Changes

              
    

          
          
        
        

            
f
1
{
f
1
{
            
2
  "author": "[{\"affiliation\": \"INVEMAR\", \"affiliation_02\": \"\", 
2
  "author": "[{\"affiliation\": \"INVEMAR\", \"affiliation_02\": \"\", 
            
3
\"affiliation_03\": \"\", \"email\": 
3
\"affiliation_03\": \"\", \"email\": 
            
4
\"andrea.polanco@invemar.org.co\", \"given_name\": \"Andrea\", 
4
\"andrea.polanco@invemar.org.co\", \"given_name\": \"Andrea\", 
            
5
\"identifier\": \"0000-0001-6121-5214\", \"name\": \"Polanco\"}, 
5
\"identifier\": \"0000-0001-6121-5214\", \"name\": \"Polanco\"}, 
            
6
{\"affiliation\": \"ETH\", \"affiliation_02\": \"WSL\", 
6
{\"affiliation\": \"ETH\", \"affiliation_02\": \"WSL\", 
            
7
\"affiliation_03\": \"\", \"email\": \"virginie.marques@wsl.ch\", 
7
\"affiliation_03\": \"\", \"email\": \"virginie.marques@wsl.ch\", 
            
8
\"given_name\": \"Virginie\", \"identifier\": \"\", \"name\": 
8
\"given_name\": \"Virginie\", \"identifier\": \"\", \"name\": 
            
9
\"Marques\"}, {\"affiliation\": \"WSL\", \"affiliation_02\": \"\", 
9
\"Marques\"}, {\"affiliation\": \"WSL\", \"affiliation_02\": \"\", 
            
10
\"affiliation_03\": \"\", \"email\": \"fabian.fopp@wsl.ch\", 
10
\"affiliation_03\": \"\", \"email\": \"fabian.fopp@wsl.ch\", 
            
11
\"given_name\": \"Fabian\", \"identifier\": \"0000-0003-0648-8484\", 
11
\"given_name\": \"Fabian\", \"identifier\": \"0000-0003-0648-8484\", 
            
12
\"name\": \"Fopp\"}, {\"affiliation\": \"University of Montpellier\", 
12
\"name\": \"Fopp\"}, {\"affiliation\": \"University of Montpellier\", 
            
13
\"affiliation_02\": \"\", \"affiliation_03\": \"\", \"email\": 
13
\"affiliation_02\": \"\", \"affiliation_03\": \"\", \"email\": 
            
14
\"jeanbaptiste.juhel@gmail.com\", \"given_name\": \"Jean-Baptiste\", 
14
\"jeanbaptiste.juhel@gmail.com\", \"given_name\": \"Jean-Baptiste\", 
            
15
\"identifier\": \"\", \"name\": \"Juhel\"}, {\"affiliation\": 
15
\"identifier\": \"\", \"name\": \"Juhel\"}, {\"affiliation\": 
            
16
\"INVEMAR\", \"affiliation_02\": \"\", \"affiliation_03\": \"\", 
16
\"INVEMAR\", \"affiliation_02\": \"\", \"affiliation_03\": \"\", 
            
17
\"email\": \"giomar.borrero@invemar.org.co\", \"given_name\": 
17
\"email\": \"giomar.borrero@invemar.org.co\", \"given_name\": 
            
18
\"Giomar\", \"identifier\": \"\", \"name\": \"Borrero\"}, 
18
\"Giomar\", \"identifier\": \"\", \"name\": \"Borrero\"}, 
            
19
{\"affiliation\": \"University of Montpellier\", \"affiliation_02\": 
19
{\"affiliation\": \"University of Montpellier\", \"affiliation_02\": 
            
20
\"\", \"affiliation_03\": \"\", \"email\": 
20
\"\", \"affiliation_03\": \"\", \"email\": 
            
21
\"marie-charlotte.cheutin@univ-tours.fr\", \"given_name\": 
21
\"marie-charlotte.cheutin@univ-tours.fr\", \"given_name\": 
            
22
\"Marie-Charlotte\", \"identifier\": \"\", \"name\": \"Cheutin\"}, 
22
\"Marie-Charlotte\", \"identifier\": \"\", \"name\": \"Cheutin\"}, 
            
23
{\"affiliation\": \"SPYGEN\", \"affiliation_02\": \"\", 
23
{\"affiliation\": \"SPYGEN\", \"affiliation_02\": \"\", 
            
24
\"affiliation_03\": \"\", \"email\": \"tony.dejean@spygen.com\", 
24
\"affiliation_03\": \"\", \"email\": \"tony.dejean@spygen.com\", 
            
25
\"given_name\": \"Tony\", \"identifier\": \"\", \"name\": \"Dejean\"}, 
25
\"given_name\": \"Tony\", \"identifier\": \"\", \"name\": \"Dejean\"}, 
            
26
{\"affiliation\": \"INVEMAR\", \"affiliation_02\": \"\", 
26
{\"affiliation\": \"INVEMAR\", \"affiliation_02\": \"\", 
            
27
\"affiliation_03\": \"\", \"email\": \"juan.gonzalez@invemar.org.co\", 
27
\"affiliation_03\": \"\", \"email\": \"juan.gonzalez@invemar.org.co\", 
            
28
\"given_name\": \"Juan David Gonzalez\", \"identifier\": \"\", 
28
\"given_name\": \"Juan David Gonzalez\", \"identifier\": \"\", 
            
29
\"name\": \"Corredor\"}, {\"affiliation\": \"INVEMAR\", 
29
\"name\": \"Corredor\"}, {\"affiliation\": \"INVEMAR\", 
            
30
\"affiliation_02\": \"\", \"affiliation_03\": \"\", \"email\": 
30
\"affiliation_02\": \"\", \"affiliation_03\": \"\", \"email\": 
            
31
\"andres.acosta@invemar.org.co\", \"given_name\": \"Andres\", 
31
\"andres.acosta@invemar.org.co\", \"given_name\": \"Andres\", 
            
32
\"identifier\": \"\", \"name\": \"Acosta-Chapparo\"}, 
32
\"identifier\": \"\", \"name\": \"Acosta-Chapparo\"}, 
            
33
{\"affiliation\": \"IRD\", \"affiliation_02\": \"\", 
33
{\"affiliation\": \"IRD\", \"affiliation_02\": \"\", 
            
34
\"affiliation_03\": \"\", \"email\": \"regis.hocde@ird.fr\", 
34
\"affiliation_03\": \"\", \"email\": \"regis.hocde@ird.fr\", 
            
35
\"given_name\": \"R\\u00e9gis\", \"identifier\": \"\", \"name\": 
35
\"given_name\": \"R\\u00e9gis\", \"identifier\": \"\", \"name\": 
            
36
\"Hocd\\u00e9\"}, {\"affiliation\": \"RiverLy Research Unit, National 
36
\"Hocd\\u00e9\"}, {\"affiliation\": \"RiverLy Research Unit, National 
            
37
Research Institute for Agriculture Food and Environment (INRAE), 
37
Research Institute for Agriculture Food and Environment (INRAE), 
            
38
Villeurbanne, France.\", \"affiliation_02\": \"\", \"affiliation_03\": 
38
Villeurbanne, France.\", \"affiliation_02\": \"\", \"affiliation_03\": 
            
39
\"\", \"email\": \"david.eme@inrae.fr\", \"given_name\": \"David\", 
39
\"\", \"email\": \"david.eme@inrae.fr\", \"given_name\": \"David\", 
            
40
\"identifier\": \"\", \"name\": \"Eme\"}, {\"affiliation\": 
40
\"identifier\": \"\", \"name\": \"Eme\"}, {\"affiliation\": 
            
41
\"University of Montpellier\", \"affiliation_02\": \"\", 
41
\"University of Montpellier\", \"affiliation_02\": \"\", 
            
42
\"affiliation_03\": \"\", \"email\": \"eva.maire@ird.fr\", 
42
\"affiliation_03\": \"\", \"email\": \"eva.maire@ird.fr\", 
            
43
\"given_name\": \"Eva\", \"identifier\": \"\", \"name\": \"Maire\"}, 
43
\"given_name\": \"Eva\", \"identifier\": \"\", \"name\": \"Maire\"}, 
            
44
{\"affiliation\": \"ETHZ\", \"affiliation_02\": \"\", 
44
{\"affiliation\": \"ETHZ\", \"affiliation_02\": \"\", 
            
45
\"affiliation_03\": \"\", \"email\": \"spescha.manuel@hotmail.de\", 
45
\"affiliation_03\": \"\", \"email\": \"spescha.manuel@hotmail.de\", 
            
46
\"given_name\": \"Manuel\", \"identifier\": \"\", \"name\": 
46
\"given_name\": \"Manuel\", \"identifier\": \"\", \"name\": 
            
47
\"spescha\"}, {\"affiliation\": \"SPYGEN\", \"affiliation_02\": \"\", 
47
\"spescha\"}, {\"affiliation\": \"SPYGEN\", \"affiliation_02\": \"\", 
            
48
\"affiliation_03\": \"\", \"email\": \"alice.valentini@spygen.com\", 
48
\"affiliation_03\": \"\", \"email\": \"alice.valentini@spygen.com\", 
            
49
\"given_name\": \"Alice\", \"identifier\": \"\", \"name\": 
49
\"given_name\": \"Alice\", \"identifier\": \"\", \"name\": 
            
50
\"Valentini\"}, {\"affiliation\": \"EPHE\", \"affiliation_02\": \"\", 
50
\"Valentini\"}, {\"affiliation\": \"EPHE\", \"affiliation_02\": \"\", 
            
51
\"affiliation_03\": \"\", \"email\": \"stephanie.manel@cefe.cnrs.fr\", 
51
\"affiliation_03\": \"\", \"email\": \"stephanie.manel@cefe.cnrs.fr\", 
            
52
\"given_name\": \"Stephanie\", \"identifier\": \"\", \"name\": 
52
\"given_name\": \"Stephanie\", \"identifier\": \"\", \"name\": 
            
53
\"Manel\"}, {\"affiliation\": \"University of Montpellier\", 
53
\"Manel\"}, {\"affiliation\": \"University of Montpellier\", 
            
54
\"affiliation_02\": \"\", \"affiliation_03\": \"\", \"email\": 
54
\"affiliation_02\": \"\", \"affiliation_03\": \"\", \"email\": 
            
55
\"david.mouillot@umontpellier.fr\", \"given_name\": \"David\", 
55
\"david.mouillot@umontpellier.fr\", \"given_name\": \"David\", 
            
56
\"identifier\": \"\", \"name\": \"Mouillot\"}, {\"affiliation\": 
56
\"identifier\": \"\", \"name\": \"Mouillot\"}, {\"affiliation\": 
            
57
\"ETH\", \"affiliation_02\": \"\", \"affiliation_03\": \"\", 
57
\"ETH\", \"affiliation_02\": \"\", \"affiliation_03\": \"\", 
            
58
\"email\": \"albouycamille@gmail.com\", \"given_name\": \"Camille\", 
58
\"email\": \"albouycamille@gmail.com\", \"given_name\": \"Camille\", 
            
59
\"identifier\": \"0000-0003-1629-2389\", \"name\": \"Albouy\"}, 
59
\"identifier\": \"0000-0003-1629-2389\", \"name\": \"Albouy\"}, 
            
60
{\"affiliation\": \"Ecosystems and Landscape Evolution, Dep. of 
60
{\"affiliation\": \"Ecosystems and Landscape Evolution, Dep. of 
            
61
Environmental Systems Science, ETH Zurich\", \"affiliation_02\": \"\", 
61
Environmental Systems Science, ETH Zurich\", \"affiliation_02\": \"\", 
            
62
\"affiliation_03\": \"\", \"email\": \"loic.pellissier@usys.ethz.ch\", 
62
\"affiliation_03\": \"\", \"email\": \"loic.pellissier@usys.ethz.ch\", 
            
63
\"given_name\": \"Loic\", \"identifier\": \"0000-0002-2289-8259\", 
63
\"given_name\": \"Loic\", \"identifier\": \"0000-0002-2289-8259\", 
            
64
\"name\": \"Pellissier\"}]",
64
\"name\": \"Pellissier\"}]",
            
65
  "author_email": null,
65
  "author_email": null,
            
66
  "creator_user_id": "382d8fab-f378-477d-88f6-26f77aee50d8",
66
  "creator_user_id": "382d8fab-f378-477d-88f6-26f77aee50d8",
            
67
  "date": "[{\"date\": \"2018-10-17\", \"date_type\": \"created\", 
67
  "date": "[{\"date\": \"2018-10-17\", \"date_type\": \"created\", 
            
68
\"end_date\": \"2018-10-26\"}, {\"date\": \"2018-10-17\", 
68
\"end_date\": \"2018-10-26\"}, {\"date\": \"2018-10-17\", 
            
69
\"date_type\": \"collected\", \"end_date\": \"2018-10-26\"}]",
69
\"date_type\": \"collected\", \"end_date\": \"2018-10-26\"}]",
            
70
  "doi": "10.16904/envidat.548",
70
  "doi": "10.16904/envidat.548",
            
71
  "extras": [
71
  "extras": [
            
72
    {
72
    {
            
73
      "key": "edna_type",
73
      "key": "edna_type",
            
74
      "value": "marine"
74
      "value": "marine"
            
75
    },
75
    },
            
76
    {
76
    {
            
77
      "key": "metadata",
77
      "key": "metadata",
            
78
      "value": 
78
      "value": 
            
79
ma_co/ma_co_gayrac_2018/metadata/metadata_field_ma_co_gayrac_2018.csv"
79
ma_co/ma_co_gayrac_2018/metadata/metadata_field_ma_co_gayrac_2018.csv"
            
80
    }
80
    }
            
81
  ],
81
  ],
            
82
  "funding": "[{\"grant_number\": \"MEGAFAUNA\", \"institution\": 
82
  "funding": "[{\"grant_number\": \"MEGAFAUNA\", \"institution\": 
            
83
\"Explorations de Monaco\", \"institution_url\": 
83
\"Explorations de Monaco\", \"institution_url\": 
            
84
.monacoexplorations.org/en/missions/caribbean-missions-atlantic/\"}]",
84
.monacoexplorations.org/en/missions/caribbean-missions-atlantic/\"}]",
            
n
85
  "groups": [],
n
85
  "groups": [
            
86
    {
            
87
      "description": "",
            
88
      "display_name": "eDNA",
            
89
      "id": "c2176351-3002-4d7a-b2aa-d8509f7dbfbe",
            
90
      "image_display_url": "",
            
91
      "name": "edna",
            
92
      "title": "eDNA"
            
93
    }
            
94
  ],
            
86
  "id": "6cbd8b2e-87e2-4484-907a-cc0eafa88e0e",
95
  "id": "6cbd8b2e-87e2-4484-907a-cc0eafa88e0e",
            
87
  "isopen": false,
96
  "isopen": false,
            
88
  "language": "en",
97
  "language": "en",
            
89
  "license_id": "wsl-data",
98
  "license_id": "wsl-data",
            
90
  "license_title": "WSL Data Policy",
99
  "license_title": "WSL Data Policy",
            
91
  "license_url": 
100
  "license_url": 
            
92
ps://www.wsl.ch/en/about-wsl/programmes-and-initiatives/envidat.html",
101
ps://www.wsl.ch/en/about-wsl/programmes-and-initiatives/envidat.html",
            
93
  "maintainer": "{\"affiliation\": \"\", \"email\": 
102
  "maintainer": "{\"affiliation\": \"\", \"email\": 
            
94
\"virginie.marques@wsl.ch\", \"given_name\": \"Virginie\", 
103
\"virginie.marques@wsl.ch\", \"given_name\": \"Virginie\", 
            
95
\"identifier\": \"\", \"name\": \"Marques\"}",
104
\"identifier\": \"\", \"name\": \"Marques\"}",
            
96
  "maintainer_email": null,
105
  "maintainer_email": null,
            
97
  "metadata_created": "2024-10-02T09:16:17.873404",
106
  "metadata_created": "2024-10-02T09:16:17.873404",
            
n
98
  "metadata_modified": "2024-10-03T14:30:35.866410",
n
107
  "metadata_modified": "2024-12-13T13:22:47.786006",
            
99
  "name": "environmental-dna-marine-colombia-gayraca-2018",
108
  "name": "environmental-dna-marine-colombia-gayraca-2018",
            
100
  "notes": "Comparing environmental DNA metabarcoding and underwater 
109
  "notes": "Comparing environmental DNA metabarcoding and underwater 
            
101
visual census to monitor tropical reef fishes, the Gayraca Bay data 
110
visual census to monitor tropical reef fishes, the Gayraca Bay data 
            
102
set.\r\n\r\n\r\nThe Gayraca bay is located in the Tayrona National 
111
set.\r\n\r\n\r\nThe Gayraca bay is located in the Tayrona National 
            
103
Natural Park along the continental Colombian Caribbean coast bordering 
112
Natural Park along the continental Colombian Caribbean coast bordering 
            
104
the Sierra Nevada de Santa Marta. Tayrona Park has a heterogeneous 
113
the Sierra Nevada de Santa Marta. Tayrona Park has a heterogeneous 
            
105
coastal topography composed of metamorphic rocks, with numerous rocky 
114
coastal topography composed of metamorphic rocks, with numerous rocky 
            
106
headlands, islets, and bays (Garz\u00f3n-Ferreira & D\u00edaz, 2003). 
115
headlands, islets, and bays (Garz\u00f3n-Ferreira & D\u00edaz, 2003). 
            
107
Coral and other hard-bottom communities are distributed along the 
116
Coral and other hard-bottom communities are distributed along the 
            
108
coast, mainly as fringing reefs, while seagrass beds, mangroves, and 
117
coast, mainly as fringing reefs, while seagrass beds, mangroves, and 
            
109
coral reefs have developed to some extent in sheltered conditions 
118
coral reefs have developed to some extent in sheltered conditions 
            
110
within the bays (Garz\u00f3n-Ferreira & Cano, 1991). The study was 
119
within the bays (Garz\u00f3n-Ferreira & Cano, 1991). The study was 
            
111
carried out in Gayraca Bay, where corals on the exposed side exhibit 
120
carried out in Gayraca Bay, where corals on the exposed side exhibit 
            
112
mainly massive to encrusting growth forms with colonies and a 
121
mainly massive to encrusting growth forms with colonies and a 
            
113
reef-like structure. In Gayraca Bay, we sampled two filtration 
122
reef-like structure. In Gayraca Bay, we sampled two filtration 
            
114
replicates from each of six stations, for a total of 12 water samples, 
123
replicates from each of six stations, for a total of 12 water samples, 
            
115
from 23 to 26 October 2018. We recorded the GPS coordinates at the 
124
from 23 to 26 October 2018. We recorded the GPS coordinates at the 
            
116
start and end of the transect. We conducted eDNA sampling by using a 
125
start and end of the transect. We conducted eDNA sampling by using a 
            
117
filtration device composed of an Athena\u00ae peristaltic pump 
126
filtration device composed of an Athena\u00ae peristaltic pump 
            
118
(Proactive Environmental Products LLC, Bradenton, Florida, USA; 
127
(Proactive Environmental Products LLC, Bradenton, Florida, USA; 
            
119
nominal flow of 1.0\u2009L/min), a VigiDNA\u00ae 0.20\u2009\u03bcM 
128
nominal flow of 1.0\u2009L/min), a VigiDNA\u00ae 0.20\u2009\u03bcM 
            
120
cross-flow filtration capsule (SPYGEN, le Bourget du Lac, France) and 
129
cross-flow filtration capsule (SPYGEN, le Bourget du Lac, France) and 
            
121
disposable sterile tubing for each filtration capsule. We performed 
130
disposable sterile tubing for each filtration capsule. We performed 
            
122
two filtration replicates in parallel on each side of a boat, at each 
131
two filtration replicates in parallel on each side of a boat, at each 
            
123
station, for 30\u2009min corresponding to a volume of ~30\u2009L of 
132
station, for 30\u2009min corresponding to a volume of ~30\u2009L of 
            
124
water filtered by each capsule. At the end of each filtration, the 
133
water filtered by each capsule. At the end of each filtration, the 
            
125
water inside the capsules was emptied, and we filled the capsules with 
134
water inside the capsules was emptied, and we filled the capsules with 
            
126
80\u2009ml of CL1 Conservation buffer (SPYGEN, le Bourget du Lac, 
135
80\u2009ml of CL1 Conservation buffer (SPYGEN, le Bourget du Lac, 
            
127
France) and stored at room temperature. We followed a strict 
136
France) and stored at room temperature. We followed a strict 
            
128
contamination control protocol in both field and laboratory stages 
137
contamination control protocol in both field and laboratory stages 
            
129
(Valentini et al., 2016). Each water sample processing included the 
138
(Valentini et al., 2016). Each water sample processing included the 
            
130
use of disposable gloves and single-use filtration equipment to avoid 
139
use of disposable gloves and single-use filtration equipment to avoid 
            
131
any risk of contamination. Libraries were prepared with ligation using 
140
any risk of contamination. Libraries were prepared with ligation using 
            
132
the MetaFast protocol (Fasteris).  \r\n\r\nData content: \r\n\t* 
141
the MetaFast protocol (Fasteris).  \r\n\r\nData content: \r\n\t* 
            
133
rawdata/: contains the raw reads for each individual sample. One 
142
rawdata/: contains the raw reads for each individual sample. One 
            
134
archive contains the paired-end reads specified by the _R1 or _R2 
143
archive contains the paired-end reads specified by the _R1 or _R2 
            
135
suffix as well as individually tagged PCR replicates (if available) 
144
suffix as well as individually tagged PCR replicates (if available) 
            
136
together with an archive containing all extraction and PCR blank 
145
together with an archive containing all extraction and PCR blank 
            
137
samples of the library. Reads have been demultiplexed using cutadapt 
146
samples of the library. Reads have been demultiplexed using cutadapt 
            
138
but not trimmed, individual demultiplexing tags and primers remain 
147
but not trimmed, individual demultiplexing tags and primers remain 
            
139
present in the sequences.  \r\n\t* taxadata/: contains the table with 
148
present in the sequences.  \r\n\t* taxadata/: contains the table with 
            
140
all detected taxonomy for each sample after bioinformatic processing 
149
all detected taxonomy for each sample after bioinformatic processing 
            
141
(see Polanco et al. 2020 for details; 
150
(see Polanco et al. 2020 for details; 
            
142
https://doi.org/10.1002/edn3.140) and associated field metadata. 
151
https://doi.org/10.1002/edn3.140) and associated field metadata. 
            
143
\r\n\t* metadata/: contains two metadata files, one related to the 
152
\r\n\t* metadata/: contains two metadata files, one related to the 
            
144
data collected in the field for each filter, and the second related to 
153
data collected in the field for each filter, and the second related to 
            
145
the sequencing process in the lab (including the tag sequence, library 
154
the sequencing process in the lab (including the tag sequence, library 
            
146
name, and marker information for each sample)\r\n",
155
name, and marker information for each sample)\r\n",
            
147
  "num_resources": 1,
156
  "num_resources": 1,
            
n
148
  "num_tags": 9,
n
157
  "num_tags": 10,
            
149
  "organization": {
158
  "organization": {
            
150
    "approval_status": "approved",
159
    "approval_status": "approved",
            
151
    "created": "2018-12-01T11:59:01.791513",
160
    "created": "2018-12-01T11:59:01.791513",
            
152
    "description": "We are an international research team with diverse 
161
    "description": "We are an international research team with diverse 
            
153
scientific expertise and backgrounds, connected by the goal to 
162
scientific expertise and backgrounds, connected by the goal to 
            
154
understand biodiversity. We study the mechanisms that shape 
163
understand biodiversity. We study the mechanisms that shape 
            
155
biodiversity patterns across spatial and temporal scales - in both 
164
biodiversity patterns across spatial and temporal scales - in both 
            
156
terrestrial and aquatic ecosystems -\u200bsuch as mountain ranges and 
165
terrestrial and aquatic ecosystems -\u200bsuch as mountain ranges and 
            
157
tropical reefs. We use an interdisciplinary approach, whereby we 
166
tropical reefs. We use an interdisciplinary approach, whereby we 
            
158
bridge ecology, evolution, Earth history and global change.\r\nTo make 
167
bridge ecology, evolution, Earth history and global change.\r\nTo make 
            
159
these connections, we collect data through biological monitoring, 
168
these connections, we collect data through biological monitoring, 
            
160
environmental DNA methods, remote sensing, and field sampling, and use 
169
environmental DNA methods, remote sensing, and field sampling, and use 
            
161
these data to answer questions with statistical and 
170
these data to answer questions with statistical and 
            
162
process-\u200bbased models of biological diversity.\r\nOur group is 
171
process-\u200bbased models of biological diversity.\r\nOur group is 
            
163
affiliated with ETH and WSL, but is also associated with Agroscope, 
172
affiliated with ETH and WSL, but is also associated with Agroscope, 
            
164
EAWAG, the European Joint Research Centre and Vogelwarte.",
173
EAWAG, the European Joint Research Centre and Vogelwarte.",
            
165
    "id": "153392ee-d556-4b16-a330-dedb177e87f9",
174
    "id": "153392ee-d556-4b16-a330-dedb177e87f9",
            
166
    "image_url": 
175
    "image_url": 
            
167
le.ethz.ch/_jcr_content/orgbox/image.imageformat.logo.1254626489.png",
176
le.ethz.ch/_jcr_content/orgbox/image.imageformat.logo.1254626489.png",
            
168
    "is_organization": true,
177
    "is_organization": true,
            
169
    "name": "ele-group",
178
    "name": "ele-group",
            
170
    "state": "active",
179
    "state": "active",
            
171
    "title": "Ecosystems and Landscape Evolution",
180
    "title": "Ecosystems and Landscape Evolution",
            
172
    "type": "organization"
181
    "type": "organization"
            
173
  },
182
  },
            
174
  "owner_org": "153392ee-d556-4b16-a330-dedb177e87f9",
183
  "owner_org": "153392ee-d556-4b16-a330-dedb177e87f9",
            
175
  "private": false,
184
  "private": false,
            
176
  "publication": "{\"publication_year\": \"2024\", \"publisher\": 
185
  "publication": "{\"publication_year\": \"2024\", \"publisher\": 
            
177
\"EnviDat\"}",
186
\"EnviDat\"}",
            
178
  "publication_state": "published",
187
  "publication_state": "published",
            
179
  "related_datasets": "",
188
  "related_datasets": "",
            
180
  "related_publications": "Polanco A., Marques, V., Fopp, F., Juhel, 
189
  "related_publications": "Polanco A., Marques, V., Fopp, F., Juhel, 
            
181
J.B., Borrero-P\u00e9rez, G.H., Cheutin, M.C., Dejean, T., 
190
J.B., Borrero-P\u00e9rez, G.H., Cheutin, M.C., Dejean, T., 
            
182
Gonz\u00e1lez Corredor J.D., Acosta-Chaparro, A., Hocd\u00e9, R., Eme, 
191
Gonz\u00e1lez Corredor J.D., Acosta-Chaparro, A., Hocd\u00e9, R., Eme, 
            
183
D., Maire, E., Spescha, M., Valentini, A., Manel, S., Mouillot, D., 
192
D., Maire, E., Spescha, M., Valentini, A., Manel, S., Mouillot, D., 
            
184
Albouy, C., & Pellissier, L. (2020). Comparing environmental DNA 
193
Albouy, C., & Pellissier, L. (2020). Comparing environmental DNA 
            
185
metabarcoding and underwater visual census to monitor tropical reef 
194
metabarcoding and underwater visual census to monitor tropical reef 
            
186
fishes; environmental DNA, 3: 142\u2013156. 
195
fishes; environmental DNA, 3: 142\u2013156. 
            
187
https://doi.org/10.1002/edn3.140.",
196
https://doi.org/10.1002/edn3.140.",
            
188
  "relationships_as_object": [],
197
  "relationships_as_object": [],
            
189
  "relationships_as_subject": [],
198
  "relationships_as_subject": [],
            
190
  "resource_type": "dataset",
199
  "resource_type": "dataset",
            
191
  "resource_type_general": "dataset",
200
  "resource_type_general": "dataset",
            
192
  "resources": [
201
  "resources": [
            
193
    {
202
    {
            
194
      "cache_last_updated": null,
203
      "cache_last_updated": null,
            
195
      "cache_url": null,
204
      "cache_url": null,
            
196
      "created": "2024-10-02T09:18:32.781595",
205
      "created": "2024-10-02T09:18:32.781595",
            
197
      "description": "Please cyberduck to download for the moment",
206
      "description": "Please cyberduck to download for the moment",
            
198
      "doi": "",
207
      "doi": "",
            
199
      "format": "csv + fastq",
208
      "format": "csv + fastq",
            
200
      "hash": "",
209
      "hash": "",
            
201
      "id": "0a36b889-d253-42fb-a2c3-3398af9a60ae",
210
      "id": "0a36b889-d253-42fb-a2c3-3398af9a60ae",
            
202
      "last_modified": "2024-10-02T11:19:58.672000",
211
      "last_modified": "2024-10-02T11:19:58.672000",
            
203
      "metadata_modified": "2024-10-03T14:06:05.407968",
212
      "metadata_modified": "2024-10-03T14:06:05.407968",
            
204
      "mimetype": null,
213
      "mimetype": null,
            
205
      "mimetype_inner": null,
214
      "mimetype_inner": null,
            
206
      "name": "Data access",
215
      "name": "Data access",
            
207
      "package_id": "6cbd8b2e-87e2-4484-907a-cc0eafa88e0e",
216
      "package_id": "6cbd8b2e-87e2-4484-907a-cc0eafa88e0e",
            
208
      "position": 0,
217
      "position": 0,
            
209
      "publication_state": "",
218
      "publication_state": "",
            
210
      "resource_size": "{\"size_units\": \"gb\", \"size_value\": 
219
      "resource_size": "{\"size_units\": \"gb\", \"size_value\": 
            
211
\"30\"}",
220
\"30\"}",
            
212
      "resource_type": null,
221
      "resource_type": null,
            
213
      "restricted": "{\"allowed_users\": \"\", \"level\": \"public\", 
222
      "restricted": "{\"allowed_users\": \"\", \"level\": \"public\", 
            
214
\"shared_secret\": \"\"}",
223
\"shared_secret\": \"\"}",
            
215
      "size": null,
224
      "size": null,
            
216
      "state": "active",
225
      "state": "active",
            
217
      "url": 
226
      "url": 
            
218
bucket=https://envicloud.wsl.ch/edna/&prefix=ma_co/ma_co_gayrac_2018",
227
bucket=https://envicloud.wsl.ch/edna/&prefix=ma_co/ma_co_gayrac_2018",
            
219
      "url_type": null
228
      "url_type": null
            
220
    }
229
    }
            
221
  ],
230
  ],
            
222
  "spatial": 
231
  "spatial": 
            
223
ies\":{\"name\":\"environmental-dna-marine-colombia-gayraca-2019\"}}",
232
ies\":{\"name\":\"environmental-dna-marine-colombia-gayraca-2019\"}}",
            
224
  "spatial_info": "Switzerland",
233
  "spatial_info": "Switzerland",
            
225
  "state": "active",
234
  "state": "active",
            
226
  "subtitle": "",
235
  "subtitle": "",
            
227
  "tags": [
236
  "tags": [
            
228
    {
237
    {
            
229
      "display_name": "BIODIVERSITY",
238
      "display_name": "BIODIVERSITY",
            
230
      "id": "cb53f136-b0e5-418c-a3d3-cda8d0945ec6",
239
      "id": "cb53f136-b0e5-418c-a3d3-cda8d0945ec6",
            
231
      "name": "BIODIVERSITY",
240
      "name": "BIODIVERSITY",
            
232
      "state": "active",
241
      "state": "active",
            
233
      "vocabulary_id": null
242
      "vocabulary_id": null
            
234
    },
243
    },
            
235
    {
244
    {
            
236
      "display_name": "BIOMONITORING",
245
      "display_name": "BIOMONITORING",
            
237
      "id": "941af5e5-e550-4178-bc69-9a7e7ab8d311",
246
      "id": "941af5e5-e550-4178-bc69-9a7e7ab8d311",
            
238
      "name": "BIOMONITORING",
247
      "name": "BIOMONITORING",
            
239
      "state": "active",
248
      "state": "active",
            
240
      "vocabulary_id": null
249
      "vocabulary_id": null
            
241
    },
250
    },
            
242
    {
251
    {
            
243
      "display_name": "CARIBBEAN REGION",
252
      "display_name": "CARIBBEAN REGION",
            
244
      "id": "8844223b-bb3e-40e8-9f26-68647209ca79",
253
      "id": "8844223b-bb3e-40e8-9f26-68647209ca79",
            
245
      "name": "CARIBBEAN REGION",
254
      "name": "CARIBBEAN REGION",
            
246
      "state": "active",
255
      "state": "active",
            
247
      "vocabulary_id": null
256
      "vocabulary_id": null
            
248
    },
257
    },
            
249
    {
258
    {
            
250
      "display_name": "CHON01",
259
      "display_name": "CHON01",
            
251
      "id": "b19ea729-3996-4704-84c3-1d31493219ad",
260
      "id": "b19ea729-3996-4704-84c3-1d31493219ad",
            
252
      "name": "CHON01",
261
      "name": "CHON01",
            
253
      "state": "active",
262
      "state": "active",
            
254
      "vocabulary_id": null
263
      "vocabulary_id": null
            
255
    },
264
    },
            
256
    {
265
    {
            
t
t
266
      "display_name": "EDNA",
            
267
      "id": "dab1a17e-9bf9-4e0a-9a60-c3ca8f8a9154",
            
268
      "name": "EDNA",
            
269
      "state": "active",
            
270
      "vocabulary_id": null
            
271
    },
            
272
    {
            
257
      "display_name": "ENVIRONMENTAL DNA",
273
      "display_name": "ENVIRONMENTAL DNA",
            
258
      "id": "db7d5622-d1fc-4d24-91f7-73842c6743b6",
274
      "id": "db7d5622-d1fc-4d24-91f7-73842c6743b6",
            
259
      "name": "ENVIRONMENTAL DNA",
275
      "name": "ENVIRONMENTAL DNA",
            
260
      "state": "active",
276
      "state": "active",
            
261
      "vocabulary_id": null
277
      "vocabulary_id": null
            
262
    },
278
    },
            
263
    {
279
    {
            
264
      "display_name": "MARINE",
280
      "display_name": "MARINE",
            
265
      "id": "1f05d702-5580-40ac-9c9a-47127e050fa7",
281
      "id": "1f05d702-5580-40ac-9c9a-47127e050fa7",
            
266
      "name": "MARINE",
282
      "name": "MARINE",
            
267
      "state": "active",
283
      "state": "active",
            
268
      "vocabulary_id": null
284
      "vocabulary_id": null
            
269
    },
285
    },
            
270
    {
286
    {
            
271
      "display_name": "REEF FISH",
287
      "display_name": "REEF FISH",
            
272
      "id": "9c505aa1-e9b4-4120-a152-49aadf53617a",
288
      "id": "9c505aa1-e9b4-4120-a152-49aadf53617a",
            
273
      "name": "REEF FISH",
289
      "name": "REEF FISH",
            
274
      "state": "active",
290
      "state": "active",
            
275
      "vocabulary_id": null
291
      "vocabulary_id": null
            
276
    },
292
    },
            
277
    {
293
    {
            
278
      "display_name": "TELEO",
294
      "display_name": "TELEO",
            
279
      "id": "d67a8d9b-568f-45dc-ac71-fd05228faa6b",
295
      "id": "d67a8d9b-568f-45dc-ac71-fd05228faa6b",
            
280
      "name": "TELEO",
296
      "name": "TELEO",
            
281
      "state": "active",
297
      "state": "active",
            
282
      "vocabulary_id": null
298
      "vocabulary_id": null
            
283
    },
299
    },
            
284
    {
300
    {
            
285
      "display_name": "VERT01",
301
      "display_name": "VERT01",
            
286
      "id": "b8661b84-0436-4daa-b41f-7ec911a0191c",
302
      "id": "b8661b84-0436-4daa-b41f-7ec911a0191c",
            
287
      "name": "VERT01",
303
      "name": "VERT01",
            
288
      "state": "active",
304
      "state": "active",
            
289
      "vocabulary_id": null
305
      "vocabulary_id": null
            
290
    }
306
    }
            
291
  ],
307
  ],
            
292
  "title": "Environmental DNA Marine Colombia Gayraca 2018",
308
  "title": "Environmental DNA Marine Colombia Gayraca 2018",
            
293
  "type": "dataset",
309
  "type": "dataset",
            
294
  "url": null,
310
  "url": null,
            
295
  "version": "1.0"
311
  "version": "1.0"
            
296
}
312
}