-perouse/) on 
            
141
board the ship La Curieuse to the seamount La P\u00e9rouse from 
142
board the ship La Curieuse to the seamount La P\u00e9rouse from 
            
142
October 27th to November 5th 2019. We followed a strict contamination 
143
October 27th to November 5th 2019. We followed a strict contamination 
            
143
control protocol in both field and laboratory stages. Each water 
144
control protocol in both field and laboratory stages. Each water 
            
144
sample processing included the use of disposable gloves and single-use 
145
sample processing included the use of disposable gloves and single-use 
            
145
filtration equipment to avoid any risk of contamination. Libraries 
146
filtration equipment to avoid any risk of contamination. Libraries 
            
146
were prepared with ligation using the MetaFast protocol 
147
were prepared with ligation using the MetaFast protocol 
            
147
(Fasteris).\n\nData content: \n\t* rawdata/: contains the raw reads 
148
(Fasteris).\n\nData content: \n\t* rawdata/: contains the raw reads 
            
148
for each individual sample. One archive contains the paired-end reads 
149
for each individual sample. One archive contains the paired-end reads 
            
149
specified by the _R1 or _R2 suffix as well as individually tagged PCR 
150
specified by the _R1 or _R2 suffix as well as individually tagged PCR 
            
150
replicates (if available) together with an archive containing all 
151
replicates (if available) together with an archive containing all 
            
151
extraction and PCR blank samples of the library. Reads have been 
152
extraction and PCR blank samples of the library. Reads have been 
            
152
demultiplexed using cutadapt but not trimmed, individual 
153
demultiplexed using cutadapt but not trimmed, individual 
            
153
demultiplexing tags and primers remain present in the sequences.  
154
demultiplexing tags and primers remain present in the sequences.  
            
154
\n\t* taxadata/: contains the table with all detected taxonomy for 
155
\n\t* taxadata/: contains the table with all detected taxonomy for 
            
155
each sample after bioinformatic processing (see Polanco et al. 2020 
156
each sample after bioinformatic processing (see Polanco et al. 2020 
            
156
for details; https://doi.org/10.1002/edn3.140) and associated field 
157
for details; https://doi.org/10.1002/edn3.140) and associated field 
            
157
metadata. \n\t* metadata/: contains two metadata files, one related to 
158
metadata. \n\t* metadata/: contains two metadata files, one related to 
            
158
the data collected in the field for each filter, and the second 
159
the data collected in the field for each filter, and the second 
            
159
related to the sequencing process in the lab (including the tag 
160
related to the sequencing process in the lab (including the tag 
            
160
sequence, library name, and marker information for each sample)\n",
161
sequence, library name, and marker information for each sample)\n",
            
161
  "num_resources": 1,
162
  "num_resources": 1,
            
162
  "num_tags": 7,
163
  "num_tags": 7,
            
163
  "organization": {
164
  "organization": {
            
164
    "approval_status": "approved",
165
    "approval_status": "approved",
            
165
    "created": "2018-12-01T11:59:01.791513",
166
    "created": "2018-12-01T11:59:01.791513",
            
166
    "description": "We are an international research team with diverse 
167
    "description": "We are an international research team with diverse 
            
167
scientific expertise and backgrounds, connected by the goal to 
168
scientific expertise and backgrounds, connected by the goal to 
            
168
understand biodiversity. We study the mechanisms that shape 
169
understand biodiversity. We study the mechanisms that shape 
            
169
biodiversity patterns across spatial and temporal scales - in both 
170
biodiversity patterns across spatial and temporal scales - in both 
            
170
terrestrial and aquatic ecosystems -\u200bsuch as mountain ranges and 
171
terrestrial and aquatic ecosystems -\u200bsuch as mountain ranges and 
            
171
tropical reefs. We use an interdisciplinary approach, whereby we 
172
tropical reefs. We use an interdisciplinary approach, whereby we 
            
172
bridge ecology, evolution, Earth history and global change.\r\nTo make 
173
bridge ecology, evolution, Earth history and global change.\r\nTo make 
            
173
these connections, we collect data through biological monitoring, 
174
these connections, we collect data through biological monitoring, 
            
174
environmental DNA methods, remote sensing, and field sampling, and use 
175
environmental DNA methods, remote sensing, and field sampling, and use 
            
175
these data to answer questions with statistical and 
176
these data to answer questions with statistical and 
            
176
process-\u200bbased models of biological diversity.\r\nOur group is 
177
process-\u200bbased models of biological diversity.\r\nOur group is 
            
177
affiliated with ETH and WSL, but is also associated with Agroscope, 
178
affiliated with ETH and WSL, but is also associated with Agroscope, 
            
178
EAWAG, the European Joint Research Centre and Vogelwarte.",
179
EAWAG, the European Joint Research Centre and Vogelwarte.",
            
179
    "id": "153392ee-d556-4b16-a330-dedb177e87f9",
180
    "id": "153392ee-d556-4b16-a330-dedb177e87f9",
            
180
    "image_url": 
181
    "image_url": 
            
181
le.ethz.ch/_jcr_content/orgbox/image.imageformat.logo.1254626489.png",
182
le.ethz.ch/_jcr_content/orgbox/image.imageformat.logo.1254626489.png",
            
182
    "is_organization": true,
183
    "is_organization": true,
            
183
    "name": "ele-group",
184
    "name": "ele-group",
            
184
    "state": "active",
185
    "state": "active",
            
185
    "title": "Ecosystems and Landscape Evolution",
186
    "title": "Ecosystems and Landscape Evolution",
            
186
    "type": "organization"
187
    "type": "organization"
            
187
  },
188
  },
            
188
  "owner_org": "153392ee-d556-4b16-a330-dedb177e87f9",
189
  "owner_org": "153392ee-d556-4b16-a330-dedb177e87f9",
            
189
  "private": false,
190
  "private": false,
            
190
  "publication": 
191
  "publication": 
            
191
"{\"publisher\":\"EnviDat\",\"publication_year\":\"2024\"}",
192
"{\"publisher\":\"EnviDat\",\"publication_year\":\"2024\"}",
            
192
  "publication_state": "published",
193
  "publication_state": "published",
            
193
  "related_publications": "Muff, Marion, et al. \"Environmental DNA 
194
  "related_publications": "Muff, Marion, et al. \"Environmental DNA 
            
194
highlights fish biodiversity in mesophotic ecosystems.\" Environ. DNA, 
195
highlights fish biodiversity in mesophotic ecosystems.\" Environ. DNA, 
            
195
vol. 5, no. 1, 1 Jan. 2023, pp. 56-72, doi:10.1002/edn3.358.",
196
vol. 5, no. 1, 1 Jan. 2023, pp. 56-72, doi:10.1002/edn3.358.",
            
196
  "relationships_as_object": [],
197
  "relationships_as_object": [],
            
197
  "relationships_as_subject": [],
198
  "relationships_as_subject": [],
            
198
  "resource_type": "dataset",
199
  "resource_type": "dataset",
            
199
  "resource_type_general": "dataset",
200
  "resource_type_general": "dataset",
            
200
  "resources": [
201
  "resources": [
            
201
    {
202
    {
            
202
      "cache_last_updated": null,
203
      "cache_last_updated": null,
            
203
      "cache_url": null,
204
      "cache_url": null,
            
204
      "created": "2024-12-10T15:19:34.794121",
205
      "created": "2024-12-10T15:19:34.794121",
            
205
      "description": "Please use cyberduck to download for the 
206
      "description": "Please use cyberduck to download for the 
            
206
moment",
207
moment",
            
207
      "doi": "",
208
      "doi": "",
            
208
      "format": "csv + fasta",
209
      "format": "csv + fasta",
            
209
      "hash": "",
210
      "hash": "",
            
210
      "id": "add08aff-55fa-4e9d-a96f-014465c2436e",
211
      "id": "add08aff-55fa-4e9d-a96f-014465c2436e",
            
211
      "last_modified": "2024-12-10T16:20:42.072000",
212
      "last_modified": "2024-12-10T16:20:42.072000",
            
212
      "metadata_modified": "2024-12-11T12:00:15.003656",
213
      "metadata_modified": "2024-12-11T12:00:15.003656",
            
213
      "mimetype": null,
214
      "mimetype": null,
            
214
      "mimetype_inner": null,
215
      "mimetype_inner": null,
            
215
      "name": "Data access",
216
      "name": "Data access",
            
216
      "package_id": "27331019-15d4-41c5-b9e4-866c6bc0a96a",
217
      "package_id": "27331019-15d4-41c5-b9e4-866c6bc0a96a",
            
217
      "position": 0,
218
      "position": 0,
            
218
      "publication_state": "",
219
      "publication_state": "",
            
219
      "resource_size": "{\"size_units\": \"gb\", \"size_value\": 
220
      "resource_size": "{\"size_units\": \"gb\", \"size_value\": 
            
220
\"1.6\"}",
221
\"1.6\"}",
            
221
      "resource_type": null,
222
      "resource_type": null,
            
222
      "restricted": "{\"allowed_users\": \"\", \"level\": \"public\", 
223
      "restricted": "{\"allowed_users\": \"\", \"level\": \"public\", 
            
223
\"shared_secret\": \"\"}",
224
\"shared_secret\": \"\"}",
            
224
      "size": null,
225
      "size": null,
            
225
      "state": "active",
226
      "state": "active",
            
226
      "url": 
227
      "url": 
            
227
cket=https://envicloud.wsl.ch/edna/&prefix=/ma_fr/ma_fr_lapero_2019/",
228
cket=https://envicloud.wsl.ch/edna/&prefix=/ma_fr/ma_fr_lapero_2019/",
            
228
      "url_type": null
229
      "url_type": null
            
229
    }
230
    }
            
230
  ],
231
  ],
            
231
  "spatial": 
232
  "spatial": 
            
232
ies\":{\"name\":\"environmental-dna-marine-france-laperouse-2019\"}}",
233
ies\":{\"name\":\"environmental-dna-marine-france-laperouse-2019\"}}",
            
233
  "state": "active",
234
  "state": "active",
            
234
  "subtitle": "",
235
  "subtitle": "",
            
235
  "tags": [
236
  "tags": [
            
236
    {
237
    {
            
237
      "display_name": "CORAL REEF",
238
      "display_name": "CORAL REEF",
            
238
      "id": "63718352-c39f-4313-9ca3-bdb1d680dbef",
239
      "id": "63718352-c39f-4313-9ca3-bdb1d680dbef",
            
239
      "name": "CORAL REEF",
240
      "name": "CORAL REEF",
            
240
      "state": "active",
241
      "state": "active",
            
241
      "vocabulary_id": null
242
      "vocabulary_id": null
            
242
    },
243
    },
            
243
    {
244
    {
            
244
      "display_name": "ENVIRONMENTAL DNA",
245
      "display_name": "ENVIRONMENTAL DNA",
            
245
      "id": "db7d5622-d1fc-4d24-91f7-73842c6743b6",
246
      "id": "db7d5622-d1fc-4d24-91f7-73842c6743b6",
            
246
      "name": "ENVIRONMENTAL DNA",
247
      "name": "ENVIRONMENTAL DNA",
            
247
      "state": "active",
248
      "state": "active",
            
248
      "vocabulary_id": null
249
      "vocabulary_id": null
            
249
    },
250
    },
            
250
    {
251
    {
            
251
      "display_name": "FISH COMPOSITION",
252
      "display_name": "FISH COMPOSITION",
            
252
      "id": "4c441df2-c810-49ad-81a3-483b6a9ff2bb",
253
      "id": "4c441df2-c810-49ad-81a3-483b6a9ff2bb",
            
253
      "name": "FISH COMPOSITION",
254
      "name": "FISH COMPOSITION",
            
254
      "state": "active",
255
      "state": "active",
            
255
      "vocabulary_id": null
256
      "vocabulary_id": null
            
256
    },
257
    },
            
257
    {
258
    {
            
258
      "display_name": "INDIAN OCEAN",
259
      "display_name": "INDIAN OCEAN",
            
259
      "id": "064cc0db-d544-453d-98f9-54b9f46fba27",
260
      "id": "064cc0db-d544-453d-98f9-54b9f46fba27",
            
260
      "name": "INDIAN OCEAN",
261
      "name": "INDIAN OCEAN",
            
261
      "state": "active",
262
      "state": "active",
            
262
      "vocabulary_id": null
263
      "vocabulary_id": null
            
263
    },
264
    },
            
264
    {
265
    {
            
265
      "display_name": "LAPEROUSE",
266
      "display_name": "LAPEROUSE",
            
266
      "id": "b5062b96-2335-4fde-b7e5-0b615d947d89",
267
      "id": "b5062b96-2335-4fde-b7e5-0b615d947d89",
            
267
      "name": "LAPEROUSE",
268
      "name": "LAPEROUSE",
            
268
      "state": "active",
269
      "state": "active",
            
269
      "vocabulary_id": null
270
      "vocabulary_id": null
            
270
    },
271
    },
            
271
    {
272
    {
            
272
      "display_name": "MARINE",
273
      "display_name": "MARINE",
            
273
      "id": "1f05d702-5580-40ac-9c9a-47127e050fa7",
274
      "id": "1f05d702-5580-40ac-9c9a-47127e050fa7",
            
274
      "name": "MARINE",
275
      "name": "MARINE",
            
275
      "state": "active",
276
      "state": "active",
            
276
      "vocabulary_id": null
277
      "vocabulary_id": null
            
277
    },
278
    },
            
278
    {
279
    {
            
279
      "display_name": "TELEO",
280
      "display_name": "TELEO",
            
280
      "id": "d67a8d9b-568f-45dc-ac71-fd05228faa6b",
281
      "id": "d67a8d9b-568f-45dc-ac71-fd05228faa6b",
            
281
      "name": "TELEO",
282
      "name": "TELEO",
            
282
      "state": "active",
283
      "state": "active",
            
283
      "vocabulary_id": null
284
      "vocabulary_id": null
            
284
    }
285
    }
            
285
  ],
286
  ],
            
286
  "title": "Environmental DNA Marine France LaPerouse 2019",
287
  "title": "Environmental DNA Marine France LaPerouse 2019",
            
287
  "type": "dataset",
288
  "type": "dataset",
            
288
  "url": null
289
  "url": null
            
289
}
290
}